KEGG   Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0292056
Entry
DDB_G0292056      CDS       T00245                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K20409  SEA/GATOR complex protein SEA3/WDR59
Organism
ddi  Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ddi00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking [BR:ddi04131]
    DDB_G0292056
Membrane trafficking [BR:ddi04131]
 Autophagy
  Other autophagy associated proteins
   SEACAT/GATOR2 complex
    DDB_G0292056
SSDB
Motif
Pfam: WD40 zf-RING_16 zinc_ribbon_16 Corazonin
Other DBs
NCBI-GeneID: 8628476
NCBI-ProteinID: XP_629798
dictyBase: DDB_G0292056
UniProt: Q54DS4
Position
6:1115547..1121605
AA seq 1823 aa
MTYNNNNNYLAPPLMTSTSTSTSTSTPTSTKTSPLNTSSSSNILKSNSRNPSPNNPTNIG
NSSGGGGVSSNNSNNIVYSNSNNINTSTFHYNFNVKFNEIVNSIAVNRAGTLVCLGGKKS
LQVVDLELLKSVRNIPQQSKWEVGVVDWNSQSPNLVASSSNQDTFIWDIENPKYPLLGQF
SSHQRAISDLSWSLFDNNILATTSADSFVNIWDLRTPKKAVKFKSLKSHILGAIQVKWNR
FNSNVLASAHESYLMIWDIRKDSQELNTAVHSAKVYGIDWSHRDEKEILTCSQDKTVKIW
NYPSPKPKSTIITSNPILRAKYLPLGSGGIVTISDRGENHIRLWDSATSDYSTPVETFIG
HTDNVRSFDFRVRSSQNDNDIQIVSWSKDQYLRLWKLDDHLKDLFNIEYIPFTPLNLPTT
TTTTTTATTTTTNNSTSEMLNESTDNNNNTNSLNSSTLLSTPNLESSINSLNMELTIEQQ
QLDDSNTPKDLEYELKIIQSKVIDKYLKIEQVNLFKRTCVVICTIPNNYQPDDDNNNNNL
NNLNNNNNTQDNIDNNDDNNNNELIDSTTVQIRFSFPSLYPSTYPNLEFIPHACTTPLKT
NLLIKSTLNELCAFKSSQSKNCFEQCLIELVKLVKQYILDEKPKNTSINITETNNNNNNH
NNSVQNNNNNNNNNNNNNNNSGGGFLKNVFSKSSKAVEVVKQPFINLRNSSGRIDISQQQ
QQQQQQQAATTSTSSSSSSSSNTQQQQQFLTATVSNKGGTVLSKSPTSPRMFEQYRPGKT
NKTNEIIFLNNYKDSNEEQLPLSPILTNLNNNSNNNSGSGGGGSSNMNASITTSTTTNDQ
VSLSVHRNSYRIQENYPCPRLCGAVFGGCGKLIVFRNTIITNIPNNNKNSDNSNNNNSSS
SNKNSDNSNNSNNNSNNTNSSSSSNNGGIANVGGGSSSTSSLIHHHLQHLHLNQPQLNLL
SLSLSSSSSSISDTTNNTSNTTQNIQNTTKNINPPRTYKELLNILSTTNNTIKNNITGNN
NINSNSNTTNNLTSPNPNRLNRLNEKQPYSSSPFNDNPLINDYKNNIFGTPSTSHSFLAS
PQPSSPISFMNHIDTLLDDSENNLMTMDNNNNNNIVNDEETQQLVTSSSPTFSKSSLNNI
NNTTNNSNNNSSNSNNNSNSNNNNNNNNNNNNVNNNNDNNNGNGKSLQKTMKIIDISTLS
LLNVNLANSYILSGKPVEEICKYNSELAEKENRKDLVKLWNTLGMITDSKLYLKQLINQQ
QQQSHFGFSGSSGSTGMGGSSSTGIASSTGSNSIRRPTKLESSLHQSISMSNLGQIPSSA
SSSYSQTSPSLPYNQLYHQTTLQTPSSPSSQQQQIQFYQQQALQLQQQQQQQQQQQREIQ
FKQTQLIQQAQIEDNGWPNHALGRKLVKSLIDYYKKLEDVQTLATISCILILAANQLQKL
KNGESITSIGSSSSSSSSSLASSPLTFSAGGGGGGSYSPMFNFSAISISAPMGIDDMVSK
QKGHLYNYYGQQQHSHYHHGYQHHNIHQTYGSHPNDVITYDPNLCLLDPNNSKIYDYYRQ
QYSDLLYRWGLLEKRAEVLKYIQHKEVDKGINFSIECIKCNRKLNNFYCNNCKIYAVKCS
ICNISVRGLSSFCLYCGHGGHTNHIKGWFEKQTKCPTGCGCTCSFNLPFIQQQQYQQQLQ
QQQQQLQQQLQLQQTQQQQPQHYQQHRHSMSGTSHYHQQQPHTHNYQQHISSYAHTTYQP
HTPRNNGQPVLPQQRRYSISTFDPQQEQDHEKFNHGGGSGGGDAIFHDILFSPNSSSSSS
SYQQQTKNSHQYHHPSNPYMFSN
NT seq 5472 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgacatataataataataataattatttagcacctccattaatgacatcaacctctacc
tcaacatcaacatcaacgccaacctcaactaaaacatcaccattgaatacatcatcttca
tcaaatattctaaagagtaattcaagaaatccatcaccaaacaatccaaccaatataggt
aatagtagtggtggtggtggtgttagtagtaataatagtaataacatagtttatagtaat
agtaataatataaatacatcaacatttcactataatttcaatgttaaattcaatgaaatt
gttaattccattgcagtgaacagagcgggtacacttgtttgtttaggtggaaaaaagtca
ttacaagtagttgatttggaattattaaaaagtgttagaaatataccacaacaaagtaaa
tgggaagttggtgtagttgattggaatagtcaatcaccaaatttagttgcttcatcttca
aatcaagatacatttatatgggatattgaaaatccaaagtatccattacttggacaattt
tcatcacatcaacgtgcaatctcagatttatcatggagtttattcgataataatatattg
gcgactactagtgccgattcatttgtaaatatttgggatttaagaacaccaaagaaagca
gtaaaatttaaatctttaaaatctcatattcttggtgcaattcaagttaaatggaataga
ttcaatagtaatgttttagcttctgctcatgaaagttatttaatgatttgggatattaga
aaagattcacaagaattaaatacagcagtacattcagcaaaagtttatggtattgattgg
tcacatagggatgagaaagagatattgacatgtagtcaagataagactgtaaaaatatgg
aattatccatcaccaaaaccaaaatcaacaattataacctccaatccaatattgagagca
aaatatttaccacttggtagtggtggtattgtgacaatatcagatcgtggtgaaaatcat
attagactatgggatagtgcaactagtgattattcaactcctgttgaaactttcattggt
catactgataatgttcgttcattcgatttcagagttagatcctctcaaaatgataatgat
attcaaatagtatcttggtcaaaagatcaatatttacgtctttggaaattagatgatcat
ttaaaagatttatttaatattgaatatataccatttacaccattaaatttaccaacaaca
acaacaactacaaccaccgcaaccactacaacaacaaataattctacaagcgaaatgtta
aatgaatcaactgataataataataatacaaatagtttaaatagttcaacattattatca
acaccaaatttagaaagtagtattaatagtttaaatatggaattaactattgaacaacaa
caacttgatgattcaaatacaccaaaagatttagaatatgaattaaaaattatacaaagt
aaagtaattgataaatatttaaagattgaacaagtcaatttatttaaaaggacttgcgtt
gtaatttgtacaattccaaataattatcaaccagatgatgataataataataataattta
aataatttaaataataataataatacccaagataatattgataacaatgatgataataat
aataatgaattaattgattcaacaactgtacaaattagattttcatttccatcactttat
ccaagtacatatccaaatttagaatttataccacatgcttgtacaacaccattgaaaact
aatttattaattaaatcaactttaaatgaattatgtgcattcaaatcatcacaatctaaa
aattgttttgaacaatgtttaattgaattggttaaattggttaaacaatatattttagat
gaaaaaccaaaaaatacttcaattaatataaccgaaactaataataataataataaccat
aataattctgtacaaaataataataataataataataataataataataataataataat
agtggtggtggatttttaaagaatgtattttcaaaatcgtcaaaagcggttgaagttgtt
aaacaaccatttataaatttaagaaattcaagtggaagaattgatattagtcaacaacaa
caacagcaacagcaacaacaagcagcaacaacatctacatcatcatcatcatcgagtagt
tctaacacccaacaacaacaacaatttttaacagcaacagtatcaaataaaggtggtaca
gttttatcaaaatcaccaacatctccaagaatgtttgaacaatatagacctggtaaaact
aataaaacaaatgaaattatatttttaaataattataaagattcaaatgaagaacaatta
ccactttctccaattttaacaaatttaaataataatagtaataataatagtggtagtggt
ggtggtggtagtagtaatatgaatgcatcaataacaacatcaaccactacaaatgatcaa
gtatcattatcagttcatagaaattcctatagaattcaagagaattatccatgtccaaga
ttatgtggtgctgtttttggtggttgtggtaaattaatagtttttagaaatacaattata
acaaatattccaaataataataaaaatagcgacaatagcaataataataatagtagtagt
agtaataaaaatagtgacaatagtaataatagtaataataatagtaataataccaatagt
agtagtagtagtaataatggtggtatagcaaatgttggtggtggatcatcatctacttca
tcactcattcatcaccatcttcaacatcttcatcttaatcaacctcaattaaatttatta
tctttatcattatcctcatcttcttcatcaatttctgatacaacaaataatacttcaaat
acaacacaaaatatacaaaatacaactaaaaatattaatccaccaagaacatacaaagaa
ttattaaatattttatcaacaacaaataatacaattaaaaataatattactggcaataat
aatattaatagtaatagtaatacaacaaataatttaacttcaccaaatccaaatagatta
aatcgtttaaatgaaaaacaaccatattcctcttctccttttaatgataaccctttaatt
aatgattataaaaataatatttttgggacaccatcaacaagccattcatttttagcatca
ccacaaccatcatcaccaatttcatttatgaatcacattgatactttattagatgacagt
gaaaataatttaatgacaatggataataataataacaataatattgtaaatgatgaagaa
actcaacaactagtaacttcatcttcaccaactttttccaagtcatcattaaataatatt
aataatacaacaaacaattcaaataataatagttctaatagtaataataatagtaatagt
aataataataataataataataataataataataatgttaataacaataacgataataat
aatggcaatggtaaatccttacaaaaaactatgaaaataattgatatatcaacattatca
ttattaaatgtaaatttagcaaattcatatattttatcaggtaaaccagttgaagaaatt
tgtaaatataattcagaattagcagagaaagaaaacagaaaagatttagttaaactttgg
aatacacttggaatgataacagattcaaagttatatcttaaacaattgataaatcaacaa
caacaacaatcacattttggatttagtggtagttcaggtagtacaggaatgggtggaagt
agtagtactggtattgcatcaagtactggtagtaatagtataagaaggccaacaaaattg
gaatcatcattacatcaaagtatttcaatgagtaatttaggtcaaattccttcatctgcc
tcttcatcatattcacaaacttcaccatcattaccatataatcaactctatcatcaaacc
actttacaaacaccatcatcaccatcatcacaacaacaacaaatacaattttatcaacaa
caagcattacagctacaacaacaacaacaacagcaacaacaacaacaaagagaaattcaa
tttaaacaaactcaattaatacaacaagcacaaattgaagataatggttggccaaatcat
gcattaggtagaaaattagtaaaatcattaattgattactataagaaattggaagatgtt
caaacattggctacaatatcttgtattttaattttagctgcaaatcaattacaaaaattg
aaaaatggtgaatcgataacctcaattggttcatcgtcttcatcatcatcatcttcattg
gcatcttcacctttaacattttctgctggaggtggtggtggtggtagctactcaccaatg
tttaatttctctgcaatttcaattagtgctccaatgggtattgatgatatggtttcaaaa
caaaaaggtcatctttataactattatggtcagcaacaacatagccactatcatcatgga
tatcaacatcataatattcaccaaacctatggtagtcatccaaatgatgtcattacctat
gatccaaatctttgtttattagatccaaataattcaaaaatttacgattactatagacaa
caatattcagatttattatatcgttggggtcttttagaaaagagagcagaggtattgaaa
tatattcaacataaggaagtagataagggtattaatttctcaattgaatgtataaaatgc
aatagaaagttaaataacttttattgtaacaattgtaagatatatgccgttaaatgttca
atttgtaatatttcagtacgtggtctttcaagtttttgtctttattgtggtcatggtggt
catactaatcatattaaaggttggtttgaaaaacaaaccaaatgtccaactggctgtggt
tgtacttgttcttttaatttaccttttattcaacaacaacaatatcaacaacaattacaa
caacaacaacaacaattacaacaacaattacaactacaacaaacacaacaacaacaacca
caacattatcaacaacatcgtcatagtatgagtggaacttcacattatcatcaacaacaa
ccacatactcataattatcaacaacatatttcttcatacgctcatacaacttatcaacca
catactccaagaaataatggtcaaccagttctaccacaacaaagaagatatagtatttca
acatttgatccacaacaagaacaagaccatgaaaaatttaatcatggtggtggtagtggt
ggtggtgatgccatttttcatgatattttattttcaccaaattcatcatcatcctcttct
tcttaccaacaacaaactaaaaatagtcatcaatatcatcacccaagtaacccatatatg
ttttcaaattaa

DBGET integrated database retrieval system