KEGG   Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0270828
Entry
DDB_G0270828      CDS       T00245                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K14827  pre-rRNA-processing protein IPI1
Organism
ddi  Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi03083  Polycomb repressive complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ddi00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09126 Chromosome
   03083 Polycomb repressive complex
    DDB_G0270828
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis [BR:ddi03009]
    DDB_G0270828
Ribosome biogenesis [BR:ddi03009]
 Eukaryotic type
  Pre-60S particles
   5-FMC complex
    DDB_G0270828
SSDB
Motif
Pfam: Ipi1_N
Other DBs
NCBI-GeneID: 8617022
NCBI-ProteinID: XP_646072
dictyBase: DDB_G0270828
UniProt: Q55DQ9
Position
1:complement(3009708..3012882)
AA seq 959 aa
MGRSAPKKTLQPSLDFKVKKKKLGKKPPPNPNITVTTFKSKALNMPGQNIVEEKDDLVNH
RNLTLKDLLTKLNHYNDQVKKDAVTGIRDLILKHPSVLFVHLGAIMNKLVEVINDLDKDV
RHCTHTLISTILPMLDEISISPFIPLFSVYINSGMTHLKTTIRLDSLRLLDIFIDHYPNL
VSRSCHQMIPNYIDLLKRVSGAATVATISTSTSSSANVPISASVPVSQQKNKSSTASSTP
KANSLHTRVMILKSLFKLIKVLLHEPDLSFSSLLNKIHKQRENTQIIDGKMAIDCSLTYQ
AYNDRKVFPDLFSKYLVKNNEQQQLNSDGTVKSLFPTILETSEEVKQFSSTLLPILIDLW
LELGPSNPGISFQVLEDLELVVSIIQLLVHCLKENFSTTDFYEQLRKDYIKFFSVHFPFY
VGSPSNPDSKEWIISCSINSLMTQTASHFLGYSPSISNVDQTINGWYQPFFEFIEDALNG
KLIDEKVEATKGQSIKTHISNLLWIVKIILPILSSTQSESILNSFISFDEKCHPHSTSKK
ACVFFIKELIDIQSNPLLSNVKSFKNIIEWGLTSLPKLLWKLGNSDNDTSLMILNILLSV
GRDKSKIKQYDSIQNALVPFFFTISKPTPQFPNGKQIYGPFSSLPLNIQFLALNTLYYFS
SLNKIMIRSLIAICRSNKSSPEIISIVLDLIHNLYLVGTLSLSHYTAFCIAITLSITSKE
IEDNTNNVIMIDEEKIQEQEKIIKKLCWNINSLRLSNSIENILEPMTEPFISELKKISTN
FQDNNNENSGDSLNYILSLILSCFTDKNDYNNEIREKEFKSLSNELIITITNSIFIYIFQ
SIKFINSTSTKIYDLNIILKIIQLDNSNQILINILNLISSKLNVGNNQVEKNNNNQYSIL
SLIELFKSKELYEIFQLSNVKSIVGSIVKKVEKSVSTQLSTEKQLLEKLLSEVKLLFNE
NT seq 2880 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgggtagatcagcaccaaaaaaaacattacaaccatcacttgattttaaagtgaaaaag
aagaaattgggtaagaaaccaccaccaaacccaaatattacagttacaacttttaaatct
aaagcattaaatatgccaggtcaaaatatagttgaagaaaaagatgatttagttaatcat
cgtaatttaacattaaaggatttattaacaaaattaaatcattataatgatcaagttaaa
aaggatgcagttacaggtatacgtgatttaatattaaaacatccaagtgtattattcgtt
catttaggtgcaattatgaataaattagtagaggtaatcaatgatttagataaagatgtt
agacattgtacccatactttaatatcaacaattttaccaatgcttgacgaaatatcaatt
tcaccattcataccattgttttcagtttacattaattccggtatgacacatttaaagaca
accatccgtttagattcattacgtttattggatattttcattgatcattatccaaattta
gtatcacgtagttgtcatcaaatgattccaaattatattgaccttttgaaaagagtatct
ggtgcagccaccgttgcaaccatttcaacttcaacttcatcctctgcaaatgttccaatt
tcagcatcagtaccagtatctcaacaaaagaacaaatcatcaactgcttcatcaactcca
aaagcaaattcattacatactagagttatgattttaaaaagtctttttaaattaattaaa
gttttattacatgaaccagatttatcattctcttcattattaaataaaattcataaacaa
agagaaaatactcaaattattgatggaaagatggcaattgattgtagtttaacctatcaa
gcttataatgatagaaaagtttttccagatttatttagtaaatatttagttaaaaataat
gaacaacaacaattaaatagtgatggtacagttaaatcattatttccaacaattttagag
acatcagaagaagttaaacaattttcaagtacattattaccaattttaattgatttatgg
ttagagttgggaccatcaaatccaggtatttcattccaagttttagaggatttagaattg
gtagtttcaattattcaacttttagttcactgtttaaaagaaaacttttcaaccactgat
ttctatgaacaattaagaaaggattatattaaattcttttcagttcattttccattttat
gttggttcaccaagtaatccagattcaaaagaatggattataagttgttcaatcaattca
ttgatgactcaaacagcttcacactttttaggttattcaccatcgatttcaaatgttgat
caaactattaatggttggtatcaaccattctttgaatttattgaagatgcattgaatggt
aaattaattgatgaaaaagttgaggctacaaaaggccaatctattaaaactcacatttca
aatcttttatggatagttaaaattatcttaccaattttatcatcaactcaaagtgaatcc
attttaaattctttcattagttttgatgaaaaatgtcatccacatagtacttcaaagaaa
gcttgtgttttctttattaaggaattaattgatattcaatcaaatccattattatcaaat
gttaaatcttttaaaaatataattgaatggggtttaacttctttaccaaaattattatgg
aaattgggtaattctgataatgatacatcattgatgattttaaatattttattatcagtt
ggtagagataagagtaaaattaaacaatatgattcaattcaaaatgcattagtaccattc
ttttttacaatttcaaaaccaacaccacaatttccaaatggtaaacaaatttatggtcca
ttctcaagtttaccattgaatattcaatttttagctttaaatactttatattatttctca
agtttaaacaaaattatgattagatctttaattgcaatttgtagatcaaataaatcatca
ccagaaattatttcaattgttttagatttaattcataatttatatttagttggtacatta
tcattatcacattatacagcattttgtattgcaattactttatcaattacatcaaaagaa
attgaggataatactaataatgtaataatgattgatgaagagaaaattcaagaacaagaa
aaaattataaagaaattatgttggaatataaattcattaagattatcaaattcaattgaa
aatattttagaaccaatgacagaaccatttataagtgaattaaaaaagatttcaacaaat
ttccaagataataataatgaaaattcaggtgattctttaaattatattttatctttaatt
ttatcatgttttactgataaaaatgattataataatgaaattagagaaaaagaattcaaa
tcattatcaaatgaattaataataacaattacaaatagtatttttatttatattttccaa
tcaattaaatttataaattcaacatcaacaaaaatttatgacttaaatatcattttaaaa
attattcaattggataattcaaatcaaatattaattaatattttaaatttaatttcaagt
aaattaaatgttggtaataatcaagttgaaaaaaataataataatcaatattcaatttta
tcacttatcgagttatttaaatcaaaagaattatatgaaatattccaattgtcaaatgtt
aaatcaatcgttggttcaattgtaaaaaaagttgaaaaatcagtttccactcaactttcc
actgagaaacaattacttgaaaaattattatctgaagtaaaattattatttaatgaataa

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (60)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (55)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   DICTYBASE (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (1)   
   Pfam (1)   
All databases (68)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system