KEGG   Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0290369
Entry
DDB_G0290369      CDS       T00245                                 
Name
(RefSeq) Arf guanyl-nucleotide exchange factor
  KO
K18442  brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein
Organism
ddi  Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi04144  Endocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ddi00001]
 09140 Cellular Processes
  09141 Transport and catabolism
   04144 Endocytosis
    DDB_G0290369
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking [BR:ddi04131]
    DDB_G0290369
Membrane trafficking [BR:ddi04131]
 Endosome - Golgi transport
  Arf GTPases and associated proteins
   Arf GTPase associated proteins
    DDB_G0290369
SSDB
Motif
Pfam: Sec7 Sec7-like_HUS Sec7-like_HDS DCB BIG2_C
Other DBs
NCBI-GeneID: 8627613
NCBI-ProteinID: XP_635808
dictyBase: DDB_G0290369
UniProt: Q54G75
Position
5:3976953..3983217
AA seq 1886 aa
MDDSIALMFNNTLQKIYSQCSRKCIQLRESCKVAQDTIRDSPLFSASETKHDNKEYELLG
NKLFIAMKLACETKEPKIMIIALDCLDKMMLYGIIKANINDETSPPVNGEKKKLVESVVD
LIGSYFSFQNENVQLQIIKALLTSVTTPSCDVHDTCLMNSIKTSYNIYLVSTAKTVNCTA
ARSALFQMVDCVLQKFELVSQQKMHNPSPSSSSSSSSSSNTLLSNSNEEINTAYQSNLSD
VILLFRAFCKLSTKDIPDGLQPESHEMKSKLLSLELLSRILENPLPSLKLSEKFINSSIK
RYLSNSLLINGTNQHLPVFKLTLSLFLSLIIHFKEYLKEEIGLFFSKILLNVLSSTSCSA
KQKWLILPVLYEICKNPQTIVDIFVNYDCDPDRKDIFEKMVYELSRVAQGTITGDQRSST
SLDDQKFKTLGLECIVTIMKSLVDWSKELYQDSLISNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
TTTTTTTTSSSSSLNSSSDRNPTTKKRSSSNASNSEESTTTIDLSKLSPLEQGIYKFNQS
PKRGIEYLLKMKLVKETPEDIAQFIKSNTLTLEPKKIGEYLVQQNSFNFSVLFKYVELFN
FLSIPIDEALRNLLFGFLLHGENQCIDKIIEKFAEKYYHDNIGQESSVFSNAESVYLLSY
AIIILSTDLHNPSITTKLTKQEWIKMNSKINNKNDFEESFLFGIYDRLLKEPYKIINDDL
ALNSQDKLLRYNRESDYIAKQCQELIKAKLSKKSIFYKARNIEHVRPMFLLSWCYVLSTL
SVVLDDTKDRRVVQLCLEGFSYAIRVSCIFYMNVERSSFITSLSKFSLLDSIKEPTLKNI
ECVKTLLSIGISEGNYLQDSWTPILKAICILERFQLFNSVKQQILSSPNNIDNENNNNGE
SINIFSTTTTTSLTTTTYSSSSSPINNSPNTIINIVAGINNSPNLYIIENQIKRLIEENP
KELTFDSSIIERIFTNTSSLSDDSIVTFFRCLCEVSDDEINHYQRNYSLIKLVEVIEYNF
KRIRLVFYNIWEIVVQHFTKVGCNANIEIAQHAIDSLRQLANKYLEKQELTNYNFQNEFL
IPFQDIMKCNPSIIIKELVIRCVAQLSILKSKNIKSGWKTIINVFTLGSKVLNESIVQLS
FQGIDQLIQKNFQLIEDNFFINLIESCSSFSLPTVPYFEISIKSLELLLLLSKRLPTNST
TSSTSSLSTSTGLTISTIEKLLLPIIQGTSFAILHESEPVRKLSSALLFDLLNSRGSEFN
SEIWNRIIMKVITPIFQSIDLTKLNNEVTNNWLRQTFPILLNYLIDLFIQFNKELNQYYD
TFLTLLEPFICCWSELSVQVAIDYYANFISKCSPYFSNEFWCTSLIDSINRIIKKLLISK
SSPSSSSSSSSLSSLQQITSPLTNNNNNNNNNIPISAITPETPKKQNNNNNNNNNNINNN
NNCRSFSRTLLSLKPFLVIDEESSFIGKKMKSNVMKYEKTEPFLSIHNWNTIIKFQSLIN
KVYSELQLKVPIKFGVLLVKKWDLVFILSQRINSEQIFISHFGEQNTQNYECSTLSLLLS
LLFEMYIRPDTKKSSDSKNHEDYLQAKKRSKEVEDILSRFTIGILKENSLVVSNNLNNNN
NNNNVNSPITTTTSSSTSSSNTTTRIFNSTRMINIICQILQGFTRYNQKQFKKHQPSFFP
YCIDLSLHDNLQIRQSLSKLFERCKSDLPTIILSQSPPSPLTLDPIPTIGQKNNSQIQQQ
QQQEQQEQNLENASHYTVKDKVLIIEDNQNQNQNHNQNNNDDNITIKESNTSIEIIQADD
NDDDDNNNNDNNNNINEKRNDEDDNSNEIKQNDENEKIEIIQDDETEDLSNNTNNGISDD
FTPIETNENLTDIDGFVNINEEEDIL
NT seq 5661 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggacgattcaatagcattgatgtttaataacacattgcaaaagatttatagtcagtgt
tcaagaaaatgtattcaattaagagaatcatgtaaagttgcacaagacactattagagat
tctccattattcagtgcatctgaaactaaacatgataataaagaatatgaacttttaggt
aataaattatttatagctatgaaattagcatgcgaaactaaagaaccaaaaataatgata
attgcattagattgtttagataaaatgatgttatatggaattattaaagcaaatataaat
gatgaaacttcaccaccagtaaatggagagaaaaagaaattggtagagagtgttgtggat
ttaattggatcatattttagttttcaaaatgagaatgttcaacttcaaatcattaaagca
ttattaacatcagtaacaacaccatcatgtgatgtacatgatacttgtttaatgaattca
attaaaacttcatataatatctatttagttagtactgctaaaactgtaaattgtaccgct
gctagaagtgcactctttcaaatggttgattgtgttttacaaaaatttgaattggttagc
caacaaaaaatgcataatccatcaccatcatcatcatcatcatcatcatcatcatcaaat
acattattatcaaattcaaatgaagaaataaatacagcatatcaaagtaatttatcagat
gttatattattatttagagcattttgtaaattatcaacaaaagatataccagatggatta
caaccagaatcacatgaaatgaagagtaaattattatcattggagttgttgagtagaata
ttggagaatccattaccatcattaaagttatcagagaaatttataaattcaagtataaag
agatacctatcgaattcattattgatcaatggtaccaatcaacatttaccagttttcaaa
ttaacattatcattgtttttatcattgataattcatttcaaagagtatttaaaggaagag
attggtttattcttttcaaagattctattaaatgttttatcatcaacgagttgttcagcg
aaacaaaaatggttaattttaccagtactatatgaaatttgtaagaatcctcaaactatt
gttgacattttcgtaaattatgattgtgacccagatagaaaggatatctttgagaaaatg
gtttatgaactctcaagagttgctcaaggtacaattacaggtgaccaacgttcttcaact
tctttagatgatcaaaaatttaaaactttaggtttagaatgtatagttacaattatgaaa
tctttagttgattggagtaaagaattatatcaagatagtttaataagtaataataataat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
actacaaccaccactaccactacatcatcatcatcatcattaaattccagtagtgatcgt
aatccaactactaaaaaaagatcatcatcaaacgcatcaaattcagaggaatcaacaacc
acaattgatctttcaaaattatcaccattagaacaaggtatatataaatttaatcaatca
ccaaaaagaggaattgaatatttattaaaaatgaaattagttaaagaaacaccagaagat
atagcacaatttataaaatcaaatactttaacattagaaccaaaaaaaattggtgaatat
ttagttcaacaaaattcatttaattttagtgtattatttaaatatgtagaattatttaat
ttcttaagtattccaattgatgaagcattaagaaatttattatttggatttttattacat
ggtgagaatcaatgtattgataagattattgaaaagtttgcagagaaatattatcatgat
aatattggtcaagaatcatcagtattttcaaatgcagaatcagtttatttattatcctat
gcaatcattatactttcaaccgatttacataatccatcaatcactacaaaattaacaaaa
caagaatggattaaaatgaattcaaaaattaataataaaaatgattttgaagaatcattt
ttatttggaatttatgatagattattaaaagaaccatataaaattataaatgatgattta
gcattaaattcacaagataaattattaagatataatagagaatcagattatattgcaaaa
caatgtcaagaattaattaaagcaaaattatcaaagaaatcaatattttataaagctaga
aatattgaacatgtaagaccaatgtttttattatcatggtgttatgtattatctacatta
tcggttgtattggatgatacaaaggatagaagagttgttcaattatgtttagaaggtttt
tcatatgcaattagagttagttgtattttttatatgaatgttgaaagatcttctttcata
acatctttatcgaaattctcattattggattcaatcaaagaaccaacattaaaaaatatt
gaatgtgttaaaactttattatcaattggtatttctgaaggaaattatttacaagatagt
tggacaccaattttaaaagcaatttgtattttagaaagatttcaattatttaatagtgta
aaacaacaaatattatcatcccctaataatatagataatgaaaataataataatggagaa
tcaataaatattttctcaacaacaactacaacatcattaactacaactacatattcatca
tcatcatcaccaattaataatagtccaaatacaattataaatatagtagcaggtattaat
aatagtccaaatttatatataatagagaatcaaataaagagattaattgaagagaatcca
aaggaattgacatttgatagtagtataattgaaagaatatttacaaatacaagttcatta
tcggatgattcaatagttacattctttagatgtttatgtgaagttagtgatgatgagatt
aatcattatcaaagaaactatagtttaattaaattggtagaggtgattgaatataacttt
aagcgtataagattggtattctataatatttgggagattgtagttcaacattttacaaag
gttggttgtaatgcaaatattgagattgctcaacatgcaatcgattcattaagacaattg
gcaaataaatatttggagaaacaagaattgacaaattataatttccaaaatgaattttta
ataccatttcaagatattatgaaatgtaacccttcgattatcatcaaagagttggtcatt
agatgtgtggcacaattgtcaatattaaagagtaaaaatatcaaatctggttggaaaacc
attatcaatgttttcacattgggatcaaaggttttaaatgagtccattgttcaattgtct
tttcaaggtattgatcaattgattcaaaagaatttccaattaattgaagataatttcttt
ataaacctaattgaatcttgttcatcattctctttaccaactgtaccttattttgaaatt
tcaattaaatctttagaattattattattattatcaaaacgtttaccaaccaatagtact
acatcatcaacatcatcattatcaacatcaacaggtttaacaatttcaacaattgaaaaa
ttattattaccaattattcaaggcacttcatttgcaattttacatgaaagtgaaccagtt
agaaaattatcatcagctttattatttgatcttttgaattcaagaggatctgaattcaat
agtgaaatttggaatagaatcattatgaaggttattacaccaatctttcaatctatcgat
ttaactaaattgaataatgaagtcacaaataattggttacgtcaaacttttccaatctta
ttaaattatttaattgatttgtttatacaattcaataaggagttaaatcaatattatgat
acttttttaactttattagaaccattcatatgttgttggagtgaattatctgttcaagtt
gcaattgattattatgctaatttcataagtaaatgttcaccttatttttcaaatgaattt
tggtgtacaagtttaattgattcaattaatagaattataaagaaattattaatttcaaaa
tcatcaccatcttcatcatcatcttcatcatcattatcatcattacaacaaataacgtca
cctttaacaaataataataataataataataataatataccaatatcagcaataacgcca
gaaacaccaaagaaacaaaataataacaataataataataataataatattaataataat
aataattgtagatcatttagtcgtacattattatcattaaaaccatttttagtaatagat
gaagaatcaagttttataggtaaaaaaatgaagagtaatgttatgaaatatgaaaagact
gaaccatttttatcaattcataattggaatacaataattaaattccaaagtcttataaat
aaggtttatagtgaattacaattaaaggttccaattaaatttggtgtattattagtaaaa
aaatgggatttagtattcattttatcacaacgtatcaattctgaacaaattttcatctct
cattttggtgaacaaaatactcaaaactatgaatgttcaacactttctttgttattgtca
ttattgtttgaaatgtatattagacctgatacaaagaaatcctctgatagtaaaaatcat
gaagattatcttcaagcaaagaaacgttcaaaagaagttgaagatattttatcaagattt
acaattgggatattaaaagaaaattctttagtagtttcaaataatcttaataataataat
aataataataatgtaaattcaccaataacaacaacaacatcatcatcaacttcatcatca
aatacaactactagaatatttaatagtactagaatgattaatattatttgccaaatttta
caaggttttacaagatataatcaaaaacaatttaaaaaacatcaaccatctttctttcca
tattgtatcgatttatcattacatgataatttacaaattagacaaagtttatcaaaatta
tttgaaagatgtaaatctgatcttccaactattattttatcacaatcaccaccatctcca
ttaactcttgatccaattccaaccattggtcaaaagaataattcacaaattcaacaacaa
caacaacaagaacaacaagaacaaaatttagaaaatgcttctcactatactgtaaaggat
aaagttttaattattgaagataatcaaaatcaaaatcaaaatcacaatcaaaataataat
gatgataatattactattaaagaatcaaatacttcaattgaaataattcaagctgatgat
aatgatgatgatgataataataataatgataataataataatattaacgagaaaagaaat
gatgaagatgataatagtaatgaaataaaacaaaatgatgaaaatgaaaaaattgaaata
attcaagatgatgaaaccgaagatttaagtaataatacaaataatggtatttctgatgac
ttcactccaatcgaaactaatgaaaatttaacagatatcgatggatttgttaacattaac
gaggaagaagatatattataa

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (106)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (101)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   DICTYBASE (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (5)   
   Pfam (5)   
All databases (118)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system