KEGG   ENZYME: 2.5.1.21Help
Entry
EC 2.5.1.21                 Enzyme                                 

Name
squalene synthase;
farnesyltransferase;
presqualene-diphosphate synthase;
presqualene synthase;
squalene synthetase;
farnesyl-diphosphate farnesyltransferase;
SQS
Class
Transferases;
Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups;
Transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (only sub-subclass identified to date)
BRITE hierarchy
Sysname
(2E,6E)-farnesyl-diphosphate:(2E,6E)-farnesyl-diphosphate farnesyltransferase
Reaction(IUBMB)
2 (2E,6E)-farnesyl diphosphate + NAD(P)H + H+ = squalene + 2 diphosphate + NAD(P)+ (overall reaction) [RN:R06223];
(1a) 2 (2E,6E)-farnesyl diphosphate = diphosphate + presqualene diphosphate [RN:R00702];
(1b) presqualene diphosphate + NAD(P)H + H+ = squalene + diphosphate + NAD(P)+ [RN:R02872]
Reaction(KEGG)
Substrate
(2E,6E)-farnesyl diphosphate [CPD:C00448];
NADH [CPD:C00004];
NADPH [CPD:C00005];
H+ [CPD:C00080];
presqualene diphosphate [CPD:C03428]
Product
squalene [CPD:C00751];
diphosphate [CPD:C00013];
NAD+ [CPD:C00003];
NADP+ [CPD:C00006];
presqualene diphosphate [CPD:C03428]
Comment
This microsomal enzyme catalyses the first committed step in the biosynthesis of sterols. The enzyme from yeast requires either Mg2+ or Mn2+ for activity. In the absence of NAD(P)H, presqualene diphosphate (PSPP) is accumulated. When NAD(P)H is present, presqualene diphosphate does not dissociate from the enzyme during the synthesis of squalene from farnesyl diphosphate (FPP) [8]. High concentrations of FPP inhibit the production of squalene but not of PSPP [8].
History
EC 2.5.1.21 created 1976, modified 2005, modified 2012
Pathway
Steroid biosynthesis
Sesquiterpenoid and triterpenoid biosynthesis
Metabolic pathways
Biosynthesis of secondary metabolites
Orthology
K00801  
farnesyl-diphosphate farnesyltransferase
Genes
HSA: 
2222(FDFT1)
PTR: 
740684(FDFT1)
PPS: 
100987932(FDFT1)
GGO: 
101151217(FDFT1)
PON: 
100173463(FDFT1)
MCC: 
696396(FDFT1)
MCF: 
102131949(FDFT1)
MMU: 
14137(Fdft1)
RNO: 
29580(Fdft1)
CGE: 
100689192(Fdft1)
HGL: 
101709374(Fdft1)
TUP: 
102482751(FDFT1)
CFA: 
477362(FDFT1)
AML: 
100479603(FDFT1)
FCA: 
101084620(FDFT1)
PTG: 
102968349(FDFT1)
BTA: 
281767(FDFT1)
BOM: 
102284633(FDFT1)
PHD: 
102318836(FDFT1)
CHX: 
102173564(FDFT1)
SSC: 
100312971(FDFT1)
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102519424(FDFT1)
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102999512(FDFT1)
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103090735(FDFT1)
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102883195(FDFT1)
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100029000(FDFT1)
SHR: 
100920775(FDFT1)
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100082427(FDFT1)
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422038(FDFT1)
MGP: 
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101815980(FDFT1)
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FCH: 
102049604(FDFT1)
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102084937(FDFT1)
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103051265(FDFT1)
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100216201(fdft1)
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571911(fdft1)
TRU: 
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102352076(FDFT1)
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103171628(fdft1)
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586013(fdft1)
TAD: 
AQU: 
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POPTR_0004s16830g(POPTRDRAFT_818128) POPTR_0009s12590g(POPTRDRAFT_833037)
VVI: 
SLY: 
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SORBI_01g004550(SORBIDRAFT_01g004550)
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s00003p00232080(AMTR_s00003p00232080)
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PPP: 
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VCN: 
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YHR190W(ERG9)
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KAFR_0L01990(KAFR0L01990)
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AOR_1_362024(AO090010000204)
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ANI_1_256104(An12g01890)
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Tb927.8.7120(Tb08.10K10.670)
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MCA0813(sqs)
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HAH: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:3805037]
  Authors
Kuswik-Rabiega G, Rilling HC.
  Title
Squalene synthetase. Solubilization and partial purification of squalene synthetase, copurification of presqualene pyrophosphate and squalene synthetase activities.
  Journal
J. Biol. Chem. 262 (1987) 1505-9.
  Organism
Saccharomyces cerevisiae
Reference
2  [PMID:1527001]
  Authors
Ericsson J, Appelkvist EL, Thelin A, Chojnacki T, Dallner G.
  Title
Isoprenoid biosynthesis in rat liver peroxisomes. Characterization of cis-prenyltransferase and squalene synthetase.
  Journal
J. Biol. Chem. 267 (1992) 18708-14.
  Organism
Rattus norvegicus
Reference
3  [PMID:11111077]
  Authors
Tansey TR, Shechter I.
  Title
Structure and regulation of mammalian squalene synthase.
  Journal
Biochim. Biophys. Acta. 1529 (2000) 49-62.
  Organism
Rattus norvegicus, Homo sapiens, Arabidopsis thaliana, Saccharomyces cerevisiae, Neurospora crassa
Reference
4  [PMID:8239656]
  Authors
LoGrasso PV, Soltis DA, Boettcher BR.
  Title
Overexpression, purification, and kinetic characterization of a carboxyl-terminal-truncated yeast squalene synthetase.
  Journal
Arch. Biochem. Biophys. 307 (1993) 193-9.
  Organism
Saccharomyces cerevisiae
Reference
5  [PMID:1569107]
  Authors
Shechter I, Klinger E, Rucker ML, Engstrom RG, Spirito JA, Islam MA, Boettcher BR, Weinstein DB.
  Title
Solubilization, purification, and characterization of a truncated form of rat hepatic squalene synthetase.
  Journal
J. Biol. Chem. 267 (1992) 8628-35.
  Organism
Rattus norvegicus
  Sequence
[rno:29580]
Reference
6  [PMID:26684]
  Authors
Agnew WS, Popjak G.
  Title
Squalene synthetase. Stoichiometry and kinetics of presqualene pyrophosphate and squalene synthesis by yeast microsomes.
  Journal
J. Biol. Chem. 253 (1978) 4566-73.
  Organism
Homo sapiens
Reference
7  [PMID:10896663]
  Authors
Pandit J, Danley DE, Schulte GK, Mazzalupo S, Pauly TA, Hayward CM, Hamanaka ES, Thompson JF, Harwood HJ Jr.
  Title
Crystal structure of human squalene synthase. A key enzyme in cholesterol biosynthesis.
  Journal
J. Biol. Chem. 275 (2000) 30610-7.
  Organism
Homo sapiens
  Sequence
[hsa:2222]
Reference
8  [PMID:10677224]
  Authors
Radisky ES, Poulter CD.
  Title
Squalene synthase: steady-state, pre-steady-state, and isotope-trapping studies.
  Journal
Biochemistry. 39 (2000) 1748-60.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
9077-14-9

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