KEGG   ENZYME: 4.1.1.39Help
Entry
EC 4.1.1.39                 Enzyme                                 

Name
ribulose-bisphosphate carboxylase;
D-ribulose 1,5-diphosphate carboxylase;
D-ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase;
RuBP carboxylase;
carboxydismutase;
diphosphoribulose carboxylase;
ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase;
ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase;
ribulose 1,5-diphosphate carboxylase;
ribulose 1,5-diphosphate carboxylase/oxygenase;
ribulose bisphosphate carboxylase/oxygenase;
ribulose diphosphate carboxylase;
ribulose diphosphate carboxylase/oxygenase;
rubisco;
3-phospho-D-glycerate carboxy-lyase (dimerizing)
Class
Lyases;
Carbon-carbon lyases;
Carboxy-lyases
BRITE hierarchy
Sysname
3-phospho-D-glycerate carboxy-lyase (dimerizing; D-ribulose-1,5-bisphosphate-forming)
Reaction(IUBMB)
2 3-phospho-D-glycerate + 2 H+ = D-ribulose 1,5-bisphosphate + CO2 + H2O [RN:R00024]
Reaction(KEGG)
R00024;
(other) R03140
Show
Substrate
3-phospho-D-glycerate [CPD:C00197];
H+ [CPD:C00080]
Product
D-ribulose 1,5-bisphosphate [CPD:C01182];
CO2 [CPD:C00011];
H2O [CPD:C00001]
Comment
Will utilize O2 instead of CO2, forming 3-phospho-D-glycerate and 2-phosphoglycolate.
Pathway
Glyoxylate and dicarboxylate metabolism
Carbon fixation in photosynthetic organisms
Metabolic pathways
Biosynthesis of secondary metabolites
Microbial metabolism in diverse environments
Orthology
K01601  
ribulose-bisphosphate carboxylase large chain
K01602  
ribulose-bisphosphate carboxylase small chain
Genes
ATH: 
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
GMX: 
MTR: 
CAM: 
6797517(rbcL)
FVE: 
CSV: 
101219300(RBCS) 3429289(rbcL)
RCU: 
POP: 
VVI: 
SLY: 
101257875 101268337(Rbcs-3B) 3950460(rbcL) 543973(RBCS-1) 543974(RBCS-2A)
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os02t0152400-01(Os02g0152400) Os05t0427800-00(Os05g0427800) Os10t0356000-00(Os10g0356000) Os12t0207600-00(Os12g0207600) Os12t0274700-01(Os12g0274700) Os12t0291100-01(Os12g0291100) Os12t0291400-01(Os12g0291400) Os12t0292400-01(Os12g0292400)
BDI: 
SBI: 
SORBI_05g003480(SORBIDRAFT_05g003480) SobiCp030(rbcL)
ZMA: 
100279574 542212(ssu1) 845212(rbcL)
SITA: 
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
OTA: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
CymeCp013(rbcL)
GSL: 
CCP: 
CHC_950(rbcL)
TPS: 
PPF: 
PPI: 
MCA: 
MCA2743(rbcL) MCA2744(cbbS)
TCX: 
TCY: 
MEJ: 
NOC: 
NHL: 
NWA: 
ALV: 
TVI: 
TMB: 
AEH: 
HHA: 
TGR: 
TKM: 
TNI: 
TVNIR_2991(cbbS_[H]) TVNIR_2992(cbbL_[H])
HNA: 
CSA: 
HEL: 
MMW: 
MME: 
AFE: 
AFR: 
AFE_1690(cbbS-2) AFE_1691(rbcL) AFE_2155(cbbL2) AFE_3051(rbcL) AFE_3052(cbbS-1)
ACU: 
AFI: 
RMA: 
VOK: 
COSY_0653(cbbM)
REH: 
H16_B1394(cbbS2) H16_B1395(rbcL) PHG426(cbbSp) PHG427(rbcL)
RME: 
Rmet_1500(cbbS) Rmet_1501(cbbL)
CTI: 
CNC: 
BAC: 
BXE: 
BPH: 
BPY: 
BUG: 
BGE: 
BGF: 
BYI: 
BPX: 
BUO: 
PPK: 
PRB: 
BBR: 
BBM: 
BBH: 
AXY: 
AXN: 
AKA: 
RFR: 
POL: 
PNA: 
ACK: 
DAC: 
VAP: 
VPE: 
VPD: 
MPT: 
Mpe_A1478(rbcL) Mpe_A1479(cbbS) Mpe_A2782(rbcL) Mpe_A2783(cbbS)
LCH: 
TIN: 
THI: 
THI_0135(rbcL) THI_0136(cbbS) THI_2041(cbbM)
RGE: 
RGE_36050(cbbS) RGE_36060(cbbL)
NEU: 
NE1920(cbbS) NE1921(rbcL)
NET: 
NIT: 
NII: 
NMU: 
AZA: 
AZKH_p0230(cbbS_rbcS) AZKH_p0231(cbbL_rbcL)
DAR: 
TBD: 
Tbd_2623(cbbS) Tbd_2624(rbcL) Tbd_2638(cbbM)
SDR: 
SCD_n02031(cbbL) SCD_n02032(cbbS) SCD_n02850(cbbM)
APP: 
SLT: 
GCA: 
DAS: 
DHY: 
MLO: 
MCI: 
MOP: 
MAM: 
SME: 
SM_b20197(cbbS) SM_b20198(rbcL) SM_b20393(rbcL)
SMK: 
SMQ: 
SMX: 
SMI: 
SMEG: 
SMEL: 
SMD: 
RHI: 
NGR_b22000(rbcL1) NGR_c06470(rbcL2)
SFH: 
SFD: 
ARA: 
Arad_9230(rbcL)
RET: 
REC: 
REL: 
RLE: 
pRL120396(cbbl1)
RLT: 
RLG: 
RTR: 
OAN: 
BJA: 
blr2585(rbcL) blr2586(cbbS)
BJU: 
BRA: 
BRADO1659(rbcL) BRADO1660(cbbS) BRADO2274(rbcL) BRADO2275(cbbS)
BBT: 
BBta_0451(rbcL) BBta_0452(cbbS) BBta_2641(rbcL) BBta_2642(cbbS) BBta_6396(cbbS) BBta_6397(rbcL)
BRS: 
S23_53960(cbbS) S23_53970(cbbL)
RPA: 
RPA0262(rlp2) RPA1559(rbcL) RPA1560(cbbS) RPA2169(rlp1) RPA4641(cbbM)
RPB: 
RPC: 
RPD: 
RPE: 
RPT: 
RPX: 
NWI: 
NHA: 
OCG: 
OCO: 
AOL: 
XAU: 
AZC: 
SNO: 
MET: 
MNO: 
MSL: 
RVA: 
RSP: 
RSP_1281(cbbS) RSP_1282(cbbL) RSP_3271(rbpL)
RSH: 
RSQ: 
RSK: 
RCP: 
JAN: 
PDE: 
OAT: 
ACR: 
AMV: 
ACMV_08240(rbcL) ACMV_10880(cbbS) ACMV_10890(cbbL)
RRU: 
RRF: 
RCE: 
RC1_0239(rbcL) RC1_0240(ccbS2) RC1_4061(rbcL) RC1_4062(cbbS1)
RPM: 
MAG: 
MGY: 
ALI: 
PGV: 
BSUB: 
GYM: 
PMS: 
PMQ: 
PMW: 
BTS: 
CCL: 
SAY: 
TPY_0781(rbcS) TPY_0782(rbcL)
SAP: 
ADG: 
TNR: 
VPR: 
NCY: 
GOR: 
AAU: 
ACH: 
ARR: 
MPH: 
TCU: 
GOB: 
PDX: 
AFO: 
MIN: 
Minf_1263(rbcS) Minf_1264(rbcL)
PLM: 
IPA: 
SYN: 
slr0009(rbcL) slr0012(rbcS)
SYZ: 
SYY: 
SYT: 
SYS: 
SYQ: 
SYW: 
SYNW1717(rbcS) SYNW1718(rbcL)
SYC: 
syc0129_c(rbcS) syc0130_c(rbcL)
SYF: 
SYD: 
SYE: 
SYG: 
sync_1966(cbbS) sync_1967(rbcL)
SYR: 
SYX: 
SYP: 
CYA: 
CYA_1194(rbcL) CYA_1196(cbbS)
CYB: 
CYB_2577(cbbS) CYB_2579(rbcL)
SYNE: 
SYNP: 
TEL: 
tll1504(rbcS) tll1506(rbcL)
THN: 
MAR: 
MAE_47870(rbcS) MAE_47890(rbcL)
CYT: 
cce_3164(rbcS) cce_3166(rbcL)
CYP: 
CYC: 
CYN: 
CYH: 
CYJ: 
AMR: 
AM1_1783(rbcS) AM1_1785(rbcL)
CGC: 
CAN: 
CSN: 
DSL: 
HAO: 
GLP: 
CMP: 
GVI: 
gvip295(rbcL) gvip297(rbcS)
GLJ: 
GKIL_0667(rbcS) GKIL_0669(rbcL)
ANA: 
alr1524(rbcL) alr1526(rbcS)
NPU: 
NOS: 
NOP: 
AVA: 
ANB: 
ACY: 
NAZ: 
CSG: 
CALO: 
CALT: 
RIV: 
PMA: 
Pro_0551(rbcL) Pro_0552(rbcS)
PMM: 
PMM0550(rbcL) PMM0551(rbcS)
PMT: 
PMT1204(rbcS) PMT1205(rbcL)
PMN: 
PMI: 
PMB: 
PMC: 
PMF: 
PMG: 
PMH: 
PMJ: 
PME: 
TER: 
LEP: 
GEI: 
OAC: 
ONI: 
PSEU: 
CEP: 
MIC: 
ARP: 
CTHE: 
PLP: 
SCS: 
RMR: 
RMG: 
NKO: 
PHE: 
SHG: 
EVI: 
DFE: 
CTE: 
CT1772(rbcL)
CPC: 
CCH: 
CPH: 
CPB: 
CLI: 
PVI: 
PLT: 
PPH: 
PAA: 
CTS: 
TRO: 
CAP: 
TOS: 
MRB: 
MRE: 
MSV: 
OPR: 
TLE: 
NDE: 
LFC: 
LFI: 
MOX: 
DAMO_2165(cbbL) DAMO_2166(cbbS)
SRB: 
MJA: 
MJ_1235(rbcL)
MFE: 
MVU: 
MFS: 
MIG: 
MOK: 
MAC: 
MA4555(rbcL)
MBA: 
MMA: 
MM_1249(rbcL)
MMAZ: 
MBU: 
MMH: 
MEV: 
MZH: 
MPY: 
MHZ: 
MTP: 
MCJ: 
MCON_3086(cbbM)
MHI: 
MHU: 
MLA: 
MEM: 
MBG: 
MPI: 
MBN: 
Mboo_1105(rbcL)
MFO: 
MPL: 
MPD: 
MCP_1116(rbcL)
MEZ: 
Mtc_1074(rbcL)
RCI: 
RCIX222(rbcL)
MER: 
MAX: 
AFU: 
AF1638(rbcL)
APO: 
AVE: 
AST: 
FPL: 
NPH: 
NP2770A(rbcL)
HMU: 
Hmuk_2766(rbcL)
NMG: 
HVO: 
HVO_0970(rbcL)
HME: 
HFX_0967(rbcL)
HBO: 
NAT: 
TAR: 
PHO: 
PH0939(rbcL)
PAB: 
PAB1580(rbcL)
PFU: 
PF1156(rbcL)
PFI: 
PFC_05005(rbcL)
PYN: 
PYA: 
PYS: 
TKO: 
TK2290(rbcL)
TON: 
TON_1234(rbcL)
TGA: 
TGAM_1751(rbcL)
TSI: 
TSIB_1596(rbcL)
TBA: 
THE: 
GQS_09490(rbcL)
THA: 
THM: 
TLT: 
THS: 
ABI: 
ACF: 
SMR: 
Smar_1051(rbcL)
SHC: 
DKA: 
DKAM_1140(rbcL)
DMU: 
DFD: 
TAG: 
IAG: 
THG: 
HBU: 
Hbut_0503(rbcL)
TPE: 
Tpen_1227(rbcL)
THB: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:4331471]
  Authors
Bowes G, Ogren WL, Hageman RH.
  Title
Phosphoglycolate production catalyzed by ribulose diphosphate carboxylase.
  Journal
Biochem. Biophys. Res. Commun. 45 (1971) 716-22.
  Organism
Zea mays [GN:zma], Glycine max
Reference
2  [PMID:4310607]
  Authors
Wishnick M, Lane MD, Scrutton MC, Mildvan AS.
  Title
The presence of tightly bound copper in ribulose diphosphate carboxylase from spinach.
  Journal
J. Biol. Chem. 244 (1969) 5761-3.
  Organism
Spinacia oleracea
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
9027-23-0

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