KEGG   ENZYME: 3.1.13.4Help
Entry
EC 3.1.13.4                 Enzyme                                 

Name
poly(A)-specific ribonuclease;
3'-exoribonuclease;
2',3'-exoribonuclease
Class
Hydrolases;
Acting on ester bonds;
Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
BRITE hierarchy
Reaction(IUBMB)
Exonucleolytic cleavage of poly(A) to 5'-AMP
Comment
Cleaves poly(A) in either the single- or double-stranded form.
History
EC 3.1.13.4 created 1984
Orthology
K01148  
poly(A)-specific ribonuclease
K12571  
PAB-dependent poly(A)-specific ribonuclease subunit 2
K12603  
CCR4-NOT transcription complex subunit 6
K18764  
nocturnin
Genes
HSA: 
246175(CNOT6L) 25819(CCRN4L) 5073(PARN) 57472(CNOT6) 9924(PAN2)
PTR: 
100611804(CCRN4L) 451995 453936(PARN) 462338(CNOT6) 467690(CNOT6L)
PPS: 
100971742(PAN2) 100979611(CCRN4L) 100986002(PARN) 100986322(CNOT6L) 100991206(CNOT6)
GGO: 
PON: 
100171660(CNOT6L) 100172259(PARN) 100449251(CCRN4L) 100454964(PAN2)
NLE: 
100582571(CNOT6) 100585062(PAN2) 100591529(CCRN4L) 100598246(PARN) 100606122(CNOT6L)
MCC: 
100428993(CCRN4L) 697981(CNOT6L) 712478(PAN2) 712984 716286(CNOT6)
MCF: 
101864913 102119460(PARN) 102121928(CNOT6) 102122150(CNOT6L) 102134207(CCRN4L)
CJC: 
100390585(CNOT6L) 100393251(CCRN4L) 100394289(PARN) 100413819(PAN2) 100414347(CNOT6)
MMU: 
103135(Pan2) 104625(Cnot6) 12457(Ccrn4l) 231464(Cnot6l) 74108(Parn)
RNO: 
287249(Cnot6) 310395(Ccrn4l) 360464(Parn) 360917(Cnot6l) 408200(Pan2)
CGE: 
100764369(Cnot6) 100765354(Pan2) 100766002(Ccrn4l) 100769928(Cnot6l) 100771839(Parn) 103164067
NGI: 
103731559(Parn) 103742363(Ccrn4l) 103742612(Cnot6l) 103746518(Pan2) 103749363(Cnot6)
HGL: 
101700106(Cnot6) 101708269(Pan2) 101708643(Cnot6l) 101710110(Ccrn4l) 101715275(Parn)
OCU: 
100343097(CNOT6) 100348337(CCRN4L) 100350183(CNOT6L) 100351489(PARN) 100351819(PAN2)
TUP: 
102473091(PARN) 102476865(PAN2) 102496231(CNOT6) 102501402(CNOT6L) 102502756(CCRN4L)
CFA: 
474404(PAN2) 479839(PARN) 481463(CNOT6) 483818(CCRN4L) 487817(CNOT6L)
AML: 
UMR: 
103656142(PAN2) 103657961(CCRN4L) 103665339(CNOT6L) 103668616(PARN) 103679993(CNOT6)
FCA: 
101084253(CNOT6) 101092681(CCRN4L) 101096648(CNOT6L) 101098726(PAN2) 101100021(PARN)
PTG: 
102952677(CNOT6L) 102959344(PARN) 102961768(CNOT6) 102965630(CCRN4L) 102967975(PAN2)
BTA: 
518225(CNOT6L) 524155(PARN) 534707(CNOT6) 538820(PAN2) 540641(CCRN4L)
BOM: 
102266193(CNOT6) 102279918(CCRN4L) 102279992(CNOT6L) 102285191(PAN2) 102287848(PARN)
PHD: 
102314991(PARN) 102318973(PAN2) 102323224(CNOT6L) 102325735(CNOT6) 102335450(CCRN4L)
CHX: 
102169374(CNOT6) 102171479(PARN) 102187886(CCRN4L) 102190587(PAN2) 102191783(CNOT6L)
OAS: 
101108473(PAN2) 101111369(CNOT6L) 101112185(PARN) 101117790(CCRN4L) 101120323(CNOT6)
SSC: 
100153107(PAN2) 100512848(CNOT6L) 100513746(CCRN4L) 100515887(PARN) 100516183(CNOT6)
CFR: 
102505226(CNOT6) 102505693(PARN) 102510361(PAN2) 102520991(CNOT6L) 102524312(CCRN4L)
BACU: 
103001925(PAN2) 103003260(CCRN4L) 103005398(CNOT6) 103006131(CNOT6L) 103017586(PARN)
LVE: 
103069542(CNOT6L) 103072303(CCRN4L) 103074639(CNOT6) 103076055(PARN) 103082456(PAN2)
ECB: 
100050655(PARN) 100052396(PAN2) 100057912(CNOT6) 100059049(CNOT6L) 100071468(CCRN4L)
MYB: 
102239430(PAN2) 102243649(PARN) 102260842(CCRN4L) 102261756(CNOT6) 102263967(CNOT6L)
MYD: 
102753760(PARN) 102756082(CNOT6) 102759031(CCRN4L) 102759558 102760982(CNOT6L) 102765099(PAN2)
PALE: 
102878811(PAN2) 102883027(CCRN4L) 102890026(CNOT6) 102891690(PARN) 102898411(CNOT6L)
MDO: 
100009944(CNOT6L) 100024540(PARN) 100027658(CCRN4L) 100032045(CNOT6)
SHR: 
100915402(PARN) 100917730(CNOT6) 100924852(CNOT6L) 100930989(CCRN4L) 100932645(PAN2)
OAA: 
100074018(CNOT6) 100074145(PARN) 100075507(CNOT6L) 100078856(CCRN4L) 100083102(PAN2) 100086173
GGA: 
404779(CCRN4L) 416293(CNOT6) 416423(PARN) 422508(CNOT6L) 429172(PAN2)
MGP: 
APLA: 
101793853(PARN) 101797379(CCRN4L) 101798399(CNOT6) 101798647(PAN2) 101800648(CNOT6L)
TGU: 
100218557(CNOT6L) 100219669(PARN) 100231015(CNOT6) 100231561
FAB: 
101806807(CCRN4L) 101816393(PARN) 101816895 101817075(CNOT6L) 101820084(CNOT6) 101821635(PAN2)
PHI: 
102099780(PAN2) 102100419(PARN) 102100975(CCRN4L) 102103701(CNOT6L) 102107484(CNOT6)
FPG: 
101912915(PAN2) 101912941(CNOT6L) 101913740(PARN) 101917647(CCRN4L) 101920906(CNOT6)
FCH: 
102049107(CNOT6L) 102053174(CCRN4L) 102055496(CNOT6) 102055535(PAN2) 102055624(PARN)
CLV: 
102085441(PAN2) 102086728(PARN) 102088785(CCRN4L) 102091681(CNOT6) 102092282(CNOT6L)
ASN: 
102369135(CNOT6L) 102369243(PAN2) 102373172(CCRN4L) 102375620(CNOT6) 102379982(PARN)
AMJ: 
102558230(CNOT6L) 102562455(PARN) 102567362(CCRN4L) 102568939(PAN2) 102569926(CNOT6)
PSS: 
102451508(CCRN4L) 102454438(CNOT6) 102457145(PAN2) 102459670(PARN) 102460953(CNOT6L)
CMY: 
102932157(PAN2) 102934548(PARN) 102937437(CNOT6L) 102939146(CCRN4L) 102943090(CNOT6)
ACS: 
100556448(cnot6l) 100556517(ccrn4l) 100560566(pan2) 100560800(parn) 100565621(cnot6)
PBI: 
103052772(PARN) 103058940(CCRN4L) 103060122(CNOT6) 103064231(CNOT6L) 103065550(PAN2)
XLA: 
100505426(cnot6) 378568(ccrn4l-a) 394409(parn) 432104(cnot6l-a) 444430(pan2) 495050(cnot6l-b) 734309(ccrn4l-b) 779198
XTR: 
100145505(cnot6l) 100145682(pan2) 549285(ccrn4l) 733861(parn)
DRE: 
324048(cnot6) 553665(cnot6l) 560386 568973 572044(ccrn4la) 791461(parn) 792831
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102349012(CCRN4L) 102349497 102350014(CNOT6L) 102359649(PARN)
CMK: 
103172817 103180886(cnot6l) 103181305(ccrn4l) 103183734(cnot6) 103187090(parn) 103191017(pan2)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
408626(GB12931) 412552(twin) 724505(GB12069)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CELE_F31E3.4(panl-2)
CBR: 
CBG03318(Cbr-ccr-4) CBG16490
BMY: 
LOA: 
TSP: 
HRO: 
LGI: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
PMUM: 
MDM: 
CSV: 
CMO: 
RCU: 
POP: 
POPTR_0001s37710g(POPTRDRAFT_753285) POPTR_0003s10520g(POPTRDRAFT_1073812) POPTR_0006s21030g(POPTRDRAFT_819331) POPTR_0014s01880g(POPTRDRAFT_572061) POPTR_0014s175701(POPTRDRAFT_1100212) POPTR_0014s175702 POPTR_0016s06170g(POPTRDRAFT_825136)
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os03t0166800-01(Os03g0166800) Os04t0467400-01(Os04g0467400) Os05t0389500-01(Os05g0389500) Os08t0440200-01(Os08g0440200) Os10t0412100-01(Os10g0412100)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_01g022180(SORBIDRAFT_01g022180) SORBI_06g019420(SORBIDRAFT_06g019420) SORBI_07g021600(SORBIDRAFT_07g021600) SORBI_09g019230(SORBIDRAFT_09g019230)
ZMA: 
SITA: 
PDA: 
ATR: 
s00002p00239870(AMTR_s00002p00239870) s00011p00267070(AMTR_s00011p00267070) s00061p00208140(AMTR_s00061p00208140) s00163p00014030(AMTR_s00163p00014030) s00163p00015730(AMTR_s00163p00015730)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
OTA: 
BPG: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YAL021C(CCR4) YGL094C(PAN2)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0D03600(NCAS0D03600) NCAS_0F01640(NCAS0F01640)
NDI: 
NDAI_0H02520(NDAI0H02520) NDAI_0I01290(NDAI0I01290)
TPF: 
TPHA_0H02680(TPHA0H02680) TPHA_0N01190(TPHA0N01190)
TBL: 
TBLA_0A04660(TBLA0A04660) TBLA_0B05250(TBLA0B05250)
TDL: 
TDEL_0F01750(TDEL0F01750) TDEL_0H03730(TDEL0H03730)
KAF: 
KAFR_0A04350(KAFR0A04350) KAFR_0K00670(KAFR0K00670)
PPA: 
DHA: 
PIC: 
PGU: 
SPAA: 
LEL: 
CAL: 
CTP: 
COT: 
CDU: 
CTEN: 
YLI: 
CLU: 
NCR: 
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
CTHR: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
NHE: 
TRE: 
MAW: 
MAJ: 
CMT: 
VAL: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_448154(AO090003000263) AOR_1_496184(AO090009000303)
ANG: 
ANI_1_1100014(An01g08240) ANI_1_1934094(An11g04210)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
CPW: 
PBL: 
URE: 
ABE: 
TVE: 
AJE: 
PNO: 
PTE: 
BZE: 
BSC: 
BOR: 
ZTR: 
PFJ: 
BCOM: 
NPA: 
TML: 
SPO: 
CNE: 
CNB: 
CGI: 
TMS: 
PPL: 
DSQ: 
PCO: 
SHS: 
PSQ: 
ADL: 
FME: 
GTR: 
LBC: 
MPR: 
MRR: 
CCI: 
SCM: 
ABP: 
AGABI1DRAFT118214(AGABI1DRAFT_118214) AGABI1DRAFT65118(AGABI1DRAFT_65118)
ABV: 
AGABI2DRAFT183307(AGABI2DRAFT_183307) AGABI2DRAFT79322(AGABI2DRAFT_79322)
CPUT: 
SLA: 
UMA: 
PFP: 
MGL: 
PGR: 
MLR: 
WSE: 
ECU: 
EIN: 
EHE: 
NCE: 
MBR: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
ACAN: 
PFA: 
PFD: 
PFH: 
PYO: 
PCB: 
PBE: 
PKN: 
PVX: 
PCY: 
TAN: 
TPV: 
BBO: 
BBOV_II007020(18.m06581) BBOV_III004920(17.m10537)
BEQ: 
CPV: 
CHO: 
TGO: 
TET: 
PTM: 
PTI: 
TPS: 
PIF: 
NGD: 
EHX: 
GTT: 
TCR: 
LMA: 
LIF: 
LDO: 
LMI: 
LBZ: 
NGR: 
TVA: 
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:6246077]
  Authors
Schroder HC, Zahn RK, Dose K, Muller WE.
  Title
Purification and characterization of a poly(A)-specific exoribonuclease from calf thymus.
  Journal
J. Biol. Chem. 255 (1980) 4535-8.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
110541-21-4

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