KEGG   ENZYME: 6.6.1.2Help
Entry
EC 6.6.1.2                  Enzyme                                 

Name
cobaltochelatase;
hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase;
CobNST;
CobNCobST
Class
Ligases;
Forming nitrogen-D-metal bonds;
Forming coordination complexes
BRITE hierarchy
Sysname
hydrogenobyrinic-acid-a,c-diamide:cobalt cobalt-ligase (ADP-forming)
Reaction(IUBMB)
ATP + hydrogenobyrinic acid a,c-diamide + Co2+ + H2O = ADP + phosphate + cob(II)yrinic acid a,c-diamide + H+ [RN:R05227]
Reaction(KEGG)
Substrate
ATP [CPD:C00002];
hydrogenobyrinic acid a,c-diamide [CPD:C06503];
Co2+ [CPD:C00175];
H2O [CPD:C00001]
Product
ADP [CPD:C00008];
phosphate [CPD:C00009];
cob(II)yrinic acid a,c-diamide [CPD:C06504];
H+ [CPD:C00080]
Comment
This enzyme, which forms part of the aerobic cobalamin biosynthesis pathway, is a type I chelatase, being heterotrimeric and ATP-dependent. It comprises two components, one of which corresponds to CobN and the other is composed of two polypeptides, specified by cobS and cobT in Pseudomonas denitrificans, and named CobST [1]. Hydrogenobyrinic acid is a very poor substrate. ATP can be replaced by dATP or CTP but the reaction proceeds more slowly. CobN exhibits a high affinity for hydrogenobyrinic acid a,c-diamide. The oligomeric protein CobST possesses at least one sulfhydryl group that is essential for ATP-binding. Once the Co2+ is inserted, the next step in the pathway ensures that the cobalt is ligated securely by reducing Co(II) to Co(I). This step is carried out by EC 1.16.8.1, cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase.
History
EC 6.6.1.2 created 2004
Pathway
Porphyrin and chlorophyll metabolism
Metabolic pathways
Orthology
K02230  
cobaltochelatase CobN
K09882  
cobaltochelatase CobS
K09883  
cobaltochelatase CobT
Genes
EOI: 
ECV: 
ESM: 
EUN: 
STY: 
SEX: 
SETC: 
SEE: 
SEEC: 
YPE: 
YPMT1.88(cobS)
YPK: 
Y1105.pl(cobS)
YPA: 
YPN: 
YPM: 
YPP: 
YPG: 
YPZ: 
YPT: 
YPD: 
YPX: 
YPH: 
EAR: 
KPM: 
CFD: 
PMR: 
XNE: 
BUJ: 
FAU: 
RHD: 
VCE: 
VCJ: 
VPH: 
VNI: 
PAE: 
PAEV: 
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PAEU: 
BN889_03289(cobN_1) BN889_03290(cobN_2)
PAEG: 
PAEC: 
PPU: 
PP_3507(cobN)
PPF: 
Pput_2269(cobN)
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
T1E_1713(cobN)
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PP4_23330(cobN)
PPUU: 
PST: 
PSB: 
Psyr_3015(cobN)
PSYR: 
PSP: 
PCI: 
PFL: 
PFL_3654(cobN)
PPRC: 
PFO: 
PFS: 
PFE: 
PFC: 
PPZ: 
PEN: 
PSEEN2433(cobN)
PMY: 
Pmen_4586(cobN)
PMK: 
PSA: 
PST_1796(cobN)
PSZ: 
PSR: 
PSJ: 
PBA: 
PFV: 
PDR: 
PRE: 
PSV: 
PSK: 
PMON: 
PMOT: 
PKC: 
PKB_0666(cobN)
AVN: 
AVL: 
AVD: 
ABR: 
ABAZ: 
SPC: 
SHP: 
SHW: 
SVO: 
MAQ: 
MAD: 
MBS: 
AMH: 
AMAA: 
AMAL: 
AMAE: 
AMAO: 
AMAD: 
AMAI: 
AMAG: 
TTU: 
MMT: 
MEJ: 
MEC: 
ALV: 
TVI: 
HHC: 
TKM: 
HCH: 
HCH_06504(cobN)
HEL: 
HELO_1832(cobN)
ADI: 
B5T_02529(cobN)
MMW: 
MME: 
MPC: 
OCE: 
AFR: 
AFI: 
GPB: 
CVI: 
CV_1571(cobN)
PSE: 
NH8B_1628(cobS) NH8B_1629(cobT) NH8B_1840(cobN)
RSO: 
RSp0626(cobN)
RSL: 
RSN: 
RSM: 
RSE: 
RPF: 
REU: 
REH: 
H16_B1887(cobT2) H16_B1888(cobS2)
CNC: 
CTI: 
RALTA_B1586(cobT2) RALTA_B1587(cobS2)
BMA: 
BMV: 
BML: 
BMN: 
BPS: 
BPSL1768(cobN)
BPM: 
BPL: 
BPD: 
BPR: 
BPSE: 
BDL_292(cobN)
BPSU: 
BBN_1754(cobN)
BPZ: 
BPQ: 
BPK: 
BTE: 
BTH_I2407(cobN)
BTJ: 
BTJ_843(cobN)
BTZ: 
BTL_2086(cobN)
BTD: 
BTI_2050(cobN)
BVI: 
BUR: 
BCN: 
Bcen_1177(cobN)
BCH: 
BCM: 
BCJ: 
BAM: 
Bamb_1557(cobN)
BAC: 
BMU: 
BMJ: 
BCT: 
BXE: 
BPH: 
BPY: 
BGL: 
BUG: 
BGE: 
BGF: 
BGD: 
BYI: 
BUK: 
BPX: 
BUO: 
PPK: 
PPNO: 
PRB: 
PUT: 
AKA: 
AMIM: 
CDN: 
POL: 
DIA: 
DAC: 
DEL: 
VAP: 
VPE: 
VPD: 
CTT: 
ADN: 
ADK: 
HSE: 
RGE: 
RGE_06060(cobN) RGE_44520(cobN)
NEU: 
NE0757(cobN)
EBA: 
AZO: 
azo2630(cobN)
AZA: 
TMZ: 
DSU: 
MFA: 
MMB: 
MEI: 
MEP: 
MPQ_0161(cobN)
GSU: 
GUR: 
GLO: 
PPD: 
DVU: 
DVL: 
DVG: 
DDE: 
DPI: 
LIP: 
LIR: 
DPR: 
DAL: 
DTO: 
DAO: 
DTI: 
SFU: 
DBR: 
MLO: 
MCI: 
MOP: 
MAM: 
MES: 
PLA: 
SME: 
SMc00700(cobS) SMc00701(cobT) SMc04303(cobN)
SMK: 
SMQ: 
SMX: 
SMI: 
BN406_01687(cobN) BN406_02529(cobT3) BN406_02530(cobS3)
SMEG: 
SMEL: 
SMD: 
RHI: 
NGR_c18190(cobN) NGR_c27170(cobT) NGR_c27180(cobS)
SFH: 
SFD: 
EAD: 
OV14_0133(cobT) OV14_0134(cobS) OV14_3189(cobN)
ATU: 
Atu2804(cobN) Atu3621(cobT) Atu3622(cobS)
ARA: 
Arad_2797(cobN) Arad_4228(cobT) Arad_4229(cobS)
AVI: 
Avi_2647(cobN) Avi_4045(cobT) Avi_4046(cobS)
AGR: 
RET: 
REC: 
REL: 
RLE: 
RL2830(cobN) RL4348(cobT) RL4349(cobS)
RLT: 
RLG: 
RLB: 
RLU: 
RTR: 
RIR: 
RHL: 
LPU83_2120(cobN) LPU83_3847(cobT3) LPU83_3848(cobS3)
BME: 
BMI: 
BMZ: 
BMG: 
BMW: 
BMF: 
BMB: 
BMC: 
BAA: 
BMS: 
BSI: 
BMT: 
BSV: 
BOV: 
BOV_1269(cobN) BOV_1945(cobT-1) BOV_1946(cobS-1)
BCS: 
BCAN_A1329(cobN) BCAN_A2067(cobT) BCAN_A2068(cobS)
BSK: 
BOL: 
BMR: 
BPP: 
BCET: 
BCEE: 
OAN: 
BJA: 
bll0178(cobT) bll0180(cobS) blr3263(cobN)
BJU: 
BRA: 
BRADO0617(cobS) BRADO0618(cobT) BRADO4907(cobN)
BBT: 
BBta_3144(cobN) BBta_7564(cobT) BBta_7565(cobS)
BRS: 
S23_06280(cobS) S23_06290(cobT) S23_47410(cobN)
AOL: 
RPA: 
RPA0496(cobT2) RPA0498(cobS2) RPA0716(cobN) RPA2399(cobN)
RPB: 
RPC: 
RPD: 
RPE: 
RPT: 
RPX: 
NWI: 
NHA: 
OCA: 
OCAR_4069(cobT) OCAR_4070(cobS)
OCG: 
OCA5_c04370(cobS) OCA5_c04380(cobT1) OCA5_c23580(cobT2)
OCO: 
OCA4_c04360(cobS) OCA4_c04370(cobT1) OCA4_c23570(cobT2)
BHE: 
BH15880(cobS) BH15890(cobT2)
BHN: 
BQU: 
BQ12800(cobS) BQ12810(cobT)
BQR: 
BBK: 
BTR: 
Btr_2554(cobS) Btr_2555(cobT2)
BGR: 
Bgr_19470(cobS) Bgr_19480(cobT2)
BCD: 
BAUS: 
BVN: 
XAU: 
AZC: 
AZC_3679(cobS) AZC_3680(cobT) AZC_3935(cobN)
SNO: 
MEX: 
MEA: 
MDI: 
MCH: 
MRD: 
MET: 
MPO: 
MNO: 
BID: 
MSL: 
HDN: 
HDT: 
HMC: 
HNI: 
RVA: 
PHL: 
MSC: 
HCI: 
CCR: 
CCS: 
CAK: 
CSE: 
PZU: 
BSB: 
AEX: 
SIL: 
SIT: 
RSP: 
RSP_1976(cobT) RSP_1977(cobS) RSP_2827(cobN)
RSH: 
RSQ: 
RSK: 
RCP: 
JAN: 
RDE: 
RD1_3339(cobS) RD1_3340(cobT) RD1_3827(cobN)
RLI: 
PDE: 
PAMI: 
DSH: 
Dshi_0158(cobN) Dshi_2711(cobS2) Dshi_2719(cobT1)
KVU: 
KVL: 
KVU_1211(cobS) KVU_1214(cobT)
PSF: 
PSE_0073(cobS) PSE_0074(cobT) PSE_3495(cobN)
PGA: 
PGL: 
PGD: 
OAT: 
OAR: 
LMD: 
RED: 
MMR: 
HNE: 
HNE_3493(cobT) HNE_3494(cobS)
HBA: 
ZMO: 
ZMN: 
ZMM: 
ZMB: 
ZMI: 
ZMP: 
NAR: 
NPP: 
SAL: 
SWI: 
SPHM: 
SJP: 
SCH: 
SSY: 
ELI: 
GOX: 
GOH: 
GBE: 
GBH: 
ACR: 
AMV: 
GDI: 
GDI_1892(cobT) GDI_1893(cobS)
GDJ: 
GXY: 
GXL: 
APT: 
APW: 
APF: 
APU: 
APG: 
APQ: 
APX: 
APZ: 
APK: 
RRU: 
RRF: 
RCE: 
RPM: 
MAG: 
MGY: 
MGMSR_0898(cobN) MGMSR_4074(cobT) MGMSR_4075(cobS)
AZL: 
AZL_000750(cobT) AZL_000760(cobS) AZL_d03280(cobN)
ALI: 
ABS: 
TMO: 
TMO_0335(cobT) TMO_0336(cobS) TMO_2759(cobN)
THAL: 
A1OE_867(cobS) A1OE_868(cobT)
PBR: 
MAI: 
MICA_1471(cobS) MICA_1472(cobT)
MAN: 
PGV: 
PUB: 
PEL: 
APC: 
APM: 
APB: 
BSUB: 
AOE: 
DSY: 
DSY3871(cobN)
DKU: 
DGI: 
DAU: 
TJR: 
DRS: 
AWO: 
Awo_c10320(cobN1) Awo_c10370(cobN2) Awo_c10400(cobN3)
ADG: 
TPZ: 
VPR: 
SSG: 
MTU: 
Rv2062c(cobN)
MTV: 
MTC: 
MT2121(cobN)
MRA: 
MRA_2075(cobN)
MTF: 
MTB: 
MTK: 
MTZ: 
MTG: 
MTE: 
MTUR: 
CFBS_2182(cobN)
MTL: 
MTO: 
MTD: 
UDA_2062c(cobN)
MTN: 
MTUB: 
MTX: 
MTUH: 
MTUL: 
MBO: 
Mb2088c(cobN)
MBB: 
BCG_2081c(cobN)
MBT: 
JTY_2075(cobN)
MBM: 
MBK: 
MAF: 
MAF_20770(cobN)
MCE: 
MCQ: 
MCV: 
MCX: 
MCZ: 
MPA: 
MAP1805c(cobN)
MAO: 
MAV: 
MAV_2437(cobN)
MIT: 
MIR: 
MIA: 
MID: 
MYO: 
MSM: 
MSG: 
MSA: 
MUL: 
MUL_2277(cobN)
MVA: 
Mvan_3426(cobN)
MGI: 
Mflv_3112(cobN)
MSP: 
MAB: 
MABB: 
MASS_2128(cobN)
MMV: 
MMC: 
Mmcs_2496(cobN)
MKM: 
Mkms_2541(cobN)
MJL: 
Mjls_2533(cobN)
MJD: 
MMI: 
MMAR_3037(cobN)
MRH: 
MMM: 
W7S_11740(cobN)
MCB: 
MLI: 
MKN: 
MNE: 
ASD: 
AS9A_2046(cobN)
CDI: 
DIP1229(cobN)
CDP: 
CDH: 
CDT: 
CDE: 
CDR: 
CDA: 
CDZ: 
CDB: 
CDS: 
CDD: 
CDW: 
CDV: 
CKP: 
CPU: 
CPL: 
CPG: 
CPP: 
CPK: 
CPQ: 
CPX: 
CPZ: 
COR: 
COP: 
Cp31_1028(cobN)
COD: 
COS: 
COI: 
COU: 
CUL: 
CUC: 
CUE: 
CAZ: 
CVT: 
NFA: 
nfa31370(cobN)
NCY: 
NBR: 
NNO: 
RHA: 
RER: 
RER_31410(cobN)
REY: 
O5Y_14420(cobN)
ROP: 
ROP_02910(cobN) ROP_33530(cobS) ROP_33540(cobT)
ROA: 
REQ: 
REQ_23600(cobN)
RPY: 
GBR: 
GPO: 
GOR: 
TPR: 
SCO: 
SCO1849(cobN)
SMA: 
SAV_6415(cobN)
SGR: 
SGR_3825(cobN)
SCB: 
SCAB_9771(cobN)
SSX: 
SVL: 
SCT: 
SCAT_1048(cobN) SCAT_p1408(cobN)
SCY: 
SFA: 
SBH: 
SBI_01764(cobN)
SHY: 
SHO: 
SVE: 
SDV: 
SALB: 
STRP: 
SFI: 
SCI: 
SRC: 
SALU: 
KSK: 
KSE_64800(cobN)
ICA: 
PAC: 
PAK: 
PAV: 
PAX: 
PAZ: 
PAW: 
PAD: 
PCN: 
PACC: 
PACH: 
PPC: 
PRA: 
MPH: 
MLP_03840(cobN)
NCA: 
Noca_2878(cobN)
KFL: 
TFU: 
Tfu_0319(cobN)
NDA: 
NAL: 
B005_0623(cobN)
TCU: 
SRO: 
FRA: 
FRE: 
FRI: 
FAL: 
FRAAL2330(cobN)
FSY: 
NML: 
Namu_0145(cobN)
GOB: 
BSD: 
MMAR: 
SEN: 
SACE_5955(cobN)
SVI: 
TBI: 
AMD: 
AMED_7069(cobN)
AMN: 
RAM_36270(cobN)
AMM: 
AMES_6961(cobN)
AMZ: 
B737_6961(cobN)
AOI: 
AORI_1656(cobN) AORI_4752(cobS) AORI_4753(cobT)
PDX: 
AMI: 
Amir_1784(cobN)
SESP: 
BN6_25840(cobN)
KAL: 
STP: 
SAQ: 
Sare_2710(cobN)
MIL: 
AMS: 
ASE: 
ACPL_6898(cobN)
ACTN: 
L083_6533(cobN)
AFS: 
AFR_33975(cobN)
CAI: 
Caci_6126(cobN)
RXY: 
Rxyl_0635(cobN)
RRD: 
AFO: 
TDE: 
TPI: 
ACM: 
GMA: 
CTM: 
PBS: 
SACI: 
SYN: 
sll1890(cobN) slr1211(cobN)
SYZ: 
MYO_116360(cobN) MYO_18240(cobN)
SYY: 
SYT: 
SYS: 
SYQ: 
SYW: 
SYNW1240(CobN)
SYC: 
syc1407_d(cobN)
SYF: 
SYD: 
SYE: 
SYG: 
sync_1355(cobN)
SYR: 
SYX: 
CYA: 
CYB: 
SYNE: 
SYNP: 
TEL: 
tlr0900(cobN)
THN: 
MAR: 
MAE_43720(cobN)
CYT: 
cce_4752(cobN)
CYP: 
CYC: 
CYN: 
CYH: 
CYJ: 
AMR: 
AM1_4431(cobN)
CGC: 
CAN: 
CSN: 
DSL: 
HAO: 
GLP: 
CMP: 
CYU: 
TER: 
Tery_0132(cobN)
GEI: 
OAC: 
ONI: 
PSEU: 
CEP: 
MIC: 
ARP: 
GVI: 
gvip423(cobN)
ANA: 
alr1689(cobN)
NPU: 
NOS: 
NOP: 
AVA: 
Ava_1167(cobN)
ANB: 
ACY: 
NAZ: 
CSG: 
CALT: 
RIV: 
PMA: 
Pro_0957(cobN)
PMM: 
PMM0879(CobN)
PMT: 
PMT0727(CobN)
PMN: 
PMI: 
PMB: 
PMC: 
PMF: 
PMG: 
PMH: 
PMJ: 
PME: 
CTHE: 
PLP: 
SCS: 
BFR: 
BFS: 
BFG: 
BHL: 
PGN: 
PGT: 
PAH: 
OSP: 
TFO: 
PIT: 
PRO: 
CPI: 
SHG: 
CMR: 
DFE: 
RSI: 
FCO: 
COC: 
NDO: 
CTE: 
CLI: 
PAA: 
CTS: 
RRS: 
RCA: 
CAU: 
CAG: 
CHL: 
HAU: 
CAP: 
DGE: 
DDR: 
DMR: 
DGO: 
DPD: 
TID: 
MJA: 
MFE: 
MVU: 
MFS: 
MIF: 
MIG: 
MMP: 
MMP0493(cobN)
MMQ: 
MMX: 
MMZ: 
MMD: 
MAE: 
MVN: 
MVO: 
MOK: 
MAC: 
MA0346 MA0384(cobN) MA0385(cobN) MA0872(cobN) MA0882(cobN) MA4424
MBA: 
MMA: 
MM_1602(cobN) MM_1998(cobN)
MMAZ: 
MBU: 
MMH: 
MEV: 
MZH: 
MPY: 
MHZ: 
MTP: 
MCJ: 
MHI: 
MHU: 
MEM: 
MBG: 
BN140_0216(cobN1) BN140_2365(cobN3)
MPI: 
MFO: 
MEZ: 
MER: 
MTH: 
MMG: 
MST: 
Msp_1110(cobN)
MSI: 
MRU: 
mru_2047(bchH)
MEB: 
METH: 
MFV: 
MKA: 
MAX: 
APO: 
AVE: 
HAL: 
VNG1566G(cobN)
HSL: 
OE3230F(cobN)
HMA: 
rrnAC3019(cobN)
HHI: 
HAH_0274(cobN)
HHN: 
HWA: 
HQ2296A(cobN)
HWC: 
Hqrw_2540(cobN)
NPH: 
NP1092A(cobN)
NMO: 
Nmlp_1046(cobN)
HLA: 
HMU: 
HTU: 
HVO: 
HVO_B0050(cobN)
HME: 
HFX_5054(cobN)
HBO: 
HXA: 
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:1429466]
  Authors
Debussche L, Couder M, Thibaut D, Cameron B, Crouzet J, Blanche F.
  Title
Assay, purification, and characterization of cobaltochelatase, a unique complex enzyme catalyzing cobalt insertion in hydrogenobyrinic acid a,c-diamide during coenzyme B12 biosynthesis in Pseudomonas denitrificans.
  Journal
J. Bacteriol. 174 (1992) 7445-51.
  Organism
Pseudomonas denitrificans
  Sequence
Reference
2  [PMID:12195810]
  Authors
Warren MJ, Raux E, Schubert HL, Escalante-Semerena JC.
  Title
The biosynthesis of adenosylcobalamin (vitamin B12).
  Journal
Nat. Prod. Rep. 19 (2002) 390-412.
  Organism
Pseudomonas denitrificans
Other DBs
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CAS: 
81295-49-0

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