KEGG   ENZYME: 3.5.1.88Help
Entry
EC 3.5.1.88                 Enzyme                                 

Name
peptide deformylase
Class
Hydrolases;
Acting on carbon-nitrogen bonds, other than peptide bonds;
In linear amides
BRITE hierarchy
Sysname
formyl-L-methionyl peptide amidohydrolase
Reaction(IUBMB)
formyl-L-methionyl peptide + H2O = formate + methionyl peptide [RN:R05635]
Reaction(KEGG)
Substrate
formyl-L-methionyl peptide [CPD:C11439];
H2O [CPD:C00001]
Product
formate [CPD:C00058];
methionyl peptide [CPD:C11440]
Comment
Requires Fe(II). Also requires at least a dipeptide for an efficient rate of reaction. N-terminal L-methionine is a prerequisite for activity but the enzyme has broad specificity at other positions. Differs in substrate specifity from EC 3.5.1.27 (N-formylmethionylaminoacyl-tRNA deformylase) and EC 3.5.1.31 (formylmethionine deformylase).
History
EC 3.5.1.88 created 2001
Orthology
K01462  
peptide deformylase
Genes
HSA: 
64146(PDF)
PON: 
MCC: 
MMU: 
68023(Pdf)
RNO: 
690214(Pdf)
CGE: 
HGL: 
TUP: 
CFA: 
610955(PDF)
AML: 
FCA: 
BTA: 
788473(PDF)
BOM: 
CHX: 
OAS: 
SSC: 
CFR: 
BACU: 
LVE: 
ECB: 
MYB: 
MYD: 
PALE: 
MDO: 
SHR: 
TGU: 
PHI: 
ACS: 
XLA: 
XTR: 
448425(pdf)
DRE: 
619248(pdf)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
CMK: 
BFO: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
ISC: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
ATH: 
AT1G15390(PDF1A) AT5G14660(PDF1B)
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
PMUM: 
MDM: 
CSV: 
CMO: 
RCU: 
POP: 
POPTR_0001s17170g(POPTRDRAFT_640630) POPTR_0001s35190g(POPTRDRAFT_173925)
VVI: 
SLY: 
543648(PDF1B) 544225(PDF1A)
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os01t0555800-01(Os01g0555800) Os01t0636600-01(Os01g0636600) Os01t0637600-01(Os01g0637600)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_02g041130(SORBIDRAFT_02g041130) SORBI_03g029040(SORBIDRAFT_03g029040)
ZMA: 
100272955(umc2541)
SITA: 
ATR: 
s00081p00136350(AMTR_s00081p00136350) s00096p00105910(AMTR_s00096p00105910)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
OSTLU_33985(PDF1B) OSTLU_35850(PDF1A)
OTA: 
BPG: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
CCP: 
DPP: 
PFH: 
PCB: 
PBE: 
PKN: 
PVX: 
PCY: 
TGO: 
TET: 
PTM: 
TPS: 
EHX: 
GTT: 
TBR: 
TCR: 
LMA: 
LIF: 
LDO: 
LMI: 
LBZ: 
ECO: 
b3287(def)
ECJ: 
ECD: 
EBW: 
ECOK: 
ECE: 
Z4657(def)
ECS: 
ECs4152(def)
ECF: 
ETW: 
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c4047(def)
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ELL: 
ELC: 
ELD: 
ELP: 
EBL: 
EBE: 
ELF: 
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
EFE: 
STY: 
STY4391(fms)
STT: 
t4098(def)
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM3406(def)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SEEN: 
SENR: 
SEND: 
SPT: 
SPA3273(fms)
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SEC: 
SC3342(def)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SEG: 
SG4032(def)
SEL: 
SEGA: 
SET: 
SEN3234(def)
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
BN855_34830(SBOV34731)
SENE: 
SES: 
SBG: 
SBZ: 
YPE: 
YPO0242(def)
YPK: 
y4023(def)
YPA: 
YPN: 
YPM: 
YP_0240(def)
YPP: 
YPG: 
YPZ: 
YPT: 
YPD: 
YPX: 
YPH: 
YPS: 
YPI: 
YPY: 
YPB: 
YEN: 
YE3889(def)
YEP: 
YEY: 
YEL: 
YSI: 
SFL: 
SF3318(def)
SFX: 
S3543(def)
SFV: 
SFE: 
SSN: 
SSJ: 
SBO: 
SBC: 
SDY: 
SDZ: 
ECA: 
ECA3999(def)
PATR: 
PCT: 
PCC: 
PWA: 
PEC: 
ETA: 
EPY: 
EPR: 
EAM: 
EAY: 
EBI: 
ERJ: 
PLU: 
plu4695(def)
PAY: 
PAU_00456(def1) PAU_04177(def)
BUC: 
BU496(def)
BAP: 
BAU: 
BAK: 
BUH: 
BAPF: 
BAPG: 
BAPU: 
BAPW: 
BAS: 
BUsg477(def)
BAB: 
bbp439(def)
BCC: 
BCc_313(def)
BAJ: 
WBR: 
WGLp496(def)
WGL: 
SGL: 
SG2246(def)
SOD: 
PES: 
ENT: 
ENC: 
ENO: 
ECLO: 
EEC: 
ENL: 
ESC: 
EAS: 
EAU: 
EAE: 
EAR: 
ENR: 
ESA: 
CSK: 
CSZ: 
CSI: 
CTU: 
KPN: 
KPU: 
KPM: 
KPP: 
KPE: 
KPO: 
KPR: 
KPR_4868(def) KPR_4905(def)
KPJ: 
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KVA: 
KOX: 
KOE: 
KOY: 
CKO: 
CRO: 
CFD: 
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SRY: 
SRS: 
SRA: 
SSZ: 
SCc_072(def)
SMAF: 
SMW: 
SLQ: 
SERR: 
SFO: 
PMR: 
PMI2825(def) PMI3288(def)
PMIB: 
EIC: 
ETR: 
ETD: 
ETC: 
BFL: 
Bfl219(def)
BPN: 
BVA: 
BCHR: 
HDE: 
SECT: 
SEHC: 
DDA: 
DDC: 
DDD: 
DZE: 
XBO: 
XNE: 
PAM: 
PLF: 
PAJ: 
PAQ: 
PVA: 
PAO: 
RIP: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
MEN: 
MEO: 
MPC_185(def)
PSI: 
EBT: 
MMK: 
ROR: 
EBF: 
PSTS: 
HIN: 
HI0622(def)
HIT: 
HIP: 
HIQ: 
HIF: 
HIL: 
HIU: 
HIE: 
HIZ: 
HIK: 
HDU: 
HD1889(def)
HAP: 
HPAZ: 
HPR: 
HSO: 
HS_0041(def)
HSM: 
PMU: 
PM1559(def)
PMV: 
PUL: 
PMP: 
MSU: 
MS2201(def)
MHT: 
MHQ: 
MHX: 
MHAE: 
MHAM: 
MHAO: 
MHAL: 
MVR: 
MVI: 
MVG: 
MVE: 
APL: 
APJ: 
APA: 
ASU: 
ASI: 
AAP: 
AAT: 
AAO: 
AAN: 
AAH: 
GAN: 
BTO: 
BTRE: 
BTRH: 
BTRA: 
XFA: 
XF0926(def)
XFT: 
PD1763(def)
XFM: 
XFN: 
XFF: 
XCC: 
XCC0687(def) XCC3749(def)
XCB: 
XC_3547(def) XC_3819(def)
XCA: 
XCP: 
XCR_0556(def) XCR_0851(def)
XCV: 
XCV3636(def) XCV3926(def)
XAC: 
XAC3510(def) XAC3801(def)
XCI: 
XAX: 
XAO: 
XOO: 
XOO0585(def) XOO1075(def)
XOM: 
XOP: 
XOR: 
XOC_3776(def) XOC_4134(def)
XAL: 
XFU: 
SML: 
SMT: 
BUJ: 
SMZ: 
PSU: 
PSD: 
FAU: 
RHD: 
DJI: 
DJA: 
VCH: 
VC0046(def) VCA0150(def)
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VC395_0134(def-1) VC395_A0143(def-2)
VCM: 
VCI: 
VCL: 
VVU: 
VV1_1048(def) VV2_0863(def)
VVY: 
VV3225(def) VVA1334(def)
VVM: 
VPA: 
VP3042(def) VPA0784(def)
VPB: 
VPK: 
VPF: 
VPH: 
VHA: 
VCA: 
VAG: 
VSP: 
VS_3126(def)
VEX: 
VEJ: 
VFU: 
VNI: 
VAN: 
LAG: 
VFI: 
VF_2543(def)
VFM: 
VSA: 
PPR: 
PAE: 
PA0019(def)
PAEV: 
PAEI: 
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PAEU: 
PAEG: 
PAEC: 
PAEO: 
M801_1161(def) M801_19(def)
PPU: 
PP_0068(def) PP_4559(def)
PPF: 
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PPUU: 
PST: 
PSPTO_0177(def-1) PSPTO_1598(def-2)
PSB: 
PSYR: 
PSP: 
PCI: 
PFL: 
PFL_0022(def_2) PFL_4594(def_1)
PPRC: 
PFO: 
PFS: 
PFE: 
PFC: 
PPZ: 
PEN: 
PSEEN0025(def) PSEEN4003(def2)
PMY: 
PMK: 
PSA: 
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PBA: 
PBC: 
PFV: 
PDR: 
PRE: 
PSV: 
PSK: 
PMON: 
PMOT: 
PKC: 
PKB_0019(def) PKB_1717(def2)
PCH: 
CJA: 
AVN: 
AVL: 
AVD: 
PAR: 
PCR: 
PRW: 
PSO: 
ACI: 
ACIAD0211(def) ACIAD1039(def2)
ACD: 
ACB: 
ABM: 
ABY: 
ABAYE2833(def2) ABAYE3705(def)
ABC: 
ABN: 
ABB: 
ABX: 
ABZ: 
ABR: 
ABD: 
ABH: 
ABAD: 
ABJ: 
ABAB: 
ABAJ: 
ABAZ: 
ACC: 
MCT: 
MCS: 
SON: 
SO_0032(def) SO_1062(def) SO_2530(def)
SDN: 
SFR: 
SAZ: 
SBL: 
SBM: 
SBN: 
SBP: 
SBT: 
SBS: 
SBB: 
SLO: 
SPC: 
SHP: 
SSE: 
SPL: 
SHE: 
SHM: 
SHN: 
SHW: 
SHL: 
SWD: 
SWP: 
swp_0057(def) swp_2321(def)
SVO: 
SVI_0063(def-1) SVI_2376(def-2)
ILO: 
IL0018(def)
ILI: 
CPS: 
CPS_0020(def1) CPS_0407(def)
PHA: 
PAT: 
PSM: 
SDE: 
MAQ: 
MHC: 
MAD: 
MBS: 
AMC: 
AMAC: 
AMB: 
AMG: 
AMH: 
AMK: 
AMAA: 
AMAL: 
AMAE: 
AMAO: 
AMAD: 
AMAI: 
AMAG: 
ALT: 
AAL: 
GAG: 
GNI: 
GPS: 
PIN: 
PSY: 
TTU: 
FBL: 
CBU: 
CBS: 
CBD: 
CBUD_0110(def2) CBUD_1053(def)
CBG: 
CbuG_0254(def2) CbuG_1014(def)
CBC: 
CbuK_0179(def2)
LPN: 
LPH: 
LPO: 
LPU: 
LPM: 
LPF: 
LPP: 
LPC: 
LPA: 
LPE: 
LLO: 
MCA: 
MCA1371(def) MCA2843(def-2)
MMT: 
MAH: 
FTU: 
FTT_0403(def1) FTT_1675(def2)
FTF: 
FTF0403(def1) FTF1675(def2)
FTW: 
FTW_1671(def1) FTW_1942(def2)
FTR: 
FTT: 
FTV_1594(def3)
FTG: 
FTU_1679(def3)
FTL: 
FTH: 
FTH_0070(def) FTH_0470(def1)
FTA: 
FTA_0082(def1) FTA_0499(def2)
FTS: 
FTI: 
FTO: 
FTM: 
FTN: 
FCF: 
FCN: 
FPH: 
FRT: 
FNA: 
FNL: 
TCX: 
TCY: 
MEJ: 
MEC: 
CYQ: 
CZA: 
NOC: 
NHL: 
NWA: 
ALV: 
TVI: 
TMB: 
AEH: 
HHA: 
HHC: 
TGR: 
TKM: 
TNI: 
TVNIR_0417(def_[H])
SSAL: 
SPIU: 
HNA: 
HCH: 
CSA: 
HEL: 
HCS: 
PLE: 
PLY: 
PLR: 
PAQ_209(def)
PLO: 
PLD: 
CRP: 
CRU: 
CRC: 
CRT: 
CRH: 
CRV: 
CRI: 
ABO: 
ABO_0131(def-1)
ADI: 
B5T_00117(def-1)
KKO: 
MMW: 
MME: 
MPC: 
TOL: 
TOR: 
AHA: 
AHA_0258(def) AHA_2373(def)
AHY: 
AHD: 
AHR: 
AHP: 
ASA: 
AVR: 
AMED: 
TAU: 
OCE: 
DNO: 
AFE: 
AFR: 
AFE_0019(def-2) AFE_0438(def-1)
ACU: 
AFI: 
GAP: 
SAGA: 
BCI: 
RMA: 
VOK: 
GPB: 
NMA: 
NMA0164(def)
NME: 
NMB0110(def)
NMP: 
NMH: 
NMC: 
NMC0102(def)
NMN: 
NMT: 
NMI: 
NMD: 
NMM: 
NMS: 
NMQ: 
NMW: 
NMZ: 
NGO: 
NGO1871(def)
NGK: 
NGT: 
NLA: 
SALV: 
CVI: 
CV_4265(def)
LHK: 
PSE: 
RSO: 
RSc0070(def) RSc1399(def)
RSC: 
RSL: 
RSN: 
RSM: 
RSE: 
RPI: 
RPF: 
RPJ: 
REU: 
REH: 
CNC: 
RME: 
CTI: 
BMA: 
BMA0142(def) BMA1559(def)
BMV: 
BML: 
BMN: 
BPS: 
BPSL0121(def) BPSL2163(def)
BPM: 
BPL: 
BPD: 
BPR: 
BPSE: 
BDL_1825(def) BDL_3384(def)
BPSM: 
BBQ_1172(def) BBQ_3264(def)
BPSU: 
BBN_1299(def) BBN_3386(def)
BPSD: 
BBX_1785(def) BBX_215(def)
BPZ: 
BPQ: 
BPK: 
BBK_1303(def) BBK_2800(def)
BTE: 
BTH_I0128(def) BTH_I2023(def-2)
BTQ: 
BTQ_153(def) BTQ_1887(def)
BTJ: 
BTJ_2523(def) BTJ_468(def)
BTZ: 
BTL_1708(def) BTL_246(def)
BTD: 
BTI_1467(def) BTI_3591(def)
BVI: 
BUR: 
BCN: 
BCH: 
BCM: 
BCJ: 
BAM: 
BAC: 
BMU: 
BMJ: 
BCT: 
BXE: 
BPH: 
BPY: 
BGL: 
BUG: 
BGE: 
BGF: 
BRH: 
BGD: 
BYI: 
BUK: 
BPX: 
BUO: 
PNU: 
PNE: 
PPK: 
PPNO: 
PRB: 
BPE: 
BP0039(def) BP0552(def)
BPC: 
BPER: 
BPA: 
BPP0243(def) BPP3660(def)
BPAR: 
BBR: 
BB0247(def) BB4095(def)
BBM: 
BBH: 
BPT: 
BAV: 
BAV0202(def) BAV0700(def)
BHO: 
AXY: 
AXO: 
AXN: 
TEQ: 
TEA: 
TEG: 
TAS: 
TAT: 
PUT: 
AKA: 
AMIM: 
CDN: 
BPSI: 
RFR: 
POL: 
PNA: 
AAV: 
AJS: 
DIA: 
AAA: 
ACK: 
VEI: 
DAC: 
DEL: 
VAP: 
VPE: 
VPD: 
CTT: 
CTES: 
ADN: 
ADK: 
RTA: 
CBX: 
MPT: 
HAR: 
MMS: 
mma_0143(def1) mma_1680(def2) mma_2063(def3)
JAG: 
GJA_2811(def) GJA_4627(def)
HSE: 
ZIN: 
CFU: 
LCH: 
TIN: 
THI: 
THI_0106(def1) THI_1669(def2)
RGE: 
NEU: 
NE1755(def) NE1970(def)
NET: 
NIT: 
NII: 
NMU: 
EBA: 
ebA62(def) ebB91(def)
AZO: 
azo0099(def) azo3610(def2)
AZA: 
DAR: 
TMZ: 
DSU: 
TBD: 
SDR: 
MFA: 
MMB: 
MEH: 
MEI: 
MEP: 
APP: 
TPJ: 
SLT: 
GCA: 
KCI: 
KCT: 
KBL: 
KBT: 
KDE: 
KGA: 
KON: 
SSDC: 
BPRC: 
HPY: 
HP0793(def)
HEO: 
HPJ: 
jhp0729(def)
HPA: 
HPS: 
HHP: 
HHQ: 
HHR: 
HPG: 
HPP: 
HPB: 
HPL: 
HPC: 
HCA: 
HPM: 
HPE: 
HPO: 
HPI: 
HPQ: 
HPW: 
HPU: 
HEF: 
HPF: 
HEQ: 
HEX: 
HPT: 
HPZ: 
HPV: 
HPX: 
HEN: 
HPH: 
HEG: 
HPN: 
HEP: 
HEU: 
HES: 
HPYS: 
HCN: 
HPD: 
HEY: 
HER: 
HEI: 
HPYA: 
HPYK: 
HPYO: 
HPYL: 
HPYB: 
HPYR: 
HPYI: 
HPYU: 
HPYM: 
HEM: 
HEB: 
HEZ: 
HHE: 
HH0569(def)
HAC: 
HMS: 
HFE: 
HBI: 
HCE: 
HCM: 
HCP: 
HCB: 
HHM: 
WSU: 
WS2212(def)
TDN: 
SUA: 
SKU: 
SULR: 
CJE: 
Cj0191c(def)
CJB: 
CJJ: 
CJU: 
CJN: 
CJI: 
CJM: 
CJS: 
CJP: 
CJEJ: 
CJEU: 
CJEN: 
CJEI: 
CJER: 
CJR: 
CJE0184(def)
CJD: 
CJZ: 
CJX: 
CFF: 
CFV: 
CAMP: 
CCV: 
CHA: 
CCO: 
CLA: 
CCOL: 
CCC: 
CCQ: 
CCF: 
CCY: 
CCOI: 
ABU: 
ABT: 
ABL: 
ANT: 
ARC: 
SDL: 
SBA: 
SMUL: 
NSA: 
NIS: 
SUN: 
NAM: 
GSU: 
GSU0129(def-1) GSU3456(def-2)
GSK: 
KN400_0105(def-1) KN400_3401(def-2)
GME: 
Gmet_3338(def-1) Gmet_3553(def-2)
GUR: 
GLO: 
GBM: 
Gbem_0634(def-1) Gbem_3968(def-2)
GEO: 
GEM: 
GEB: 
PCA: 
Pcar_0245(def-1) Pcar_2534(def-2)
PPD: 
DVU: 
DVU3366(def)
DVL: 
DVM: 
DVG: 
DDE: 
DDS: 
DDN: 
DMA: 
DSA: 
DAS: 
DAF: 
DHY: 
DPI: 
DGG: 
LIP: 
LI0767(def)
LIR: 
DBA: 
DRT: 
BBA: 
Bd2759(def)
BBAT: 
BBW: 
BBAC: 
BEX: 
BMX: 
BMS_2806(def) BMS_3417(def)
DPS: 
DAK: 
DPR: 
DSF: 
DOL: 
DAL: 
DAT: 
DTO: 
ADE: 
ACP: 
AFW: 
ANK: 
MXA: 
MFU: 
MSD: 
CCX: 
SUR: 
SCL: 
sce3810(def1) sce7414(def2) sce9022(def3)
SCU: 
HOH: 
SAT: 
DAO: 
DTI: 
SFU: 
DBR: 
HMR: 
DAV: 
RPR: 
RP208(def)
RPO: 
RPW: 
RPZ: 
RPG: 
RPS: 
RPV: 
RPQ: 
RPL: 
RPN: 
RTY: 
RT0197(def)
RTT: 
RTB: 
RCM: 
RCC: 
RBE: 
RBE_0560(def) RBE_0681(def2)
RBO: 
RCO: 
RC0080(def3) RC0278(def) RC0674(def2)
RFE: 
RF_0124(def3) RF_0324(def) RF_0730(def2)
RAK: 
RRI: 
RRJ: 
RRA: 
RRC: 
RRH: 
RRB: 
RRN: 
RRP: 
RMS: 
RMA_0087(def3) RMA_0279(def) RMA_0678(def2)
RMI: 
RPK: 
RAF: 
RHE: 
RJA: 
RJP_0052(def3) RJP_0216(def) RJP_0515(def2)
RSV: 
Rsl_102(def3) Rsl_325(def1) Rsl_781(def2)
RSW: 
RPH: 
RAU: 
RMO: 
RPP: 
RRE: 
RAM: 
OTS: 
OTT: 
WOL: 
WD0165(def)
WRI: 
WEN: 
WED: 
WPI: 
WBM: 
Wbm0114(def)
WOO: 
AMA: 
AMF: 
AMF_204(def) AMF_933(def)
AMW: 
AMP: 
ACN: 
APH: 
APY: 
APD: 
APHA: 
ERU: 
Erum0540(def1) Erum1820(def2)
ERW: 
ERG: 
ECN: 
ECH: 
ECHA: 
ECHJ: 
ECHL: 
ECHS: 
EMR: 
EHH: 
NSE: 
NRI: 
NHM: 
MMN: 
PACA: 
MLO: 
mll4855(def)
MCI: 
MOP: 
MAM: 
MES: 
PLA: 
SME: 
SMc01101(def) SMc01262(def)
SMK: 
SMQ: 
SMX: 
SMI: 
SMEG: 
SMEL: 
SMD: 
RHI: 
SFH: 
SFD: 
EAD: 
ATU: 
Atu0366(def) Atu1550(def)
ARA: 
AVI: 
Avi_0542(def) Avi_2025(def)
AGR: 
RET: 
REC: 
REL: 
RLE: 
RL0430(def) RL2552(def)
RLT: 
RLG: 
RLB: 
RLU: 
RTR: 
RIR: 
RHL: 
NGL: 
LAS: 
LAA: 
LSO: 
LCC: 
LAR: 
lam_889(def)
BME: 
BMI: 
BMZ: 
BMG: 
BMW: 
BMF: 
BAB2_0782(def-1) BAB2_0997(def)
BMB: 
BMC: 
BAA: 
BMS: 
BRA0454(def) BRA1035(def)
BSI: 
BMT: 
BSV: 
BSF: 
BOV: 
BCS: 
BSK: 
BOL: 
BMR: 
BMI_II1029(def) BMI_II451(def-1)
BPP: 
BPI_II1091(def-2) BPI_II436(def-1)
BCET: 
OAN: 
BJA: 
bll4005(def) bll8109(def)
BJU: 
BRA: 
BBT: 
BRS: 
AOL: 
RPA: 
RPA0621(def)
RPB: 
RPC: 
RPD: 
RPE: 
RPT: 
RPX: 
NWI: 
NHA: 
OCA: 
OCG: 
OCO: 
BHE: 
BH00760(def)
BHN: 
BQU: 
BQ00690(def)
BQR: 
BBK: 
BTR: 
BGR: 
BCD: 
BAUS: 
BVN: 
XAU: 
AZC: 
SNO: 
MEX: 
MEA: 
MDI: 
MCH: 
MRD: 
MET: 
MPO: 
MNO: 
BID: 
MSL: 
HDN: 
HDT: 
HMC: 
HNI: 
RVA: 
PHL: 
MSC: 
HCI: 
HCT: 
CCR: 
CCS: 
CAK: 
CSE: 
PZU: 
BSB: 
AEX: 
SIL: 
SPO3217(def-1) SPO3218(def-2) SPO3219(def-3)
SIT: 
RSP: 
RSH: 
RSQ: 
RSK: 
RCP: 
JAN: 
RDE: 
RD1_1337(def) RD1_1338(def)
RLI: 
PDE: 
PAMI: 
DSH: 
Dshi_0179(def1) Dshi_0180(def2)
KVU: 
KVL: 
PSF: 
PGA: 
PGL: 
PGD: 
OAT: 
OAR: 
LMD: 
RED: 
PTP: 
MMR: 
HNE: 
HBA: 
ZMO: 
ZMN: 
ZMM: 
ZMB: 
ZMI: 
ZMR: 
ZMP: 
NAR: 
NPP: 
SAL: 
SWI: 
SPHM: 
SJP: 
SCH: 
SSY: 
ELI: 
GOX: 
GOH: 
GBE: 
GBH: 
GBC: 
GBS: 
ACR: 
AMV: 
GDI: 
GDI_2127(def) GDI_3083(def2)
GDJ: 
GXY: 
GXL: 
APT: 
APW: 
APF: 
APU: 
APG: 
APQ: 
APX: 
APZ: 
APK: 
RRU: 
RRF: 
RCE: 
RC1_2069(def) RC1_2298(def)
RPM: 
MAG: 
MGY: 
AZL: 
ALI: 
ABS: 
TMO: 
THAL: 
PBR: 
MGM: 
MAI: 
MAN: 
PGV: 
PUB: 
PEL: 
APC: 
APM: 
APB: 
BSU: 
BSU14560(def) BSU15720(def)
BSR: 
BSL: 
BSH: 
BSY: 
BSS: 
BST: 
BSO: 
BSN: 
BSQ: 
BSUB: 
BSX: 
C663_1616(defA)
BSP: 
BLI: 
BL01629(def) BL02297(def)
BLD: 
BLi01671(ykrB) BLi01793(def)
BLH: 
BAO: 
BAMF_1530(defB) BAMF_1644(defA)
BAY: 
BAQ: 
BYA: 
BAMP: 
BAML: 
BAMA: 
RBAU_1413(defB) RBAU_1531(defA)
BAMN: 
BASU_1392(defB) BASU_1511(defA)
BAMB: 
BAMT: 
BAZ: 
BQL: 
LL3_01561(defB) LL3_01732(defA)
BXH: 
BQY: 
MUS_1541(defB) MUS_1723(defA)
BAMI: 
BAMC: 
BAMF: 
BAE: 
BHA: 
BH2658(def)
BAN: 
BA_4005(def) BA_4187(def)
BAR: 
BAT: 
BAS3718(def) BAS3884(def)
BAH: 
BAI: 
BAA_4029(def1) BAA_4209(def)
BAX: 
BANT: 
BANR: 
BANS: 
BAL: 
BCE: 
BC3865(def) BC3974(def)
BCA: 
BCE_3910(deF) BCE_4023(deF)
BCZ: 
BCZK3626(def) BCZK3732(def)
BCR: 
BCB: 
BCU: 
BCG: 
BCQ: 
BCQ_3652(def) BCQ_3763(def)
BCX: 
BCA_3967(def1) BCA_4079(def)
BNC: 
BCF: 
BCER: 
BCY: 
BTK: 
BTL: 
BTB: 
BTT: 
BTC: 
BTF: 
BTM: 
BTG: 
BTI: 
BTN: 
BTHT: 
BTHU: 
BWE: 
BTY: 
BCL: 
ABC2423(def)
BPU: 
BPUM: 
BPF: 
BMQ: 
BMQ_1343(defB) BMQ_4240(def)
BMD: 
BMD_1323(defB) BMD_4227(def)
BMH: 
BCO: 
BCK: 
BAG: 
BJS: 
BACI: 
BIF: 
BLE: 
BMET: 
OIH: 
OB1410(def)
GKA: 
GK1057(def) GK1171(def)
GTN: 
GTH: 
GTE: 
GWC: 
GYC: 
GYA: 
GCT: 
GMC: 
GGH: 
GJF: 
AFL: 
AXL: 
LSP: 
LGY: 
HHD: 
TAP: 
VIR: 
BSE: 
SAU: 
SAV: 
SAW: 
SAH: 
SAJ: 
SAM: 
SAS: 
SAR: 
SAR1065(def) SAR1191(def)
SAC: 
SACOL1100(def) SACOL1227(def2)
SAX: 
SAA: 
SAO: 
SAE: 
SAD: 
SAAV_1056(def) SAAV_1187(def2)
SUU: 
SUV: 
SUH: 
SUE: 
SUJ: 
SUK: 
SUC: 
SUT: 
SUQ: 
SUZ: 
SUD: 
SUX: 
SUW: 
SUG: 
SUF: 
SAUA: 
SAUE: 
SAUN: 
SAUS: 
SAUU: 
SAUZ: 
SAB: 
SAB0957c(def) SAB1079(def)
SUY: 
SAUB: 
SAUM: 
SAUC: 
SAUR: 
SAUI: 
SAUT: 
SAUJ: 
SAUK: 
SAUQ: 
SAUV: 
SAUW: 
SAUX: 
SAUY: 
SEP: 
SER: 
SERP0678(def) SERP0781(def-2)
SHA: 
SSP: 
SCA: 
Sca_0717(def) Sca_0835(def)
SLG: 
SLN: 
SSD: 
SDT: 
SPSE_1588(defA) SPSE_1700(defB)
SWA: 
SPAS: 
MCL: 
LMO: 
lmo1051(def)
LMF: 
LMH: 
LMC: 
LMN: 
LMY: 
LMT: 
LMG: 
LMS: 
LMJ: 
LMQ: 
LML: 
LMP: 
LMW: 
LMX: 
LMZ: 
LMON: 
LMOC: 
LMOS: 
LMOO: 
LMOY: 
LMOT: 
LMOA: 
LMOL: 
LMOG: 
LMOE: 
LMOB: 
LMOJ: 
LMOZ: 
LMOD: 
LMOW: 
LMOX: 
LMOQ: 
LMR: 
LIN: 
lin1043(def)
LWE: 
lwe1027(def)
LSG: 
LIV: 
LIW: 
ESI: 
EAT: 
EAN: 
EXM: 
BBE: 
PJD: 
GYM: 
PPY: 
PPE_02918(def1) PPE_04088(def2)
PPM: 
PPO: 
PPM_3131(def1) PPM_4303(def3)
PPOL: 
PPQ: 
PMS: 
PMQ: 
PMW: 
PTA: 
PLV: 
PSAB: 
TCO: 
AAC: 
AAD: 
BTS: 
SIV: 
LLA: 
L154885(def)
LLK: 
LLT: 
LLS: 
LLD: 
LLC: 
LLM: 
LLR: 
LLN: 
LLI: 
LLW: 
LGR: 
LGV: 
SPY: 
SPy_0870(fms) SPy_1958(def)
SPZ: 
SPYM: 
SPM: 
SPG: 
SPS: 
SPH: 
SPI: 
SPJ: 
SPK: 
SPF: 
SPA: 
SPB: 
STG: 
SOZ: 
STZ: 
STX: 
SPYA: 
A20_0718(def2) A20_1717(def)
SPYH: 
SPN: 
SPD: 
SPD_1285(def) SPD_1381(def-2)
SPR: 
spr1310(def) spr1408(def)
SPW: 
SPX: 
SPG_1382(def) SPG_1477(defA)
SNE: 
SPV: 
SPH_1572(def) SPH_1665(def2)
SNM: 
SJJ: 
SPJ_1355(def) SPJ_1457(def2)
SPP: 
SPP_1476(def) SPP_1574(def2)
SNT: 
SPT_0819(def) SPT_1491(def2)
SNC: 
SNB: 
SNP: 
SNI: 
SNV: 
SNX: 
SND: 
SNU: 
SPNG: 
SPNE: 
SPNU: 
SPNM: 
SPNO: 
SPNN: 
SAG: 
SAN: 
SAK: 
SAK_1365(def) SAK_1863(def)
SGC: 
SAGS: 
SAGL: 
SAGM: 
SAGI: 
SAGR: 
SAGP: 
SMU: 
SMC: 
SMJ: 
SMUT: 
STC: 
str0151(def) str0431(defA)
STL: 
stu0151(def) stu0431(defA)
STE: 
STN: 
STU: 
STW: 
SSA: 
SSU: 
SSV: 
SSB: 
SSI: 
SSU0351(fms) SSU1736(def)
SSS: 
SST: 
SSF: 
SSK: 
SSQ: 
SSW: 
SUI: 
SUO: 
SRP: 
SUP: 
SSUS: 
SSUT: 
SSUI: 
SSUY: 
SGO: 
SEQ: 
SEZ: 
Sez_1089(def) Sez_1760(def)
SEZO: 
SEU: 
SUB: 
SUB0260(def) SUB0763(fms)
SDS: 
SDG: 
SDA: 
GGS_0232(def) GGS_0796(fms)
SDC: 
SDQ: 
SGA: 
SGG: 
SGT: 
SGGB_0255(def) SGGB_1285(defA)
SMB: 
SOR: 
STK: 
STB: 
SGPB_0199(def) SGPB_1196(defA)
SCP: 
SCF: 
SSR: 
STF: 
STJ: 
STD: 
SMN: 
SMA_0235(def) SMA_1224(def)
SIF: 
SIE: 
SIB: 
SIR_1501(def1) SIR_1600(def)
SIU: 
SII_1487(def1) SII_1586(def)
SANG: 
SAIN_1446(def1) SAIN_1529(def)
SANC: 
SANR_1672(def1) SANR_1768(def)
SCG: 
SCI_1596(def1) SCI_1663(def)
SCON: 
SCRE_1552(def1) SCRE_1619(def)
SCOS: 
SCR2_1552(def1) SCR2_1619(def)
SOI: 
SIK: 
SLU: 
SIG: 
SIP: 
LPL: 
lp_2155(def1) lp_2935(def2)
LPJ: 
JDM1_1806(def) JDM1_2353(def2)
LPT: 
LPS: 
LPR: 
LPZ: 
LJO: 
LJF: 
LJH: 
LJN: 
LAC: 
LAI: 
LAD: 
LSA: 
LSA1087(def) LSA1499(def2)
LSL: 
LSL_0363(def) LSL_0649(def)
LSI: 
LDB: 
LBU: 
LDE: 
LDL: 
LBR: 
LBK: 
LCA: 
LCB: 
LCZ: 
LCS: 
LCE: 
LCW: 
LCL: 
LGA: 
LRE: 
LRF: 
LRU: 
LRT: 
LRR: 
LHE: 
LHL: 
LHR: 
LHV: 
LHH: 
LFE: 
LFF: 
LRH: 
LRG: 
LRL: 
LRA: 
LRO: 
LRC: 
LCR: 
LAM: 
LAY: 
LBH: 
LBN: 
LKE: 
LRM: 
LSN: 
LPI: 
LPQ: 
PPE: 
PPEN: 
PCE: 
EFA: 
EF3066(def)
EFL: 
EF62_0142(def_2) EF62_0194(def_1)
EFI: 
EFD: 
EFS: 
EFS1_2500(def-1) EFS1_2553(def-2)
EFN: 
EFC: 
EFAU: 
EFU: 
EFM: 
EHR: 
ENE: 
ECAS: 
EMU: 
EMQU_0185(def) EMQU_2728(def2)
MPS: 
MPX: 
THL: 
OOE: 
LME: 
LMM: 
LMK: 
LCI: 
LKI: 
LGS: 
LEC: 
LCN: 
LGE: 
WKO: 
WCE: 
WS08_0479(def2)
AUR: 
CRN: 
CML: 
CAW: 
CAC: 
CA_C1722(def) CA_C2474(def)
CAE: 
SMB_G1747(def1) SMB_G2509(def2)
CAY: 
CPE: 
CPE0760(def) CPE1633(def) CPE1744(def)
CPF: 
CPF_0754(def) CPF_1885(def) CPF_1997(def)
CPR: 
CPR_1604(def) CPR_1715(def)
CTC: 
CTET: 
CNO: 
CBO: 
CBA: 
CLB_0915 CLB_2234(def-1) CLB_2383(def) CLB_2564(def-3)
CBH: 
CLC_0929 CLC_2217(def-1) CLC_2365(def) CLC_2495(def-3)
CBY: 
CBL: 
CBK: 
CBB: 
CBI: 
CBN: 
CBT: 
CBF: 
CLI_0956 CLI_2343(def-1) CLI_2571(def) CLI_2686(def-3)
CBM: 
CBJ: 
CBE: 
CKL: 
CKL_0359(def1) CKL_1369(def) CKL_2653(def2) CKL_2745(def3)
CKR: 
CCE: 
CLJ: 
CCB: 
CLS: 
CLB: 
CSR: 
CPAS: 
CSB: 
CAH: 
CLT: 
AMT: 
AOE: 
ASF: 
ASM: 
ASB: 
CTH: 
CTX: 
CCL: 
ESR: 
ESU: 
CSS: 
CSD: 
EHA: 
RAL: 
RBR: 
RCH: 
RUM: 
RUS: 
FPR: 
FPA: 
BPB: 
bpr_I1992(def1) bpr_I2696(def2)
BFI: 
CLE: 
RHO: 
RIX: 
RIM: 
COO: 
CCT: 
ROB: 
RTO: 
CPY: 
CSH: 
CSO: 
CAD: 
CDF: 
CDC: 
CDL: 
CDG: 
CST: 
FAA: 
STH: 
SWO: 
SLP: 
DSY: 
DSY2694(def)
DHD: 
DDH: 
DDL: 
DRM: 
DAE: 
DCA: 
DKU: 
DRU: 
DGI: 
PTH: 
DAU: 
TJR: 
SGY: 
DOR: 
DAI: 
DMI: 
DED: 
DEC: 
DRS: 
HMO: 
FMA: 
APR: 
EEL: 
ERE: 
ERT: 
ERA: 
ELM: 
EAC: 
AWO: 
OVA: 
SAY: 
SAP: 
CLO: 
BPRS: 
BPRL: 
TTE: 
TTE1507(def)
TEX: 
THX: 
TPD: 
TIT: 
TMT: 
TBO: 
TWI: 
CHY: 
TEP: 
TAE: 
MTA: 
ADG: 
TPZ: 
CSC: 
ATE: 
COB: 
CHD: 
COW: 
CKI: 
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TTM: 
TTO: 
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TSH: 
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TNR: 
MAS: 
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HOR: 
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SRI: 
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MHG: 
PUF: 
AFN: 
AIN: 
ERH: 
ERS: 
EUC: 
MGE: 
MG_106(def)
MGU: 
MGC: 
MGQ: 
MGX: 
MPN: 
MPN245(def)
MPM: 
MPJ: 
MPB: 
MPU: 
MPE: 
MGA: 
MGH: 
MGF: 
MGN: 
MGS: 
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MGV: 
MGW: 
MGAC: 
MGAN: 
MGNC: 
MGZ: 
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MML: 
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MAT: 
MHO: 
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MFR: 
MFM: 
MFP: 
MBV: 
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MBI: 
MLC: 
MLH: 
MPF: 
MPUT: 
MCY: 
MCYN_0019(MCYN0019)
UUR: 
UU465(def)
UPA: 
UUE: 
HCR: 
ACL: 
ABRA: 
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SCR: 
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SDI: 
STAI: 
SAPI: 
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SCQ: 
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Rv0429c(def)
MTV: 
MTC: 
MT0444(def)
MRA: 
MTF: 
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MTK: 
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MTI: 
MTE: 
MTUR: 
MTL: 
MTO: 
MTD: 
MTN: 
MTJ: 
MTUB: 
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MTX: 
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MTUT: 
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MTQ: 
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Mb0437c(def)
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MBT: 
MBM: 
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MAF: 
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MCV: 
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MLE: 
ML1929(def)
MLB: 
MPA: 
MAO: 
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MID: 
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MSM: 
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MGI: 
MSP: 
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MABB: 
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MMC: 
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MJL: 
MJD: 
MMI: 
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MCB: 
MLI: 
MKN: 
MNE: 
ASD: 
CGL: 
NCgl1539(def) NCgl2643(def)
CGB: 
cg1804(def) cg3034(def)
CGU: 
WA5_1539(Def) WA5_2643(Def)
CGT: 
CGS: 
CGG: 
CGM: 
cgp_1804(def2) cgp_3034(def1)
CEF: 
CE1720(def) CE2577(def)
CDI: 
DIP1323(def) DIP2045(def)
CDP: 
CDH: 
CDT: 
CDE: 
CDR: 
CDA: 
CDZ: 
CDB: 
CDS: 
CDD: 
CDW: 
CDV: 
CJK: 
jk0261(defA) jk1014(def)
CUR: 
CUA: 
CAR: 
CKP: 
CPU: 
CPL: 
CPG: 
CPP: 
CPK: 
CPQ: 
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COR: 
COP: 
Cp31_1129(def1) Cp31_1815(def)
COD: 
COS: 
COI: 
COE: 
COU: 
CRD: 
CRES_0159(defB) CRES_1095(defA)
CUL: 
CUC: 
CUE: 
CVA: 
CVAR_0466(defB) CVAR_1498(defA)
CHN: 
CCN: 
CTER: 
CMD: 
CAZ: 
CFN: 
CCG: 
CVT: 
CGY: 
CAX: 
NFA: 
nfa26520(def) nfa36090(def) nfa53010(def)
NCY: 
NBR: 
NNO: 
RHA: 
RER: 
REY: 
ROP: 
ROA: 
REQ: 
RPY: 
GBR: 
GPO: 
GOR: 
TPR: 
SRT: 
SCO: 
SCO0883(def) SCO1211(2SCG58.11c) SCO4560(SCD16A.23) SCO5221(SC7E4.18)
SMA: 
SAV_3033(def1) SAV_7126(def2) SAV_7349(def)
SGR: 
SCB: 
SSX: 
SVL: 
SCT: 
SCY: 
SFA: 
SBH: 
SHY: 
SHO: 
SVE: 
SDV: 
BN159_1184(def3) BN159_3156(def1) BN159_3819(def3) BN159_7374(def2)
SALB: 
STRP: 
SFI: 
SCI: 
SRC: 
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SLIV_12260(def4) SLIV_15465(def3) SLIV_31740(def2) SLIV_33520(def1)
KSK: 
KSE_13790(def2) KSE_49250(def1)
TWH: 
TWT310(def)
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TW462(def)
LXX: 
LXY: 
CMI: 
CMM_1595(defA) CMM_1878(defB)
CMS: 
CMC: 
CMN_01573(def) CMN_01856(defB)
MTS: 
RLA: 
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KRH: 
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AMN: 
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PDX: 
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VMA: 
AMS: 
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AFS: 
CAI: 
SNA: 
AHE: 
MCU: 
TPY: 
ASG: 
BLO: 
BL1186(def) BL1502(def) BL1700(fms)
BLJ: 
BLD_0402(def1) BLD_0944(def) BLD_1867(def3)
BLN: 
BLON: 
BLF: 
BLL: 
BLB: 
BLM: 
BLK: 
BLG: 
BAD: 
BAD_0780(def2) BAD_1293(def)
BLA: 
BLA_0479(fms) BLA_0530(def) BLA_1294(def)
BLC: 
BLT: 
BBB: 
BBC: 
BNM: 
BLV: 
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BLS: 
BANI: 
BANL: 
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BDE: 
BBI: 
BBP: 
BBF: 
BBB_0418(def) BBB_0998(def) BBB_1113(def)
BBV: 
BBRU: 
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BBRN: 
BBRS: 
BAST: 
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APV: 
ELE: 
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CGO: 
GPA: 
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CTR: 
CT_353(def)
CTD: 
CTF: 
CTRD: 
CTRO: 
CTRT: 
CTA: 
CTY: 
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CTRQ: 
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CTRZ: 
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CTL0607(def)
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CTLI: 
CTL: 
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CTRV: 
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CTLM: 
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CTLQ: 
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CTRN: 
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CTK: 
CSW: 
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CTRB: 
CTRE: 
CTRS: 
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CFS: 
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CTRF: 
CTCH: 
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CTQ: 
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CTW: 
CTRG: 
CTRI: 
CTRA: 
CTRH: 
CTRJ: 
CTRK: 
CTJT: 
CTCF: 
CTFS: 
CTHF: 
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CTTJ: 
CTJS: 
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CTRW: 
CTRY: 
CTCT: 
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TC_0632(def)
CMN: 
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CPT: 
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CLP: 
CPM: 
CPEC: 
CPEO: 
CPER: 
CHP: 
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CHS: 
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CHT: 
CHC: 
CHR: 
CPSC: 
CPSN: 
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CPSV: 
CPSW: 
CPST: 
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CCA: 
CAB: 
CAB307(def)
CFE: 
CF0692(def)
PCU: 
pc0541(def) pc0803(def)
PUV: 
PUV_09310(def-A) PUV_12790(def-B)
WCH: 
SNG: 
OTE: 
CAA: 
MIN: 
AMU: 
BBU: 
BB_0065(def)
BBN: 
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BBUR: 
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BTU: 
BT0065(def)
BHR: 
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BRE_68(def)
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TPC: 
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TPM: 
TPB: 
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TDE1645(def)
TSU: 
TBE: 
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TPED: 
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SSM: 
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STQ: 
SFC: 
SLR: 
SBU: 
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SGP: 
LIL: 
LA_2438(def)
LIE: 
LIC: 
LBJ: 
LBL: 
LBI: 
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FSU: 
FSC: 
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TAI: 
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TLI: 
AMO: 
SBR: 
RBA: 
RB12856(def)
PSL: 
PLM: 
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PHM: 
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slr1549(def)
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SYS: 
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TEL: 
tlr1676(def)
THN: 
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CYT: 
CYP: 
CYC: 
CYN: 
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CYJ: 
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gll2228(def) glr1729(def)
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NOS: 
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NAZ: 
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CALO: 
CALT: 
RIV: 
PMA: 
PMM: 
PMM0068(def)
PMT: 
PMN: 
PMI: 
PMB: 
PMC: 
PMF: 
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PMH: 
PMJ: 
PME: 
CTHE: 
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SCS: 
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BT_0420(def)
BFR: 
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BF1691(def)
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BHL: 
BSA: 
BXY: 
BACC: 
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PG2201(def)
PGN: 
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PDT: 
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RBC: 
DOI: 
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NKO: 
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NIDE1806(def1) NIDE2589(def2)
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TOP: 
TCM: 
SAAL: 
SBE: 
TTR: 
MOX: 
HHS: 
SRB: 
WWE: 
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:4973445]
  Authors
Adams JM.
  Title
On the release of the formyl group from nascent protein.
  Journal
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Mazel D, Pochet S, Marliere P.
  Title
Genetic characterization of polypeptide deformylase, a distinctive enzyme of eubacterial translation.
  Journal
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Chan MK, Gong W, Rajagopalan PT, Hao B, Tsai CM, Pei D.
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Crystal structure of the Escherichia coli peptide deformylase.
  Journal
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Structure of peptide deformylase and identification of the substrate binding site.
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Determination of substrate specificity for peptide deformylase through the screening of a combinatorial peptide library.
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Substrate recognition and selectivity of peptide deformylase. Similarities and differences with metzincins and thermolysin.
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Peptide deformylase as a target for new generation, broad spectrum antimicrobial agents.
  Journal
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Peptide deformylase: a target for novel antibiotics?
  Journal
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CAS: 
369636-51-1

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