KEGG   ENZYME: 3.5.1.98Help
Entry
EC 3.5.1.98                 Enzyme                                 

Name
histone deacetylase;
HDAC
Class
Hydrolases;
Acting on carbon-nitrogen bonds, other than peptide bonds;
In linear amides
BRITE hierarchy
Sysname
histone amidohydrolase
Reaction(IUBMB)
Hydrolysis of an N6-acetyl-lysine residue of a histone to yield a deacetylated histone
Comment
A class of enzymes that remove acetyl groups from N6-acetyl-lysine residues on a histone. The reaction of this enzyme is opposite to that of EC 2.3.1.48, histone acetyltransferase. Histone deacetylases (HDACs) can be organized into three classes, HDAC1, HDAC2 and HDAC3, depending on sequence similarity and domain organization. Histone acetylation plays an important role in regulation of gene expression. In eukaryotes, HDACs play a key role in the regulation of transcription and cell proliferation [4]. May be identical to EC 3.5.1.17, acyl-lysine deacylase.
History
EC 3.5.1.98 created 2008
Orthology
K06067  
histone deacetylase 1/2
K11404  
histone deacetylase 3
K11405  
histone deacetylase 8
K11406  
histone deacetylase 4/5
K11407  
histone deacetylase 6
K11408  
histone deacetylase 7
K11409  
histone deacetylase 9
K11418  
histone deacetylase 11
K11482  
histone deacetylase HOS1
K11483  
histone deacetylase HOS2
K11484  
histone deacetylase HOS3
K18671  
histone deacetylase 10
Genes
HSA: 
10013(HDAC6) 10014(HDAC5) 3065(HDAC1) 3066(HDAC2) 51564(HDAC7) 55869(HDAC8) 79885(HDAC11) 83933(HDAC10) 8841(HDAC3) 9734(HDAC9) 9759(HDAC4)
PTR: 
100610515(HDAC6) 454721(HDAC5) 458935(HDAC10) 460060(HDAC4) 460190(HDAC11) 462950(HDAC2) 463280(HDAC9) 465712(HDAC8) 466968(HDAC7) 738624(HDAC3) 748850
PPS: 
100967488(HDAC9) 100967730(HDAC11) 100970870(HDAC4) 100973483(HDAC10) 100978715(HDAC2) 100978769(HDAC3) 100979180(HDAC6) 100980355(HDAC7) 100980497(HDAC1) 100985135(HDAC5) 100988053(HDAC8)
GGO: 
101124293(HDAC7) 101128693(HDAC5) 101129415(HDAC3) 101132578(HDAC10) 101139570(HDAC9) 101142713(HDAC11) 101142824(HDAC4) 101148332(HDAC6) 101150249(HDAC8) 101151959(HDAC1) 101153607 109023024(HDAC2)
PON: 
100172482(HDAC3) 100172663(HDAC1) 100173507(HDAC9) 100294534(HDAC2) 100431300(HDAC7) 100434761(HDAC8) 100436624(HDAC10) 100438699(HDAC11) 100440788 100458256(HDAC5) 100459509(HDAC6)
NLE: 
100581124(HDAC4) 100585277(HDAC5) 100587031(HDAC8) 100587160(HDAC11) 100588704(HDAC10) 100589125(HDAC6) 100591033(HDAC1) 100591451(HDAC7) 100591684(HDAC2) 100596866(HDAC3) 100606143(HDAC9)
MCC: 
693537(HDAC11) 694662(HDAC2) 699642(HDAC8) 704467(HDAC3) 708314(HDAC9) 708441(HDAC1) 710605(HDAC4) 710797 711363(HDAC6) 711456(HDAC5) 715698(HDAC10) 718225(HDAC7)
MCF: 
101926822(HDAC6) 102115906(HDAC4) 102119873(HDAC3) 102121227(HDAC9) 102125039(HDAC1) 102125090 102127738(HDAC7) 102131773(HDAC8) 102133368(HDAC11) 102136167(HDAC10) 102140055(HDAC5) 102140882(HDAC2)
CSAB: 
103218195(HDAC4) 103223554(HDAC10) 103225192(HDAC1) 103226420(HDAC9) 103228040(HDAC11) 103231941(HDAC6) 103232180(HDAC8) 103238208(HDAC7) 103239354 103240535(HDAC2) 103243334(HDAC5) 103244700(HDAC3)
RRO: 
104654705(HDAC5) 104654770(HDAC1) 104654835(HDAC7) 104657112(HDAC2) 104658630(HDAC9) 104660448(HDAC4) 104660656(HDAC6) 104660766(HDAC10) 104660893 104671474(HDAC8) 104677352 104679017(HDAC11) 104681822(HDAC3)
RBB: 
108512070(HDAC2) 108514096 108515947(HDAC7) 108517465(HDAC6) 108521101 108524017(HDAC1) 108527145 108527707(HDAC8) 108530206(HDAC3) 108531930(HDAC4) 108532177(HDAC5) 108532627 108539405(HDAC10) 108540828(HDAC9) 108544875(HDAC11)
CJC: 
100386059(HDAC4) 100386715(HDAC3) 100387191(HDAC11) 100396535(HDAC8) 100398785(HDAC10) 100399690(HDAC1) 100400747(HDAC5) 100402023(HDAC7) 100402327(HDAC2) 100406361(HDAC9) 100414028(HDAC6)
SBQ: 
101028689(HDAC11) 101030664(HDAC3) 101036245(HDAC4) 101039964(HDAC1) 101040591(HDAC10) 101040990(HDAC8) 101041477(HDAC2) 101043404(HDAC7) 101048948(HDAC5) 101053160(HDAC9) 101053695(HDAC6) 104650467
MMU: 
15182(Hdac2) 15183(Hdac3) 15184(Hdac5) 15185(Hdac6) 170787(Hdac10) 208727(Hdac4) 232232(Hdac11) 433759(Hdac1) 56233(Hdac7) 70315(Hdac8) 79221(Hdac9)
RNO: 
108348065 297453(Hdac11) 297893(Hdac1) 362981(Hdac10) 363287(Hdac4) 363481(Hdac8) 687001(Hdac9) 84576(Hdac1l) 84577(Hdac2) 84578(Hdac3) 84580(Hdac5) 84581(Hdac6) 84582(Hdac7)
CGE: 
100689350(Hdac5) 100752639(Hdac3) 100752721(Hdac1) 100757696(Hdac9) 100758596(Hdac10) 100761556 100763688(Hdac6) 100764557(Hdac2) 100765184 100766171(Hdac7) 100767877(Hdac4) 100772691(Hdac11) 107980001
NGI: 
103730371(Hdac11) 103730826(Hdac4) 103733778(Hdac2) 103733781(Hdac9) 103735470(Hdac10) 103736071(Hdac3) 103738280(Hdac5) 103740630(Hdac7) 103741648(Hdac6) 103745919(Hdac1) 103751938(Cited1)
HGL: 
101696612(Hdac4) 101697998(Hdac8) 101705971(Hdac9) 101706833(Hdac10) 101708442(Hdac6) 101708680(Hdac3) 101712029(Hdac2) 101713063(Hdac7) 101715102(Hdac1) 101721186(Hdac5) 101726705(Hdac11)
CCAN: 
OCU: 
100338458(HDAC4) 100345764(HDAC9) 100352038(HDAC8) 100352120(HDAC10) 100352253(HDAC11) 100354595(HDAC3) 100354982(HDAC6) 100355156(HDAC1) 100355860(HDAC7) 100356004(PICK1) 100358981(HDAC5) 103347301
TUP: 
102468100(HDAC1) 102472062(HDAC3) 102481827(HDAC5) 102482702(HDAC11) 102484908(HDAC8) 102487728(HDAC6) 102488021(HDAC10) 102490757(HDAC4) 102499627(HDAC9) 102501841(HDAC7) 102503291(HDAC2)
CFA: 
475035(HDAC2) 478040(HDAC3) 480907(HDAC6) 480957(HDAC8) 482339(HDAC9) 484633(HDAC11) 486589(HDAC7) 487309(HDAC1) 490941(HDAC5) 607032(HDAC10) 607662(HDAC4)
AML: 
100466134(HDAC3) 100468249(HDAC5) 100468902(HDAC9) 100474458(HDAC7) 100476818(HDAC11) 100477725(HDAC1) 100478424(HDAC2) 100478591(HDAC4) 100478725(HDAC6) 100479978(HDAC10) 100480623(HDAC8)
UMR: 
103658850(HDAC9) 103662823(HDAC4) 103663723(HDAC3) 103665860(HDAC5) 103666443(HDAC1) 103668837(HDAC6) 103669506(HDAC11) 103674006(HDAC10) 103675597(HDAC7) 103676974(HDAC2) 103680190(HDAC8)
FCA: 
101080901(HDAC10) 101081876(HDAC11) 101084086(HDAC6) 101085705(HDAC9) 101087242(HDAC7) 101088165(HDAC2) 101093384(HDAC4) 101096383(HDAC8) 101098019(HDAC5) 101099228(HDAC1) 101100941(HDAC3)
PTG: 
102950287(HDAC6) 102952507(HDAC2) 102956025(HDAC7) 102959505(HDAC8) 102960000(HDAC10) 102960966(HDAC5) 102961741(HDAC3) 102963015(HDAC4) 102968123(HDAC1) 102971547(HDAC11) 102972297(HDAC9)
AJU: 
106967107(HDAC4) 106967267(HDAC3) 106968918(HDAC2) 106969353(HDAC7) 106974278(HDAC5) 106978633(HDAC11) 106982392(HDAC8) 106982428(HDAC1) 106984149(HDAC9) 106987623(HDAC10) 106989010(HDAC6)
BTA: 
100849030 404125(HDAC3) 404126(HDAC1) 407223(HDAC2) 504242(HDAC5) 509843(HDAC7) 510654(HDAC10) 513602(HDAC6) 517559(HDAC4) 519899(HDAC11) 535415(HDAC9) 540666(HDAC8)
BOM: 
102265183(HDAC1) 102265865(HDAC3) 102270486(HDAC8) 102270629(HDAC6) 102271862(HDAC5) 102277833(HDAC9) 102279281(HDAC11) 102279602(HDAC2) 102282588(HDAC4) 102282763(HDAC10) 102282865(HDAC7)
BIU: 
109555290(HDAC6) 109556936(HDAC4) 109557285(HDAC9) 109559172(HDAC7) 109562142(HDAC3) 109563503(HDAC2) 109572356(HDAC1) 109573873(HDAC5) 109576304(HDAC11)
PHD: 
102319680(HDAC7) 102326835(HDAC6) 102331874(HDAC11) 102332234(HDAC10) 102333560(HDAC2) 102335385(HDAC4) 102339088(HDAC1) 102339848(HDAC9) 102340610(HDAC8) 102343642(HDAC3) 102344448(HDAC5)
CHX: 
102172214(HDAC11) 102177165(HDAC2) 102177869(HDAC7) 102180254(HDAC5) 102181263(HDAC9) 102183307(HDAC6) 102184131(HDAC8) 102184143(HDAC3) 102184233(HDAC10) 102187544(HDAC1) 102187736(HDAC4) 108633221 108634294
OAS: 
100642178(HDAC9) 100820752(HDAC1) 101107092(HDAC3) 101107515(HDAC7) 101107708(HDAC2) 101108012(HDAC4) 101109245(HDAC6) 101110121(HDAC8) 101110455(HDAC11) 101113686(HDAC5) 101115701(HDAC10)
SSC: 
100156170(HDAC2) 100511372(HDAC3) 100515165(HDAC5) 100515581(HDAC11) 100518786(HDAC10) 100523163(HDAC9) 100621798(HDAC6) 100622482(HDAC1) 100624050(HDAC4) 100625846(HDAC8) 100627559(HDAC7)
CFR: 
102503564(HDAC4) 102504100(HDAC2) 102505871(HDAC8) 102507599(HDAC6) 102508320(HDAC1) 102511155(HDAC3) 102514257(HDAC5) 102515612(HDAC9) 102517408 102519541(HDAC10) 102524559(HDAC7) 106729042(HDAC11) 106730661
CDK: 
105085792(HDAC1) 105090357(HDAC10) 105090801(HDAC3) 105092890(HDAC9) 105092891 105093074(HDAC11) 105098583(HDAC8) 105099222(HDAC2) 105101051(HDAC5) 105103240(HDAC4) 105103305(HDAC6) 105103805(HDAC7)
BACU: 
102998477(HDAC1) 103000794 103001313(HDAC9) 103005269(HDAC5) 103005377(HDAC8) 103006122(HDAC4) 103006780(HDAC7) 103007075(HDAC6) 103007516(HDAC10) 103013037(HDAC3) 103015316(HDAC11) 103015711(HDAC2) 103017578
LVE: 
103068824(HDAC9) 103069141(HDAC11) 103070161(HDAC1) 103070274(HDAC2) 103070550(HDAC5) 103074668(HDAC6) 103077804(HDAC10) 103078231(HDAC8) 103079661(HDAC4) 103079886(HDAC7) 103082097(HDAC3) 103088729
ECB: 
100050617(HDAC7) 100051252(HDAC5) 100052401(HDAC8) 100053170 100055240(HDAC11) 100061405(HDAC3) 100062208(HDAC6) 100067014(HDAC4) 100070281(HDAC1) 100072578(HDAC2) 100146361(HDAC10) 106780857(HDAC9)
EPZ: 
103544928(HDAC6) 103545120 103546792(HDAC7) 103547671(HDAC9) 103550705(HDAC3) 103551196(HDAC5) 103552097(HDAC1) 103555986(HDAC4) 103556786(HDAC11) 103559484(HDAC10) 103561341(HDAC2) 103563223(HDAC8)
EAI: 
106824324 106824358(HDAC9) 106826974(HDAC6) 106829049(HDAC1) 106829378(HDAC11) 106832203(HDAC4) 106835298(HDAC8) 106836446(HDAC5) 106836841(HDAC7) 106836963(HDAC3) 106846003(HDAC10) 106847042(HDAC2)
MYB: 
102241535(HDAC8) 102242095(HDAC7) 102242800(HDAC1) 102243153(HDAC2) 102243365 102246168(HDAC4) 102247726(HDAC5) 102247937(HDAC11) 102248540(HDAC9) 102251571(HDAC3) 102254335(HDAC10) 102260131 102261327(HDAC6)
MYD: 
102752529(HDAC5) 102752858 102758798 102760146(HDAC4) 102760511(HDAC3) 102762261(HDAC8) 102764528(HDAC9) 102764610(HDAC1) 102764898(HDAC6) 102769724(HDAC10) 102771261(HDAC11) 102772156(HDAC7) 102773716(HDAC2)
HAI: 
109372516(HDAC7) 109374070(HDAC4) 109374770(HDAC8) 109374787(HDAC6) 109377185(HDAC11) 109384760(HDAC2) 109386986(HDAC9) 109391669(HDAC1) 109393589(HDAC3) 109394999(HDAC5) 109396619(HDAC10)
RSS: 
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Reference
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  Authors
Krieger DE, Levine R, Merrifield RB, Vidali G, Allfrey VG.
  Title
Chemical studies of histone acetylation. Substrate specificity of a histone deacetylase from calf thymus nuclei.
  Journal
J. Biol. Chem. 249 (1974) 332-4.
Reference
2  [PMID:7980438]
  Authors
Sanchez del Pino MM, Lopez-Rodas G, Sendra R, Tordera V.
  Title
Properties of the yeast nuclear histone deacetylase.
  Journal
Biochem. J. 303 ( Pt 3) (1994) 723-9.
Reference
3  [PMID:16883049]
  Authors
Ouaissi M, Ouaissi A.
  Title
Histone deacetylase enzymes as potential drug targets in cancer and parasitic diseases.
  Journal
J. Biomed. Biotechnol. 2006 (2006) 13474.
Reference
4  [PMID:17632079]
  Authors
Song YM, Kim YS, Kim D, Lee DS, Kwon HJ.
  Title
Cloning, expression, and biochemical characterization of a new histone deacetylase-like protein from Thermus caldophilus GK24.
  Journal
Biochem. Biophys. Res. Commun. 361 (2007) 55-61.
Reference
5  [PMID:10490031]
  Authors
Finnin MS, Donigian JR, Cohen A, Richon VM, Rifkind RA, Marks PA, Breslow R, Pavletich NP.
  Title
Structures of a histone deacetylase homologue bound to the TSA and SAHA inhibitors.
  Journal
Nature. 401 (1999) 188-93.
Reference
6  [PMID:11473107]
  Authors
Phiel CJ, Zhang F, Huang EY, Guenther MG, Lazar MA, Klein PS.
  Title
Histone deacetylase is a direct target of valproic acid, a potent anticonvulsant, mood stabilizer, and teratogen.
  Journal
J. Biol. Chem. 276 (2001) 36734-41.
Reference
7  [PMID:12429021]
  Authors
de Ruijter AJ, van Gennip AH, Caron HN, Kemp S, van Kuilenburg AB.
  Title
Histone deacetylases (HDACs): characterization of the classical HDAC family.
  Journal
Biochem. J. 370 (2003) 737-49.
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 
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ExPASy - ENZYME nomenclature database: 
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