KEGG   Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0274803
Entry
DDB_G0274803      CDS       T00245                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K20306  trafficking protein particle complex subunit 9
Organism
ddi  Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ddi00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking [BR:ddi04131]
    DDB_G0274803
Membrane trafficking [BR:ddi04131]
 Endosome - Golgi transport
  Tethering complex
   TRAPP complex II
    DDB_G0274803
SSDB
Motif
Pfam: TRAPPC9-Trs120
Other DBs
NCBI-GeneID: 8619364
NCBI-ProteinID: XP_643937
dictyBase: DDB_G0274803
UniProt: Q555X3
Position
2:complement(3928531..3933047)
AA seq 1464 aa
MEMNLTFTENRSIKILILPIGDISPEKYKEYTSLIKTINIIELSSITRSQNELSPFEKIS
WVDGSMILNFVDIGSFQRSEYEDLQTYKKVFGVIGVVDCKKSKDLQETKRLFEIAVAQYP
SCVSSLCCAFDPMDDQPDLGLGANLIMIPNNSDRKHLIFYLTTLLIDFSHMILKYFEKMV
YLSLEHDGTVSTLLSNQYNNINNNSSGIINSNSIGGNNNNNNSLIGNSTIGGAMNSGVLG
SSVISNSNNNSLITTPLDSIKLWDEIGRAKKRKFGRLNKCRGDFCLLAGSPLDAIKYYDL
SIDACRSNNDWEWLAGSCEGYISAVLLKRNQEFNTQAQSSTVRPINSPNSITGSNSNSNS
GSYGNSNSGIVNTPSGGSNYNTNNTNSSSNNNNNNNNNSNNTNSTNNNLNNNNNNNNNGV
NGMNGTMNILDLQIQSDDLKIRELASEAIISYNKRKVPQFEVDVMLKFANYHISMDRRIE
ASELLTNAYDFGMDLSFTDRITLSCSIALLYYSMGFRRKFAFYLREAAFLYNTRPENWEK
INHLLIIASKYYQLEDLFSNSPSRFLDEGGSKKSHLSFTLNQMKKSNSVTSGRNNNNNGG
GGGGGGGSNGNNSKNSSPTNVGFQAQYNQFNQSIQQQVQSNSSNRSSSSSSTSSRFTNNI
PELSYRKPKFGWSVIQRYLIYNLISVSTNLMDSLNICKYIIHLLRTQYKKIAQQKQVEFQ
LDLLHHSKALSLSINTNVHMNLLGLPFIVKVSPIQLPNQLEPIVRPSQQSLFAQREKNSN
NFFIYSPYGGGFSNGSGIGGGGIGGGGSGGDSNSNRKKVVWAQGEECSVVVTLSNPFSFD
IFIQSLTLSTAGVPFESYPLSFKILSLTDSMDIVISGKPLESGPLIIKGVFVRAYNLLSE
HPVDPYGNSISISQYNELVRIGDAYKVDILEFDSTTTASNNTSSFSRDNNNNNELPIVNK
IKATPKLPILKADVPTLGKVLNLLAGESFSFNLEFQNIGTTQIDSISVSLNEFDKALKKK
TLADNNQYFTDSDDETISFQWDSNIIKSSLPLLPGETFKLPIKSFSKPFLIGNQFIIDYY
SNCENEEEEEEFNNTTTTTNTNTQTLTVTGNTQSTLTATTTTTATKYQRKITIPLPLSIT
HGPQVINFDIVYASSKIIKSLSPYLVDRSTSNNGLFKVEKDQDLIEKDCENIYNDYCLLL
FDIKNCTSTHTFTISSELELGIPNIVDNNKEINNNLSSKFILSPNGIITIIVPMKRESLP
DQLPPLRQAKGQYIKPKKKLTEYEEYVKCLIQYYKDLLTSKIKLLWNSSDNTNGSILLDN
IVLTSKLIHKLNKDQVLIQFKNNKQLVKTIEQGGFETIEVLVTNLTNTPINGLVLHILPI
IDQTNNNNNGNNKNNGNIVDVSNKLGYIGSLTTPIQELPVGATFNHSLDVIFFERESYKF
IISCEIFKTKQIIPASHSLLVNVV
NT seq 4395 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaaatgaatttaacattcacagagaatagatcaattaaaattctaattcttccaatt
ggtgatatctcaccagaaaaatataaagaatatacaagtttaattaaaacaatcaatata
attgaattaagtagtattacaagaagtcaaaatgaattatcaccatttgaaaaaatatca
tgggttgatggtagtatgatattaaattttgttgatattggttcatttcaaagatcagag
tatgaggatcttcaaacatataagaaagtatttggagttattggtgttgtagattgtaag
aaatcaaaagatttacaagagacgaaaagattattcgagattgcagttgcacaatatcca
tcatgtgtaagctcattatgttgtgcattcgatccaatggatgatcaaccagatttaggt
ttaggtgcaaatttaattatgataccaaataatagtgatagaaagcatttaatattctat
ctaactacattactcatcgatttctctcatatgattttaaaatattttgaaaaaatggtt
tatttatcattagaacatgatggcacagtttcaacattattatcaaatcagtataataat
attaataataatagtagcggaattattaatagtaatagtattggtggtaataataataat
aataatagtttaattggaaattcaacaattggtggtgctatgaattcaggtgtattgggt
agtagtgttatatcaaatagtaataataattcattgataactacaccattggattcaatt
aaactttgggatgaaattggtagagcaaaaaagagaaagtttggtcgtttaaataaatgt
agaggtgatttttgtttattggcaggttcaccattggatgctattaaatattatgatctt
tcaatagatgcttgtagaagtaataatgattgggaatggttagctggttcttgtgaaggt
tatatctctgcagttctcttaaagagaaaccaagaatttaatactcaagctcaatcttca
accgttagaccaattaatagtccaaattcaataactggtagtaatagtaatagtaatagt
ggtagttatggtaatagtaatagtggtatagtaaatacaccaagtggtggtagtaattat
aatacaaataatacaaatagcagtagtaataataataataataataataataattcaaat
aatacaaatagtacaaataataatttaaataataataataataataataataatggagtt
aatggtatgaatggtacaatgaatattttagatttacaaattcaatcagatgatttaaag
attagagaattagcatctgaagcaataattagttataataagagaaaagtaccacaattt
gaagttgatgttatgttaaagtttgcaaattatcatatttcaatggatagaagaattgaa
gcatccgagctattgaccaatgcttatgattttggtatggatttatcatttactgataga
attacattatcatgttcaattgcattattatattatagtatgggatttagaagaaagttt
gcattttatttacgtgaagctgcattcctttataatacaagaccagagaattgggaaaag
attaatcatttacttataatagcatcgaaatattatcaattggaggatcttttctcaaat
tcaccatcaagattcttggatgaaggtggttctaaaaaatctcatttatcattcacattg
aatcaaatgaaaaagtcaaattctgttacctctggtagaaataataataataatggtggt
ggtggtggtggcggtggcggtagtaatggtaataatagtaaaaattcatcacctactaat
gttggatttcaagcacaatataatcaattcaatcaatctattcaacaacaggttcaatct
aatagttcgaatagatcatcatcgtcttcatcgacatcatcaagatttacaaataatata
ccagaattatcctacaggaaaccaaaatttggttggtcagttattcaaagatatttaatt
tataatttaatatcagttagtaccaatttaatggattcattgaatatttgtaaatatata
atccatttattaagaactcaatataaaaaaatagctcaacagaaacaagtggaatttcaa
ttggatttactacatcatagtaaagcattatcattaagtatcaataccaatgttcatatg
aatttacttggtttaccattcattgtaaaggtttcaccaattcaattaccaaatcaattg
gaaccaattgttagaccttcacaacaatcattatttgctcaaagagaaaagaattcaaat
aactttttcatttattcaccctatggtggtggttttagtaatggtagtggtattggcggt
ggtggtattggtggtggtggtagtggtggtgattcaaattcaaatagaaaaaaagtagtt
tgggctcaaggtgaagagtgtagtgttgtagtaaccttatcaaatccattcagttttgat
attttcattcaatcattaacattaagtactgcaggtgtaccatttgaatcatatccatta
tcatttaaaatcctatcattaactgattcaatggatattgttatctctggtaaaccatta
gaatctggtccattgattattaaaggtgtatttgtacgtgcttataatttattatcagaa
catccagttgatccatatggtaattcaatttcaattagtcaatataatgaattggttaga
attggtgatgcctataaagttgatattttagaatttgattcaacaacaaccgctagtaat
aatacatcatcattttcaagagataataataataataatgaactaccaattgttaataaa
atcaaagctacacccaaattaccaatactaaaggcagatgtaccaactctaggtaaggtg
ttgaatttgttagctggtgaatcatttagtttcaatttagaattccaaaatattggtaca
actcaaatcgattcaatttcagtctcattgaatgaatttgataaagcattgaaaaagaag
acattggctgataataatcaatatttcacagattctgatgatgaaactatttcattccaa
tgggattcaaatatcatcaaatcttcattaccattattacctggcgaaacttttaaatta
ccaattaaatcattttcaaaaccattcttaattggtaatcaattcataattgattattat
tcaaattgtgaaaatgaagaagaagaagaagaatttaataataccactaccactacaaat
accaatactcaaacattaacagtaacaggtaatacacaatcaacattaacagcaaccacc
acgacaacagcaacaaagtatcaacgtaaaattacaattccattaccattatcaattaca
catggaccacaagttataaattttgatatagtttatgcaagttcaaaaattattaaatca
ttatcaccttatttagtcgatagatcaacatcaaataatggtttatttaaagttgaaaaa
gatcaagatttaattgaaaaagattgtgaaaatatttataatgattattgtttattatta
tttgatattaaaaattgtacttcaactcatacttttacaatctcttcagaattagaatta
ggtataccaaatattgttgataataataaggaaattaataataatttatcatctaaattt
attttatcaccaaatggtataattacaattattgtaccaatgaaaagagaatcattacct
gatcaattaccaccattaagacaagctaaaggacaatatattaaaccaaagaagaagtta
actgaatatgaagagtatgtcaaatgtttaattcaatactataaggatttattaacaagt
aaaattaaattgttatggaattcatccgataatacaaatggttcaatcctattggataat
atcgtattaacctcaaaattaattcataaattgaataaggatcaagttttaattcaattc
aaaaataataaacaattggttaaaacaattgaacaaggtggttttgaaacaattgaagtt
ttagttacaaatttaacaaatactccaattaatggtttagttttacatattttaccaata
attgatcaaactaataataacaataatggtaataacaagaataatggtaacattgttgat
gtatcaaataaattaggatatattggttcattaacaacaccaattcaagaattaccagtc
ggtgctacttttaatcattctttggatgtcatattctttgaaagagaatcttataaattt
ataatatcttgtgaaatctttaaaactaaacaaattattccagcttcacattcactttta
gttaatgttgtttaa

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (46)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (41)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   DICTYBASE (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (1)   
   Pfam (1)   
All databases (53)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system