KEGG   ENZYME: 3.1.13.4Help
Entry
EC 3.1.13.4                 Enzyme                                 

Name
poly(A)-specific ribonuclease;
3'-exoribonuclease;
2',3'-exoribonuclease
Class
Hydrolases;
Acting on ester bonds;
Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
BRITE hierarchy
Reaction(IUBMB)
Exonucleolytic cleavage of poly(A) to 5'-AMP
Comment
Cleaves poly(A) in either the single- or double-stranded form.
History
EC 3.1.13.4 created 1984
Orthology
K01148  
poly(A)-specific ribonuclease
K12571  
PAB-dependent poly(A)-specific ribonuclease subunit 2
K12603  
CCR4-NOT transcription complex subunit 6
K18764  
nocturnin
K19612  
2',5'-phosphodiesterase
Genes
HSA: 
201626(PDE12) 246175(CNOT6L) 25819(NOCT) 5073(PARN) 57472(CNOT6) 9924(PAN2)
PTR: 
100611804(NOCT) 101057768(PAN2) 453936(PARN) 461027(PDE12) 462338(CNOT6) 467690(CNOT6L)
PPS: 
100971742(PAN2) 100979611(NOCT) 100986002(PARN) 100986322(CNOT6L) 100991206(CNOT6) 100993820(PDE12)
GGO: 
101124170(PDE12) 101124672 101130011(CNOT6) 101132161(CNOT6L) 101133256(NOCT) 101144172(PAN2) 101150804(PARN)
PON: 
100171660(CNOT6L) 100172259(PARN) 100439178(PDE12) 100449251(NOCT) 100454964(PAN2)
NLE: 
100582571(CNOT6) 100585062(PAN2) 100591529(NOCT) 100598246(PARN) 100600767(PDE12) 100606122(CNOT6L)
MCC: 
100428993(NOCT) 697981(CNOT6L) 703552(PDE12) 712478(PAN2) 712984(PARN) 716286(CNOT6)
MCF: 
101864913(PAN2) 102119460(PARN) 102121928(CNOT6) 102122150(CNOT6L) 102128118(PDE12) 102134207(NOCT)
CSAB: 
103227798(PDE12) 103228729(PARN) 103235851(CNOT6L) 103236274(NOCT) 103238524(PAN2) 103245122(CNOT6)
RRO: 
104654345(NOCT) 104660182(PDE12) 104664873(PARN) 104670120 104671527(CNOT6) 104673678(PAN2) 104679096(CNOT6L)
CJC: 
100390585(CNOT6L) 100393251(NOCT) 100394289(PARN) 100403371(PDE12) 100413819(PAN2) 100414347(CNOT6)
SBQ: 
101030297(CCRN4L) 101032438(PDE12) 101032829(CNOT6) 101034063(PAN2) 101034109(PARN) 101035015(CNOT6L)
MMU: 
103135(Pan2) 104625(Cnot6) 12457(Noct) 211948(Pde12) 231464(Cnot6l) 74108(Parn)
RNO: 
287249(Cnot6) 306231(Pde12) 310395(Noct) 360464(Parn) 360917(Cnot6l) 408200(Pan2)
CGE: 
100764369(Cnot6) 100765354(Pan2) 100766002(Noct) 100769630(Pde12) 100769928(Cnot6l) 100771839(Parn) 103164067
NGI: 
103731559(Parn) 103742363(Noct) 103742612(Cnot6l) 103746518(Pan2) 103747003(Pde12) 103749363(Cnot6)
HGL: 
101700106(Cnot6) 101708269(Pan2) 101708643(Cnot6l) 101710110(Noct) 101710298(Pde12) 101715275(Parn)
OCU: 
100343097(CNOT6) 100348337(NOCT) 100350183(CNOT6L) 100351489(PARN) 100351819(PAN2) 100353603(PDE12)
TUP: 
CFA: 
474404(PAN2) 479839(PARN) 481463(CNOT6) 483818(NOCT) 484714(PDE12) 487817(CNOT6L)
AML: 
100469832(PARN) 100471669(PAN2) 100472917(NOCT) 100474935(CNOT6L) 100478261(CNOT6) 100480045(PDE12)
UMR: 
103656142(PAN2) 103657961(NOCT) 103665339(CNOT6L) 103668616(PARN) 103674274(PDE12) 103679993(CNOT6)
FCA: 
101084253(CNOT6) 101092681(NOCT) 101096648(CNOT6L) 101097626(PDE12) 101098726(PAN2) 101100021(PARN)
PTG: 
102952677(CNOT6L) 102959344(PARN) 102961768(CNOT6) 102964343(PDE12) 102965630(NOCT) 102967975(PAN2)
AJU: 
106967038(PDE12) 106969943(CNOT6) 106970567(PARN) 106976192(NOCT) 106976919(CNOT6L) 106986877(PAN2)
BTA: 
107131294 518225(CNOT6L) 524155(PARN) 534707(CNOT6) 538820(PAN2) 538860(PDE12) 540641(NOCT)
BOM: 
102265471(PDE12) 102266193(CNOT6) 102279918(NOCT) 102279992(CNOT6L) 102285191(PAN2) 102287848(PARN) 106701477
PHD: 
102314991(PARN) 102318973(PAN2) 102323224(CNOT6L) 102325735(CNOT6) 102335450(NOCT) 102344651(PDE12)
CHX: 
102168671(PDE12) 102169374(CNOT6) 102171479(PARN) 102187886(NOCT) 102190587(PAN2) 102191783(CNOT6L)
OAS: 
101108473(PAN2) 101108694(PDE12) 101111369(CNOT6L) 101112185(PARN) 101117790(NOCT) 101120323(CNOT6)
SSC: 
100153107(PAN2) 100157651(PDE12) 100512848(CNOT6L) 100513746(NOCT) 100515887(PARN) 100516183(CNOT6)
CFR: 
102505226(CNOT6) 102505693(PARN) 102510361(PAN2) 102516199(PDE12) 102520991(CNOT6L) 102524312(NOCT)
BACU: 
103001925(PAN2) 103003260(NOCT) 103005398(CNOT6) 103006131(CNOT6L) 103013320(PDE12) 103017586(PARN)
LVE: 
ECB: 
100050655(PARN) 100052396(PAN2) 100057912(CNOT6) 100058532(PDE12) 100059049(CNOT6L) 100071468(NOCT)
MYB: 
102239430(PAN2) 102241344(PDE12) 102243649(PARN) 102260842(NOCT) 102261756(CNOT6) 102263967(CNOT6L)
MYD: 
102753760(PARN) 102756082(CNOT6) 102759031(NOCT) 102759558 102760982(CNOT6L) 102765099(PAN2) 102773866(PDE12)
HAI: 
109374695(CNOT6L) 109388249(PDE12) 109392776(CNOT6) 109394194(NOCT) 109395237(PARN) 109396893(PAN2)
PALE: 
102878811(PAN2) 102883027(NOCT) 102887098(PDE12) 102890026(CNOT6) 102891690(PARN) 102898411(CNOT6L)
LAV: 
100654816(PARN) 100655410(CNOT6) 100656862(PDE12) 100659725(CNOT6L) 100672293(PAN2) 100677271(NOCT)
MDO: 
100009944(CNOT6L) 100013783(PDE12) 100024540(PARN) 100027658(NOCT) 100032045(CNOT6)
SHR: 
100915402(PARN) 100917730(CNOT6) 100924852(CNOT6L) 100930989(NOCT) 100932645(PAN2)
OAA: 
100074018(CNOT6) 100074145(PARN) 100075507(CNOT6L) 100078856(NOCT) 100080200(PDE12) 100083102(PAN2) 100086173
GGA: 
107054443(PDE12) 404779(NOCT) 416293(CNOT6) 416423(PARN) 422508(CNOT6L) 429172(PAN2)
MGP: 
100539601(CNOT6L) 100540861(CNOT6) 100541487(PAN2) 100541508(NOCT) 100544728(PARN) 100548354(PDE12)
CJO: 
107313121(NOCT) 107313176(CNOT6L) 107319772(PDE12) 107320180(CNOT6) 107320526(PARN) 107325844(PAN2)
APLA: 
101793853(PARN) 101795614(PDE12) 101797379(NOCT) 101798399(CNOT6) 101798647(PAN2) 101800648(CNOT6L)
TGU: 
100218557(CNOT6L) 100219669(PARN) 100230698(PDE12) 100231015(CNOT6) 100231561(NOCT) 100232571
GFR: 
102032644(PAN2) 102038115(PDE12) 102040001(NOCT) 102040201(PARN) 102043885(CNOT6) 102044826(CNOT6L)
FAB: 
101806807(NOCT) 101816393(PARN) 101817075(CNOT6L) 101818862(PDE12) 101820084(CNOT6) 101821635(PAN2)
PHI: 
102099780(PAN2) 102100419(PARN) 102100975(NOCT) 102101089(PDE12) 102103701(CNOT6L) 102107484(CNOT6)
CCW: 
104683465(PDE12) 104684717(PARN) 104685328(PAN2) 104689593(CNOT6) 104696810(CNOT6L) 104697280(NOCT)
FPG: 
101912915(PAN2) 101912941(CNOT6L) 101913740(PARN) 101915300(PDE12) 101917647(NOCT) 101920906(CNOT6)
FCH: 
102049107(CNOT6L) 102053174(NOCT) 102055230(PDE12) 102055496(CNOT6) 102055535(PAN2) 102055624(PARN)
CLV: 
102085441(PAN2) 102086728(PARN) 102087895(PDE12) 102088785(NOCT) 102091681(CNOT6) 102092282(CNOT6L)
AAM: 
106482113(PAN2) 106482599(PARN) 106491891(NOCT) 106492108(CNOT6L) 106493462(CNOT6) 106497556(PDE12)
ASN: 
102369135(CNOT6L) 102369243(PAN2) 102370098(PDE12) 102373172(NOCT) 102375620(CNOT6) 102379982(PARN)
AMJ: 
102558230(CNOT6) 102562455(PARN) 102567362(NOCT) 102568939(PAN2) 102574717(PDE12) 106737139(CNOT6L)
PSS: 
102451508(NOCT) 102454438(CNOT6) 102456233(PDE12) 102457145(PAN2) 102459670(PARN) 102460953(CNOT6L)
CMY: 
102932157(PAN2) 102934548(PARN) 102937437(CNOT6L) 102937802(PDE12) 102939146(NOCT) 102943090(CNOT6)
CPIC: 
101936301(NOCT) 101938970(PAN2) 101940954(CNOT6L) 101945694(PARN) 101950945(PDE12) 101951072(CNOT6)
ACS: 
100556448(cnot6l) 100556517(noct) 100560566(pan2) 100560800(parn) 100564841(pde12) 100565621(cnot6)
PBI: 
103052772(PARN) 103058940(NOCT) 103060122(CNOT6) 103061339(PDE12) 103064231(CNOT6L) 103065550(PAN2)
GJA: 
107106849(PDE12) 107109308(PARN) 107110787(NOCT) 107118872(CNOT6L) 107123713(CNOT6) 107126202(PAN2)
XLA: 
100036851(pan2.L) 100505426(cnot6) 108703108(parn.S) 378568(noct.L) 394409(parn.L) 432104(cnot6l.L) 443670(pde12.S) 444430(pan2.S) 495050(cnot6l.S) 734309(noct.S) 779198
XTR: 
100145505(cnot6l) 100145682(pan2) 549285(noct) 733861(parn)
DRE: 
324048(cnot6a) 553665(cnot6l) 560386(cnot6b) 568973(noctb) 572044(nocta) 692319(pde12) 791461(parn) 792831(pan2)
IPU: 
TRU: 
TNG: 
LCO: 
104919919(pan2) 104921157(parn) 104922934(noct) 104927070(cnot6) 104935033(cnot6l) 104938899(Nocturnin) 104940303(pde12) 109136939
MZE: 
OLA: 
XMA: 
SASA: 
LCM: 
102349012(NOCT) 102349497(PAN2) 102350014(CNOT6L) 102354686 102359649(PARN) 102362770(PDE12)
CMK: 
103172817 103180886(cnot6l) 103181305(noct) 103183734(cnot6) 103187090(parn) 103190124(pde12) 103191017(pan2)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
SKO: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
Dsimw501_GD18310(Dsim_GD18310) Dsimw501_GD26876(Dsim_GD26876) Dsimw501_GD27922(Dsim_GD27922) Dsimw501_GD28899(Dsim_GD28899)
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
MDE: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
408626(GB12931) 412552(twin) 724505 725486(GB12823)
BIM: 
BTER: 
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AEC: 
HST: 
CFO: 
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BMOR: 
DPL: 
PXY: 
API: 
PHU: 
DPX: 
ISC: 
CEL: 
CELE_F31E3.4(panl-2) CELE_R17.2(pde-12) CELE_ZC518.3(ccr-4)
CBR: 
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SMM: 
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HMG: 
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FVE: 
PPER: 
PMUM: 
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CMO: 
RCU: 
JCU: 
POP: 
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Reference
1  [PMID:6246077]
  Authors
Schroder HC, Zahn RK, Dose K, Muller WE.
  Title
Purification and characterization of a poly(A)-specific exoribonuclease from calf thymus.
  Journal
J. Biol. Chem. 255 (1980) 4535-8.
Other DBs
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CAS: 
110541-21-4

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