KEGG   ORTHOLOGY: K08300Help
Entry
K08300                      KO                                     

Name
rne
Definition
ribonuclease E [EC:3.1.26.12]
Pathway
RNA degradation
Module
M00394  
RNA degradosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K08300  rne; ribonuclease E
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   RNA processing
    M00394  RNA degradosome
     K08300  rne; ribonuclease E
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.26  Endoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.26.12  ribonuclease E
     K08300  rne; ribonuclease E
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Prokaryotic Type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Ribonucreases
     K08300  rne; ribonuclease E
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Prokaryotic Type
  rRNA processing factors
   K08300  rne; ribonuclease E
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: 
Genes
ECO: 
b1084(rne)
ECJ: 
ECD: 
EBW: 
ECOK: 
ECE: 
Z1722(rne)
ECS: 
ECs1462(rne)
ECF: 
ETW: 
ELX: 
EOJ: 
EOI: 
EOH: 
ECG: 
EOK: 
ELR: 
ECC: 
c1353(rne)
ECP: 
ECI: 
ECV: 
ECX: 
ECW: 
ECM: 
ECY: 
ECR: 
ECQ: 
ECK: 
ECT: 
EOC: 
EUM: 
ECZ: 
ELO: 
ELN: 
ELH: 
ESE: 
ESO: 
ESM: 
ESL: 
ECL: 
EBR: 
EBD: 
EKO: 
EKF: 
EAB: 
EDH: 
EDJ: 
EIH: 
ENA: 
ELU: 
EUN: 
ELW: 
ELL: 
ELC: 
ELD: 
ELP: 
EBL: 
EBE: 
ELF: 
ECOA: 
ECOL: 
ECOI: 
ECOJ: 
ECOO: 
ECOH: 
EFE: 
STY: 
STY1226(ams)
STT: 
t1734(rne)
SEX: 
SENT: 
STM: 
STM1185(rne)
SEO: 
SEV: 
SEY: 
SEM: 
SEJ: 
SEB: 
SEF: 
SETU: 
SETC: 
SEEN: 
SENR: 
SEND: 
SENI: 
SPT: 
SPA1666(rne)
SEK: 
SPQ: 
SEI: 
SEC: 
SC1132(rne)
SEH: 
SHB: 
SENH: 
SEEH: 
SEE: 
SENN: 
SEW: 
SEA: 
SENS: 
SED: 
SEG: 
SG1937(rne)
SEL: 
SEGA: 
SET: 
SEN1863(rne)
SENA: 
SENO: 
SENV: 
SENQ: 
SENL: 
SENJ: 
SEEC: 
SEEB: 
SENB: 
BN855_11440(SBOV11031)
SENE: 
SENC: 
SES: 
SBG: 
SBZ: 
SBV: 
YPE: 
YPO1590(rne)
YPK: 
y1749(rne)
YPA: 
YPN: 
YPM: 
YP_2263(rne)
YPP: 
YPG: 
YPZ: 
YPT: 
YPD: 
YPX: 
YPH: 
YPW: 
YPJ: 
YPV: 
YPL: 
YPS: 
YPO: 
YPI: 
YPY: 
YPB: 
YPQ: 
YPU: 
YPR: 
YPC: 
YPF: 
YEN: 
YE1627(rne)
YEP: 
YEY: 
YEL: 
YEW: 
YET: 
YEF: 
YEE: 
YSI: 
YAL: 
YFR: 
YIN: 
YKR: 
YRO: 
YRU: 
YRB: 
SFL: 
SF1088(rne)
SFX: 
S1168(rne)
SFV: 
SFE: 
SFN: 
SFS: 
SFT: 
SSN: 
SSJ: 
SBO: 
SBC: 
SDY: 
SDZ: 
ECA: 
ECA1789(rne)
PATR: 
PATO: 
PCT: 
PCC: 
PCV: 
PWA: 
PEC: 
ETA: 
EPY: 
EPR: 
EAM: 
EAY: 
EBI: 
ERJ: 
PLU: 
plu2841(rne)
PAY: 
PTT: 
BUC: 
BU347(rne)
BAP: 
BAU: 
BUP: 
BAK: 
BUH: 
BAPF: 
BAPG: 
BAPU: 
BAPW: 
BAS: 
BUsg335(rne)
BAB: 
bbp317(rne)
WBR: 
WGLp088(rne)
WGL: 
SGL: 
SG1052(rne)
SOD: 
PES: 
ENT: 
ENC: 
ENO: 
EEC: 
ENL: 
ECLA: 
ECLC: 
ECLG: 
ECLE: 
ECLN: 
ECLI: 
ECLX: 
ECLY: 
ECLZ: 
ESC: 
EAS: 
EAU: 
EAE: 
EAR: 
ENR: 
ESA: 
CSK: 
CSZ: 
CSI: 
CSJ: 
CTU: 
KPN: 
KPU: 
KPM: 
KPP: 
KPK: 
KPH: 
KPZ: 
KPV: 
KPW: 
KPY: 
KPG: 
KPC: 
KPQ: 
KPT: 
KPE: 
KPO: 
KPR: 
KPJ: 
KPI: 
KPA: 
KPS: 
KPX: 
KPB: 
KPNE: 
KPNU: 
KVA: 
KVD: 
KVQ: 
KOX: 
KOE: 
KOY: 
KOK: 
KOM: 
KMI: 
CKO: 
CRO: 
CFD: 
CAMA: 
SPE: 
SRR: 
SRL: 
SRY: 
SRS: 
SRA: 
SSZ: 
SCc_429(rne)
SMAF: 
SMW: 
SMAR: 
SLQ: 
SERR: 
SFO: 
SERF: 
SERS: 
PMR: 
PMI0852(rne)
PMIB: 
EIC: 
ETR: 
ETD: 
ETE: 
ETC: 
BFL: 
Bfl410(rne)
BPN: 
BVA: 
BCHR: 
BEN: 
BED: 
HDE: 
SECT: 
SEHC: 
DDA: 
DDC: 
DDD: 
DZE: 
DZC: 
XBO: 
XBV: 
XNE: 
XNM: 
XDO: 
XPO: 
PAM: 
PLF: 
PAJ: 
PAQ: 
PVA: 
PAO: 
KLN: 
PANT: 
PANP: 
HHS: 
PCK: 
RIP: 
RAH: 
RAQ: 
RAA: 
MEN: 
MEO: 
MPC_467(rne)
PSI: 
PSX: 
EBT: 
MMK: 
ROR: 
RON: 
CNT: 
CEM: 
CEN: 
CED: 
PGE: 
HAV: 
KSA: 
SBW: 
EBF: 
PSTS: 
HIN: 
HI0413(rne)
HIT: 
HIP: 
HIQ: 
HIF: 
HIL: 
HIU: 
HIE: 
HIZ: 
HIK: 
HIA: 
HIH: 
HIW: 
HIC: 
HIX: 
HDU: 
HD0194(rne)
HAP: 
HPAZ: 
HPAS: 
HPAK: 
HPR: 
HSO: 
HS_0715(rne)
HSM: 
PMU: 
PM0991(rne)
PMV: 
PUL: 
PMP: 
PMUL: 
MSU: 
MS1622(cafA)
MHT: 
MHQ: 
MHAT: 
MHX: 
MHAE: 
MHAM: 
MHAO: 
MHAL: 
MHAQ: 
MHAY: 
MVR: 
MVI: 
MVG: 
MVE: 
APL: 
APJ: 
APA: 
ASU: 
ASI: 
ASS: 
AEU: 
AAP: 
AAT: 
AAO: 
AAN: 
AAH: 
GAN: 
BTO: 
BTRE: 
BTRH: 
BTRA: 
XFA: 
XFT: 
PD1983(rne)
XFM: 
XFN: 
XFF: 
XFL: 
XFS: 
XCC: 
XCC2084(rne)
XCB: 
XCA: 
XCP: 
XCV: 
XCV2423(rne)
XAC: 
XAC2111(rne)
XCI: 
XCT: 
XCU: 
XCN: 
XCW: 
XCR: 
XCM: 
XCF: 
XCJ: 
XFU: 
XAX: 
XAO: 
XOO: 
XOO3073(rne)
XOM: 
XOP: 
XOY: 
XOR: 
XOZ: 
XAL: 
SML: 
SMT: 
BUJ: 
SMZ: 
PSU: 
PSD: 
FAU: 
RHD: 
DJI: 
DJA: 
VCH: 
VCF: 
VCE: 
VCJ: 
VCO: 
VCR: 
VCM: 
VCI: 
VCL: 
VCQ: 
VCS: 
VCX: 
VCZ: 
VVU: 
VVY: 
VVM: 
VVL: 
VPA: 
VPB: 
VPK: 
VPF: 
VPH: 
VHA: 
VCA: 
VAG: 
VSP: 
VEX: 
VEJ: 
VFU: 
VNI: 
VAN: 
LAG: 
VAU: 
VCY: 
VCT: 
VTU: 
VFI: 
VF_1748(rne)
VFM: 
VSA: 
AWD: 
PPR: 
PGB: 
PAE: 
PA2976(rne)
PAEV: 
PAEI: 
PAU: 
PAP: 
PAG: 
PAF: 
PNC: 
PAEB: 
PDK: 
PSG: 
PRP: 
PAEP: 
PAER: 
PAEM: 
PAEL: 
PAES: 
PAEU: 
PAEG: 
PAEC: 
PAEO: 
PPU: 
PP_1905(rne)
PPF: 
PPG: 
PPW: 
PPT: 
PPB: 
PPI: 
PPX: 
PPUH: 
PPUT: 
PPUN: 
PPUD: 
PFV: 
PMON: 
PMOT: 
PMOS: 
PPJ: 
PST: 
PSB: 
PSYR: 
PSP: 
PCI: 
PFL: 
PPRC: 
PPRO: 
PFO: 
PFS: 
PFE: 
PFC: 
PFN: 
PFW: 
PFB: 
PFF: 
PPZ: 
PMAN: 
PEN: 
PMY: 
PMK: 
PSA: 
PSZ: 
PSR: 
PSC: 
PSJ: 
PSH: 
PSTU: 
PSTT: 
PBM: 
PBA: 
PBC: 
PPUU: 
PDR: 
PRE: 
PPSE: 
PSV: 
PSK: 
PKC: 
PCH: 
PCZ: 
PCP: 
PALK: 
PRH: 
PSW: 
PPV: 
PSES: 
PSEM: 
CJA: 
AVN: 
AVL: 
AVD: 
ACX: 
PAR: 
PCR: 
PRW: 
PSO: 
ACI: 
ACD: 
ACB: 
ABM: 
ABY: 
ABC: 
ABN: 
ABB: 
ABX: 
ABZ: 
ABR: 
ABD: 
ABH: 
ABAD: 
ABJ: 
ABAB: 
ABAJ: 
ABAZ: 
ABK: 
ABAU: 
ABAA: 
ABW: 
ABAL: 
ACC: 
MCT: 
MCS: 
MCAT: 
SON: 
SO_2785(rne)
SDN: 
SFR: 
SAZ: 
SBL: 
SBM: 
SBN: 
SBP: 
SBT: 
SBS: 
SBB: 
SLO: 
SPC: 
SHP: 
SSE: 
SPL: 
SHE: 
SHM: 
SHN: 
SHW: 
SHL: 
SWD: 
SWP: 
SVO: 
ILO: 
IL1349(rne)
ILI: 
CPS: 
PHA: 
PAT: 
PSM: 
PSEO: 
SDE: 
MAQ: 
MHC: 
MAD: 
MBS: 
AMC: 
AMAC: 
AMB: 
AMG: 
AMH: 
AMK: 
AMAA: 
AMAL: 
AMAE: 
AMAO: 
AMAD: 
AMAI: 
AMAG: 
ALT: 
AAL: 
GAG: 
GNI: 
GPS: 
SPOI: 
PIN: 
PSY: 
TTU: 
FBL: 
MVS: 
CBU: 
CBS: 
CBD: 
CBG: 
CBC: 
CEA: 
LPN: 
lpg2297(rne)
LPH: 
LPO: 
LPU: 
LPM: 
LPF: 
lpl2216(rne)
LPP: 
lpp2244(rne)
LPC: 
LPA: 
lpa_03291(cafA)
LPE: 
LLO: 
LFA: 
LHA: 
LOK: 
TMC: 
MCA: 
MCA1481(rne)
MMT: 
MAH: 
FTU: 
FTQ: 
FTF: 
FTF1227(rne)
FTW: 
FTR: 
FTT: 
FTY: 
FTG: 
FTL: 
FTH: 
FTH_0719(cafA1)
FTA: 
FTS: 
FTI: 
FTO: 
FTC: 
FTV: 
FTZ: 
FTM: 
FTN: 
FTX: 
FTD: 
FCF: 
FCN: 
FPH: 
FPT: 
FPI: 
FPM: 
FPX: 
FPZ: 
FPJ: 
FRT: 
FNA: 
FNL: 
FRF: 
FGU: 
TCX: 
TCY: 
TAO: 
MEJ: 
MEC: 
CYQ: 
CZA: 
TIG: 
NOC: 
NHL: 
NWA: 
ALV: 
TVI: 
TMB: 
MPUR: 
AEH: 
HHA: 
HHC: 
TGR: 
TKM: 
TNI: 
TVNIR_1830(rne_[H])
TTI: 
SSAL: 
SPIU: 
HNA: 
HCH: 
CSA: 
HEL: 
HCS: 
HAK: 
PLE: 
PLY: 
PLR: 
PAQ_165(rne)
PLO: 
PLD: 
PLB: 
PTV_035(rne)
PLC: 
PAD_036(rne)
PLI: 
PLF_036(rne)
PALY: 
ABO: 
ADI: 
APAC: 
ALN: 
KKO: 
KGE: 
MMW: 
MME: 
MPC: 
TOL: 
TOR: 
GSN: 
AHA: 
AHY: 
AHD: 
AHR: 
AHP: 
AHJ: 
AHH: 
ASA: 
AVR: 
AMED: 
TAU: 
OCE: 
DNO: 
AFE: 
AFR: 
ACU: 
ACZ: 
AFI: 
GAP: 
FPP: 
SAGA: 
M5M_03695(rnaseE)
BCI: 
BCIB: 
RMA: 
VOK: 
GPB: 
NMA: 
NME: 
NMB0196(rne)
NMP: 
NMH: 
NMC: 
NMC0187(rne)
NMN: 
NMT: 
NMI: 
NMD: 
NMM: 
NMS: 
NMQ: 
NMW: 
NMZ: 
NMX: 
NGO: 
NGK: 
NGT: 
NLA: 
NEL: 
SALV: 
CVI: 
LHK: 
PSE: 
RSO: 
RSc1040(rne)
RSC: 
RSL: 
RSN: 
RSM: 
RSE: 
RPI: 
RPF: 
RPJ: 
RMN: 
REU: 
REH: 
H16_A2580(cafA2)
CNC: 
RME: 
CTI: 
CBW: 
BMA: 
BMA0520(rne)
BMV: 
BML: 
BMN: 
BMAL: 
BMAE: 
BMAQ: 
BMAI: 
BMAF: 
BMAZ: 
BMAB: 
BPS: 
BPM: 
BPL: 
BPD: 
BPR: 
BPSE: 
BPSM: 
BPSU: 
BPSD: 
BPZ: 
BPQ: 
BPK: 
BPSH: 
BPSA: 
BPSO: 
BTE: 
BTQ: 
BTZ: 
BTD: 
BTV: 
BTHE: 
BTHM: 
BTHA: 
BTHL: 
BOK: 
BOC: 
BUT: 
BVI: 
BVE: 
BUR: 
BCN: 
BCH: 
BCM: 
BCJ: 
BCAL0982(rne2) BCAL2888(rne1)
BCEN: 
BCEW: 
BCEO: 
BAM: 
BAC: 
BMU: 
BMJ: 
BMK: 
BMUL: 
BCT: 
BCED: 
BDL: 
BXE: 
BXB: 
BPH: 
BPY: 
BGL: 
BGP: 
BGU: 
BUG: 
BGE: 
BGF: 
BRH: 
BGD: 
BGO: 
BYI: 
BUK: 
BPX: 
BUO: 
BUE: 
BUL: 
BUB: 
BFN: 
PNU: 
PNE: 
PPK: 
PPNO: 
PPNM: 
PRB: 
PPUL: 
PSPU: 
PAPI: 
PVE: 
POX: 
BPE: 
BP0475(rne)
BPC: 
BPER: 
BPET: 
BPEU: 
BPA: 
BPP3318(rne)
BPAR: 
BBR: 
BB3769(rne)
BBM: 
BBH: 
BBX: 
BPT: 
BAV: 
BAV1108(ams)
BHO: 
BHM: 
AXY: 
AXO: 
AXN: 
AXS: 
TEQ: 
TEA: 
TEG: 
TAS: 
TAT: 
PUT: 
AKA: 
AMIM: 
CDN: 
BPSI: 
RFR: 
POL: 
PNA: 
AAV: 
AJS: 
DIA: 
AAA: 
ACK: 
VEI: 
DAC: 
DEL: 
VAP: 
VPE: 
VPD: 
CTT: 
CTES: 
ADN: 
ADK: 
RTA: 
CBX: 
CBAA: 
CBAB: 
MPT: 
HAR: 
MMS: 
JAG: 
HSE: 
CFU: 
CARE: 
LCH: 
TIN: 
THI: 
RGE: 
BBAG: 
NEU: 
NET: 
NIT: 
NII: 
NCO: 
NMU: 
EBA: 
ebA5441(rne)
AZO: 
azo1613(rne)
AZA: 
DAR: 
TMZ: 
DSU: 
SHD: 
RBU: 
TBD: 
SDR: 
MFA: 
MMB: 
MEH: 
MEI: 
MEP: 
MBAC: 
MBAT: 
APP: 
SLT: 
GCA: 
KCI: 
KCT: 
KBL: 
KBT: 
KDE: 
KGA: 
KON: 
BPRC: 
GSU: 
GME: 
GUR: 
GLO: 
GBM: 
GEO: 
GEM: 
GEB: 
GPI: 
PCA: 
PPD: 
DVU: 
DVL: 
DVM: 
DVG: 
DDE: 
DDS: 
DDN: 
DMA: 
DSA: 
DAS: 
DAF: 
DHY: 
DPI: 
DGG: 
LIP: 
LI0771(rne)
LIR: 
DBA: 
DRT: 
DPS: 
DAK: 
DPR: 
DSF: 
DOL: 
DAL: 
DAT: 
DTO: 
CCX: 
SAT: 
DAO: 
DTI: 
SFU: 
DBR: 
RPR: 
RPO: 
RPW: 
RPZ: 
RPG: 
RPS: 
RPV: 
RPQ: 
RPL: 
RPN: 
RTY: 
RT0248(rne)
RTT: 
RTB: 
RCM: 
RCC: 
RBE: 
RBO: 
RCO: 
RC0342(rne)
RFE: 
RF_1025(rne)
RAK: 
RRI: 
RRJ: 
RRA: 
RRC: 
RRH: 
RRB: 
RRN: 
RRP: 
RRM: 
RRR: 
RMS: 
RMI: 
RPK: 
RAF: 
RHE: 
RJA: 
RSV: 
Rsl_403(rne)
RSW: 
RPH: 
RAU: 
RMO: 
RPP: 
RRE: 
RAM: 
RMC: 
OTS: 
OTT: 
WOL: 
WRI: 
WEN: 
WED: 
WPI: 
WBM: 
WOO: 
WCL: 
AMA: 
AM844(rne)
AMF: 
AMF_631(rne)
AMW: 
AMP: 
ACN: 
APH: 
APY: 
APD: 
APHA: 
ERU: 
ERW: 
ERG: 
ECN: 
ECH: 
ECHA: 
ECHJ: 
ECHL: 
ECHS: 
ECHV: 
ECHW: 
ECHP: 
EMR: 
EHH: 
NSE: 
NRI: 
NHM: 
MMN: 
EAA: 
RBT: 
MLO: 
MCI: 
MOP: 
MAM: 
MES: 
HOE: 
PLA: 
SME: 
SMK: 
SMQ: 
SMX: 
SMI: 
SMEG: 
SMEL: 
SMER: 
SMD: 
RHI: 
SFH: 
SFD: 
EAD: 
ATU: 
Atu1339(rne)
ARA: 
ATF: 
AVI: 
AGR: 
RET: 
REC: 
REL: 
REI: 
REP: 
RLE: 
RLT: 
RLG: 
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Reference
  Authors
Carpousis AJ
  Title
The RNA degradosome of Escherichia coli: an mRNA-degrading machine assembled on RNase E.
  Journal
Annu Rev Microbiol 61:71-87 (2007)
  Sequence
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Reference
  Authors
Marcaida MJ, DePristo MA, Chandran V, Carpousis AJ, Luisi BF
  Title
The RNA degradosome: life in the fast lane of adaptive molecular evolution.
  Journal
Trends Biochem Sci 31:359-65 (2006)
  Sequence
[eco:b1084]
Reference
  Authors
Garrey SM, Blech M, Riffell JL, Hankins JS, Stickney LM, Diver M, Hsu YH, Kunanithy V, Mackie GA
  Title
Substrate binding and active site residues in RNases E and G: role of the 5'-sensor.
  Journal
J Biol Chem 284:31843-50 (2009)
  Sequence
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