KEGG   Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0287157
Entry
DDB_G0287157      CDS       T00245                                 
Name
(RefSeq) DUF1683 family protein
  KO
K20308  trafficking protein particle complex subunit 11
Organism
ddi  Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ddi00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking [BR:ddi04131]
    DDB_G0287157
Membrane trafficking [BR:ddi04131]
 Endosome - Golgi transport
  Tethering complex
   TRAPP complex II
    DDB_G0287157
SSDB
Motif
Pfam: Foie-gras_1 TRAPPC10 Gryzun-like TPR_1
Other DBs
NCBI-GeneID: 8625990
NCBI-ProteinID: XP_637368
dictyBase: DDB_G0287157
UniProt: Q54KR2
Position
4:complement(5407710..5412538)
AA seq 1524 aa
MNELPDDLVLSPQPLIGLIGCQSLHSQIIDCLSTKNVTDFERIHPTTPSNNNTPILTSTI
GGDNRRNSGQYSSSPSIDPFSILHNNNNNNTSNYSNSPSSLSNQLGELSLQQKSLSQFDE
LWKSPTQKVGTPILTSAATGGEAGGWRFQNSNIPLFKTVPLETDSLSFKKEKKVEVNPHP
MGILKANWIHKHTFSIPSVVSLFLQWPDDKNNSKAHDQMLQQVDLVRTNMKSRNIKLIVI
IVTSIVLDHEEKVNTIRKKADIDPKYFLFLNKQDIKPFVKKWERLALELSEQYYKEMCQY
TKSQIAKSNHPFLSIRYNFKIAFYSEFFRGDNSTSLKYYRDCYNLLNYKSNNDSRGIRFA
EIRSLASFFNFKICKISMLNSDIATTTTTPTNTTPNTPNSITTNPSISITPSIPILATTT
LTTSTPGGTILSPTGTPGMMQQPSSQQQQQAQFSTSPLQSQYQPSYLQQQSLQPSQPQQQ
IQQSGTGFFYQQQQQSQQSQQSQQQILLQQQQNQFEKQIKLIQDSLNQFEKHIKTFKIYM
GPAEKEFTHCIWLAREYQIFAELLELCPSIIRSNFNTNPGFYYQISAKHQGNRRDSFKAL
SNHYKENVNVLEYRDIKPKFDLSNLTYIGQPPPVGSHPLDDNNNNNNNTNNTNNISNNNN
TQLQTYEEQLTIADENDLSKSIAIELSLNYTNLIIKTLVKAYDQSTVSGNHRILSFIESL
IAYEYFISKQYDLALKYYNKNAFTYRREKWTTLLTHSLSMLLKSVHYLNLPTNYIGYALD
YLSPELNNTVADRANIQNTIIHILTDGAQKLSPPLSLEKSLDINMDHVHPLLDCRVQFPS
SFTFTNSTTEFYVVIGSHFPNPIRFSALKVIFSEKSYNKSIHDKQPIQSPINQSTIKRDD
HSRQDLIFLPDESRLFTFKLEVAKEKMELECLSVILELGNIGSPTKTINFVWNVQEWAIK
SDETEIEKKIKDPSSLLISTTTTPPIQNKLKDKNIKTTQQQQQQQPPKTLEKLNPYKKFL
ERSSIRILDHESLIQIKCNHSSPAIVNEFYEIELEIINNDAEIKGGTIRFEIQQSQQTTT
LLQQNPQQPLPQTQHSHHHHQQQQQQQQQQLQQQQLQQQQQQQQLQQQQQSVNIININNQ
SCEKGIYLEPNRSTPLSEMKLTTIKETKSFKKMFYVYSSVVDENKLLISISYETKTGEIS
HTSKLFTIPVVVGFNTQFQFFNEHLQLITDLYDQGVQTRENLLLLSEIKSQLPFNIIIEN
TKLSISTAAESARNATLLSPNVANNNPNTPNNNPNNNNPNNNPNNPNNNSGGVNNNIINN
LNMILDDSINNLPVAQLLSDSNKLLKDVELSKNTTYSGWFNLIPLVISESISFGSFIIEW
RRKGQSSKIISTLPIQLPYIRTTPNPFLAKVHVPSFGIVGQPLTQSIIIKNNTNFLQEFD
LQVINPPSYGNSDIPFFFSGDKQSTFSIHPDSTHEIKHILLPLVAGKLNLPHFKIISKRF
NKELSKTKNTNNFIFVKPNLNWNQ
NT seq 4575 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatgaattaccagatgatcttgtactttcaccacaaccattaattggtttaattgga
tgtcaatcattacattcacaaattattgattgtttatcaacaaagaatgtaacagatttt
gaaaggattcatccaacaacaccatcaaataataatacaccaattttaacatcaactatt
ggtggtgataatagaaggaatagtggtcaatattcatcatcaccatcaattgatccattt
tcaattttacataacaataacaataataatacttcaaattatagtaatagtccatcatca
ctatcaaatcaattgggtgaattatcattacaacaaaaatcattatcacaatttgatgaa
ttatggaaatcaccaactcaaaaagttggtacaccaattttaacatcagcagcaacaggt
ggtgaagcaggtggatggagatttcaaaattcaaatataccattatttaaaacagtacca
ttagaaactgattcattatcatttaaaaaagaaaaaaaagttgaagttaatccacatcca
atgggtattttaaaagcaaattggattcataaacatacattttcaataccatctgtagtt
tcattattccttcaatggcctgatgataaaaataattctaaagctcatgatcaaatgtta
caacaagttgatttagttagaacaaatatgaaaagtagaaatattaaattaatagttatt
attgtaacatcaatagtattagatcatgaagaaaaagttaacactattagaaagaaagca
gatattgatccaaaatactttttattcttaaataaacaagatataaaaccatttgtaaag
aaatgggaaagattagctttagaattatctgaacaatattataaagaaatgtgtcaatat
acaaaatcacaaattgcaaaatcaaatcatcctttcctttcaattcgttataattttaaa
atagctttttattctgaatttttcagaggtgataattctacaagtttaaagtattataga
gattgttataatttattaaattataaatcaaataatgatagtagaggcattaggtttgca
gagattagaagtttagcatcattttttaattttaaaatttgtaaaatatcaatgttaaat
agcgatatagcaaccactaccaccacaccaacaaatactacaccaaatacaccaaattca
ataacgacaaatccatcaatatctataacaccttcaataccaattttggcgacaacaaca
ttaacaacatctacacctggtggtacaattctatcaccaactggtacacctggaatgatg
caacaaccatcatcacaacaacaacaacaagcacaatttagtacatcaccattacaatca
caatatcaaccttcatatttacaacaacaatcattacaaccatcacagccacaacaacaa
attcaacaaagtggaacaggttttttttatcaacaacaacaacaatcacaacaatcacaa
caatcacaacaacaaatattattacaacaacaacaaaatcaatttgaaaaacaaattaaa
ttaattcaagattcattgaatcaatttgaaaaacatattaaaacatttaaaatttatatg
ggtccagctgaaaaggaattcactcattgtatttggttagcaagagagtatcaaatattt
gcagagttattagaattatgtccatcaattattagatcaaattttaatacaaatcctggt
ttttattatcaaatttctgcaaaacatcaaggtaatcgtagagatagtttcaaagcatta
tcaaatcattataaagagaatgttaatgttttagaatatcgtgatattaaaccaaagttt
gatctttcaaatttaacatatattggtcaaccaccaccagttggttcacatccacttgat
gataataataataataataataataccaataataccaataatattagtaataataataat
acacaattacaaacatatgaagaacaattaacaattgcagatgaaaatgatttatcaaaa
tcaattgcaattgaattatcattaaattatacaaatttaataattaaaacattggttaaa
gcatatgatcaatcaactgttagtggtaatcatcgtattttatcattcattgaatcatta
attgcttatgaatatttcatatcgaaacaatatgatttagcattgaaatattataataag
aatgcatttacatatcgtcgtgagaaatggacaactttattaactcatagtttatcaatg
cttttgaaatctgtacactatttaaatttaccaacaaattatattggttacgctttggat
tatctatcaccagaattaaataatacagtagcggatagagcaaatattcaaaataccatc
attcatattctaactgatggtgctcaaaaattgtcaccaccattatcattggagaaatca
ttggatatcaatatggatcatgttcatccattattagattgtagagttcagttcccttct
tctttcacttttacaaattcaaccacagaattttatgttgtaattgggtcacattttcca
aacccaattagattctctgctttaaaagttattttctctgagaaatcttataataaatca
attcatgataaacaaccaattcaatcaccaatcaatcaatcaacaattaaaagagatgat
catagcagacaagatttaattttccttcctgatgaatctagattattcacttttaaactt
gaagtagcaaaagagaaaatggaattagaatgtttatcagtaattttagaattgggtaat
attggttcaccaacaaaaactataaactttgtttggaatgttcaagaatgggcaattaaa
tctgatgaaactgaaattgaaaagaaaattaaagatccatcatcattattaatttcaaca
acaacaacaccaccaattcaaaacaaattaaaagataaaaatattaaaacaacacaacaa
caacaacaacaacaaccaccaaaaactttagagaaattaaatccatataaaaagttttta
gaaagatcatcaattagaatacttgatcatgaatcattaattcaaattaaatgtaatcat
agttcacctgcaattgtaaatgaattttatgaaattgaattagaaattataaataatgat
gctgaaattaaaggtggtacaattagatttgaaattcaacaatcacaacaaactacaact
ctactacaacagaatccacaacaaccattaccacaaactcaacactcacatcatcatcat
caacaacaacaacaacaacaacaacaacaattacaacaacaacaattacaacaacaacaa
caacaacaacaattacaacaacaacaacaatcagttaatattattaatattaataatcaa
tcatgtgaaaaaggaatttatttagaaccaaatagatcaacaccattaagtgaaatgaaa
ttaacaacgattaaagaaacaaagagttttaagaaaatgttttatgtttattcttcagtt
gttgatgaaaataaattattaattagtattagttatgaaactaaaactggtgaaatatca
catacatcaaagttatttacaattcctgtagttgttggtttcaatacacaattccaattc
tttaatgaacatttacaattgattactgatctctatgatcaaggtgtacaaactagagag
aatcttttattattaagtgaaattaaatcacaattaccttttaatattataattgaaaat
acaaaattatcaatttcaactgctgctgaatctgcaagaaatgcaactttattatcacca
aatgttgctaataataatcctaatactccaaataataatccaaataataataatccaaat
aataatccaaataatccaaataataatagtggtggtgtaaataataatattataaataat
cttaatatgattttagatgatagcattaataatttaccagttgcacaattattatcagat
tcaaataaattattaaaagatgttgaattatcaaaaaatacaacttatagtggttggttt
aatttgataccattggtaattagtgaatctattagttttggttcttttattattgaatgg
agaagaaaaggtcaatcaagtaaaatcatttcaacattaccaattcaattaccatatatt
agaacaacaccaaatccattccttgcaaaagttcatgtaccttcttttggtatagtcggt
caaccattaacccaatcgattatcattaaaaataatacaaactttttacaagaatttgat
ctacaagttattaatccaccaagttatggtaattctgatattcctttcttcttttctggt
gataaacaatcaactttctcaattcatcccgattctactcatgaaattaaacatattcta
ttacctttagttgctggtaaattaaatttacctcattttaaaattatctctaaacgtttt
aacaaagaattatcaaaaactaaaaatacaaataattttatttttgtaaaaccaaattta
aattggaatcaatag

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (51)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (46)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   DICTYBASE (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (4)   
   Pfam (4)   
All databases (61)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system