KEGG   ENZYME: 3.1.13.4Help
Entry
EC 3.1.13.4                 Enzyme                                 

Name
poly(A)-specific ribonuclease;
3'-exoribonuclease;
2',3'-exoribonuclease
Class
Hydrolases;
Acting on ester bonds;
Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
BRITE hierarchy
Reaction(IUBMB)
Exonucleolytic cleavage of poly(A) to 5'-AMP
Comment
Cleaves poly(A) in either the single- or double-stranded form.
History
EC 3.1.13.4 created 1984
Orthology
K01148  poly(A)-specific ribonuclease
K12571  PAB-dependent poly(A)-specific ribonuclease subunit 2
K12603  CCR4-NOT transcription complex subunit 6
K18764  nocturnin
K19612  2',5'-phosphodiesterase
Genes
HSA: 154197(PNLDC1) 201626(PDE12) 246175(CNOT6L) 25819(NOCT) 5073(PARN) 57472(CNOT6) 9924(PAN2)
PTR: 100611804(NOCT) 101057768(PAN2) 453936(PARN) 461027(PDE12) 462338(CNOT6) 463111(PNLDC1) 467690(CNOT6L)
PPS: 100971742(PAN2) 100979611(NOCT) 100986002(PARN) 100986322(CNOT6L) 100991206(CNOT6) 100992111(PNLDC1) 100993820(PDE12)
GGO: 101124170(PDE12) 101124672 101130011(CNOT6) 101132161(CNOT6L) 101133256(NOCT) 101144172(PAN2) 101146526(PNLDC1) 101150804(PARN)
PON: 100171660(CNOT6L) 100172259(PARN) 100173475(PNLDC1) 100439178(PDE12) 100449251(NOCT) 100454964(PAN2) 100460246(CNOT6)
NLE: 100582571(CNOT6) 100585062(PAN2) 100586640(PNLDC1) 100591529(NOCT) 100598246(PARN) 100600767(PDE12) 100606122(CNOT6L)
MCC: 100428993(NOCT) 697981(CNOT6L) 703552(PDE12) 707835(PNLDC1) 712478(PAN2) 712984(PARN) 716286(CNOT6)
MCF: 101864913(PAN2) 102118442(PNLDC1) 102119460(PARN) 102121928(CNOT6) 102122150(CNOT6L) 102128118(PDE12) 102134207(NOCT)
CSAB: 103227798(PDE12) 103228729(PARN) 103235851(CNOT6L) 103236274(NOCT) 103238524(PAN2) 103240827(PNLDC1) 103245122(CNOT6)
RRO: 104654345(NOCT) 104660182(PDE12) 104664873(PARN) 104666420(PNLDC1) 104670120 104671527(CNOT6) 104673678(PAN2) 104679096(CNOT6L)
RBB: 108514171(CNOT6) 108516017(PAN2) 108516170(PNLDC1) 108523758(PARN) 108532506(CNOT6L) 108536941(NOCT) 108543590(PDE12)
CJC: 100388797(PNLDC1) 100390585(CNOT6L) 100393251(NOCT) 100394289(PARN) 100403371(PDE12) 100413819(PAN2) 100414347(CNOT6)
SBQ: 101030297(CCRN4L) 101032438(PDE12) 101032829(CNOT6) 101034063(PAN2) 101034109(PARN) 101035015(CNOT6L) 101052910(PNLDC1)
MMU: 103135(Pan2) 104625(Cnot6) 12457(Noct) 211948(Pde12) 231464(Cnot6l) 240023(Pnldc1) 74108(Parn)
RNO: 287249(Cnot6) 306231(Pde12) 310395(Noct) 360464(Parn) 360917(Cnot6l) 361478(Pnldc1) 408200(Pan2)
CGE: 100762328(Pnldc1) 100764369(Cnot6) 100765354(Pan2) 100766002(Noct) 100769630(Pde12) 100769928(Cnot6l) 100771839(Parn) 103164067
NGI: 103731559(Parn) 103734800(Pnldc1) 103742363(Noct) 103742612(Cnot6l) 103746518(Pan2) 103747003(Pde12) 103749363(Cnot6)
HGL: 101700106(Cnot6) 101708269(Pan2) 101708643(Cnot6l) 101709845(Pnldc1) 101710110(Noct) 101710298(Pde12) 101715275(Parn)
CCAN: 109682986(Pnldc1) 109683130(Pde12) 109686121(Pan2) 109686724(Cnot6) 109691470(Noct) 109693547 109694360(Parn) 109694687 109700800(Cnot6l)
OCU: 100343097(CNOT6) 100348337(NOCT) 100350183(CNOT6L) 100351489(PARN) 100351819(PAN2) 100353603(PDE12) 100357330(PNLDC1)
CFA: 474404(PAN2) 479839(PARN) 481463(CNOT6) 483818(NOCT) 484065(PNLDC1) 484714(PDE12) 487817(CNOT6L)
AML: 100469832(PARN) 100471669(PAN2) 100472917(NOCT) 100474935(CNOT6L) 100478261(CNOT6) 100478756(PNLDC1) 100480045(PDE12)
UMR: 103656142(PAN2) 103657961(NOCT) 103660901(PNLDC1) 103665339(CNOT6L) 103668616(PARN) 103674274(PDE12) 103679993(CNOT6)
ORO: 101365311(CCRN4L) 101367547(PAN2) 101370054(PARN) 101370394(CNOT6L) 101375417(CNOT6) 101380930(PDE12) 101382142(PNLDC1)
FCA: 101084253(CNOT6) 101092681(NOCT) 101096648(CNOT6L) 101097241(PNLDC1) 101097626(PDE12) 101098726(PAN2) 101100021(PARN)
PTG: 102950961(PNLDC1) 102952677(CNOT6L) 102959344(PARN) 102961768(CNOT6) 102964343(PDE12) 102965630(NOCT) 102967975(PAN2)
AJU: 106965974(PNLDC1) 106967038(PDE12) 106969943(CNOT6) 106970567(PARN) 106976192(NOCT) 106976919(CNOT6L) 106986877(PAN2)
BTA: 107131294 518225(CNOT6L) 524155(PARN) 534707(CNOT6) 538820(PAN2) 538860(PDE12) 540641(NOCT) 615807(PNLDC1)
BOM: 102265471(PDE12) 102266193(CNOT6) 102279918(NOCT) 102279992(CNOT6L) 102283407(PNLDC1) 102285191(PAN2) 102287848(PARN) 106701477
BIU: 109559360(PAN2) 109560613(CNOT6L) 109561328(CNOT6) 109563599(PNLDC1) 109571342(NOCT) 109575960(PDE12) 109578580(PARN)
PHD: 102314991(PARN) 102318973(PAN2) 102323224(CNOT6L) 102325735(CNOT6) 102327831(PNLDC1) 102335450(NOCT) 102344651(PDE12)
CHX: 102168671(PDE12) 102169374(CNOT6) 102171479(PARN) 102183329(PNLDC1) 102187886(NOCT) 102190587(PAN2) 102191783(CNOT6L)
OAS: 101108473(PAN2) 101108694(PDE12) 101111369(CNOT6L) 101111555(PNLDC1) 101112185(PARN) 101117790(NOCT) 101120323(CNOT6)
SSC: 100152694(PNLDC1) 100153107(PAN2) 100157651(PDE12) 100512848(CNOT6L) 100513746(NOCT) 100515887(PARN) 100516183(CNOT6)
CFR: 102505226(CNOT6) 102505693(PARN) 102510361(PAN2) 102510511(PNLDC1) 102516199(PDE12) 102520991(CNOT6L) 102524312(NOCT)
CDK: 105086363(PAN2) 105087080(NOCT) 105089796(PDE12) 105091385(PARN) 105091691(CNOT6L) 105100384(PNLDC1) 105100623(CNOT6)
BACU: 103001925(PAN2) 103003260(NOCT) 103005398(CNOT6) 103006131(CNOT6L) 103009247(PNLDC1) 103013320(PDE12) 103017586(PARN)
LVE: 103069542(CNOT6L) 103072303(NOCT) 103074639(CNOT6) 103076055(PARN) 103076640(PNLDC1) 103082456(PAN2) 103085961 103087893
OOR: 101282088(PAN2) 101283045(CCRN4L) 101283574(PDE12) 101285116(CNOT6L) 101285176(PARN) 101286303(PNLDC1) 101288361(CNOT6)
ECB: 100050655(PARN) 100052396(PAN2) 100057912(CNOT6) 100058532(PDE12) 100058786(PNLDC1) 100059049(CNOT6L) 100071468(NOCT)
EPZ: 103545209 103549003(NOCT) 103549482(CNOT6L) 103551167(PARN) 103557550(PAN2) 103558455(PNLDC1) 103566204(CNOT6) 103567684(PDE12)
EAI: 106832953(PAN2) 106837991(NOCT) 106842041(PNLDC1) 106843728(CNOT6) 106846336(CNOT6L) 106847167(PARN) 106848663(PDE12)
MYB: 102239430(PAN2) 102241344(PDE12) 102243649(PARN) 102260842(NOCT) 102261756(CNOT6) 102262108(PNLDC1) 102263967(CNOT6L)
MYD: 102753760(PARN) 102756082(CNOT6) 102756543(PNLDC1) 102759031(NOCT) 102759558 102760982(CNOT6L) 102765099(PAN2) 102773866(PDE12)
HAI: 109374695(CNOT6L) 109388249(PDE12) 109392776(CNOT6) 109394002(PNLDC1) 109394194(NOCT) 109395237(PARN) 109396893(PAN2)
RSS: 109433865(PARN) 109437632(CNOT6) 109440079(CNOT6L) 109443604(PDE12) 109446942(NOCT) 109452983(PAN2) 109457042(PNLDC1)
PALE: 102878811(PAN2) 102883027(NOCT) 102887098(PDE12) 102887262(PNLDC1) 102890026(CNOT6) 102891690(PARN) 102898411(CNOT6L)
LAV: 100654816(PARN) 100655410(CNOT6) 100656862(PDE12) 100659725(CNOT6L) 100663740(PNLDC1) 100672293(PAN2) 100677271(NOCT)
MDO: 100009944(CNOT6L) 100013783(PDE12) 100024540(PARN) 100027658(NOCT) 100032045(CNOT6) 100032453(PNLDC1)
SHR: 100915402(PARN) 100917730(CNOT6) 100924852(CNOT6L) 100925885(PNLDC1) 100930989(NOCT) 100932645(PAN2) 111719426(PDE12)
OAA: 100074018(CNOT6) 100074145(PARN) 100075507(CNOT6L) 100078828(PNLDC1) 100078856(NOCT) 100080200(PDE12) 100083102(PAN2) 100086173
GGA: 107054443(PDE12) 404779(NOCT) 416293(CNOT6) 416423(PARN) 422508(CNOT6L) 428595(PNLDC1) 429172(PAN2)
MGP: 100539601(CNOT6L) 100540861(CNOT6) 100541487(PAN2) 100541508(NOCT) 100544728(PARN) 100548354(PDE12) 100550227(PNLDC1)
CJO: 107311529(PNLDC1) 107313121(NOCT) 107313176(CNOT6L) 107319772(PDE12) 107320180(CNOT6) 107320526(PARN) 107325844(PAN2)
APLA: 101793853(PARN) 101795326(PNLDC1) 101795614(PDE12) 101797379(NOCT) 101798399(CNOT6) 101798647(PAN2) 101800648(CNOT6L)
ACYG: 106032807(CNOT6) 106037915(PDE12) 106039548(PNLDC1) 106040962(NOCT) 106041221(PARN) 106049020(PAN2) 106049330(CNOT6L)
TGU: 100218557(CNOT6L) 100219669(PARN) 100225677(PNLDC1) 100230698(PDE12) 100231015(CNOT6) 100231561(NOCT) 100232571
GFR: 102032644(PAN2) 102035929(PNLDC1) 102038115(PDE12) 102040001(NOCT) 102040201(PARN) 102043885(CNOT6) 102044826(CNOT6L)
FAB: 101806807(NOCT) 101813477(PNLDC1) 101816393(PARN) 101817075(CNOT6L) 101818862(PDE12) 101820084(CNOT6) 101821635(PAN2)
PHI: 102099780(PAN2) 102100419(PARN) 102100975(NOCT) 102101089(PDE12) 102103701(CNOT6L) 102104864(PNLDC1) 102107484(CNOT6)
PMAJ: 107198931(NOCT) 107199123(PAN2) 107201941(PNLDC1) 107203340(CNOT6L) 107210233(PDE12) 107210718(CNOT6) 107211023(PARN)
CCW: 104683465(PDE12) 104684717(PARN) 104689593(CNOT6) 104690370(PNLDC1) 104696810(CNOT6L) 104697280(NOCT)
FPG: 101912915(PAN2) 101912941(CNOT6L) 101913740(PARN) 101915300(PDE12) 101917319(PNLDC1) 101917647(NOCT) 101920906(CNOT6)
FCH: 102047367(PNLDC1) 102049107(CNOT6L) 102053174(NOCT) 102055230(PDE12) 102055496(CNOT6) 102055535(PAN2) 102055624(PARN)
CLV: 102085441(PAN2) 102086728(PARN) 102087047(PNLDC1) 102087895(PDE12) 102088785(NOCT) 102091681(CNOT6) 102092282(CNOT6L)
EGZ: 104124818(PNLDC1) 104125063(PAN2) 104126648(PDE12) 104126964(PARN) 104128425(CNOT6) 104128681(CNOT6L) 104135809(CCRN4L)
AAM: 106482113(PAN2) 106482599(PARN) 106486820(PNLDC1) 106491891(NOCT) 106492108(CNOT6L) 106493462(CNOT6) 106497556(PDE12)
ASN: 102369135(CNOT6L) 102369243(PAN2) 102370098(PDE12) 102373172(NOCT) 102375620(CNOT6) 102378208(PNLDC1) 102379982(PARN)
AMJ: 102558230(CNOT6) 102562455(PARN) 102564350(PNLDC1) 102567362(NOCT) 102568939(PAN2) 102574717(PDE12) 106737139(CNOT6L)
PSS: 102445710(PNLDC1) 102451508(NOCT) 102454438(CNOT6) 102456233(PDE12) 102457145(PAN2) 102459670(PARN) 102460953(CNOT6L)
CMY: 102932157(PAN2) 102934548(PARN) 102934939(PNLDC1) 102937437(CNOT6L) 102937802(PDE12) 102939146(NOCT) 102943090(CNOT6)
CPIC: 101936301(NOCT) 101938970(PAN2) 101940954(CNOT6L) 101944137(PNLDC1) 101945694(PARN) 101950945(PDE12) 101951072(CNOT6)
ACS: 100556448(cnot6l) 100556517(noct) 100560566(pan2) 100560800(parn) 100561016(pnldc1) 100564841(pde12) 100565621(cnot6)
PVT: 110073475(CNOT6) 110073655(NOCT) 110074628(PAN2) 110082420(PDE12) 110085245(CNOT6L) 110087522(PNLDC1) 110089115(PARN)
PBI: 103052772(PARN) 103058940(NOCT) 103060122(CNOT6) 103061339(PDE12) 103064231(CNOT6L) 103065550(PAN2) 103065585(PNLDC1)
GJA: 107106849(PDE12) 107109308(PARN) 107110787(NOCT) 107111944(PNLDC1) 107118872(CNOT6L) 107123713(CNOT6) 107126202(PAN2)
XLA: 100036851(pan2.L) 100505426(cnot6) 108703108(parn.S) 378568(noct.L) 394409(parn.L) 432104(cnot6l.L) 443670(pde12.S) 444430(pan2.S) 495050(cnot6l.S) 734309(noct.S) 779198
XTR: 100145505(cnot6l) 100145682(pan2) 549285(noct) 733861(parn)
NPR: 108786876(PDE12) 108787519(NOCT) 108788646 108790521(PAN2) 108791728(PARN) 108804444(CNOT6L)
DRE: 324048(cnot6a) 553665(cnot6l) 560386(cnot6b) 568973(noctb) 572044(nocta) 692319(pde12) 791461(parn) 792831(pan2)
AMEX: 103024657(noct) 103025554 103029667(cnot6l) 103030073(pan2) 103033684(parn) 103036143(pde12) 103047334
LCO: 104919919(pan2) 104921157(parn) 104922934(noct) 104927070(cnot6) 104935033(cnot6l) 104938899(Nocturnin) 104940303(pde12) 109136939
MZE: 101465093 101465253(pde12) 101465394(pan2) 101474769(cnot6l) 101478528(noct) 101479043(cnot6) 101487719(parn) 106674601 106675883
OLA: 101157055(pan2) 101157188(parn) 101157593(noct) 101160421 101162595(pde12) 101166103(cnot6l)
PRET: 103463886 103464329(pde12) 103467774(pan2) 103469825(cnot6l) 103471162(noct) 103471263 103482010(parn)
NFU: 107375846 107385088(pde12) 107386047(cnot6l) 107389498(noct) 107390028(parn) 107391243(pan2) 107396430
LCF: 108874806(pde12) 108881616(cnot6l) 108883559(pan2) 108895516(noct) 108899234(cnot6) 108900154 108901174
HCQ: 109510332(pde12) 109511437(parn) 109512990(pan2) 109514429(noct) 109518774(cnot6) 109526929 109527505
BPEC: 110155793 110157614(cnot6) 110162078 110164597(pan2) 110168537(parn) 110173574(pde12) 110175173(noct)
LCM: 102349012(NOCT) 102349497(PAN2) 102350014(CNOT6L) 102354686 102359649(PARN) 102362508(PNLDC1) 102362770(PDE12)
CMK: 103172817 103180886(cnot6l) 103181305(noct) 103183734(cnot6) 103187090(parn) 103190124(pde12) 103191017(pan2)
DME: Dmel_CG31137(twin) Dmel_CG31299(cu) Dmel_CG31759(CG31759) Dmel_CG8232(PAN2)
DSI: Dsimw501_GD18310(Dsim_GD18310) Dsimw501_GD26876(Dsim_GD26876) Dsimw501_GD27922(Dsim_GD27922) Dsimw501_GD28899(Dsim_GD28899)
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CEL: CELE_F31E3.4(panl-2) CELE_K10C8.1(parn-1) CELE_R17.2(pde-12) CELE_ZC518.3(ccr-4)
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:6246077]
  Authors
Schroder HC, Zahn RK, Dose K, Muller WE.
  Title
Purification and characterization of a poly(A)-specific exoribonuclease from calf thymus.
  Journal
J. Biol. Chem. 255 (1980) 4535-8.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 3.1.13.4
IUBMB Enzyme Nomenclature: 3.1.13.4
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 3.1.13.4
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CAS: 110541-21-4

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