KEGG   Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0281511
Entry
DDB_G0281511      CDS       T00245                                 
Symbol
cog3
Name
(RefSeq) Sec34-like family protein
  KO
K20290  conserved oligomeric Golgi complex subunit 3
Organism
ddi  Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ddi00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking [BR:ddi04131]
    DDB_G0281511 (cog3)
Membrane trafficking [BR:ddi04131]
 Endosome - Golgi transport
  Tethering complex
   Conserved oligomeric Golgi (COG) complex
    DDB_G0281511 (cog3)
SSDB
Motif
Pfam: COG3_C COG3_N Rab3-GTPase_cat
Other DBs
NCBI-GeneID: 8623116
NCBI-ProteinID: XP_640727
dictyBase: DDB_G0281511
UniProt: Q54TT4
Position
3:complement(4648103..4651602)
AA seq 925 aa
MNNQTNQQSQTQSQSQQRINFDITGWEKKSKLSTQQYLLINNLNKSTQEKPLPQKYLEDK
INNDIKKEENQQLQQQQQQQQQQQQQQQSPIIENFMDNFNPKTDIDNLSDFYQWYSIIDK
NNPHLHQYEWFLETIVNYSKGSNQLLSMVENCDKLVESIQTDYSNLTKKTNQLNEDCEKF
FNEELKLRYIAQSIHDKLKFYNQLEIQTKKFNTTNFNVTDSTFLTSLENLENSINFMKSN
STFMESNKYLTQYGFIFSRALGLIKDYISSNLKILSRDIINAQKQLKTSVSTPTSPQLQS
SSGGSPLINDFSNSTDFNDLFQHSNIRFRAFAPKLRPLCLELEKRAIGPYLSYLYDTQNI
YFNNRRSILSLIMFEKLQSLSKMTDISSMIRSSSLFMIQFYENEYQIYSNFFSPPDLNNN
NNNNNNNNNNDNINNSTNINNSNNTNNNNQDIINNCPAFSNILDEYSQQLYDTIRPIYIH
IHSFETLCNLAHLIRNELIDDLVQKSMKYSNGFKMTIERMLQDIQERLIFIIQTYIRDEI
RSYHPNSDDLDYPNKLKIYVTAESTAVDGDGNGSGNSSPTLSYKSIYSTWYPTLEKSLTC
LSKLYLVLETRIFEGLAQEVVEACTFTLIQASRLLLIQQKNDPYIILDSQLFLIKNLLTL
REQIAPFDINFVIIEKIVDFPNLKHSLSTLYNVGSFLTLSTNNPILSLLSPRVTNTSIDS
KKDLEKELKQSIESFILSNANTIIDPLLSLLTKISVFLNQSNKNQTDPMLLSQQSFADPQ
RIKEIIEQVKEKASNYLPQVIDRMKLYLSISTQILLMKPIRTNIIDSFDQINQYTKKYYT
EDQIKIIDLQSLKLILDKILTPSKQSNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNKNENNENENENNSNVNSPSPQQL
NT seq 2778 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaataatcagacaaatcaacaatctcaaacgcaatcccaatctcaacaaagaattaat
tttgatataacgggttgggaaaaaaaaagtaaactatcaacacaacaataccttttaatc
aataatttaaataaatccacacaagaaaaaccattgccacaaaaatatttagaagataaa
ataaataatgatattaaaaaagaagaaaatcaacaactacaacagcaacaacaacagcaa
cagcaacaacagcagcaacaacaatcaccaataatagaaaattttatggataactttaat
ccaaaaacagatatagataatttatcagatttttatcaatggtattctataattgataaa
aacaatccacatttacatcaatatgaatggtttttagagacaattgtaaattattcaaaa
ggatccaatcaattattatcaatggttgaaaattgtgataaactagtggaaagtattcaa
actgattattcaaatttaacaaagaaaactaatcaattaaatgaagattgtgaaaagttt
ttcaatgaagaattaaaattaagatatatagctcaatcaattcatgataaacttaaattt
tataatcaattagaaattcaaacaaagaaatttaatacaacaaactttaatgtcactgat
tcaacctttcttacttctttagaaaatttagaaaatagtataaattttatgaaatcaaat
tcaacatttatggaatcaaataaatatttaacacaatatggatttatattttcaagagca
cttggattaattaaagattatatttcatcaaatttaaaaatcctaagtagagatattata
aatgctcaaaaacaattaaaaacatcagtatcaacaccaacatcaccacaattacaatca
tcaagtggtggttcacctttaataaatgacttttcaaattcaactgattttaatgattta
tttcaacattcaaatattagatttagagcatttgctccaaaattaagaccattatgttta
gaattagaaaaaagagcaattggaccatatttatcatatttatatgatacacaaaatatt
tattttaacaatcgtagatcaatattatcattaataatgtttgaaaaacttcaatcatta
tcaaagatgactgatatatcatctatgataagatcatcaagtttatttatgattcaattc
tatgaaaatgaatatcaaatttattcaaactttttttcaccaccagatttaaataataat
aataataacaataataacaataataataatgataatataaataatagtacaaatataaat
aatagtaataatacaaacaataataatcaagatattataaataattgtccagcattttca
aatatattagatgaatattctcaacaactttatgatacaattagaccaatttatattcat
attcatagttttgaaacactttgtaatttagcacatttaattagaaatgaattaattgat
gatttagttcaaaaatcaatgaaatattcaaatggtttcaaaatgacaattgagagaatg
ttacaagatattcaagagagattaattttcattattcaaacttatattagagatgaaatt
agatcctatcatccaaattctgatgatttagattatccaaataaactaaaaatttatgta
actgctgaatctactgctgttgatggtgatggtaatggtagtggtaattcatcaccaaca
ctatcatataaaagtatttattcaacttggtatccaacattagaaaaatctttaacttgt
ctttcaaaattatatttagttttagaaacaagaatttttgaaggattagcacaagaagtt
gttgaagcatgtacattcactttaattcaagcaagtagattattattaattcaacaaaag
aatgatccatatataattttagattctcaattatttttaattaaaaatttattaacatta
agagaacaaattgcaccatttgatataaactttgttatcattgaaaaaattgttgatttc
ccaaatttaaaacattcactttcaacactttataatgttggttcatttttaacattgtca
actaataacccaatcttatcattattatcaccaagagttacaaatacaagtattgattca
aaaaaagatttagagaaagaattaaaacagtctatagagtcttttattttatcaaatgca
aatacaattattgacccacttttatctttattaacaaaaatatcagtatttttaaatcaa
tcaaataagaatcaaactgatccaatgttattatcgcaacaatcatttgcagatccacaa
agaattaaagagattattgaacaggttaaagaaaaagcatcaaattatctaccccaagta
atcgatagaatgaaattatacctatcaatatctactcaaatacttttaatgaaaccaatt
agaactaatattattgatagtttcgatcaaattaaccaatatacaaagaaatactatact
gaagatcaaattaaaattattgatttacaatctttaaaattaatacttgataaaatatta
acaccatctaaacaatctaataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataaaaatgaaaataatgaaaatgaaaatgaaaataatagtaatgtaaattcaccg
tccccccaacaattataa

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (53)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (48)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   DICTYBASE (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (3)   
   UniProt (1)   
   SWISS-PROT (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (3)   
   Pfam (3)   
All databases (63)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system