KEGG   Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0274119
Entry
DDB_G0274119      CDS       T00245                                 
Symbol
abcA5
Name
(RefSeq) ABC transporter A family protein
  KO
K05643  ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 3
Organism
ddi  Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi02010  ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ddi00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09131 Membrane transport
   02010 ABC transporters
    DDB_G0274119 (abcA5)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:ddi02000]
    DDB_G0274119 (abcA5)
Transporters [BR:ddi02000]
 ABC transporters, eukaryotic type
  ABCA (ABC1) subfamily
   ABCA1, 2, 3, 4, 7, 12, 13 subgroups
    DDB_G0274119 (abcA5)
SSDB
Motif
Pfam: ABC_tran ABC2_membrane_3 AAA_21 SMC_N SRP54 SbcC_Walker_B AAA_29
Other DBs
NCBI-GeneID: 8619461
NCBI-ProteinID: XP_644031
dictyBase: DDB_G0274119
UniProt: Q8T6J2
Position
2:complement(4156981..4162118)
AA seq 1662 aa
MGEKSSQLKTLLKKNLLLKSKSKCGICCEIVFPIIIVLLVFAILVLVQLFKPNYDLIKTT
QFSNRINENNIIIYGGKAGSLNVEQKGVIDMMKFQLSNELNKSISEVDVYFKEINDKSEM
ENYFQINSTQVFGGIWFESNQLSSVANTTNTNTTTNSFKYSIRLDSNSVLDSNKVKDNGI
DSSDYLTKNWAYIQIAMDQAIFGYFGLDYKLVINGQRYPDPYVELWQKWINGRESVFKSA
GSVFVSAALLIFTFRLVTELVVEKETKIREGMSIMGLNQYCYFISWIITSLVTALPIDLI
IIVILKGSQVIHSTSWIIVIVTLILYLLTLQLLAFIFSMFFDKSKFAGLLTFLTILLINI
CGIFIGEYEIINIHIKLLLCCIFSPIGIACSFYIMSIRDIPDTISTINLNQVISEKQIIG
TFVFNIIFYTFLIWYLDKIVKTEYGTKEPWYFLFTKRYWTVGAGKINKKNKNKEYNYNDI
ESTIQNNNNDNIEMVPIEVRNKTTISIRNLRKEFKTGDGLRIAVNDLNLDMFDGQIHGLL
GPNGSGKSTTISMLTGLLSPTSGTAFILGNDITYQMNEIRKCTGVCLQTDIIWNQLTVLE
HLEIYASLKGITNKKQIKSESLKMANEIDLGEKLHTPAGSLSGGQKRKLCLGIAFIGRST
IIFLDEVSSGMDPSSRRKVWDFLLSHKKGKTIILTTHYLDEADYLSDRISIISHGKLITD
GSSLFLKNKYGVGYLLTCSKSLNTIDQFNVDQVTQFIRDQIPDVTVLSNAGSEISFRLPT
ASLPVFSKFFKDFDENLSNFHIDSYGISVTTLEEVFLKIGTDIDTDALSIADGNGNDDEL
KRSIGVSSTGIKSKQQLKALLIKRVKTSSKDFKAFLLSLLLPLLVIIGSIIVFKEVDNEV
IFYNNSTEPLTFSLLQQYGKNDIVPIQLAGTTSEFDFNKFLSNSPYFNQFQYLNNSINFN
QYLINNYKQSSGSINFTIPLSSSLINNTTKVISYNSLFNFNYIHSWPVHVNLINDALLRN
HNGIGIECTSLPFDHILTSFQKASQGMNIQSIVYFIVIMMAGFSLMAGSFAGSISQERTN
RIKRLLYISGCKKYIYWVSNLLWDYFFAFILLLITCIILAIVDDKFNDQFGLFFLSLVLF
SLSIIPLSYLFSFKFSSFGKSTGAITAIHFSIGVIMTIAMIILRIEVIIKNSSSLENIAD
IIDIVFNILSPLYAFSRVIFIISGFPGSLRLGALKIDDYWSLHYASTPIIILSVHVVVWT
IFILLIDYSPEFKGYLRNPKTILPPPPPIDEDSDVSAERIRLESMSPIPSTDQGSGGGGD
MLQYKGLHKLFIGKGKNPNKNAVYNSTLGIPQGQTFGLLGLNGAGKTTTVSMLAGDILPT
SGQITINGHDLVTDRAQALRGVSVCPQFDALITLLTAREQLSLYCAIKGVPDDKISLVVE
AFIKMMDLGKIANSNTGGYSGGNKRKVSLSIAMLGNPSVVLIDEASSGCDPIIRYRQCQV
ISELGKNKVIILTSHSMSEIQALCSRMTIMRDGQFKCLGSTQHIKSKFGAGYSVEVKFKK
SCLEVGIPQSLQCVLECFPNATILDQHDLMASLELPNPPENPIKVSEIFNILSTELSSIL
DDYSVSQTSLEQVFLKLTGATHEDRLNLNNQQQQQQTIPNSD
NT seq 4989 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgggagagaagtcatcacaattaaaaactcttttaaaaaagaatttattattaaaatca
aaatcaaaatgtggaatttgttgtgaaattgtttttccaattattattgtattacttgta
tttgcaattttagtattagtacaactttttaaaccaaattatgatttaataaaaacaact
caattttcaaatagaattaatgaaaataatataataatatatggtggaaaagcaggatca
ttaaatgttgaacaaaagggagttattgatatgatgaaatttcaattatcaaatgaatta
aataaaagtattagtgaagttgatgtatattttaaagagattaatgataaatcagaaatg
gagaattattttcaaattaactcaacacaagtatttggtggaatttggtttgaaagtaat
caattatcatcagtagctaatactaccaacaccaacaccacaacaaactcatttaaatat
agtatacgattagattcaaatagtgttttagattcaaataaagttaaagataatggtatt
gatagtagtgattatttaacaaagaattgggcatatattcaaattgcaatggatcaagca
atatttggatactttggattggattataaattggtaattaatggacaacgttatcctgac
ccgtatgtagagttatggcaaaaatggataaatgggagggaatcggtatttaagagtgca
ggatcagtgtttgtatctgctgctttattaatattcacttttagattggtgacggaatta
gtagttgagaaggaaacaaagattagggaaggtatgagtataatggggttaaaccaatat
tgttatttcatatcatggattatcacatcactagtgactgcactaccaattgatttaatt
ataattgtaattttaaaaggtagtcaggtgattcattcaacttcatggattatcgttatt
gttacattgatattatacttgttaacattgcaattgcttgcatttatattctcaatgttt
tttgataaatctaaatttgcaggattgttaacattcttaacgatattgttaattaatata
tgtggtattttcattggtgaatatgagattataaatatacatattaaattattattatgt
tgtatattctcaccgattggcatagcatgttcattctatataatgtcaattagagatata
ccagacacgatttcaacaataaatttaaatcaagtaatatcagaaaaacaaataataggt
acatttgtatttaatattatattttatacatttttaatttggtatttagataaaatcgtt
aaaactgaatatggtacaaaagaaccatggtattttttatttacaaaaaggtattggaca
gttggtgctggtaaaattaataaaaagaataaaaataaagaatacaattataatgatata
gaatcaactattcaaaataataataatgataatattgaaatggtaccaattgaagttaga
aataaaacaacaatttcaattagaaatttaagaaaagaatttaaaactggtgatggttta
agaattgcagtaaatgatttaaatttagatatgtttgatggtcaaattcatggtttatta
ggtccaaacggtagtggaaaatcaacaacaatctcaatgttaactggactattatcacca
acatccggtacagcattcatacttggtaatgatataacttatcaaatgaatgaaattaga
aaatgtacgggtgtatgtttacaaactgatatcatttggaatcagttaactgtattggaa
catttagaaatatatgcatcattaaaaggcataacaaataaaaaacaaattaaatctgag
tctttgaaaatggcaaatgagattgatttgggtgaaaaactacacacaccagctggctca
ctatcaggtggccaaaaacgtaaactttgcctaggcattgctttcattggtagatcgact
ataatattcttggatgaggtttcctcaggcatggatccaagttcgcgtagaaaagtatgg
gactttttattatctcataaaaagggtaaaactataattcttacaactcattatttagat
gaagcagattatttatctgatagaatttccattatatcacatggtaaattaattactgat
ggtagttcattatttttaaagaataaatatggtgttggttatttattaacttgtagtaaa
tctttgaataccattgatcaattcaatgttgatcaagttactcaattcataagagatcaa
atacctgatgtaactgtactttcaaatgcaggttcagaaatttcatttagattaccaact
gcttcattacctgtattttcaaaattctttaaagattttgatgagaatttatcaaatttt
catattgattcctatggtattagtgtaaccactttggaagaggttttcttgaaaatcggt
acagatatcgatactgatgcgctttcaattgcagatggtaatggcaatgatgatgaatta
aaaagatcaattggagtttcatcaactggtataaaatcaaagcaacaattaaaagcatta
ttaattaaacgtgttaaaacatcttcaaaagattttaaagcatttttattatcattacta
ttaccattactagttataattggatcaattatagttttcaaagaagttgataatgaggtt
atattttataataattcaacagaacctttaacattttcattacttcaacagtatggtaaa
aatgatatcgtaccaattcaattggctggcacaacttcagaatttgatttcaataaattc
ttatcaaattcaccatactttaatcaatttcagtatttaaataactcaattaactttaat
caatatttaattaataattataaacaatcatcaggttcaattaatttcacaataccatta
tcatcatcattaattaataatacaactaaagtaatatcatataattcattatttaatttt
aattatattcattcttggccagttcatgtaaatttaataaatgatgctctattaagaaat
cataatggtataggtatagaatgtacttctttaccatttgatcatatattaacaagtttt
caaaaggcaagtcaaggtatgaatattcaatcaattgtttatttcattgtaattatgatg
gctggattttcattgatggcaggttcttttgctggtagtatctctcaagagcgtacaaat
agaattaaaaggttattatatatatcaggttgtaaaaagtatatttattgggtatcaaat
ttattatgggattatttctttgcatttattttattattaatcacttgtattatattagca
attgttgatgataaatttaatgatcaatttgggttattctttttatcattagttttattc
tcattatcaatcataccattatcttatttattctcattcaaattttcatcatttggtaaa
tcaactggtgcaatcactgcaattcatttttcaattggtgtaattatgacaattgcaatg
ataattttaagaattgaagtaattattaaaaattcatcatcactagagaatattgcagat
atcattgatatagtattcaatattttatcaccattatatgcattttcaagagtgattttc
ataatttcaggtttcccaggttctctaagattaggtgcattaaaaatcgatgattattgg
tcactacattatgcctcaaccccaataataattttatcagtacatgttgtagtttggact
atattcatattattaatagattattcaccagagtttaaaggttatttaagaaatccaaaa
accattctaccacctccacctcctatcgatgaagattctgatgtctctgctgaaagaatt
aggttggaatcaatgtcaccaataccatccacagaccaaggtagtggtggtggtggtgat
atgttacaatataaaggtttacataaattattcattggtaagggtaaaaatccaaataaa
aatgcagtatataattcaacattgggtataccacaaggtcaaacatttggtttacttggt
ttaaatggtgctggtaaaactacaaccgttagtatgctagctggtgatattctaccaaca
agtggtcaaataactatcaatggtcatgatttagtaaccgatagagctcaagctttacgt
ggtgtttctgtatgtccacaatttgatgcattaataacattattaactgctcgtgaacag
ttatctctatattgtgcaatcaaaggtgtaccagatgataaaatatcactagtagttgaa
gcattcattaaaatgatggatcttggtaaaattgcaaattcaaatactggtggttattca
ggtggtaataaaagaaaagtttcattatcaattgcaatgcttggtaatccatcagtagtt
ttaatcgatgaagcatcatcaggttgtgatccaatcattagataccgtcaatgtcaagta
attagtgaattgggtaaaaataaagtcatcattttaacttctcattcaatgtctgaaatt
caagcattatgttcaagaatgacaattatgagagatggtcaattcaaatgtttaggatca
actcaacatattaaatctaaatttggagcagggtattcagttgaagttaaatttaaaaag
agttgtttagaagttggtattccacaaagtcttcaatgtgttttagaatgtttcccaaat
gcaactattttagatcaacatgatttaatggcaagtttagaattaccaaatccacctgaa
aatccaattaaagtttcagagattttcaatatactttcaacagaattatcttcaatttta
gatgattattcagttagtcaaacttcattagaacaagtatttttaaaattaactggtgca
actcatgaagatcgtttaaatttaaataaccaacaacaacaacaacaaacaattccaaat
tccgattaa

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (90)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (85)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   DICTYBASE (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (3)   
   UniProt (1)   
   SWISS-PROT (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (7)   
   Pfam (7)   
All databases (105)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system