KEGG   ORTHOLOGY: K12598Help
Entry
K12598                      KO                                     

Name
MTR4, SKIV2L2
Definition
ATP-dependent RNA helicase DOB1 [EC:3.6.4.13]
Pathway
RNA degradation
Module
M00393  
TRAMP complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   RNA processing
    M00393  TRAMP complex
     K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.6  Acting on acid anhydrides
   3.6.4  Acting on acid anhydrides to facilitate cellular and subcellular movement
    3.6.4.13  RNA helicase
     K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   U4/U6.U5 tri-snRNP related factors
    K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
 Complex C
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   U4/U6.U5 tri-SnRNP related factors
    K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Eukaryotic Type
  Pre-60S particles
   Helicases
    K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
Transfer RNA biogenesis [BR:ko03016]
 Eukaryotic Type
  tRNA degradation factors
   TRAMP complex
    K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: 
GO: 
Genes
HSA: 
23517(SKIV2L2)
PTR: 
461870(SKIV2L2)
PPS: 
100986507(SKIV2L2)
GGO: 
101152149(SKIV2L2)
PON: 
100447175(SKIV2L2)
NLE: 
100605886(SKIV2L2)
MCC: 
MCF: 
102145811(SKIV2L2)
CJC: 
100399268(SKIV2L2)
MMU: 
72198(Skiv2l2)
RNO: 
365668(Skiv2l2)
CGE: 
100768244(Skiv2l2)
NGI: 
103739917(Skiv2l2)
HGL: 
101724541(Skiv2l2)
OCU: 
100347578(SKIV2L2)
TUP: 
102498741(SKIV2L2)
CFA: 
607950(SKIV2L2)
AML: 
100479623(SKIV2L2)
UMR: 
103663675(SKIV2L2)
FCA: 
101088299(SKIV2L2)
PTG: 
102971190(SKIV2L2)
BTA: 
520256(SKIV2L2)
BOM: 
102279402(SKIV2L2)
PHD: 
102315339(SKIV2L2)
CHX: 
102190356(SKIV2L2)
OAS: 
101115066(SKIV2L2)
SSC: 
100518521(SKIV2L2)
CFR: 
102505637(SKIV2L2)
BACU: 
102997872(SKIV2L2)
LVE: 
103077784(SKIV2L2)
ECB: 
100051945(SKIV2L2)
MYB: 
102252808(SKIV2L2)
MYD: 
102752659(SKIV2L2)
PALE: 
102879653(SKIV2L2)
MDO: 
100017078(SKIV2L2)
SHR: 
100934235(SKIV2L2)
OAA: 
100083276(SKIV2L2)
GGA: 
427137(SKIV2L2)
MGP: 
APLA: 
101800697(SKIV2L2)
TGU: 
100229654(SKIV2L2)
FAB: 
101822019(SKIV2L2)
PHI: 
102107384(SKIV2L2)
FPG: 
101911883(SKIV2L2)
FCH: 
102052203(SKIV2L2)
CLV: 
102096300(SKIV2L2)
ASN: 
102385002(SKIV2L2)
AMJ: 
102557938(SKIV2L2)
PSS: 
102457515(SKIV2L2)
CMY: 
102932564(SKIV2L2)
ACS: 
100556882(skiv2l2)
PBI: 
103050278(SKIV2L2)
XTR: 
100496866(skiv2l2)
DRE: 
406795(skiv2l2)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
100304468(skiv2l2)
XMA: 
LCM: 
102361351(SKIV2L2)
CMK: 
103177819(skiv2l2)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
584685(SKIV2L2) 762385
DME: 
Dmel_CG4152(l(2)35Df)
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
551637(GB13548)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CBR: 
CBG03473(Cbr-mtr-4)
BMY: 
LOA: 
TSP: 
HRO: 
LGI: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
AQU: 
ATH: 
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
PMUM: 
MDM: 
CSV: 
CMO: 
RCU: 
POP: 
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os11t0176200-01(Os11g0176200) Os12t0279000-01(Os12g0279000)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_03g003740(SORBIDRAFT_03g003740) SORBI_10g000500(SORBIDRAFT_10g000500)
SITA: 
PDA: 
ATR: 
s00025p00200390(AMTR_s00025p00200390) s00066p00125980(AMTR_s00066p00125980)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
OTA: 
BPG: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YJL050W(MTR4)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0A09110(NCAS0A09110)
NDI: 
NDAI_0G05850(NDAI0G05850)
TPF: 
TPHA_0O01420(TPHA0O01420)
TBL: 
TBLA_0F01280(TBLA0F01280)
TDL: 
TDEL_0D01990(TDEL0D01990)
KAF: 
KAFR_0A00860(KAFR0A00860)
DHA: 
PIC: 
PGU: 
SPAA: 
LEL: 
CAL: 
CaO19.1335(MTR4) CaO19.8915(MTR4) CaO19_1335(CaJ7_0392)
CTP: 
COT: 
CDU: 
CTEN: 
YLI: 
CLU: 
NCR: 
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
CTHR: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
NHE: 
TRE: 
MAW: 
MAJ: 
CMT: 
VAL: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_1508144(AO090023000859)
ANG: 
ANI_1_338184(An04g01570)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
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CPW: 
PBL: 
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ABE: 
TVE: 
AJE: 
PNO: 
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SPO: 
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CGI: 
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PCO: 
SHS: 
PSQ: 
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FME: 
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LBC: 
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CCI: 
SCM: 
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AGABI1DRAFT101993(AGABI1DRAFT_101993) AGABI1DRAFT46451(AGABI1DRAFT_46451)
ABV: 
AGABI2DRAFT77358(AGABI2DRAFT_77358)
CPUT: 
SLA: 
UMA: 
PFP: 
MGL: 
PGR: 
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WSE: 
ECU: 
EIN: 
EHE: 
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DDI: 
DPP: 
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EHI: 
EHI_134610(131.t00001)
EDI: 
ACAN: 
PFA: 
PFD: 
PFH: 
PYO: 
PCB: 
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PKN: 
PVX: 
PCY: 
TAN: 
TPV: 
BBO: 
BBOV_II005660(18.m06470)
BEQ: 
CPV: 
CHO: 
TGO: 
TET: 
PTM: 
PTI: 
TPS: 
PIF: 
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TBR: 
TCR: 
LMA: 
LIF: 
LDO: 
LMI: 
LBZ: 
NGR: 
TVA: 
GLA: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Vanacova S, Wolf J, Martin G, Blank D, Dettwiler S, Friedlein A, Langen H, Keith G, Keller W
  Title
A new yeast poly(A) polymerase complex involved in RNA quality control.
  Journal
PLoS Biol 3:e189 (2005)
  Sequence
[sce:YJL050W]
Reference
  Authors
Schilders G, van Dijk E, Pruijn GJ
  Title
C1D and hMtr4p associate with the human exosome subunit PM/Scl-100 and are involved in pre-rRNA processing.
  Journal
Nucleic Acids Res 35:2564-72 (2007)
  Sequence
[hsa:23517]

DBGET integrated database retrieval system