KEGG   ENZYME: 5.3.3.2Help
Entry
EC 5.3.3.2                  Enzyme                                 

Name
isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase;
isopentenylpyrophosphate Delta-isomerase;
methylbutenylpyrophosphate isomerase;
isopentenylpyrophosphate isomerase
Class
Isomerases;
Intramolecular oxidoreductases;
Transposing C=C bonds
BRITE hierarchy
Sysname
isopentenyl-diphosphate Delta3-Delta2-isomerase
Reaction(IUBMB)
isopentenyl diphosphate = dimethylallyl diphosphate [RN:R01123]
Reaction(KEGG)
Substrate
isopentenyl diphosphate [CPD:C00129]
Product
dimethylallyl diphosphate [CPD:C00235]
Comment
The enzyme from Streptomyces sp. strain CL190 requires FMN and NAD(P)H as cofactors. Activity is reduced if FMN is replaced by FAD, but the enzyme becomes inactive when NAD(P)H is replaced by NAD+ or NADP+. That enzyme also requires Mg2+, Mn2+ or Ca2+ for activity.
History
EC 5.3.3.2 created 1961, modified 2002
Pathway
Terpenoid backbone biosynthesis
Metabolic pathways
Biosynthesis of secondary metabolites
Orthology
K01823  
isopentenyl-diphosphate delta-isomerase
Genes
HSA: 
3422(IDI1) 91734(IDI2)
PTR: 
450262(IDI2) 450263(IDI1)
PPS: 
100975839(IDI2) 100976186(IDI1)
GGO: 
101130797(IDI2) 101131151(IDI1)
PON: 
100173020(IDI1)
MCC: 
MCF: 
101864943(IDI1) 102121704(IDI2)
MMU: 
319554(Idi1) 320581(Idi2)
RNO: 
502143(Idi2) 689872(RGD1564999) 89784(Idi1)
CGE: 
100752366(Idi1) 100752668(Idi2)
HGL: 
101702441(Idi2) 101712767(Idi1)
TUP: 
CFA: 
100687634(IDI1)
AML: 
FCA: 
102901899(IDI1)
PTG: 
102963077(IDI1)
BTA: 
514293(IDI1)
BOM: 
102268825(IDI1)
PHD: 
102335323(IDI1)
CHX: 
102191533(IDI1)
OAS: 
101108851(IDI1)
SSC: 
CFR: 
102512168(IDI1)
BACU: 
103007308(IDI1)
LVE: 
ECB: 
MYB: 
MYD: 
102754130(IDI1)
PALE: 
102891875(IDI1)
MDO: 
SHR: 
OAA: 
100080658(IDI1)
GGA: 
420459(IDI1)
MGP: 
TGU: 
FAB: 
101810852(IDI1)
PHI: 
102100807(IDI1)
APLA: 
101792434(IDI1)
FPG: 
101910858(IDI1)
FCH: 
102059807(IDI1)
CLV: 
102097071(IDI1)
ASN: 
102370886(IDI1)
AMJ: 
102565794(IDI1)
PSS: 
102458644(IDI1)
CMY: 
102939414(IDI1)
ACS: 
PBI: 
103058764(IDI1)
XLA: 
494671(idi1)
XTR: 
496783(idi1)
DRE: 
553513(idi1)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102365989(IDI1)
CMK: 
BFO: 
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
CEL: 
CBR: 
CBG22969(Cbr-idi-1)
BMY: 
LOA: 
SMM: 
NVE: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
AT3G02780(IPP2) AT5G16440(IPP1)
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
CSV: 
RCU: 
POP: 
POPTR_0019s08090g(POPTRDRAFT_809590)
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os05t0413400-01(Os05g0413400) Os07t0546000-01(Os07g0546000)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_02g035700(SORBIDRAFT_02g035700) SORBI_09g020370(SORBIDRAFT_09g020370)
ZMA: 
100502421 541901(umc1301)
SITA: 
ATR: 
s00089p00181680(AMTR_s00089p00181680)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
BPG: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YPL117C(IDI1)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
PPA: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0C01740(NCAS0C01740)
NDI: 
NDAI_0E02450(NDAI0E02450)
TPF: 
TPHA_0A01080(TPHA0A01080)
TBL: 
TBLA_0B04230(TBLA0B04230)
TDL: 
TDEL_0A05550(TDEL0A05550)
KAF: 
KAFR_0H02800(KAFR0H02800)
DHA: 
PIC: 
PGU: 
SPAA: 
LEL: 
CAL: 
CTP: 
COT: 
CDU: 
CTEN: 
YLI: 
CLU: 
NCR: 
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
CTHR: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
NHE: 
TRE: 
MAW: 
MAJ: 
CMT: 
VAL: 
ELA: 
BFU: 
MBE: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_860144(AO090023000500)
ANG: 
ANI_1_1076074(An08g07570)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
CPW: 
PBL: 
URE: 
ABE: 
TVE: 
AJE: 
PNO: 
PTE: 
BZE: 
BSC: 
BOR: 
ZTR: 
PFJ: 
BCOM: 
NPA: 
TML: 
SPO: 
CNE: 
CNB: 
CGI: 
TMS: 
DSQ: 
SHS: 
PCO: 
PSQ: 
ADL: 
FME: 
GTR: 
LBC: 
MPR: 
MRR: 
CCI: 
SCM: 
ABP: 
AGABI1DRAFT110499(AGABI1DRAFT_110499)
ABV: 
AGABI2DRAFT189600(AGABI2DRAFT_189600)
CPUT: 
SLA: 
UMA: 
PFP: 
MGL: 
PGR: 
MLR: 
WSE: 
ECU: 
EIN: 
EHE: 
NCE: 
MBR: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
EHI: 
EHI_194410(46.t00025)
EDI: 
ACAN: 
TET: 
PTM: 
PTI: 
TPS: 
PIF: 
EHX: 
GTT: 
TBR: 
TCR: 
LMA: 
LIF: 
LDO: 
LMI: 
LBZ: 
NGR: 
TVA: 
GLA: 
ECO: 
b2889(idi)
ECJ: 
ECD: 
EBW: 
ECOK: 
ECE: 
ECS: 
ECF: 
ETW: 
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ELL: 
ELC: 
ELD: 
ELP: 
EBL: 
EBE: 
ELF: 
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
EFE: 
STY: 
STT: 
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM3039(idi)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SEEN: 
SENR: 
SEND: 
SPT: 
SPA2907(idi)
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SEC: 
SC2979(idi)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SEG: 
SG2934(idi)
SEL: 
SEGA: 
SET: 
SEN2882(idi)
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SEEP: 
SENB: 
BN855_31030(SBOV30901)
SENE: 
SES: 
SBG: 
SBZ: 
SFL: 
SFX: 
SFV: 
SFE: 
SSN: 
SSJ: 
SBO: 
SBC: 
SDY: 
SDZ: 
ECA: 
PCT: 
PCC: 
PWA: 
PEC: 
ETA: 
EPY: 
EPR: 
EAM: 
EAMY_1238(mvaD)
EAY: 
EBI: 
ERJ: 
PLU: 
PAY: 
PAU_01283(idi) PAU_03622(idi2)
SOD: 
ENT: 
ENC: 
ENO: 
ECLO: 
EEC: 
ENL: 
EAS: 
EAU: 
EAE: 
EAR: 
ENR: 
ESA: 
CSK: 
CSZ: 
CSI: 
CTU: 
KPN: 
KPU: 
KPM: 
KPP: 
KPE: 
KPO: 
KPR: 
KPJ: 
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KVA: 
KOX: 
KOE: 
KOY: 
CKO: 
CRO: 
CFD: 
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SRY: 
SRS: 
SRA: 
SMAF: 
SMW: 
SLQ: 
SERR: 
PMR: 
PMIB: 
EIC: 
ETR: 
ETD: 
ETC: 
PAM: 
PLF: 
PAJ: 
PAQ: 
PVA: 
Pvag_0631(mvaD)
PAO: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
PSI: 
EBT: 
MMK: 
ROR: 
EBF: 
PSTS: 
XOR: 
FAU: 
RHD: 
VPA: 
VPB: 
VPK: 
VPF: 
VPH: 
VHA: 
VCA: 
VAG: 
VEX: 
VEJ: 
VFI: 
VF_0403(idi)
VFM: 
PPR: 
PEN: 
PSA: 
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PFV: 
PDR: 
AVN: 
AVL: 
AVD: 
MBS: 
GNI: 
GPS: 
TTU: 
LPN: 
LPH: 
LPO: 
LPU: 
LPM: 
LPF: 
LPP: 
LPC: 
LPA: 
LPE: 
LLO: 
TCX: 
TCY: 
ALV: 
TVI: 
TMB: 
HHA: 
HHC: 
DNO: 
BMU: 
BMJ: 
EBA: 
DVU: 
DVU1679(idi)
DDE: 
LIP: 
LIR: 
DBA: 
BBA: 
BBAT: 
BBW: 
BBAC: 
BEX: 
BMX: 
DTO: 
AFW: 
MXA: 
MFU: 
MSD: 
CCX: 
SUR: 
SCL: 
sce1761(idi)
SCU: 
HOH: 
RPR: 
RPO: 
RPW: 
RPZ: 
RPG: 
RPS: 
RPV: 
RPQ: 
RPL: 
RPN: 
RTY: 
RT0439(idi)
RTT: 
RTB: 
RCM: 
RCC: 
RBE: 
RBO: 
RCO: 
RFE: 
RF_0785(fni)
RAK: 
RRI: 
RRJ: 
RRA: 
RRC: 
RRH: 
RRB: 
RRN: 
RRP: 
RMS: 
RMI: 
RPK: 
RAF: 
RHE: 
RJA: 
RSV: 
Rsl_830(fni)
RSW: 
RPH: 
RAU: 
RMO: 
RPP: 
RRE: 
RAM: 
MLO: 
MCI: 
MOP: 
MAM: 
MES: 
SFH: 
SFD: 
RET: 
REC: 
LAS: 
LAA: 
LSO: 
LCC: 
LAR: 
lam_723(lldD)
XAU: 
HDN: 
HDT: 
HMC: 
HNI: 
BSB: 
SIL: 
SIT: 
RSP: 
RSH: 
RSQ: 
RSK: 
RCP: 
JAN: 
RDE: 
RLI: 
DSH: 
KVU: 
KVL: 
PGA: 
PGL: 
PGD: 
OAT: 
OAR: 
LMD: 
RED: 
RCE: 
PBR: 
PGV: 
APB: 
BSU: 
BSR: 
BSL: 
BSH: 
BSY: 
BSS: 
BST: 
BSO: 
BSN: 
BSQ: 
BSUB: 
BSX: 
BSP: 
BLI: 
BL02217(fni)
BLD: 
BLH: 
BAO: 
BAMF_2188(seaA)
BAY: 
BAQ: 
BYA: 
BAMP: 
BAML: 
BAMA: 
BAMN: 
BAMB: 
BAMT: 
BAZ: 
BQL: 
LL3_02471(seaA)
BXH: 
BQY: 
BAMI: 
BAMC: 
BAMF: 
BAE: 
BAN: 
BAR: 
BAT: 
BAH: 
BAI: 
BAX: 
BANT: 
BANR: 
BANS: 
BAL: 
BCE: 
BCA: 
BCZ: 
BCR: 
BCB: 
BCU: 
BCG: 
BCQ: 
BCX: 
BNC: 
BCF: 
BCER: 
BCY: 
BTK: 
BTL: 
BTB: 
BTT: 
BTC: 
BTF: 
BTM: 
BTG: 
BTI: 
BTN: 
BTHT: 
BTHU: 
BWE: 
BTY: 
BPU: 
BPUM: 
BPF: 
BMQ: 
BMD: 
BMH: 
BCO: 
BCK: 
BAG: 
BJS: 
BACI: 
BIF: 
OIH: 
GWC: 
AFL: 
AXL: 
HHD: 
BSE: 
SAU: 
SA2136(fni)
SAV: 
SAV2346(fni)
SAW: 
SAH: 
SAJ: 
SAM: 
MW2267(fni)
SAS: 
SAR: 
SAR2431(fni)
SAC: 
SAX: 
SAA: 
SAO: 
SAE: 
SAD: 
SUU: 
SUV: 
SUH: 
SUE: 
SUJ: 
SUK: 
SUC: 
SUT: 
SUQ: 
SUZ: 
SUD: 
SUX: 
SUW: 
SUG: 
SUF: 
SAUA: 
SAUE: 
SAUN: 
SAUS: 
SAUU: 
SAUZ: 
SAB: 
SUY: 
SAUB: 
SAUM: 
SAUC: 
SAUR: 
SAUI: 
SAUT: 
SAUJ: 
SAUK: 
SAUQ: 
SAUV: 
SAUW: 
SAUX: 
SAUY: 
SEP: 
SER: 
SERP1937(fni-2)
SHA: 
SH0712(fni)
SSP: 
SCA: 
SLG: 
SLN: 
SSD: 
SDT: 
SWA: 
SPAS: 
LMO: 
LMF: 
LMH: 
LMC: 
LMN: 
LMY: 
LMT: 
LMG: 
LMS: 
LMJ: 
LMQ: 
LML: 
LMP: 
LMW: 
LMX: 
LMZ: 
LMON: 
LMOC: 
LMOS: 
LMOO: 
LMOY: 
LMOT: 
LMOA: 
LMOL: 
LMOG: 
LMOE: 
LMOB: 
LMOJ: 
LMOZ: 
LMOD: 
LMOW: 
LMOX: 
LMOQ: 
LMR: 
LIN: 
LWE: 
lwe1399(fni)
LSG: 
LIV: 
LIW: 
BBE: 
PJD: 
GYM: 
PPY: 
PPM: 
PPO: 
PPM_4641(M1_5077)
PPOL: 
PPQ: 
PMS: 
PMQ: 
PMW: 
PTA: 
PLV: 
PSAB: 
AAC: 
AAD: 
LLA: 
L11083(yebB)
LLK: 
LLT: 
LLS: 
lilo_0370(yebB)
LLD: 
LLC: 
LLM: 
LLR: 
LLN: 
LLI: 
LLW: 
LGR: 
LGV: 
SPY: 
SPZ: 
SPYM: 
SPM: 
SPG: 
SPS: 
SPH: 
SPI: 
SPJ: 
SPK: 
SPF: 
SPA: 
SPB: 
STG: 
SOZ: 
STZ: 
STX: 
SPYA: 
SPYH: 
SPN: 
SPD: 
SPR: 
spr0341(fni)
SPW: 
SPX: 
SNE: 
SPV: 
SNM: 
SJJ: 
SPP: 
SNT: 
SNC: 
SNB: 
SNP: 
SNI: 
SNV: 
SNX: 
SND: 
SNU: 
SPNG: 
SPNE: 
SPNU: 
SPNM: 
SPNO: 
SPNN: 
SAG: 
SAN: 
SAK: 
SGC: 
SAGS: 
SAGL: 
SAGM: 
SAGI: 
SAGR: 
SAGP: 
SMU: 
SMC: 
SMJ: 
SMUT: 
STC: 
str0562(idi)
STL: 
stu0562(idi)
STE: 
STN: 
STU: 
STW: 
SSA: 
SSU: 
SSV: 
SSB: 
SSI: 
SSU0272(fni)
SSS: 
SST: 
SSF: 
SSK: 
SSQ: 
SSW: 
SUI: 
SUO: 
SRP: 
SUP: 
SSUS: 
SSUT: 
SSUI: 
SSUY: 
SGO: 
SEQ: 
SEZ: 
SEZO: 
SEU: 
SUB: 
SUB0768(fni)
SDS: 
SDG: 
SDA: 
SDC: 
SDQ: 
SGA: 
SGG: 
SGT: 
SMB: 
SOR: 
STK: 
STB: 
SCP: 
SCF: 
SSR: 
STF: 
STJ: 
STD: 
SMN: 
SIF: 
SIE: 
SIB: 
SIU: 
SANG: 
SANC: 
SCG: 
SCON: 
SCOS: 
SOI: 
SIK: 
SLU: 
SIG: 
SIP: 
LPL: 
lp_1732(idi1)
LPJ: 
JDM1_1455(idi1)
LPT: 
LPS: 
LPR: 
LPZ: 
LJO: 
LJF: 
LJH: 
LJN: 
LAC: 
LAI: 
LAD: 
LSA: 
LSA0905(idi)
LSL: 
LSI: 
LDB: 
Ldb0996(fni)
LBU: 
LDE: 
LDL: 
LBR: 
LBK: 
LCA: 
LCB: 
LCZ: 
LCS: 
LCE: 
LCW: 
LCL: 
LGA: 
LRE: 
LRF: 
LRU: 
LRT: 
LRR: 
LHE: 
LHL: 
LHR: 
LHV: 
LHH: 
LFE: 
LFR: 
LFF: 
LRH: 
LRG: 
LRL: 
LRA: 
LRO: 
LRC: 
LCR: 
LAM: 
LAY: 
LBH: 
LBN: 
LKE: 
LRM: 
LSN: 
LPI: 
LPQ: 
PPE: 
PPEN: 
PCE: 
EFA: 
EFL: 
EFI: 
EFD: 
EFS: 
EFN: 
EFC: 
EFAU: 
EFU: 
EFM: 
EHR: 
ENE: 
ECAS: 
EMU: 
MPS: 
MPX: 
THL: 
OOE: 
LME: 
LMM: 
LMK: 
LCI: 
LKI: 
LGS: 
LEC: 
LCN: 
LGE: 
WKO: 
AUR: 
CRN: 
CML: 
CAW: 
CBE: 
CLS: 
CSR: 
CCL: 
STH: 
SWO: 
SLP: 
DRM: 
DCA: 
DKU: 
DRU: 
DGI: 
HMO: 
FMA: 
APR: 
ERE: 
TEP: 
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HAH: 
 » show all
Taxonomy
Reference
1  [PMID:11158573]
  Authors
Kaneda K, Kuzuyama T, Takagi M, Hayakawa Y, Seto H.
  Title
An unusual isopentenyl diphosphate isomerase found in the mevalonate pathway gene cluster from Streptomyces sp. strain CL190.
  Journal
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 98 (2001) 932-7.
  Organism
Staphylococcus aureus, Streptomyces sp.
  Sequence
Reference
2  [PMID:6351725]
  Authors
Bishop JM.
  Title
Cellular oncogenes and retroviruses.
  Journal
Annu. Rev. Biochem. 52 (1983) 301-54.
Reference
3  [PMID:13792054]
  Authors
AGRANOFF BW, EGGERER H, HENNING U, LYNEN F.
  Title
Biosynthesis of terpenes. VII. Isopentenyl pyrophosphate isomerase.
  Journal
J. Biol. Chem. 235 (1960) 326-32.
  Organism
Saccharomyces cerevisiae
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
IUBMB Enzyme Nomenclature: 
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
BRENDA, the Enzyme Database: 
CAS: 
9033-27-6

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