KEGG   Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0291245
Entry
DDB_G0291245      CDS       T00245                                 
Symbol
abcA6
Name
(RefSeq) ABC transporter A family protein
  KO
K05643  ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 3
Organism
ddi  Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi02010  ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ddi00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09131 Membrane transport
   02010 ABC transporters
    DDB_G0291245 (abcA6)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:ddi02000]
    DDB_G0291245 (abcA6)
Transporters [BR:ddi02000]
 ABC transporters, eukaryotic type
  ABCA (ABC1) subfamily
   ABCA1, 2, 3, 4, 7, 12, 13 subgroups
    DDB_G0291245 (abcA6)
SSDB
Motif
Pfam: ABC_tran ABC2_membrane_3 AAA_21 SMC_N Rad17 AAA_29 SbcC_Walker_B
Other DBs
NCBI-GeneID: 8628157
NCBI-ProteinID: XP_635211
dictyBase: DDB_G0291245
UniProt: Q8T6J1
Position
6:complement(313947..319147)
AA seq 1631 aa
MEFGRQLKTLLKKNLLLKGKSKCSICCEIVFPIVIIGVLFAILALIKVTNSDYNSIDVTT
FSRRVGPENKLLYGSEGSLNNDQSGVIETMKEQVATARGLTVAEVQDFFMEINDRTLMES
FFKNYSMMVYGGVWFNSSTNGGGGGNNNDPIAAGGQFGYNIRLDSDDTADTSETGKVDGG
DSSIYLNDNFASIQVAMDQAIFGYFGLDMVLNISGRHYPDPYTELWQEWITGRDAIIKSA
GSVFITAALMMFSFRLVTDVVIEKETKIVEAMRMMSLNSLAYFSSWIITSLITSLPVTLL
IVVIFKGSQLIYSTSWGIVIITFVLYLITLLLLSFIFSIFFNNSKFCGLLSFVIVIAINI
CGIFVSKNEFSVSVKLLLSIFSPIAFSNSIYIMSVKDLTMILNLNWDYIVTENQSILMLG
IDIIIYIILIWYFEKVIPGEYGTKEKFYFLFTKNYWFGKKRSIGEIDDIESTFDSEDVET
IPLKVLKNSTISIRNLRKEFETGDGLRVAVNDLYLDMFEDQIHALLGPNGCGKSTTIGML
TGLISPTSGSAFIRGYDITSQMSKIRPYIGCCLQTDIIWSQLTVLEHLVIYASLKGVEGR
NIQREAERMATEVGLAEKMNAPAGSLSGGQKRKLCLGIAFIGRSKIIFLDEVTSGMDPVS
RRQVWDFLLKYKKGKTIILTTHYLEEADYLGDRIAIISQGKLRCDGTSLFLKNRFGQGYL
LTCNKKLENASNGFNTNQVSEFIKNFIPGASILTDSGAELSYRLPTESLSNFPQFFTEFD
LNLSKFSIQTYGISVTSLEEVFISLGQEDSKKLNNNANGNNEFNKQNEMESLKLAIATPS
DGINQIQQFKGLLIKRIQQSKKDARSFFLSIILPMALIIGSIILYKSMNDQKQVLFYNNS
TQPLTMSLSIYTDSDNTINVPMQLLNNELEWSNLFNNSPYFNKFKYINESINFNDYLIDN
YKLSIGAINFTNQPISIDDNNNGQSTNCSYIAYYNSDYIHSFPIHVNLINDALLRKFKNI
SISVTSMPFDHILTAFEISSSDINASAIIYFVFILMAGFSLMAGSFAGSIAQERTNRVKR
LLYVSGCKKHIYWLSNLVWDFFFAFIISILSCSILAGVIKGAFKEQFGSFLLCLILLSCA
IIPLGYLMSYKFQTYGKAVGAITAILFVFGLVFTIASLNVRIQAVVNQNSTTQKVADIID
LIFSIISPIFALNRIVFILSGFPGSTRLGTFKVDNYWSFDYLGTPLIVLAGHAVLWNVWI
LLLDYVPQIKGFFKNPKNLPAPSPPQDEDYDVSQERRRLLNMRPSEEPIQFKNLHKLFPG
SGKNPSKTAVYNSTLGIPRGQTFGLLGLNGGGKSTTLSMLSGEIVPSSGEISINGYDVIT
NREKALGNISMVFQFDALISLLSAREHLWLFSRIKGIKESQIENCVEAFIKMVDLTRIAN
SGCGGYSGGNKRKVSLSMAMLGNPSVCFLDEISCGCDAVVRRQLWDVISELGKDKSIILT
SHSMSEVEALCSRITIMKEGKYTCLNTIQGVKNRFGAGYSIDVKFKKEYLETGIQTILQS
IPNCTVLDQHDVMASFEVPNPPGNPIKLSNIFSILSNLPILDDYNVGQTSLESVFLKLTG
ANHDQRINLYD
NT seq 4896 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaatttggaagacaattaaaaactttattaaaaaagaatcttttattaaaagggaaa
tcaaaatgttcaatttgttgtgaaattgtttttccgattgtaattattggtgtattattt
gcaattttagctttaattaaagttacaaattctgattataactcaattgatgtaacaaca
ttttcaagaagagttggacctgaaaataaattattatatggtagtgaaggatcattaaat
aatgatcaaagtggtgtaattgaaacaatgaaagaacaagttgcaactgctagaggttta
acagtagcagaggttcaagattttttcatggaaattaatgatcgtactttaatggaatca
tttttcaaaaattattcaatgatggtttatggtggtgtttggtttaatagtagcactaat
ggtggtggtggtggtaataataatgacccaatagcagcaggtggccaattcgggtataat
attagattagatagtgacgatacagcagacacatcagaaactggtaaagttgatggaggt
gatagtagtatctatttaaatgataatttcgcatcgattcaagttgcaatggatcaagct
atttttggatactttggattggatatggtattaaatatatcaggtagacattacccagat
ccatatacagagctatggcaagaatggataacaggaagagacgcaattattaagtcagca
ggaagtgtgttcattacagcggcattgatgatgtttagttttaggctagttacagatgtt
gtaattgaaaaagaaactaaaattgtagaagcaatgagaatgatgtcattgaattcattg
gcgtatttcagttcatggattatcacaagtttaataacatcattgccagtcacactatta
attgttgtcatatttaaaggtagtcaattaatttattctacaagttggggtattgtaatc
ataacatttgtattatacttgataacattattattattatcatttatttttagtatattt
tttaataattccaaattttgtggtttattatcatttgtaattgtaattgcaattaatatt
tgtggtattttcgtttcaaaaaatgaatttagtgtttctgtaaaattattactttcaata
ttttcaccaattgcattttcaaattcaatttatattatgtctgttaaagatttaacaatg
attttaaatttaaattgggattatattgtaactgaaaatcaaagtattttaatgttagga
attgatattataatttatattatattaatttggtattttgaaaaagttataccaggtgaa
tatggtacaaaagagaaattttattttttatttacaaaaaattattggtttggaaagaaa
agaagtattggtgaaattgatgatattgaatcaacatttgatagtgaagatgttgagact
ataccattgaaagtattgaaaaattcaactatatcaattcgtaatttaagaaaagaattt
gaaactggtgatggattgagagttgcagttaatgatttatatttggatatgtttgaagat
caaattcatgcattgttaggacccaatgggtgtggtaaatcaacaacgattggtatgttg
acaggtttaatatcaccaactagtggaagtgcatttattcgtggttacgatattacaagc
caaatgtcaaagattagaccatacattggttgctgcttacaaactgatatcatttggtca
caattgacagtattggaacatttggttatttacgcatcattaaaaggcgttgagggtaga
aatattcaaagagaggctgaaagaatggcaacagaggttggattagccgagaaaatgaat
gcaccagctggtagtctttcaggtggacaaaaacgtaaactttgtttaggtattgcattt
attggtagatctaaaatcattttcttggatgaagtcacctctggtatggatccagttagt
agaagacaagtttgggattttctattaaaatataaaaaaggtaaaaccatcattcttaca
actcattatttagaggaggcagattatttaggtgatcgtattgcaattatttcacaaggt
aaattacgttgtgatggtacttcattatttttaaagaatagatttggtcaaggttatctt
ttaacatgtaataaaaaattagaaaatgctagcaatggtttcaatacgaatcaagtttca
gagtttattaaaaattttatacctggtgcatcaattttaacagattctggtgcagaacta
agttatcgtttaccaactgaatcattatcaaatttcccacaattttttacagaatttgat
ttaaatttatcaaaattttcaattcaaacttatggtatatcagtaacaagtcttgaagaa
gttttcatttcattaggtcaagaagattctaaaaaattaaataataatgctaatggtaat
aatgaattcaataaacaaaatgaaatggaatcattaaaattagcaattgcaacaccatca
gatggtattaatcaaattcaacaatttaaaggtttattaattaaacgtattcaacaatct
aaaaaagatgcaagatcattctttttatcaattattttaccaatggcattaattattggt
tcaattattttatataaatcaatgaatgatcaaaaacaagttttattttataataattca
actcaaccattaacaatgtcattatcaatttatactgatagtgataacactattaatgta
ccaatgcaattattaaacaatgaattagaatggtcaaatttatttaataattcaccatat
tttaataaatttaaatatattaatgaatctataaattttaatgattatttaattgataat
tataaattatcaattggtgcaattaattttacaaatcaaccaattagcattgatgataat
aataatggtcaatcaacaaattgttcatatattgcatattataattcagattatattcat
tcatttccgattcatgttaatttaattaatgatgcattattaagaaaatttaaaaatatt
agtatttcagttacaagtatgccatttgatcatattttaacagcatttgaaatttcaagt
tcagatataaatgcatcagcaattatttattttgtatttattttaatggcaggtttttca
ttgatggcaggttcatttgctggtagtatagctcaagaacgtacaaatagagttaaaaga
ttattatatgtttcaggttgtaaaaaacatatttattggttatcaaatttagtttgggat
tttttctttgcatttataatttcaattttaagttgttcaattttagcaggagtgattaaa
ggtgcatttaaagaacaatttggttcatttttattatgtttaattttattaagttgtgca
attataccattgggttatttaatgtcttataaatttcaaacctatggtaaagcagttggt
gcaatcactgcaattttatttgtttttggtttagtatttacaattgcaagtttaaatgta
cgtattcaagctgtggtcaatcaaaatagtacaactcaaaaagttgccgatattattgat
ttgatattttcaattattagtccgatttttgcattgaatagaattgttttcattttatct
ggtttcccaggttcaactcgtttgggtacttttaaagttgataactattggtcatttgat
tatttaggtacaccattgattgttttggcaggtcatgcagtactttggaatgtttggata
ttactattggattatgtaccacaaattaaaggtttctttaagaatccaaagaatttacct
gcaccatcaccaccacaagatgaagattatgatgtatcacaagagagaagaagattacta
aatatgagaccatcggaagaaccaattcaatttaaaaatcttcataagctattcccaggt
tcaggtaaaaatccatcaaaaactgctgtatacaattcaacattgggtattccacgtggt
caaacatttggtttattgggtttaaatggtggtggtaaatcaactacactatcaatgtta
tctggtgagattgtaccttcaagtggtgaaatttcaatcaatggttatgatgttattacc
aatagagagaaagcacttggtaatatttcaatggtattccaatttgatgctctcatttca
ttattatcagctcgtgaacatctatggttattctctagaatcaaaggtattaaagagagt
caaattgaaaattgtgttgaagctttcattaaaatggttgatttaactcgtattgcaaat
agtggttgtggtggttattcaggtggtaataaaagaaaagtttcattatcaatggcaatg
ctcggtaatccatcagtttgtttcttggatgaaatttcttgtggttgtgatgctgttgtt
agaagacaactttgggatgtaattagtgaattaggtaaagataaatcaataattttaaca
agtcattcaatgagtgaagttgaagcattatgtagtcgtattacaattatgaaagaaggt
aaatatacatgtttaaatacaattcaaggtgtaaagaatcgttttggtgctggttattca
attgatgttaaatttaaaaaagaatatttggaaactggtattcaaacaatattacaatca
ataccaaattgtacagttttggatcaacatgatgttatggcaagtttcgaagtaccaaat
ccacctggaaatccaattaaattatcaaatatcttttcaattttatcaaatttaccaatt
ttagatgattataacgttggtcaaacatctttagaatcagttttcttaaaattaactggt
gcaaatcatgatcaacgtattaatttatatgattaa

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (75)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (70)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   DICTYBASE (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (3)   
   UniProt (1)   
   SWISS-PROT (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (7)   
   Pfam (7)   
All databases (90)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system