KEGG   Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0277945
Entry
DDB_G0277945      CDS       T00245                                 
Symbol
nol9
Name
(RefSeq) NUC156 family protein
  KO
K06947  polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase GRC3/NOL9 [EC:2.7.1.-]
Organism
ddi  Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ddi00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis [BR:ddi03009]
    DDB_G0277945 (nol9)
Ribosome biogenesis [BR:ddi03009]
 Eukaryotic type
  Pre-60S particles
   Kinases
    DDB_G0277945 (nol9)
SSDB
Motif
Pfam: CLP1_P AAA_14
Other DBs
NCBI-GeneID: 8621236
NCBI-ProteinID: XP_642025
dictyBase: DDB_G0277945
UniProt: Q54Z27
Position
3:44863..47023
AA seq 683 aa
MEINKNDNNNNINNNNINNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNQNNNQKNNYR
NYKPIKTGTLIQHQILQQTLSNFQTKNKVFQLGSDKLILIFKENETIYFHGTIQARSIIG
SVEVYGYTITPQSTTYYPIYSPFCSPTLSITSNNSNNKLYTLKEIIENQLIKIPELVKNK
LKENEKQIEIDEPTLAISSIIVLKILDDHCENPKMFTKKKIEIIDSFKLLKGFYPLYQPD
FNTQLLTIPNEWLNLINTQFLYNDHCNNNGLSILTCGERNVGKSTFNRILINKLLKKYTH
IIFIETDTGQTEFTPSGIMSIDIINSPLLGPPFTHCKNNPLKSYFFGDTSPKNNPEYFLN
LSFQLIDCCNLIKQQYPNIPIILNTNGWLKSLGLHLTQEIIKYFKPTSIVQLINNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNLNDNLNNFINRFDSTVTFSQDCINQLFEDCDDDNDDNKNLK
TTIITKLYSINSINNFSQSIYKPIFNLGSSEIRNLMFKSYFKLESKGSLSHQSPYQVSWK
ELKVKILTNNVPPSQTMYALNASLVGICIDEDPEKNYKYISYKVGNNLPTIINQSPLISQ
CIGLGLIRSIDMVNGYYYIITPIDPSLLEISNTILKGSIEIPQTLTISVSSKGKILVPYL
QLDVLSSYGTGSDVMNRPSFFDD
NT seq 2052 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaaattaataaaaatgataataataataatataaacaataataatataaataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataataataatcaaaataataatcaaaaaaataattatagg
aattataaaccaattaaaacaggtacattaatacaacatcaaatattacaacaaacatta
agtaattttcaaacaaagaataaagtatttcaattgggaagcgataaattaatattaatt
ttcaaagaaaatgaaaccatttatttccatggtactattcaagcacgttcaataattgga
tcggtagaagtttatggatatacaattacaccacaatctactacatactatccaatttat
tcaccattttgttcaccaactttatcaattacaagtaataatagtaataataaattatac
acattaaaagaaataatagaaaatcaattaattaaaataccagaattagttaaaaataaa
ttaaaagagaatgaaaaacaaattgaaattgatgaaccaacattagcaatttcatcaatt
atagtattaaagattttagatgatcattgtgaaaatcctaaaatgtttacaaagaaaaag
attgaaatcattgattcatttaaacttttaaaaggtttttatccattatatcaaccagat
tttaatactcaattattaacaataccaaatgaatggttaaatttaataaatactcaattc
ttatataatgatcattgtaataataatggtttatcaattttaacttgtggtgaaagaaat
gttggtaaaagtacatttaatagaattttaattaacaaacttttaaaaaagtatacacat
ataatttttattgaaactgatacaggtcaaactgaatttacaccaagtggtataatgtca
attgatattataaattcgccattattaggaccaccatttactcattgtaaaaataatcca
ttaaaatcttatttctttggtgatacatcaccaaagaataatccagaatattttttaaat
ttatcatttcaattaattgattgttgtaatttaataaaacaacaatatccaaatatacca
ataattttaaatacaaacggttggttaaaaagtttaggtcttcatttaactcaagaaatt
ataaaatattttaaaccaacatcaatagtccaattaattaataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataacaataataataataataattta
aatgataatttaaataattttattaatagatttgatagtactgttacattttctcaagat
tgtattaatcaattatttgaagattgtgatgatgataatgatgataataaaaatttaaaa
acaacaataattacaaaattatattcaattaatagtattaataattttagtcaatcaata
tataaaccaatttttaatttgggatcatcagaaattagaaatttaatgtttaaaagttat
tttaaattagagagtaaaggatcattatcacatcaatcaccctatcaagtatcatggaaa
gaattaaaagttaaaattttaaccaataatgtaccaccaagtcaaactatgtatgcattg
aatgcaagtttagttggaatttgtatcgatgaagatcctgaaaagaattataaatatata
tcatataaagttggtaataatttaccaacgatcattaatcaatcacctttaatttcacaa
tgtattggtttgggtttaattcgttcaatcgatatggtaaatggttattactatataatc
actccaatcgatccttcattacttgaaatctcaaatacaattttaaaaggttcaattgaa
atccctcaaactcttactatctctgtatcttcaaaaggtaaaatattggtaccatacctt
caattagatgtcctctcttcttatggaactggttcagatgtaatgaatagaccttctttc
tttgatgattaa

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (34)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (29)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   DICTYBASE (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (3)   
   UniProt (1)   
   SWISS-PROT (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (2)   
   Pfam (2)   
All databases (43)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system