KEGG   ENZYME: 1.14.99.46Help
Entry
EC 1.14.99.46               Enzyme                                 

Name
pyrimidine oxygenase;
RutA
Class
Oxidoreductases;
Acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen;
Miscellaneous
BRITE hierarchy
Sysname
uracil,FMNH2:oxygen oxidoreductase (uracil hydroxylating, ring-opening)
Reaction(IUBMB)
(1) uracil + FMNH2 + O2 = (Z)-3-ureidoacrylate peracid + FMN [RN:R09936];
(2) thymine + FMNH2 + O2 = (Z)-2-methylureidoacrylate peracid + FMN [RN:R09937]
Reaction(KEGG)
Substrate
uracil [CPD:C00106];
FMNH2 [CPD:C01847];
O2 [CPD:C00007];
thymine [CPD:C00178]
Product
(Z)-3-ureidoacrylate peracid [CPD:C20231];
FMN [CPD:C00061];
(Z)-2-methylureidoacrylate peracid [CPD:C20232]
Comment
In vitro the product (Z)-3-ureidoacrylate peracid is spontaneously reduced to ureidoacrylate [1,2]. Part of the Rut pyrimidine catabolic pathway.
History
EC 1.14.99.46 created 2012
Pathway
Pyrimidine metabolism
Metabolic pathways
Orthology
K09018  
pyrimidine oxygenase
Genes
ECO: 
b1012(rutA)
ECJ: 
JW0997(ycdM)
ECD: 
EBW: 
BWG_0866(rutA)
ECOK: 
ECE: 
ECS: 
ECF: 
ETW: 
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
CE10_1090(rutA)
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
ECB_01015(ycdM)
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ECW_m1122(rutA)
ELL: 
WFL_05475(rutA)
ELC: 
ELD: 
ELP: 
EBL: 
ECD_01015(ycdM)
EBE: 
B21_01022(rutA)
ELF: 
LF82_2049(rutA)
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
ECOS: 
SFL: 
SFX: 
SFV: 
SFE: 
SFxv_1101(rutA)
SFN: 
SFS: 
SFT: 
SSJ: 
SBO: 
SBC: 
SDY: 
SDZ: 
SHQ: 
ENT: 
ENC: 
ECL_02622(rutA)
ENO: 
EEC: 
ENL: 
ECLG: 
ECLE: 
ECLN: 
ECLI: 
ECLX: 
ECLY: 
ECLZ: 
ECLA: 
ECLC: 
EAS: 
EAU: 
ENX: 
ENF: 
ESA: 
CSK: 
ES15_2461(rutA)
CSZ: 
CSI: 
CSJ: 
CCON: 
CDM: 
CMJ: 
CUI: 
CMW: 
CTU: 
CTU_15930(rutA)
KPN: 
KPN_01038(ycdM)
KPU: 
KP1_2027(ycdM)
KPM: 
KPP: 
KPK: 
KPH: 
KPZ: 
KPV: 
KPW: 
KPY: 
KPG: 
KPC: 
KPQ: 
KPT: 
KPE: 
KPO: 
KPR: 
KPR_3485(rutA)
KPJ: 
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KPX: 
KPB: 
KPNE: 
KPNU: 
KVA: 
KVD: 
KVQ: 
KOX: 
KOE: 
KOY: 
KOK: 
KOC: 
KOM: 
KQU: 
EAE: 
EAR: 
ROR: 
RON: 
PGE: 
KOR: 
KIN: 
LAX: 
PSTS: 
YEN: 
YE1950(ssuD)
YEP: 
YEY: 
YEW: 
CH47_1382(rutA)
YET: 
CH48_3374(rutA)
YEF: 
YEE: 
YAK: 
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SRY: 
SRS: 
SRA: 
SLQ: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
EBI: 
EGE: 
PAM: 
PANA_4033(ycdM)
PLF: 
PAJ: 
PAJ_p0253(ycdM)
PAQ: 
PVA: 
Pvag_0805(ycdM)
PAO: 
KLN: 
PANT: 
PANP: 
PAGG: 
PLU: 
PAY: 
PTT: 
XBO: 
XBV: 
PST: 
PSB: 
PSYR: 
PSP: 
PSA: 
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSTU: 
PSTT: 
PRH: 
PSES: 
ACC: 
ACI: 
AEI: 
AJO: 
ACW: 
MOS: 
MSR: 
MPQ: 
AMC: 
AMH: 
AMAA: 
AMAL: 
AMAE: 
AMAO: 
AMAD: 
AMAI: 
AMAG: 
AMAC: 
AMG: 
AAL: 
AAUS: 
GPS: 
HAA: 
MME: 
VAP: 
VPD: 
HOH: 
PLA: 
ATU: 
Atu2500(rutA)
ARA: 
ATF: 
ATA: 
AVI: 
AGR: 
AGC: 
RIR: 
BBT: 
BBta_1128(ycdM)
MEX: 
MEA: 
MDI: 
MCH: 
MRD: 
MPO: 
MOR: 
MOC_1964(rutA)
META: 
MAQU: 
CCR: 
CCS: 
CAK: 
CSE: 
CHQ: 
KVU: 
KVL: 
CID: 
YAN: 
HNE: 
HBA: 
NPP: 
NPN: 
NRE: 
SWI: 
SPHI: 
SSAN: 
SPHR: 
AAY: 
WYH_00064(rutA)
TAP: 
NNO: 
RAV: 
CART: 
SKE: 
NDA: 
KRA: 
PDX: 
PSEA: 
PSEE: 
PSEQ: 
PECQ: 
AMI: 
ACTN: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:20369853]
  Authors
Mukherjee T, Zhang Y, Abdelwahed S, Ealick SE, Begley TP
  Title
Catalysis of a flavoenzyme-mediated amide hydrolysis.
  Journal
J. Am. Chem. Soc. 132 (2010) 5550-1.
  Sequence
[eco:b1012]
Reference
2  [PMID:20400551]
  Authors
Kim KS, Pelton JG, Inwood WB, Andersen U, Kustu S, Wemmer DE
  Title
The Rut pathway for pyrimidine degradation: novel chemistry and toxicity problems.
  Journal
J. Bacteriol. 192 (2010) 4089-102.
  Sequence
[eco:b1012]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 

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