KEGG   Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0273209
Entry
DDB_G0273209      CDS       T00245                                 
Symbol
trappc10-1
Name
(RefSeq) trafficking protein particle complex subunit 10
  KO
K20307  trafficking protein particle complex subunit 10
Organism
ddi  Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ddi00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking [BR:ddi04131]
    DDB_G0273209 (trappc10-1)
Membrane trafficking [BR:ddi04131]
 Endosome - Golgi transport
  Tethering complex
   TRAPP complex II
    DDB_G0273209 (trappc10-1)
SSDB
Motif
Pfam: TRAPPC10 Foie-gras_1 MotA_N
Other DBs
NCBI-GeneID: 8618876
NCBI-ProteinID: XP_644774
dictyBase: DDB_G0273209
UniProt: Q556Z3
Position
2:2711050..2715761
AA seq 1442 aa
MSNVSPNSMNLNGSTSSTASVNDSGGGGGGGNVTSPTLSSSSASSISNSNSSSSNNLKPS
TQPLSSSSTLNTPTQFSLQHSSSSSSLNNTNIDIIEHITISYQDESSIWKYIEAELPNHL
PLKNISWKTKTGHTKVVEKMPIEILQYNDERVKAHYDNQNLYKKPYLYLYLVHCDDPDTY
KNVVRAKIKQWVTQMTERQQEWLIVYVSLGPKRFSELTSKLTRTVFDRIKNDFNVKRDRC
CQLRFLDTNNTSSGNNKDKDNDNGGGSSGTGLSTSTKQQDDLWDDFLIKMKEGIISSAEQ
YLTTYEDEIRKMDAKRTTPGWSYQNFFFIKEGLALIYERAQLYEDALMQYFELEVLFGDP
NNRSQFDQITDEVLQPNSIHCNGNILDTSFKNYRKLIYENKISLFDFKVYLFARQSKLLF
LLQKPIEAATKSISFITSMSMIIKQYPNSFAPMFKESWIFSTSMELIKACQDSFDKIVNG
AQQQQQQQQQQLQLQQQLQQQQQQQTINGSAQKVVKSISSTTPISKLFGAFGPFGSSSSN
TPSSTSATTAANGKNTPMPSNSGIASLSAGGSTIIAGLSGSQSLNNLQSAQLSGALNTQH
YIRTPSLNLTSDLSERLTEKQDRESLDFLVGDLLFSSAQRLEELAIIIGYLPVDDYNSEM
FFQNVEEVIFKSVENKKIEVDSMTAFSYQPLQVSLQSSKQFTQLYFELLGQIEKLYIQSN
RMRSISRLTFAIANLNFKLKEFQIAENLFKSISNLYSREHWSYIEYAVKTRLSYCQKQLG
HLVDYVTTCVGLLAPGLLTNRFEKDHYLSEIIQISRKPELNIVQPMIPLFKCKVTFKETV
YRYFETIKINVRIKSNLISPIRFNNGAVSFVKSGFGDKLVFQLNDFLVEPGVNNFQFTAV
GTTKATFVKDSIWLKIDNLSFGYSLRNADTAIGGGGGGTNTTTTTLPGEIKVIDSESQIT
LESFANSPLLFYSIQYVGIKLHTHSDTIEAGVLTFTSPTGATIIPTSSVIIIQSDDKTCE
TSSRTINLINDKLPLSQIGYNQTLEFYLPLMAVNTDTCTHQIRIELQHQKQTKEKFSSSL
VSSILFINPLTIDESVINVNNRLFLKTIIQCNSPNMIQFNSYSLEGCDSEYQSPEQQQLQ
QQLQQQQQLSLSSSSSSISSISSKSSQQPNLYYLVKDHNHSLAPNLNLYPGQLVSLIFEI
KKYENESLSSSTSPSSATDSSNSNGNNNNNNNNNNHSKNDLKLKIKYTSKMPQQDLDRPL
IRECKSLWRDQNEFSWPIKIELPTYLYQIDLSIQSRAYVGTIVLFEIEITNLKQQQQQQK
ESNNDNGNEKQQKQQQLQYHIVADSQIWMISGKSKHTFSFNSDTVGEKLKFSCGLIPISS
GSLPIPKVTLVGINNSNISYPKTKNEKIFVYPSPQIYSCHQLQDNNNNNNNSINSQTSTN
KT
NT seq 4329 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtctaatgtatcaccaaattctatgaatttaaatggatcaacatcatcgacagcatca
gttaatgatagtggaggcggtggtggtggtggcaatgtaacatctccaacactatcatca
tcatcagcatcatcaattagtaatagtaatagtagtagtagtaataatttaaaaccatca
acacaaccattatcatcgtcatctactttaaatactccaacacaattttcacttcaacat
tcttcttcatcatcttcattaaataatacaaatattgatataattgaacatattacaatt
tcatatcaagatgaatcatcaatttggaaatatattgaagcagaattaccaaatcattta
ccgttaaagaatatatcatggaaaactaaaacaggacatacaaaagtagtggagaagatg
ccaattgaaatattacaatataatgatgaacgtgtaaaggcacattatgataatcaaaat
ctatacaagaaaccatacctctatttgtatttggtacattgtgatgatcctgatacctat
aagaatgttgtacgtgctaaaataaaacaatgggtaactcaaatgactgaacgtcaacaa
gagtggttaatagtttatgtttcattaggtccaaaaagatttagcgaattaacttcaaaa
ttaacaagaactgttttcgatagaattaaaaatgatttcaatgttaaacgagatcgttgt
tgtcaattaagatttttagatacaaataatacaagcagcggcaataataaagataaagat
aatgataatggtggtggtagtagtggaacaggtttgtcaacaagtacgaaacaacaagat
gatttatgggatgattttctaattaaaatgaaagagggtataatttcatcagcagaacaa
tatttaacaacctatgaagatgaaattagaaaaatggatgcaaagaggacaacaccaggt
tggagttatcaaaacttttttttcataaaggaaggtttagcattaatctatgaacgtgct
caattatatgaggatgcattaatgcaatattttgaattggaagtacttttcggtgatcca
aataataggtcacaatttgatcaaatcactgatgaagttttacaaccaaatagtattcat
tgtaatggtaacattttagatacttcctttaaaaattatagaaagttaatttatgaaaat
aaaattagtttatttgattttaaagtttatttatttgcaagacaatcaaaattattattt
ttattacaaaaaccaattgaagcagcaacgaaatcaatatcatttattacatcaatgtca
atgataattaaacaatatccaaattcatttgcaccaatgtttaaagaatcatggatattc
agtacaagtatggaattgattaaagcatgtcaagattcattcgataagattgtaaatggt
gctcaacaacaacaacagcaacagcaacaacaattacaacttcaacaacaattacaacaa
caacaacagcaacaaactataaatggtagtgcacaaaaagttgtgaaatcaattagttca
actacacccatttcaaaattatttggtgcatttggaccttttggtagtagtagtagtaat
acaccatcatcgacatcagcaactacagcagcaaatggtaaaaatacaccaatgccaagt
aatagtggtatagcttcattaagtgcaggtggatcaacgattatagcaggtttatcaggt
tcacaatctttaaacaatttacaatctgcacaattatcaggtgctttaaatactcaacat
tatattcgtacaccttctttaaatttaacaagtgatctctctgaaagattaactgaaaaa
caagatagagaaagtttagattttttagttggtgatttattatttagttcagctcaaaga
ttagaagaattggcaataattattggatatttaccagttgatgattataatagtgaaatg
ttctttcaaaatgtagaagaagttatatttaagagtgtagagaataaaaagattgaagtt
gattcaatgacagcatttagttatcagccattacaagtctcacttcaatcatcgaaacaa
ttcactcaactttatttcgaattgttaggtcaaattgagaaattgtatattcaatctaat
agaatgagaagtattagtagattaacatttgcaattgcaaatttaaatttcaaattaaaa
gaatttcaaattgcagagaatcttttcaaatcaatttcaaatctttactctagagaacat
tggtcctatatagaatatgccgttaaaactagattatcctattgtcaaaagcagttgggt
catttagttgattatgtaacaacttgtgttggtttattagctcctggtttattaacaaat
agatttgaaaaagatcattatttatctgaaattattcaaatttctcgaaaacctgaatta
aatattgttcaaccaatgataccattatttaaatgtaaagttacatttaaagaaacagtt
tatagatattttgaaacaattaaaatcaatgttagaataaagagtaatttaatatcacca
attagatttaataatggtgcagttagttttgtaaagagtggtttcggtgataaattagta
tttcaattgaatgatttccttgttgaaccaggtgtaaacaatttccaattcacagcagtt
ggtacaactaaagcaacctttgttaaagattcaatttggttaaaaattgataacctttca
tttggttattcattacgtaatgctgatacagctattggtggtggtggtggtggtacaaat
acaacaacaactacattaccaggtgaaattaaagttattgatagtgaatcacaaataact
ttagaatcatttgcaaatagtccattattattttatagtattcaatatgttggaattaaa
ttacatactcattccgatacgattgaagcgggtgtattaacattcacttcaccaactggt
gcaactataataccaacttcatcagtaatcatcatacagagtgacgataaaacttgtgaa
acttcctcaagaacaataaatttaattaatgataagttaccattatctcaaattggttat
aatcaaacattggaattctatttaccattgatggctgtaaataccgatacttgcactcat
caaattagaatcgaattacaacatcaaaaacaaaccaaagaaaaattttcatcatcattg
gtctcttcaattttattcattaatccattgacaatcgatgaatctgtcattaatgtaaat
aatagattattcttaaaaactattatacaatgtaattctccaaatatgattcaatttaat
tcttattctttagaaggttgtgattcagaatatcaatcacctgaacaacaacaattacaa
caacaattacaacaacagcagcaattatcattatcatcttcaagttcatcaatctcatca
atctcttcaaaatcttcacaacaaccaaatttatattatttagtaaaagatcataatcat
tcattagcaccaaatttaaatttataccctggccaattagtttcattaatttttgaaatt
aaaaagtatgaaaatgaatctttatcatcatcaacatcaccttcatcagcaactgatagt
agtaatagtaatggaaacaataacaacaacaacaataacaacaaccatagtaaaaatgat
ttgaaattaaagataaaatatacaagtaaaatgcctcaacaagatttagatagaccatta
attagagaatgtaaatcattatggagagatcaaaacgaatttagttggccaattaaaatc
gagcttccaacttatctttatcaaatagatctatcaattcaaagtagggcttatgttggt
acaatagttctttttgaaattgaaattacaaatttaaaacaacaacaacaacaacaaaaa
gaaagtaataatgataacggtaatgaaaaacaacaaaaacaacaacaattacaatatcat
atagttgctgattcacaaatttggatgatatctggtaagagtaaacatacattttcattt
aatagtgatacagttggtgaaaagcttaaatttagttgtggtttaattccaatctcctct
ggctcattaccaattccaaaagtaactttagtcggtataaataattcaaatatttcttat
ccaaaaactaaaaatgaaaagatattcgtttatccatcaccacaaatttattcatgtcat
caattacaagataataataataataataataatagtattaatagtcaaactagtacaaac
aaaacataa

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (50)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (45)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   DICTYBASE (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (3)   
   UniProt (1)   
   SWISS-PROT (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (3)   
   Pfam (3)   
All databases (60)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system