KEGG   Candidatus Carsonella ruddii HC: A353_0218
Entry
A353_0218         CDS       T02197                                 
Symbol
lysA
Name
(GenBank) diaminopimelate decarboxylase
  KO
K01586  diaminopimelate decarboxylase [EC:4.1.1.20]
Organism
crh  Candidatus Carsonella ruddii HC
Pathway
crh00300  Lysine biosynthesis
crh00470  D-Amino acid metabolism
crh01100  Metabolic pathways
crh01110  Biosynthesis of secondary metabolites
crh01120  Microbial metabolism in diverse environments
crh01230  Biosynthesis of amino acids
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:crh00001]
 09100 Metabolism
  09105 Amino acid metabolism
   00300 Lysine biosynthesis
    A353_0218 (lysA)
  09106 Metabolism of other amino acids
   00470 D-Amino acid metabolism
    A353_0218 (lysA)
Enzymes [BR:crh01000]
 4. Lyases
  4.1  Carbon-carbon lyases
   4.1.1  Carboxy-lyases
    4.1.1.20  diaminopimelate decarboxylase
     A353_0218 (lysA)
SSDB
Motif
Pfam: Orn_Arg_deC_N Orn_DAP_Arg_deC SNAD1
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFP84042
UniProt: J3TED2
Position
161868..163061
AA seq 397 aa
MIEYKKNIFFDKVKLNFFLEKIDLPLYIYNYKKIIFNFFFIKKLKFFFFYSVKSNDNIFL
LKLINNFFFKFDIVSIEELKKIILISKKKPFIVFSGSGKNLSEILISLNLKIFSINIESI
QEILKLYYLKKKYKKNINIMIRINPNIDAKTHKKITTGTNLNKFGINLFHLKNLFYLNKI
LKFNILGYDFHIGSQLTKINPLKKLLKLINILYINKKYKYLDIGGGLGVNYYFNKNIINF
YKYYNQIYLLIKKYNLKTKIIIEIGRYIFCNSCVIISKSNYIKFYKKIFFCINKLGMNDV
LRPSLYNSFHKIESLNLGKNTSFFFGPICESSDKFLSKKIKVKNNSLLIFYSMGSYCKTM
SNNYNSKKKIFEVIICNNKIKIIFKKEKFKNLINNYE
NT seq 1194 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattgaatataaaaaaaatattttttttgataaagtaaaattaaatttttttttagaa
aaaattgatttacctttatatatttataattataaaaaaataatttttaacttttttttt
ataaaaaaattaaaatttttttttttttattctgtaaaatctaatgataatattttttta
ttaaaattaataaataattttttttttaaatttgatattgtatcaattgaagaattaaaa
aaaataattttaatttcaaaaaaaaaaccatttattgttttttctggtagtggtaaaaat
ttatcagaaattttaatttctttaaatttaaaaatatttagtattaatatagaatcaatt
caagaaattttaaaattatattatttaaaaaaaaaatataaaaaaaatattaatataatg
attagaattaatcctaatattgatgcaaaaactcataaaaaaataactactggaaccaat
ttaaataaatttggtattaatttatttcatttaaaaaatttattttatttaaataaaata
ttaaaatttaatattttaggatatgattttcatattggatcacaattaacaaaaataaac
cctttaaaaaaattattgaaattaattaatattttatatataaataaaaaatataaatat
ttagatataggtggtgggttaggcgttaattattattttaataaaaatattattaatttt
tataaatattataatcaaatatatttattaattaaaaaatataatttaaaaactaaaatt
attattgaaattggaagatatattttttgtaattcatgtgttattatttctaaatcaaat
tatataaaattttataaaaaaatttttttttgtattaacaaattaggaatgaatgatgtt
ttaagaccttctttgtataattcatttcataaaattgaatctttaaatttaggtaaaaat
acatcatttttttttggtccaatatgtgaatcaagtgataaatttttaagtaaaaaaata
aaagtaaaaaataattctttattaatattttattcaatgggaagttattgtaaaacaatg
agtaacaattataattcaaaaaaaaaaatttttgaagtaattatttgtaataataaaata
aaaataatttttaaaaaagaaaaatttaaaaatttaataaataattatgaataa

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Pathway (10)   
   KEGG PATHWAY (6)   
   KEGG MODULE (4)   
Chemical substance (3)   
   KEGG COMPOUND (3)   
Chemical reaction (2)   
   KEGG ENZYME (1)   
   KEGG REACTION (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (3)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   UniProt (1)   
Protein domain (3)   
   Pfam (3)   
All databases (25)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system