KEGG   ENZYME: 1.1.1.41Help
Entry
EC 1.1.1.41                 Enzyme                                 

Name
isocitrate dehydrogenase (NAD+);
isocitric dehydrogenase;
beta-ketoglutaric-isocitric carboxylase;
isocitric acid dehydrogenase;
NAD dependent isocitrate dehydrogenase;
NAD isocitrate dehydrogenase;
NAD-linked isocitrate dehydrogenase;
NAD-specific isocitrate dehydrogenase;
NAD isocitric dehydrogenase;
isocitrate dehydrogenase (NAD);
IDH (ambiguous);
nicotinamide adenine dinucleotide isocitrate dehydrogenase
Class
Oxidoreductases;
Acting on the CH-OH group of donors;
With NAD+ or NADP+ as acceptor
BRITE hierarchy
Sysname
isocitrate:NAD+ oxidoreductase (decarboxylating)
Reaction(IUBMB)
isocitrate + NAD+ = 2-oxoglutarate + CO2 + NADH [RN:R00709]
Reaction(KEGG)
Substrate
isocitrate [CPD:C00311];
NAD+ [CPD:C00003]
Product
2-oxoglutarate [CPD:C00026];
CO2 [CPD:C00011];
NADH [CPD:C00004]
Comment
Requires Mn2+ or Mg2+ for activity. Unlike EC 1.1.1.42, isocitrate dehydrogenase (NADP+), oxalosuccinate cannot be used as a substrate. In eukaryotes, isocitrate dehydrogenase exists in two forms: an NAD+-linked enzyme found only in mitochondria and displaying allosteric properties, and a non-allosteric, NADP+-linked enzyme that is found in both mitochondria and cytoplasm [7]. The enzyme from some species can also use NADP+ but much more slowly [9].
History
EC 1.1.1.41 created 1961, modified 2005
Pathway
Citrate cycle (TCA cycle)
Metabolic pathways
Biosynthesis of secondary metabolites
Microbial metabolism in diverse environments
Biosynthesis of antibiotics
Orthology
K00030  
isocitrate dehydrogenase (NAD+)
Genes
HSA: 
3419(IDH3A) 3420(IDH3B) 3421(IDH3G)
PTR: 
453565(IDH3A) 458048(IDH3B) 741179(IDH3G)
PPS: 
100968720(IDH3B) 100972968(IDH3G) 100987648(IDH3A)
GGO: 
101126919(IDH3G) 101135027(IDH3A) 101141517(IDH3B)
PON: 
100172089(IDH3A) 100172344(IDH3B) 100436005(IDH3G)
NLE: 
100590336(IDH3B) 100593540(IDH3G) 100606177(IDH3A)
MCC: 
677715(IDH3A) 698558(IDH3G) 716726(IDH3B)
MCF: 
101865050(IDH3A) 102124727(IDH3G) 102129545(IDH3B)
RRO: 
104661175(IDH3G) 104674376(IDH3A) 104674627(IDH3B)
CJC: 
100403538(IDH3B) 100405727(IDH3G) 100413152(IDH3A)
MMU: 
15929(Idh3g) 170718(Idh3b) 243996(4933405O20Rik) 67834(Idh3a)
RNO: 
100125384 103690168 114096(Idh3a) 25179(Idh3g) 94173(Idh3B)
CGE: 
100751753(Idh3g) 100754480(Idh3a) 100771661(Idh3b) 100772968
NGI: 
103726021(Idh3a) 103731201(Idh3g) 103751138(Idh3b)
HGL: 
OCU: 
100328743(IDH3G) 100338100(IDH3A) 100342113(IDH3B) 103351073
TUP: 
102475641(IDH3G) 102479509(IDH3A) 102493633(IDH3B)
CFA: 
477177(IDH3B) 479066(IDH3A) 481081(IDH3G)
AML: 
100466084(IDH3B) 100482520(IDH3A) 100483295(IDH3G)
UMR: 
103659417 103660316(IDH3A) 103674513(IDH3B) 103679698(IDH3G)
FCA: 
101085721(IDH3A) 101099035(IDH3B) 102902308(IDH3G)
PTG: 
102955736(IDH3B) 102968859(IDH3A) 102972038(IDH3G)
BTA: 
282446(IDH3A) 613338(IDH3B) 614145(IDH3G)
BOM: 
102269910(IDH3B) 102273099(IDH3G) 102281295(IDH3A)
PHD: 
102318399(IDH3A) 102322009(IDH3G) 102324803(IDH3B)
CHX: 
102172823(IDH3B) 102181480(IDH3G) 102181902(IDH3A)
OAS: 
101104080(IDH3B) 101110910(IDH3G) 101120868(IDH3A)
SSC: 
100157242(IDH3A) 100525850(IDH3G) 100624447 733641(IDH3B)
CFR: 
102504528(IDH3A) 102504939(IDH3B) 102513449(IDH3G)
BACU: 
102998515(IDH3B) 103016817(IDH3G) 103018652(IDH3A)
LVE: 
103072517(IDH3B) 103087344(IDH3A) 103091109(IDH3G)
ECB: 
100052969(IDH3B) 100057896(IDH3G) 100060114(IDH3A) 102148971
MYB: 
MYD: 
PALE: 
102879783(IDH3B) 102885938(IDH3G) 102898135(IDH3A)
MDO: 
100012825(IDH3A) 100017654(IDH3B) 100027983(IDH3G)
SHR: 
OAA: 
100080286(IDH3G) 100082669(IDH3A)
GGA: 
415362(IDH3A) 426573(IDH3B)
MGP: 
100538992(IDH3B) 100549122(IDH3A)
APLA: 
101795551(IDH3A)
TGU: 
100190682(IDH3A) 100224627(IDH3B)
GFR: 
FAB: 
101812942(IDH3B) 101821410(IDH3A)
PHI: 
102101435(IDH3G) 102102008(IDH3A) 102102923(IDH3B)
CCW: 
104685351(IDH3B) 104697486(IDH3A)
FPG: 
FCH: 
CLV: 
102084068(IDH3A) 102089326(IDH3B)
ASN: 
AMJ: 
PSS: 
102447300(IDH3B) 102452545(IDH3A)
CMY: 
ACS: 
100558969(idh3b) 100566326(idh3a) 100567899(idh3g)
PBI: 
XLA: 
443821(idh3b) 444419(idh3a) 444551(idh3g)
XTR: 
100144949(idh3b) 394979(idh3a) 594985(idh3g)
DRE: 
393926(idh3a) 415247(idh3b) 550579(wu:fa01b02)
TRU: 
101066481(idh3g) 101068530(idh3a) 101078713(idh3b)
MZE: 
OLA: 
101156895 101164134(idh3a) 101166544(idh3b) 101169534(idh3g)
XMA: 
LCM: 
CMK: 
103173064(idh3b) 103188099(idh3a)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
Dyak_GE14404(dyak_GLEANR_14528) Dyak_GE17383(dyak_GLEANR_18718) Dyak_GE23616(dyak_GLEANR_7388) Dyak_GE24066(dyak_GLEANR_7797)
DGR: 
DMO: 
DVI: 
MDE: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
409292(GB19422) 410396(GB15716) 552128(GB18960)
SOC: 
AEC: 
HST: 
CFO: 
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
PXY: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CELE_C30F12.7(idhg-2) CELE_C37E2.1(idhb-1) CELE_F35G12.2(idhg-1) CELE_F43G9.1(idha-1)
CBR: 
BMY: 
LOA: 
TSP: 
HRO: 
LGI: 
CRG: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
AT1G32480(IDH-IV) AT2G17130(IDH2) AT3G09810(IDH-VI) AT4G35260(IDH1) AT4G35650(IDH-III) AT5G03290(IDH-V)
ALY: 
CRB: 
EUS: 
BRP: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
EGR: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
PMUM: 
MDM: 
PXB: 
CSV: 
CMO: 
RCU: 
JCU: 
POP: 
POPTR_0004s21440g POPTR_0005s10260g(POPTRDRAFT_558763) POPTR_0006s12860g POPTR_0007s08590g(POPTRDRAFT_819931) POPTR_0009s16680g(POPTRDRAFT_832930) POPTR_0016s09240g(POPTRDRAFT_825258)
VVI: 
SLY: 
SOT: 
BVG: 
OSA: 
DOSA: 
Os01t0276100-01(Os01g0276100) Os02t0595500-01(Os02g0595500) Os04t0479200-01(Os04g0479200)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_03g011050(SORBIDRAFT_03g011050) SORBI_04g024840(SORBIDRAFT_04g024840)
ZMA: 
SITA: 
PDA: 
EGU: 
MUS: 
ATR: 
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YNL037C(IDH1) YOR136W(IDH2)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0B06290(NCAS0B06290) NCAS_0H02250(NCAS0H02250)
NDI: 
NDAI_0B03590(NDAI0B03590) NDAI_0C01410(NDAI0C01410)
TPF: 
TPHA_0D01560(TPHA0D01560) TPHA_0E01480(TPHA0E01480) TPHA_0J02770(TPHA0J02770)
TBL: 
TBLA_0B02240(TBLA0B02240) TBLA_0B06910(TBLA0B06910)
TDL: 
TDEL_0A03370(TDEL0A03370) TDEL_0C03840(TDEL0C03840)
KAF: 
KAFR_0B06370(KAFR0B06370) KAFR_0J01410(KAFR0J01410)
PPA: 
DHA: 
PIC: 
PGU: 
SPAA: 
LEL: 
CAL: 
CTP: 
COT: 
CDU: 
CTEN: 
YLI: 
CLU: 
NCR: 
NCU00775(tca-6) NCU07697(tca-4)
NTE: 
NEUTE1DRAFT116362(NEUTE1DRAFT_116362) NEUTE1DRAFT118602(NEUTE1DRAFT_118602)
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
CTHR: 
MGR: 
TMN: 
FPU: 
NHE: 
TRE: 
MAW: 
MAJ: 
CMT: 
VAL: 
VDA: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_1098194(AO090012000629) AOR_1_14154(AO090003000008)
ANG: 
ANI_1_798074(An08g05580) ANI_1_906164(An18g06760)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
CPW: 
PBL: 
PBN: 
URE: 
ABE: 
TVE: 
AJE: 
PNO: 
PTE: 
BZE: 
BSC: 
BOR: 
ZTR: 
PFJ: 
BCOM: 
NPA: 
TML: 
SPO: 
CNE: 
CNB: 
CGI: 
TMS: 
PPL: 
DSQ: 
PCO: 
SHS: 
HIR: 
PSQ: 
ADL: 
FME: 
GTR: 
LBC: 
MPR: 
MRR: 
CCI: 
SCM: 
ABP: 
AGABI1DRAFT113316(AGABI1DRAFT_113316) AGABI1DRAFT113330(AGABI1DRAFT_113330)
ABV: 
AGABI2DRAFT135516(AGABI2DRAFT_135516) AGABI2DRAFT192040(AGABI2DRAFT_192040)
CPUT: 
SLA: 
WSE: 
WIC: 
UMA: 
PFP: 
MGL: 
PGR: 
MLR: 
MBR: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
DFA_05642(idhA) DFA_10000(idhB)
ACAN: 
TET: 
PTM: 
EHX: 
NGR: 
EFE: 
XFA: 
XFT: 
PD1973(icdA)
XFM: 
XFN: 
XFF: 
XFL: 
XFS: 
XCC: 
XCC0967(icd)
XCB: 
XCA: 
XCP: 
XCV: 
XAC: 
XAC1046(icd)
XCI: 
XCT: 
XCU: 
XCN: 
XCW: 
XCR: 
XCM: 
XCF: 
XCJ: 
XFU: 
XAX: 
XAO: 
XOO: 
XOO1024(icd)
XOM: 
XOP: 
XOY: 
XOR: 
XOZ: 
XAL: 
XSA: 
XTN: 
SML: 
SMT: 
BUJ: 
SMZ: 
PSU: 
PSD: 
FAU: 
RHD: 
DJI: 
DJA: 
SON: 
SDN: 
SFR: 
SAZ: 
SBL: 
SBM: 
SBN: 
SBP: 
SBT: 
SBS: 
SBB: 
SLO: 
SPC: 
SHP: 
SSE: 
SPL: 
SHE: 
SHM: 
SHN: 
SHW: 
SHL: 
SWD: 
SWP: 
SVO: 
ILO: 
ILI: 
CPS: 
PHA: 
PAT: 
PSM: 
PSEO: 
AMC: 
AMAC: 
AMB: 
AMG: 
AMH: 
AMK: 
AMAA: 
AMAL: 
AMAE: 
AMAO: 
AMAD: 
AMAI: 
AMAG: 
ALT: 
AAL: 
AAUS: 
GAG: 
GNI: 
FBL: 
MVS: 
MCA: 
MMT: 
MAH: 
AEH: 
CSA: 
HCS: 
HAK: 
ABO: 
ADI: 
ALN: 
AHA: 
AHY: 
AHD: 
AHR: 
AHP: 
AHJ: 
AHH: 
AHI: 
ASA: 
AVR: 
AMED: 
OCE: 
RPJ: 
REH: 
H16_B1016(icd3)
CNC: 
CBW: 
BXE: 
BXB: 
RFR: 
VAP: 
VPE: 
VPD: 
HAR: 
MMS: 
CFU: 
CFU_0031(citC)
LCH: 
TIN: 
THI: 
THI_2911(idh2)
SHD: 
BBA: 
Bd1264(leuB)
BBAT: 
Bdt_1246(leuB)
BBW: 
BBAC: 
BEX: 
MXA: 
MFU: 
MSD: 
CCX: 
SUR: 
AGE: 
SCL: 
sce5773(icd1) sce6432(leuB2)
SCU: 
HOH: 
MET: 
GOX: 
GOH: 
GOY: 
GBE: 
GBH: 
GBC: 
GBS: 
GDI: 
GDJ: 
GXY: 
GXL: 
APT: 
APW: 
APF: 
APU: 
APG: 
APQ: 
APX: 
APZ: 
APK: 
THL: 
CAC: 
CA_C0972(citC)
CAE: 
CAY: 
CEA_G0983(citC)
CNO: 
CBO: 
CBA: 
CBH: 
CBY: 
CBL: 
CBB: 
CBI: 
CBN: 
CBF: 
CBM: 
CBJ: 
CLJ: 
CCB: 
CPAS: 
CPAT: 
CPAE: 
CAH: 
CSQ: 
CLD: 
CACE: 
CCK: 
AMT: 
CCEL: 
EHA: 
CLE: 
CPY: 
CDF: 
PDC: 
CDC: 
CDL: 
CDG: 
PDF: 
CST: 
DCA: 
DKU: 
DRU: 
PTH: 
PTH_2517(LeuB)
DAU: 
DAI: 
APR: 
ELM: 
AWO: 
TMR: 
BPRS: 
CHY: 
TEP: 
TAE: 
MTA: 
ADG: 
TPZ: 
Tph_c09030(leuB1)
CSC: 
ATE: 
COB: 
CHD: 
COW: 
CKI: 
CKN: 
CLC: 
MAS: 
HOR: 
HAS: 
AAR: 
HHL: 
SSG: 
MED: 
MHG: 
AFN: 
AIN: 
RXY: 
RRD: 
CCU: 
ELE: 
CBAC: 
ABA: 
ACA: 
ACM: 
GMA: 
SUS: 
CTM: 
EMI: 
EPO: 
IPO: 
LBA: 
STR: 
GAU: 
GBA: 
ACO: 
PSL: 
PLM: 
PBS: 
IPA: 
SACI: 
CYA: 
CYB: 
SYNE: 
SYNP: 
TEL: 
THN: 
AMR: 
PSEU: 
GVI: 
gvip428(icd)
GLJ: 
SRU: 
SRM: 
HSW: 
HYM: 
HYD: 
PKO: 
CTS: 
DET: 
DEH: 
DEB: 
DEV: 
DEG: 
DMC: 
btf_415(icd)
DMD: 
DMG: 
DMX: 
DMY: 
DMZ: 
DUC: 
DLY: 
DEW: 
HAU: 
STI: 
TTA: 
PMO: 
DTN: 
DTL3_1456(l(1)G0156)
CCZ: 
FGI: 
TYE: 
LFC: 
LFI: 
LFP: 
TTR: 
MTP: 
MCJ: 
MCON_1315(aksF)
MHI: 
TAR: 
MAX: 
MER: 
MEAR: 
ABI: 
ACF: 
IAG: 
THG: 
PFM: 
KCR: 
 » show all
Taxonomy
Reference
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A suggested new nomenclature for the isomers of isocitric acid.
  Journal
J. Biol. Chem. 237 (1962) 1739-41.
Reference
7  [PMID:8593959]
  Authors
Camacho ML, Brown RA, Bonete MJ, Danson MJ, Hough DW.
  Title
Isocitrate dehydrogenases from Haloferax volcanii and Sulfolobus solfataricus: enzyme purification, characterisation and N-terminal sequence.
  Journal
FEMS. Microbiol. Lett. 134 (1995) 85-90.
Reference
8  [PMID:10601238]
  Authors
Kim YO, Koh HJ, Kim SH, Jo SH, Huh JW, Jeong KS, Lee IJ, Song BJ, Huh TL.
  Title
Identification and functional characterization of a novel, tissue-specific NAD(+)-dependent isocitrate dehydrogenase beta subunit isoform.
  Journal
J. Biol. Chem. 274 (1999) 36866-75.
  Sequence
[hsa:3420]
Reference
9  [PMID:12204383]
  Authors
Inoue H, Tamura T, Ehara N, Nishito A, Nakayama Y, Maekawa M, Imada K, Tanaka H, Inagaki K.
  Title
Biochemical and molecular characterization of the NAD(+)-dependent isocitrate dehydrogenase from the chemolithotroph Acidithiobacillus thiooxidans.
  Journal
FEMS. Microbiol. Lett. 214 (2002) 127-32.
Other DBs
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CAS: 
9001-58-5

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