KEGG   ENZYME: 1.13.11.53Help
Entry
EC 1.13.11.53               Enzyme                                 

Name
acireductone dioxygenase (Ni2+-requiring);
ARD;
2-hydroxy-3-keto-5-thiomethylpent-1-ene dioxygenase (ambiguous);
acireductone dioxygenase (ambiguous);
E-2
Class
Oxidoreductases;
Acting on single donors with incorporation of molecular oxygen (oxygenases);
With incorporation of two atoms of oxygen
BRITE hierarchy
Sysname
1,2-dihydroxy-5-(methylthio)pent-1-en-3-one:oxygen oxidoreductase (formate- and CO-forming)
Reaction(IUBMB)
1,2-dihydroxy-5-(methylthio)pent-1-en-3-one + O2 = 3-(methylthio)propanoate + formate + CO [RN:R07363]
Reaction(KEGG)
Substrate
1,2-dihydroxy-5-(methylthio)pent-1-en-3-one [CPD:C15606];
O2 [CPD:C00007]
Product
3-(methylthio)propanoate;
formate [CPD:C00058];
CO [CPD:C00237]
Comment
Requires Ni2+. If iron(II) is bound instead of Ni2+, the reaction catalysed by EC 1.13.11.54, acireductone dioxygenase [iron(II)-requiring], occurs instead [1]. The enzyme from the bacterium Klebsiella oxytoca (formerly Klebsiella pneumoniae) ATCC strain 8724 is involved in the methionine salvage pathway.
History
EC 1.13.11.53 created 2006
Pathway
Cysteine and methionine metabolism
Metabolic pathways
Orthology
K08967  
1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene dioxygenase
Genes
HSA: 
55256(ADI1)
PTR: 
743384(ADI1)
PPS: 
100973573(ADI1)
GGO: 
PON: 
100451787(ADI1)
MCC: 
MCF: 
102141197(ADI1)
MMU: 
104923(Adi1)
RNO: 
298934(Adi1)
CGE: 
HGL: 
101715211(Adi1)
TUP: 
CFA: 
100855962(ADI1)
AML: 
100465706(ADI1)
FCA: 
101097719(ADI1)
PTG: 
102966913(ADI1)
BTA: 
615764(ADI1)
BOM: 
102272056(ADI1)
PHD: 
102316835(ADI1)
CHX: 
102181302(ADI1)
SSC: 
100626434(ADI1)
CFR: 
102508869(ADI1)
BACU: 
LVE: 
ECB: 
100072837(ADI1)
MYB: 
102259900(ADI1)
MYD: 
102753209(ADI1)
PALE: 
MDO: 
100032300(ADI1)
SHR: 
100934309(ADI1)
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GGA: 
421918(ADI1)
MGP: 
100547720(ADI1)
TGU: 
100229689(ADI1)
FAB: 
101811709(ADI1)
PHI: 
102109414(ADI1)
APLA: 
101798237(ADI1)
FPG: 
101922892(ADI1)
FCH: 
102050788(ADI1)
CLV: 
102096012(ADI1)
ASN: 
102381843(ADI1)
AMJ: 
PSS: 
102449726(ADI1)
CMY: 
102939421(ADI1)
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PBI: 
103061729(ADI1)
XLA: 
734860(adi1)
XTR: 
448325(adi1)
DRE: 
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102364832(ADI1)
CMK: 
103185966(adi1)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
551839(GB19130)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CELE_F42F12.4(F42F12.4)
CBR: 
BMY: 
LOA: 
HMG: 
AQU: 
ATH: 
AT2G26400(ARD3) AT4G14710(ATARD2) AT4G14716(ARD1) AT5G43850(ARD4)
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
CSV: 
RCU: 
POP: 
POPTR_0008s15720g(POPTRDRAFT_720930) POPTR_0008s15730g(POPTRDRAFT_720244) POPTR_0010s09220g
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os03t0161800-01(Os03g0161800) Os04t0345800-00(Os04g0345800) Os10t0419400-01(Os10g0419400) Os10t0419500-01(Os10g0419500)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_01g046360(SORBIDRAFT_01g046360)
ZMA: 
SITA: 
ATR: 
s00002p00270670(AMTR_s00002p00270670) s00002p00270700(AMTR_s00002p00270700)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
SCE: 
YMR009W(ADI1)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
PPA: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0F00990(NCAS0F00990)
NDI: 
NDAI_0H01480(NDAI0H01480)
TPF: 
TPHA_0H02500(TPHA0H02500)
TBL: 
TBLA_0A04840(TBLA0A04840)
TDL: 
TDEL_0H03380(TDEL0H03380)
KAF: 
KAFR_0K00850(KAFR0K00850)
DHA: 
PIC: 
PGU: 
LEL: 
SPAA: 
CAL: 
CTP: 
CDU: 
COT: 
CTEN: 
YLI: 
CLU: 
NCR: 
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
CTHR: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
NHE: 
TRE: 
MAJ: 
CMT: 
VAL: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_192114(AO090701000107)
ANG: 
ANI_1_1156134(An15g00990)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
CPW: 
PBL: 
URE: 
ABE: 
TVE: 
AJE: 
PNO: 
PFJ: 
BCOM: 
TML: 
SPO: 
CNE: 
CNB: 
CGI: 
LBC: 
MPR: 
CCI: 
SCM: 
PGR: 
MBR: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
DFA_11400(adi1)
ACAN: 
TET: 
PTI: 
TPS: 
NGD: 
TBR: 
Tb927.4.360(Tb04.5D20.430)
TCR: 
LMA: 
LIF: 
LDO: 
LMI: 
LBZ: 
NGR: 
YPP: 
YPG: 
YPS: 
YPI: 
YPY: 
YPB: 
YEN: 
YE3231(mntD)
YEP: 
YEY: 
YSI: 
ECA: 
PCT: 
PCC: 
PWA: 
PEC: 
ETA: 
EPY: 
EPR: 
EAM: 
EAY: 
EBI: 
ERJ: 
SGL: 
SOD: 
ENT: 
ENC: 
ENO: 
ECLO: 
EEC: 
ENL: 
ESC: 
EAS: 
EAU: 
EAE: 
EAR: 
ENR: 
ESA: 
CSK: 
ES15_2796(mtnD)
CSZ: 
CSI: 
CTU: 
CTU_12360(mtnD)
KPN: 
KPU: 
KP1_1594(mtnD)
KPM: 
KPP: 
KPE: 
KPK_3931(mtnD)
KPO: 
KPR: 
KPR_3933(mtnD)
KPJ: 
KPI: 
KVA: 
KOX: 
KOE: 
CKO: 
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SRY: 
SRS: 
SRA: 
SMAF: 
SMW: 
SLQ: 
SFO: 
DDA: 
DDC: 
DDD: 
DZE: 
PAM: 
PANA_0873(mtnD)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_0208(mtnD)
PAQ: 
PVA: 
PAO: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
ROR: 
XFA: 
XFT: 
XFM: 
XFN: 
XFF: 
XCC: 
XCB: 
XCA: 
XCP: 
XCV: 
XAC: 
XCI: 
XAX: 
XAO: 
XOO: 
XOM: 
XOP: 
XOR: 
XAL: 
XFU: 
SML: 
SMT: 
BUJ: 
SMZ: 
SMD_1971(mtnD)
PSU: 
PSD: 
FAU: 
RHD: 
DJI: 
PAE: 
PAEV: 
N297_1730(mtnD)
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PAEU: 
PAEG: 
PAEC: 
M802_1727(mtnD)
PPU: 
PPF: 
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PPUU: 
PST: 
PSB: 
PSYR: 
PSP: 
PCI: 
PFL: 
PPRC: 
PFO: 
PFS: 
PFE: 
PFC: 
PPZ: 
PEN: 
PMY: 
PMK: 
PSA: 
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PBA: 
PFV: 
PDR: 
PRE: 
PSV: 
PSK: 
PMON: 
PMOT: 
PKC: 
PKB_1889(mtnD)
AVN: 
AVL: 
AVD: 
PSM: 
MAQ: 
MHC: 
MAD: 
MCA: 
MMT: 
MAH: 
NHL: 
NWA: 
TGR: 
HCH: 
ABO: 
ADI: 
TOL: 
TOR: 
AFE: 
AFR: 
ACU: 
AFI: 
AXO: 
AXN: 
DAC: 
DEL: 
RGE: 
RGE_20920(mtnD)
DSU: 
CCX: 
SUR: 
SCL: 
SCU: 
HOH: 
PLA: 
BBT: 
RPA: 
RPT: 
SCH: 
GOX: 
GOH: 
GBE: 
GBH: 
ACR: 
AMV: 
GDI: 
GDI_0586(mtnD)
GDJ: 
GXY: 
GXL: 
APT: 
APW: 
APF: 
APU: 
APG: 
APQ: 
APX: 
APZ: 
APK: 
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ABS: 
TMO: 
TMO_a0146(mtnD)
BSU: 
BSU13620(mtnD)
BSR: 
BSL: 
BSH: 
BSY: 
BSS: 
BST: 
BSO: 
BSN: 
BSQ: 
BSUB: 
BSX: 
C663_1403(mtnD)
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BL03542(mtnZ)
BLD: 
BLi01517(mtnD)
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BAMF_1443(mtnD)
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BAQ: 
BYA: 
BAMP: 
BAML: 
BAMA: 
RBAU_1318(mtnD)
BAMN: 
BASU_1297(mtnD)
BAMB: 
BAZ: 
BQL: 
LL3_01464(mtnD)
BXH: 
BQY: 
MUS_1443(mtnD)
BAMI: 
BAMC: 
BAMF: 
BAE: 
BAN: 
BAR: 
BAT: 
BAH: 
BAI: 
BAX: 
BANT: 
BANR: 
BAL: 
BCE: 
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BCZ: 
BCR: 
BCB: 
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BCQ: 
BCX: 
BNC: 
BCF: 
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BTL: 
BTB: 
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BTC: 
BTF: 
BTM: 
BTG: 
BTI: 
BTN: 
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BTHU: 
BWE: 
BTY: 
BPU: 
BPUM_1255(mtnZ)
BPF: 
BMQ: 
BMQ_1253(mtnD)
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BMD_1237(mtnD)
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GKA: 
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GTH: 
GTE: 
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GGH: 
GJF: 
AFL: 
ESI: 
EAT: 
EAN: 
Eab7_0402(mtnD)
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GYM: 
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PPM: 
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PPM_2690(ykrZ)
PPOL: 
PMS: 
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PMW: 
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TC41_0115(mtnD)
SAY: 
TPY_2542(mtnD)
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NFA: 
NBR: 
NNO: 
SMA: 
SCB: 
SCT: 
SCAT_3260(mtnD)
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AORI_2694(mtnD)
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SESP: 
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KAL: 
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LBL: 
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SYG: 
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CYP: 
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TER: 
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MIC: 
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GKIL_1170(mtnD)
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NPU: 
NOS: 
NOP: 
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NAZ: 
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CALO: 
CALT: 
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PMT: 
PMF: 
CTHE: 
PLP: 
SCS: 
HHY: 
SGN: 
SGRA_3041(mtnD)
FTE: 
AAE: 
HYA: 
HHO: 
HYS: 
HTH: 
HTE: 
SUL: 
SAF: 
PMX: 
LFC: 
LFI: 
MOX: 
DAMO_2927(mtnD)
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:8407993]
  Authors
Wray JW, Abeles RH.
  Title
A bacterial enzyme that catalyzes formation of carbon monoxide.
  Journal
J. Biol. Chem. 268 (1993) 21466-9.
  Organism
Klebsiella pneumoniae
  Sequence
[kpn:KPN_00643]
Reference
2  [PMID:7852397]
  Authors
Wray JW, Abeles RH.
  Title
The methionine salvage pathway in Klebsiella pneumoniae and rat liver. Identification and characterization of two novel dioxygenases.
  Journal
J. Biol. Chem. 270 (1995) 3147-53.
  Organism
Rattus norvegicus, Klebsiella pneumoniae
Reference
3  [PMID:2838472]
  Authors
Furfine ES, Abeles RH.
  Title
Intermediates in the conversion of 5'-S-methylthioadenosine to methionine in Klebsiella pneumoniae.
  Journal
J. Biol. Chem. 263 (1988) 9598-606.
  Organism
Klebsiella pneumoniae
Reference
4  [PMID:9880484]
  Authors
Dai Y, Wensink PC, Abeles RH.
  Title
One protein, two enzymes.
  Journal
J. Biol. Chem. 274 (1999) 1193-5.
  Organism
Klebsiella pneumoniae
  Sequence
[kpn:KPN_00643]
Reference
5  [PMID:10481280]
  Authors
Mo H, Dai Y, Pochapsky SS, Pochapsky TC.
  Title
1H, 13C and 15N NMR assignments for a carbon monoxide generating metalloenzyme from Klebsiella pneumoniae.
  Journal
J. Biomol. NMR. 14 (1999) 287-8.
  Organism
Klebsiella pneumoniae
Reference
6  [PMID:11371200]
  Authors
Dai Y, Pochapsky TC, Abeles RH.
  Title
Mechanistic studies of two dioxygenases in the methionine salvage pathway of Klebsiella pneumoniae.
  Journal
Biochemistry. 40 (2001) 6379-87.
  Organism
Klebsiella pneumoniae
  Sequence
[kpn:KPN_00643]
Reference
7  [PMID:12022880]
  Authors
Al-Mjeni F, Ju T, Pochapsky TC, Maroney MJ.
  Title
XAS investigation of the structure and function of Ni in acireductone dioxygenase.
  Journal
Biochemistry. 41 (2002) 6761-9.
  Organism
Klebsiella pneumoniae
Reference
8  [PMID:12402029]
  Authors
Pochapsky TC, Pochapsky SS, Ju T, Mo H, Al-Mjeni F, Maroney MJ.
  Title
Modeling and experiment yields the structure of acireductone dioxygenase from Klebsiella pneumoniae.
  Journal
Nat. Struct. Biol. 9 (2002) 966-72.
  Organism
Klebsiella pneumoniae
  Sequence
[kpn:KPN_00643]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 

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