KEGG   Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0289867
Entry
DDB_G0289867      CDS       T00245                                 
Symbol
pex1
Name
(RefSeq) peroxin 1
  KO
K13338  peroxin-1
Organism
ddi  Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi04146  Peroxisome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ddi00001]
 09140 Cellular Processes
  09141 Transport and catabolism
   04146 Peroxisome
    DDB_G0289867 (pex1)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking [BR:ddi04131]
    DDB_G0289867 (pex1)
Membrane trafficking [BR:ddi04131]
 Autophagy
  Pexophagy
   Other pexophagy associated proteins
    DDB_G0289867 (pex1)
SSDB
Motif
Pfam: AAA PEX-1N AAA_lid_3 AAA_16 AAA_14 NACHT Sigma54_activat Mg_chelatase RNA_helicase AAA_25 CDC48_2 AAA_5 RuvB_N IstB_IS21 TIP49 PEX-2N TsaE ABC_tran AAA_28
Other DBs
NCBI-GeneID: 8627359
NCBI-ProteinID: XP_636032
dictyBase: DDB_G0289867
UniProt: Q54GX5
Position
5:3340420..3344303
AA seq 1227 aa
MELHVQLKHSTDCFVSLPPKIVHSLLLLSEKQSKSLGTLGLEITWYDKINKKENKGYVGW
AGGSTDPRFTDSIEMSQEMAQCLGGIKNEQKLKLKALNNIELAHSVQVEPLTSDDWEIME
VHQQYLEEQLLNQVNILYSGQIVPIWIHHKTIIKLKVTETLPTPVVKLSSNSEIIVAPKP
RNLPTTTTSSQQQQISKETLKPRFLQIKDFKIDYNNNNTFINEIYINKELLNQFQWNIGD
IIEISKVSKNNNKNNKKEKNNNGGDEEEDDDDNEEFDDDDDDDNNNNEDDTSKLQKQLDN
KNNNNKKNKKNNKTIYARVFINDKSNNQQVLIHRNIRTIGNFYINTIVRLKYTTSHSLPI
CPIGSILVKQVIWKQNSLSNLIKQQSSQKIYSVEQIKEQIKVWSNNNLSNNQRYPLLNGS
IVSINSNLDLSFNFNNLTSSIIPPTSSSSSSPSNNLDSQRSNNNNNNINNDQLNDITNNM
NNPYLSSIQQIGDIMSNLNTNNNQNNQNNNSNKLMNQFQMNNGIFMLSLEILSNDKLLKI
ESGGNNSIEKKKSLEDYNEIGDRLFQRIGGMEKQIKQAKEFLSLYMYKDLSVIREQLNTP
GVNGMIIAGSHGSGKSLLATSLGGYYSTDSRSNAFIIKLDCNQLKELKVENIRKQFNKLF
YKSCKESGNTLSATTSTNTTPPPIIIILESLDLILGTPNDQDPGSKIRCEQLVSHIKSLC
FKYQNRSSPIVMIATVISSQSLCQSIQIPELFGLTIELQAPTREERVEILERYLKYQGKQ
LKDQQSLNLMKFSASMEGYLGCDVEQIVDRSIHLSSIKEIENNNNNNDDNDDDNIIEFSI
IEKAKEGYTPITLKGIKLHSSEIKWQDIGGLDSVRAMLKETIEWPTKYPKLFQSSPLRLR
SGILLYGPTGCGKTLLASAIAGECGLNFISVKGPELLNKYIGSSEQGVRDVFSRASSAKP
CVLFFDEFDSIAPRRGHDNSGVTDRVVNQFLTQLDGVEGLTGVYVLAATSRPDLIDPALL
RPGRLDKSLYCNIPEFNERLDILTCLKSKMNLSPSISLEQLSTNTQYYTGADLRALMYNA
QLKSIHEWMNHLEEEKKRKRKEKEDQSNKNSSQQQDDFIIFQPKNNDNSISKSNLTFEEK
TNLQKQIDTIKSQFINSNTSTLNKSNLSNEQPPLITQSHIDLALKESSPSISESERKKYE
RIYNNFLKERGSVTGNKKEGVPKQTLA
NT seq 3684 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggagttacatgttcaattaaaacatagtactgactgtttcgtttcacttccacctaaa
atagtacattcactgttattattatcagaaaaacaatcaaaatcattaggtacattagga
ttagaaataacatggtatgataaaattaataaaaaagagaataaaggatatgttggatgg
gcaggtggatcaacagatccaagattcacagattcaatagagatgagtcaagagatggca
caatgtttaggtggtataaagaatgagcaaaaattaaaactaaaagcattaaataatatt
gaattagctcattcagttcaagttgaaccattaacatcagatgattgggaaattatggaa
gttcatcaacaatacctagaagaacaattacttaatcaagttaatattttatatagtggt
caaatcgtaccaatttggattcatcataaaactataattaaattaaaagttactgaaact
ttaccaacaccagtagttaaattatcttcaaattctgaaattatagttgcaccaaaacct
agaaatttaccaacaacaacaacatcatcacaacaacaacaaatttcaaaagaaacttta
aaaccaagatttttacaaattaaagattttaaaatagattataataataataatacattt
ataaatgaaatttatataaataaagagttattaaaccaatttcaatggaatattggtgat
attatagaaatttcaaaagtttcaaaaaataataataaaaataataaaaaagaaaagaat
aataatggtggtgatgaagaagaagatgatgatgataatgaagagtttgacgatgatgat
gatgatgataataataataatgaagatgatacaagtaaattacaaaaacaattagataat
aaaaataataataataagaagaataagaagaataataaaacaatttatgcaagagtattt
ataaatgataaatcaaataatcaacaagtattaattcatagaaatattagaactattggt
aatttctatataaatacaattgttagattaaaatatacaacaagtcattcattaccaatt
tgtccaattggttcaattttagttaaacaagttatttggaaacaaaattcattatcaaat
ttaataaaacaacaatcatcacaaaaaatatattcagttgaacaaattaaagaacaaatt
aaagtttggtcaaataataatttatcaaataatcaaagatatccattattaaatggttca
atagtttcaattaattcaaatttagatttatcatttaattttaataatttaacatcatca
attattcctcctacatcatcatcatcatcatcaccttcaaataatttagattctcaaaga
tcaaataataataataacaatattaataatgatcaattaaatgatataactaataatatg
aataatccatatttatcaagtattcaacaaattggtgatattatgtcaaatttaaatact
aataataatcaaaataatcaaaataataattcaaataaattaatgaatcaatttcaaatg
aataatggtatatttatgttaagtttagaaattttatcaaatgataaattattaaagatt
gaaagtggtggtaataattcaattgaaaaaaagaaatcattagaggattataatgaaatt
ggtgatagattatttcaaagaattggtggtatggaaaaacaaattaaacaagctaaagag
tttttatcattatatatgtataaagatttatcagtaatacgtgaacaattaaatacacca
ggtgttaatggtatgatcattgcaggtagtcatggtagtggtaaatcgttattggcaact
tcattgggtggttattattcaacagattcaagatcaaatgctttcattataaaattagat
tgtaatcaattaaaagaattaaaagttgaaaatataagaaaacaatttaataaattattt
tataaatcttgtaaagaaagtggtaatactttatcagcaaccacatcaactaatactacg
ccaccaccaataataataattttagaatcattagatttaatattgggtacaccaaatgat
caagatccaggttcaaaaattagatgtgaacaattagtatcacatattaaatcattatgt
tttaaatatcaaaataggtcaagtccaattgttatgattgcaactgtaatctcatcacaa
tcattatgtcaatcaattcaaataccagaattatttggattaacaatcgaattacaagca
ccaacaagagaagaacgtgttgaaatacttgaaagatatttaaagtatcaaggtaaacaa
ttaaaagatcaacaatcattaaatttaatgaaattctctgcttctatggaaggttattta
ggttgtgatgttgaacaaattgttgatcgttcaatacatttatcttcaattaaagagatt
gaaaataataataataataacgatgataatgatgatgataatattattgaattttcaata
attgaaaaagcaaaagaaggttatacaccaataacattgaaaggtataaaattacatagt
tcagagattaaatggcaagatattggtggattggattcagttagagcaatgttaaaggaa
actattgaatggccaactaaatatccaaaattatttcaatcatcaccattacgtttaaga
tcgggtattctattatatggtccaactggttgtggtaaaactttattggcatctgcaatc
gccggtgaatgtggtttaaatttcatctctgtaaagggaccggaattgttgaataaatat
attggttcatccgaacaaggcgttagagatgttttctcaagagcatcttctgcaaaacct
tgtgttttatttttcgatgaattcgatagtattgcaccacgtagaggtcacgataattct
ggtgtcactgatagagtggtaaatcaattcctcactcaattggatggtgttgaagggtta
actggtgtttatgttttggcagcaactagtagacctgatttaatagatcctgcactacta
cgtcctggtagattagataaatcattatattgtaatataccagagtttaatgaacgttta
gatattctaacttgtttaaagagtaaaatgaatttatcaccatcaatatctcttgaacaa
ttgtcaacaaatactcaatattacactggtgctgatttaagagcattaatgtataatgct
caattaaaatcaattcatgaatggatgaatcatttagaagaagaaaagaaaagaaaaaga
aaagaaaaagaagatcaatcgaataaaaacagttctcaacaacaagatgattttattata
tttcaacctaaaaataatgataattcaatttcaaaatcaaatttaacatttgaagaaaaa
acaaatctccaaaaacaaattgatactattaaatctcaatttataaattcaaatacctct
actttaaataaatcaaatttatcaaatgaacaaccaccattaataactcaatctcatatt
gatttggctttgaaagaatcttcaccatctatctctgaatctgaaagaaaaaaatatgaa
agaatttataataattttttaaaagaaagaggatcagtcactggtaacaagaaagaagga
gtaccaaaacaaacattggcttaa

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (68)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (63)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   DICTYBASE (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (3)   
   UniProt (1)   
   SWISS-PROT (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (19)   
   Pfam (19)   
All databases (95)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system