KEGG   ENZYME: 5.3.1.25Help
Entry
EC 5.3.1.25                 Enzyme                                 

Name
L-fucose isomerase
Class
Isomerases;
Intramolecular oxidoreductases;
Interconverting aldoses and ketoses, and related compounds
BRITE hierarchy
Sysname
L-fucose aldose-ketose-isomerase
Reaction(IUBMB)
L-fucopyranose = L-fuculose [RN:R03163]
Reaction(KEGG)
Substrate
L-fucopyranose
Product
L-fuculose [CPD:C01721]
Comment
Requires a divalent metal ion (the enzyme from the bacterium Escherichia coli prefers Mn2+). The enzyme binds the closed form of the sugar and catalyses ring opening to generate a form of open-chain conformation that facilitates the isomerization reaction, which proceeds via an ene-diol mechanism [3]. The enzyme from Escherichia coli can also convert D-arabinose to D-ribulose [1]. The enzyme from the thermophilic bacterium Caldicellulosiruptor saccharolyticus also converts D-altrose to D-psicose and L-galactose to L-tagatose [4].
History
EC 5.3.1.25 created 1999
Pathway
Fructose and mannose metabolism
Microbial metabolism in diverse environments
Orthology
K01818  
L-fucose isomerase
Genes
ECO: 
b2802(fucI)
ECJ: 
Y75_p2739(fucI)
ECD: 
EBW: 
BWG_2540(fucI)
ECOK: 
ECE: 
Z4119(fucI)
ECS: 
ECs3662(fucI)
ECF: 
ETW: 
ECSP_3754(fucI)
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c3371(fucI)
ECP: 
ECP_2785(fucI)
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECSE_3062(fucI)
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
CE10_3229(fucI)
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
O3O_20165(fucI)
ESM: 
O3M_05530(fucI)
ESL: 
O3K_05485(fucI)
ECL: 
EBR: 
ECB_02653(fucI)
EBD: 
ECBD_0920(fucI)
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ECW_m3012(fucI)
ELL: 
WFL_14715(fucI)
ELC: 
i14_3095(fucI)
ELD: 
i02_3095(fucI)
ELP: 
EBL: 
ECD_02653(fucI)
EBE: 
B21_02614(fucI)
ELF: 
LF82_0770(fucI)
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
STY: 
STY3116(fucI)
STT: 
t2884(fucI)
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM2976(fucI)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SEEN: 
SENR: 
SEND: 
SPT: 
SPA2840(fucI)
SEK: 
SSPA2646(fucI)
SPQ: 
SEI: 
SPC_3035(fucI)
SEC: 
SC2916(fucI)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SeD_A3301(fucI)
SEG: 
SG2886(fucI)
SEL: 
SPUL_2986(fucI)
SEGA: 
SET: 
SEN2820(fucI)
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
BN855_30380(SBOV30221)
SENE: 
IA1_14320(fucI)
SES: 
SFL: 
SF2816(fucI)
SFX: 
S3011(fucI)
SFV: 
SFV_2881(fucI)
SFE: 
SFxv_3089(fucI)
SSJ: 
SBO: 
SBO_2685(fucI)
SBC: 
SDY: 
SDY_3020(fucI)
SDZ: 
PAY: 
PAU_00702(fucI)
SGL: 
SG0181(fucI)
SOD: 
Sant_3737(fucI)
ECLO: 
ESC: 
KPN: 
KPN_03153(fucI)
KPU: 
KP1_4433(fucI)
KPM: 
KPP: 
KPE: 
KPK_0964(fucI)
KPO: 
KPR: 
KPR_4167(fucI)
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KVA: 
KOX: 
KOX_01280(fucI)
KOE: 
KOY: 
CKO: 
CKO_04161(fucI)
CRO: 
ROD_28471(fucI)
CFD: 
SFO: 
ETR: 
ETAE_0290(fucI)
ETD: 
ETC: 
ROR: 
HIN: 
HI0614(fucI)
HIT: 
NTHI0871(fucI)
HIP: 
HIQ: 
HIF: 
HIL: 
HIU: 
HIE: 
HIZ: 
HIK: 
HAP: 
HAPS_1526(fucI)
HPAZ: 
HSO: 
HS_1448(fucI)
HSM: 
HSM_0583(fucI)
MHT: 
MHQ: 
MHX: 
MHAE: 
MHAM: 
MHAO: 
MHAL: 
MVR: 
MVI: 
MVG: 
MVE: 
APL: 
APL_1684(fucI)
APJ: 
APJL_1716(fucI)
APA: 
GAN: 
VVY: 
VV2179(fucI)
VVM: 
VEJ: 
AHY: 
AHR: 
AHP: 
GDI: 
GDI_2657(fucI)
GDJ: 
Gdia_0870(fucI)
BCR: 
BCQ: 
BCQ_2997(fucI)
BNC: 
BTF: 
LIV: 
LIW: 
PJD: 
GYM: 
PMS: 
PMQ: 
PMW: 
B2K_21345(fucI)
AAD: 
TC41_0681(fucI)
SPN: 
SP_2158(fucI)
SPD: 
SPD_1986(fucI)
SPR: 
spr1964(fucI)
SPW: 
SPCG_2126(fucI)
SPX: 
SNE: 
SPV: 
SPH_2352(fucI)
SNM: 
SJJ: 
SPJ_2184(fucI)
SPP: 
SPP_2209(fucI)
SNT: 
SPT_2171(fucI)
SNC: 
SNB: 
SNP: 
SNI: 
SNV: 
SNX: 
SND: 
SNU: 
SPNG: 
SPNE: 
SPNU: 
SPNM: 
SPNO: 
SPNN: 
SSF: 
SSQ: 
SSUI: 
T15_1048(fucI)
LRH: 
LGG_02685(fucI)
LRG: 
EHR: 
EHR_02425(fucI)
CPE: 
CPE0318(fucI)
CPF: 
CPF_1048(fucI)
CCB: 
ESR: 
ESU: 
RUM: 
ROB: 
RTO: 
CPY: 
Cphy_3155(fucI)
ELM: 
CSC: 
ATE: 
Athe_2073(fucI)
CHD: 
CKN: 
MAS: 
HOR: 
MHG: 
PUF: 
NNO: 
PAC: 
PAK: 
PAV: 
PAX: 
PAZ: 
PAW: 
PAZ_c06460(fucI1) PAZ_c06470(fucI2)
PCN: 
PACC: 
PACH: 
PPC: 
SEN: 
AMQ: 
SNA: 
TPY: 
RXY: 
CWO: 
AMU: 
Amuc_1832(fucI)
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TAZ: 
SCD: 
STQ: 
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SCC: 
SGP: 
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BPW: 
BIP: 
BTH: 
BT_1273(fucI)
BFR: 
BFS: 
BF0211(fucI)
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BVU_1373(fucI)
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TFO: 
BFO_0306(fucI)
BVS: 
PRU: 
PRU_2781(fucI)
DOI: 
SHG: 
EVI: 
MRO: 
CAP: 
TMA: 
TMM: 
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TLE: 
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TNP: 
PMO: 
MPG: 
CCZ: 
FGI: 
DTH: 
DTU: 
Dtur_0410(fucI)
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:13319278]
  Authors
GREEN M, COHEN SS.
  Title
Enzymatic conversion of L-fucose to L-fuculose.
  Journal
J. Biol. Chem. 219 (1956) 557-68.
  Sequence
[eco:b2802]
Reference
2  [PMID:2664711]
  Authors
Lu Z, Lin EC.
  Title
The nucleotide sequence of Escherichia coli genes for L-fucose dissimilation.
  Journal
Nucleic. Acids. Res. 17 (1989) 4883-4.
  Sequence
[eco:b2802]
Reference
3  [PMID:9367760]
  Authors
Seemann JE, Schulz GE
  Title
Structure and mechanism of L-fucose isomerase from Escherichia coli.
  Journal
J. Mol. Biol. 273 (1997) 256-68.
  Sequence
[eco:b2802]
Reference
4  [PMID:19856146]
  Authors
Ju YH, Oh DK
  Title
Characterization of a recombinant L-fucose isomerase from Caldicellulosiruptor saccharolyticus that isomerizes L-fucose, D-arabinose, D-altrose, and L-galactose.
  Journal
Biotechnol. Lett. 32 (2010) 299-304.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
60063-83-4

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