KEGG   ORTHOLOGY: K12598
Entry
K12598                      KO                                     
Symbol
MTR4, SKIV2L2
Name
ATP-dependent RNA helicase DOB1 [EC:5.6.2.6]
Pathway
map03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
   03041 Spliceosome
    K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
   03009 Ribosome biogenesis
    K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
   03016 Transfer RNA biogenesis
    K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
Enzymes [BR:ko01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.6  RNA 3'-5' helicase
     K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    TRAMP complex
     K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   U4/U6.U5 tri-snRNP related factors
    K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
 Complex C
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   U4/U6.U5 tri-SnRNP related factors
    K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Eukaryotic type
  Pre-60S particles
   Helicases
    K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
Transfer RNA biogenesis [BR:ko03016]
 Eukaryotic type
  tRNA degradation factors
   TRAMP complex
    K12598  MTR4, SKIV2L2; ATP-dependent RNA helicase DOB1
Other DBs
COG: COG0513
GO: 0034458
Genes
HSA: 23517(MTREX)
PTR: 461870(MTREX)
PPS: 100986507(MTREX)
GGO: 101152149(MTREX)
PON: 100447175(MTREX)
NLE: 100605886(MTREX)
HMH: 116462557(MTREX)
MCC: 706419(MTREX)
MCF: 102145811(MTREX)
MTHB: 126957163
MNI: 105499390(MTREX)
CSAB: 103221515(SKIV2L2)
CATY: 105597708(SKIV2L2)
PANU: 101024675(MTREX)
TGE: 112626738(MTREX)
MLEU: 105551499(SKIV2L2)
RRO: 104680487(MTREX)
RBB: 108530980(SKIV2L2)
TFN: 117065129(MTREX)
PTEH: 111541630(MTREX)
CANG: 105509879(SKIV2L2)
CJC: 100399268(MTREX)
SBQ: 101033038(SKIV2L2)
CIMI: 108317962(MTREX)
CSYR: 103268237(SKIV2L2)
MMUR: 105877295(SKIV2L2)
LCAT: 123647982(MTREX)
PCOQ: 105819100(SKIV2L2)
OGA: 100961374(MTREX)
MMU: 72198(Mtrex)
MCAL: 110307553(Mtrex)
MPAH: 110328776(Skiv2l2)
RNO: 365668(Mtrex)
MCOC: 116083512(Mtrex)
ANU: 117723769(Mtrex)
MUN: 110558761(Mtrex)
CGE: 100768244(Mtrex)
MAUA: 101842574(Mtrex)
PROB: 127221155(Mtrex)
PLEU: 114703617(Mtrex)
MORG: 121455810(Mtrex)
MFOT: 126507992
AAMP: 119808842(Mtrex)
NGI: 103739917(Skiv2l2)
HGL: 101724541(Skiv2l2)
CPOC: 100734537(Mtrex)
DORD: 105987355(Skiv2l2)
DSP: 122117125(Mtrex)
PLOP: 125367835(Mtrex)
NCAR: 124987058
MMMA: 107151883(Mtrex)
OCU: 100347578(MTREX)
OPI: 101527638(MTREX)
TUP: 102498741(SKIV2L2)
GVR: 103590787(SKIV2L2)
CFA: 607950(MTREX)
CLUD: 112660480(MTREX)
VVP: 112935148(MTREX)
VLG: 121496854(MTREX)
NPO: 129513797(MTREX)
AML: 100479623(MTREX)
UMR: 103663675(MTREX)
UAH: 113255328(MTREX)
UAR: 123790185(MTREX)
ELK: 111156866
LLV: 125099882
MPUF: 101670395(SKIV2L2)
MNP: 132028643(MTREX)
MLK: 131832235(MTREX)
NVS: 122889502(MTREX)
ORO: 101370395(SKIV2L2)
EJU: 114221018(MTREX)
ZCA: 113928743(MTREX)
MLX: 118016790(MTREX)
NSU: 110591272(MTREX)
LWW: 102729830(MTREX)
FCA: 101088299(MTREX)
PYU: 121015894(MTREX)
PCOO: 112861706(MTREX)
PBG: 122488936(MTREX)
PVIV: 125162804(MTREX)
LRUF: 124517259
PTG: 102971190(SKIV2L2)
PPAD: 109246333(SKIV2L2)
PUC: 125935621
AJU: 106987315(MTREX)
HHV: 120239968(MTREX)
BTA: 520256(MTREX)
BOM: 102279402(SKIV2L2)
BIU: 109574776(SKIV2L2)
BBUB: 102407198(MTREX)
BBIS: 105001038(SKIV2L2)
CHX: 102190356(SKIV2L2)
OAS: 101115066(MTREX)
BTAX: 128065944(MTREX)
ODA: 120879518(MTREX)
CCAD: 122454270(MTREX)
MBEZ: 129553252(MTREX)
SSC: 100518521(SKIV2L2)
CFR: 102505637(MTREX)
CBAI: 105077807(SKIV2L2)
CDK: 105087142(MTREX)
VPC: 102526701(MTREX)
BACU: 102997872(SKIV2L2)
BMUS: 118893470(MTREX)
LVE: 103077784(SKIV2L2)
OOR: 101284931(MTREX)
DLE: 111186665(MTREX)
PCAD: 102985847(MTREX)
PSIU: 116750945(MTREX)
NASI: 112413392(MTREX)
ECB: 100051945(MTREX)
EPZ: 103559062(SKIV2L2)
EAI: 106843360(MTREX)
MYB: 102252808(SKIV2L2)
MYD: 102752659(SKIV2L2)
MMYO: 118655935(MTREX)
MLF: 102441903(MTREX)
PKL: 118702796(MTREX)
EFUS: 103303103(MTREX)
MNA: 107527148(SKIV2L2)
DRO: 112315302(MTREX)
SHON: 118981720(MTREX)
AJM: 119049177(MTREX)
PDIC: 114497361(MTREX)
PHAS: 123819494(MTREX)
MMF: 118641650(MTREX)
PPAM: 129071970(MTREX)
HAI: 109382140(SKIV2L2)
RFQ: 117024872(MTREX)
PALE: 102879653(MTREX)
PGIG: 120608182(MTREX)
PVP: 105305811(MTREX)
RAY: 107509644(SKIV2L2)
MJV: 108384185(MTREX)
TOD: 119261461(MTREX)
SARA: 101549979(SKIV2L2)
SETR: 126000928(MTREX)
LAV: 100653830(MTREX)
TMU: 101360684
ETF: 101647937(MTREX)
DNM: 101443951(MTREX)
MDO: 100017078(SKIV2L2)
GAS: 123237188(MTREX)
SHR: 100934235(MTREX)
AFZ: 127557445
PCW: 110215606(SKIV2L2)
OAA: 100083276(MTREX)
GGA: 427137(SKIV2L2)
PCOC: 116239411(MTREX)
MGP: 104914891
CJO: 107305984(MTREX)
TPAI: 128074600(MTREX)
LMUT: 125687319(MTREX)
NMEL: 110389342(SKIV2L2)
APLA: 101800697(MTREX)
ACYG: 106035590(MTREX)
CATA: 118251522(MTREX)
AFUL: 116500383(MTREX)
TGU: 100229654(MTREX)
LSR: 110472551(MTREX)
SCAN: 103821095(MTREX)
PMOA: 120502326(MTREX)
OTC: 121346606(MTREX)
PRUF: 121355314(MTREX)
GFR: 102037101(SKIV2L2)
FAB: 101822019(SKIV2L2)
OMA: 130264889(MTREX)
PHI: 102107384(SKIV2L2)
PMAJ: 107216075(MTREX)
CCAE: 111941442(MTREX)
CCW: 104686770(MTREX)
CBRC: 103624037(SKIV2L2)
ZAB: 102068340(MTREX)
ACHL: 103806529(SKIV2L2)
SVG: 106859612(SKIV2L2)
MMEA: 130588768(MTREX)
HRT: 120765212(MTREX)
FPG: 101911883(SKIV2L2)
FCH: 102052203(MTREX)
CLV: 102096300(SKIV2L2)
EGZ: 104134678(SKIV2L2)
NNI: 104013736(SKIV2L2)
PCRI: 104035935(SKIV2L2)
PCAO: 104051218(SKIV2L2)
ACUN: 113489582(MTREX)
TALA: 104367748(MTREX)
PADL: 103919429(SKIV2L2)
AFOR: 103893432(SKIV2L2)
ACHC: 115336459(MTREX)
HLE: 104839950(SKIV2L2)
AGEN: 126036445
GCL: 127027195
CCRI: 104157574(SKIV2L2)
CSTI: 104549160(SKIV2L2)
MUI: 104533199(SKIV2L2)
BREG: 104634136(SKIV2L2)
FGA: 104069119(SKIV2L2)
MNB: 103769650(SKIV2L2)
OHA: 104337790(SKIV2L2)
NNT: 104408444(SKIV2L2)
SHAB: 115601246(MTREX)
DPUB: 104296758(SKIV2L2)
CPEA: 104395667(SKIV2L2)
AVIT: 104279191(SKIV2L2)
CVF: 104294605(SKIV2L2)
RTD: 128902380(MTREX)
CUCA: 104054804(SKIV2L2)
TEO: 104378063(SKIV2L2)
BRHI: 104490054(SKIV2L2)
AROW: 112964509(MTREX)
NPD: 112945734(MTREX)
TGT: 104579124(SKIV2L2)
DNE: 112995755(MTREX)
SCAM: 104146903(SKIV2L2)
ASN: 102385002(MTREX)
AMJ: 102557938(SKIV2L2)
CPOO: 109307911(SKIV2L2)
GGN: 109297819(SKIV2L2)
PSS: 102457515(MTREX)
CMY: 102932564(MTREX)
CCAY: 125637292(MTREX)
DCC: 119855414(MTREX)
CPIC: 101933895(MTREX)
TST: 117878996(MTREX)
CABI: 116818257(MTREX)
MRV: 120408722(MTREX)
ACS: 100556882(skiv2l2)
ASAO: 132766992(MTREX)
PVT: 110085397(SKIV2L2)
SUND: 121923408(MTREX)
PBI: 103050278(MTREX)
PMUR: 107294977(MTREX)
CTIG: 120313609(MTREX)
TSR: 106546042(SKIV2L2)
PGUT: 117679193(MTREX)
PTEX: 113446841(MTREX)
NSS: 113413894(MTREX)
VKO: 123031300(MTREX)
PMUA: 114606650(MTREX)
PRAF: 128423751(MTREX)
ZVI: 118077147(MTREX)
HCG: 128341742(MTREX)
GJA: 107120509(SKIV2L2)
STOW: 125436241(MTREX)
EMC: 129334846(MTREX)
XLA: 108707288(mtrex.S) 108718355(mtrex.L)
XTR: 100496866(mtrex)
NPR: 108796692(SKIV2L2)
RTEM: 120928351(MTREX)
BBUF: 120992337(MTREX)
BGAR: 122924795(MTREX)
MUO: 115462989(MTREX)
GSH: 117354217(MTREX)
DRE: 406795(mtrex)
SRX: 107713350 107744101
SANH: 107685151(skiv2l2) 107686493
SGH: 107562544 107571110
CCAR: 109096825(skiv2l2)
CAUA: 113110382(mtrex)
CGIB: 127966666
PTET: 122353110(mtrex)
LROH: 127172459(mtrex)
OMC: 131547864(mtrex)
PPRM: 120481680(mtrex)
RKG: 130087130(mtrex)
MAMB: 125257186(mtrex)
CIDE: 127521294
MASI: 127432736 127433495
TROS: 130545770(mtrex)
TDW: 130412213(mtrex)
MANU: 129447246(mtrex)
IPU: 108277035(mtrex)
IFU: 128620772(mtrex)
PHYP: 113543991(mtrex)
SMEO: 124393907(mtrex)
TFD: 113661303(mtrex)
TVC: 132863590(mtrex)
AMEX: 103046062(skiv2l2)
CMAO: 118824722(mtrex)
EEE: 113590381(mtrex)
CHAR: 105894631(mtrex) 116222779
TRU: 101069433(mtrex)
TFS: 130517591(mtrex)
TNG: GSTEN00014455G001
LCO: 104920099(mtrex)
TBEN: 117478856(mtrex)
CGOB: 115017069(mtrex)
PGEO: 117443634
GACU: 117556485(mtrex)
EMAC: 134867969(mtrex)
ELY: 117269628(mtrex)
EFO: 125878547(mtrex)
PLEP: 121960217(mtrex)
SLUC: 116062906(mtrex)
ECRA: 117959425(mtrex)
ESP: 116704789(mtrex)
PFLV: 114570822(mtrex)
GAT: 120831997(mtrex)
PPUG: 119226610(mtrex)
AFB: 129102898(mtrex)
CLUM: 117740157(mtrex)
PSWI: 130205431(mtrex)
MSAM: 119914518(mtrex)
SCHU: 122865555(mtrex)
CUD: 121524982(mtrex)
ALAT: 119029921(mtrex)
MZE: 101471175(mtrex)
ONL: 100708186(mtrex)
OAU: 116331743(mtrex)
OLA: 100304468(mtrex)
OML: 112163482(mtrex)
CSAI: 133454933(mtrex)
XMA: 102228439(mtrex)
XCO: 114149525(mtrex)
XHE: 116724306(mtrex)
PRET: 103473474(skiv2l2)
PFOR: 103142779
PLAI: 106939763(skiv2l2)
PMEI: 106912322(skiv2l2)
GAF: 122846838(mtrex)
PPRL: 129374228(mtrex)
CVG: 107088972(skiv2l2)
CTUL: 119776549(mtrex)
GMU: 124872483(mtrex)
NFU: 107374728(skiv2l2)
KMR: 108231010(mtrex)
ALIM: 106516239(skiv2l2)
NWH: 119424841(mtrex)
AOCE: 111564818(mtrex)
MCEP: 124996780(mtrex)
CSEM: 103390251(skiv2l2)
POV: 109626272(skiv2l2)
SSEN: 122758410(mtrex)
HHIP: 117772079(mtrex)
HSP: 118098167(mtrex)
SMAU: 118285190(mtrex)
LCF: 108874026
SDU: 111239869(skiv2l2)
SLAL: 111656802(mtrex)
XGL: 120806399(mtrex)
HCQ: 109527849(skiv2l2)
SSCV: 125979551
SBIA: 133490664(mtrex)
PEE: 133413566(mtrex)
PTAO: 133465271(mtrex)
BPEC: 110157399(skiv2l2)
MALB: 109972309(skiv2l2)
BSPL: 114866679(mtrex)
SJO: 128380361(mtrex)
SASA: 100380870(sk2l2) 106568406
STRU: 115149378 115159169
OTW: 112219677 112257290
OMY: 110523912 110536793
OGO: 123999249 124019131
ONE: 115105969 115127087
OKI: 109868275 109892374
OKE: 118387889 118391524
SALP: 111961294 111980880
SNH: 120025488 120044927
CCLU: 121573492 121582834
ELS: 105026680(mtrex)
SFM: 108925051(mtrex)
PKI: 111849991(mtrex)
AANG: 118206279(mtrex)
LOC: 102694071(skiv2l2)
PSPA: 121304031(mtrex) 121314243
ARUT: 117409410(mtrex)
PSEX: 120527196(mtrex)
LCM: 102361351(SKIV2L2)
CMK: 103177819(mtrex)
RTP: 109929412(mtrex)
CPLA: 122549237(mtrex)
HOC: 132812477(mtrex)
LERI: 129696498(mtrex)
PMRN: 116941950(MTREX) 116948772
LRJ: 133352042 133358972(MTREX)
BFO: 118431630
BBEL: 109467068
CIN: 100182540
SCLV: 120347099
SPU: 762385
LPIC: 129270963
APLC: 110980177
AJC: 117114382
SKO: 100379085
DME: Dmel_CG4152(Mtr4)
DER: 6542475
DSE: 6611391
DSI: Dsimw501_GD24019(Dsim_GD24019)
DYA: Dyak_GE21122
DAN: 6497735
DSR: 110185600
DPO: 4816314
DPE: 6603384
DMN: 108162569
DWI: 6644019
DGR: 6566498
DMO: Dmoj_GI13953
DAZ: 108610936
DNV: 108649742
DHE: 111600622
DVI: 6633931
CCAT: 101455726
BOD: 106623662
BDR: 105229074
RZE: 108371677 108371854
AOQ: 129247788 129249487
TDA: 119687274
MDE: 101893682
SCAC: 106093887
LCQ: 111684355
LSQ: 119612139
GFS: 119642317
ECOE: 129938736
CLON: 129612424
HIS: 119650604
AGA: 1278973
ACOZ: 120957731
AARA: 120903202
AMER: 121597218 121601952
ASTE: 118513223
AFUN: 125761116
AMOU: 128302017
AALI: 118460968
AAG: 5571427
CQU: CpipJ_CPIJ005981
CPII: 120420136
CNS: 116341688
BCOO: 119076250
AME: 551637
ACER: 108004263
ALAB: 122718438
ADR: 102679512
AFLR: 100869646
BIM: 100740506
BBIF: 117210823
BVK: 117236224
BVAN: 117166590
BTER: 100649317
BAFF: 126919723
BPYO: 122565790
BPAS: 132910461
FVI: 122536866
CCAL: 108625826
OBB: 114873656
OLG: 117601086
MGEN: 117229100
NMEA: 116429981
CGIG: 122400039
SOC: 105195248
MPHA: 105838271
AEC: 105149222
ACEP: 105627092
PBAR: 105427772
VEM: 105561605
HST: 105182137
DQU: 106741640
CFO: 105258686
FEX: 115246028
LHU: 105671997
PGC: 109853771
OBO: 105278177
PCF: 106793263
PFUC: 122524425
VPS: 122629428
VCRB: 124423558
VVE: 124949788
NVI: 100116475
CSOL: 105366740
TPRE: 106654682
LHT: 122504376
LBD: 127285620
MDL: 103570857
CGLO: 123264526
FAS: 105263661
DAM: 107042161
AGIF: 122858057
CINS: 118067033
VCAN: 122413413
CCIN: 107263028
DSM: 124416391
NPT: 124219285
NFB: 124185188
NLO: 107216656
NVG: 124310148
AROA: 105690264
TCA: 658969
DPA: 109533618
SOY: 115886558
AGRG: 126741884
ATD: 109603790
CSET: 123312935 123313909
AGB: 108914247
LDC: 111508411
NVL: 108557812
APLN: 108744526
PPYR: 116176567
OTU: 111413481
BMOR: 101743187
MSEX: 115443736 119190600
DPL: KGM_215771
BANY: 112052164
MJU: 123877625
NIQ: 126776112
VCD: 124536709
MCIX: 123657490
PMAC: 106709308
PPOT: 106099312
PXU: 106124694
PRAP: 111003836
PBX: 123716753
PNAP: 125050602
ZCE: 119829500
CCRC: 123706179
LSIN: 126966577
AAGE: 121730479
HAW: 110377767
HZE: 124633286
TNL: 113502214
SLIU: 111353159
OFU: 114351753
PXY: 105396873 105397558
PGW: 126372832
CFEL: 113365939 113368477
CCRN: 123303104
API: 100158988
AGS: 114125068
RMD: 113560376
ACOO: 126845720
DVT: 126895826
BTAB: 109037355
DCI: 103512446
CLEC: 106662583
HHAL: 106680549
NLU: 111052101
HVI: 124355129
MQU: 128996272 128996790
PHU: Phum_PHUM218140
FOC: 113206109
TPAL: 117644361
ZNE: 110826482
CSEC: 111863605
SGRE: 126316758 126366010
BROR: 134532589
IEL: 124157526
FCD: 110847776
DPX: DAPPUDRAFT_304340
DMK: 116917648
DPZ: 124314638
PVM: 113830397
PJA: 122251269
PCHN: 125042987
PMOO: 119585221
HAME: 121856938
PCLA: 123768266
CQD: 128689961
PTRU: 123515917
ESN: 127004047
MNZ: 135209670
HAZT: 108678915
EAF: 111698938
LSM: 121120375
TCF: 131877123
PPOI: 119096280 119097008
ISC: 8026444
DSV: 119432972
RSAN: 119404903
RMP: 119181386
VDE: 111249840
VJA: 111262399
TUT: 107362011
DPTE: 113790095 113795338 113796123
DFR: 124490389 124494854
CSCU: 111634705
PTEP: 107449781
ABRU: 129983711
UDV: 129225202
SDM: 118201932
LPOL: 106463843
PMEO: 129581587
CEL: CELE_W08D2.7(mtr-4)
CBR: CBG_03473(Cbr-mtr-4)
CRQ: GCK72_014425
NAI: NECAME_06651
BMY: BM_BM13791(Bma-mtr-4)
LOA: LOAG_06429
TSP: Tsp_00364
HRO: HELRODRAFT_96072
LGI: LOTGIDRAFT_162536
PVUL: 126818450
PCAN: 112574037
BGT: 106061269
GAE: 121375133
HRF: 124115582
HRJ: 124270382
CRG: 105341233
CVN: 111119263 111121481
CANU: 128165738
OED: 125670996
MYI: 110463294
PMAX: 117325972
MCAF: 127727041
MMER: 123524048
RPHI: 132727311
DPOL: 127874483
OBI: 106881995
OSN: 115214013
LAK: 106161202
SMM: Smp_120360 Smp_212530
OVI: T265_06266 T265_15315
EGL: EGR_02546 EGR_08106
NVE: 5515925
EPA: 110233742 110249714
ATEN: 116289174
ADF: 107353624 107354814
AMIL: 114961302
PDAM: 113682953
SPIS: 111323146
DGT: 114535863
XEN: 124438185
HMG: 100201206
HSY: 130630359
AQU: 100632290
ATH: AT1G59760(MTR4) AT2G06990(HEN2)
ALY: 9319812 9322727
CRB: 17893500 17896073
CSAT: 104699386 104700771 104747232 104750141 104766591 104787180
EUS: EUTSA_v10019987mg EUTSA_v10023236mg
BRP: 103829199 103838580 103870525
BNA: 106373695 106376939 106418603 106434706 106452760 111197833
BOE: 106295374 106318897
RSZ: 108828339 108863219
THJ: 104808911 104809621 104815315
CPAP: 110807370 110809808
CIT: 102611776 102621716
CIC: CICLE_v10018695mg CICLE_v10027747mg
PVY: 116111900 116126656
MINC: 123193119 123194700
TCC: 18589487 18595202
GRA: 105773245 105782109
GHI: 107888367 107893491 107899861 107961953
GAB: 108464031 108486226
HSYR: 120117706 120119642 120204330
DZI: 111280266 111301777
EGR: 104435888 104452464
GMX: 100785694 100804792
GSJ: 114421108 114423810
PVU: PHAVU_002G303000g PHAVU_008G002600g
VRA: 106759389 106768574
VAR: 108321699 108322943
VUN: 114177733 114185025
VUM: 124845603 124846936
CCAJ: 109799440 109801935
APRC: 113853664 113860710
MTR: 11408570 11442176 11442551
TPRA: 123915579 123924652
CAM: 101505143 101507765(SKIV2L2) 101515118
PSAT: 127100941 127128786
VVO: 131603764 131608705
LJA: Lj1g3v3329390.1(Lj1g3v3329390.1) Lj4g3v3015040.2(Lj4g3v3015040.2)
ADU: 107479312 107486857
AIP: 107630658 107635764
AHF: 112732383 112745006 112790754 112798292
LANG: 109329387 109333101 109349874
PCIN: 129293254 129320088
QSA: O6P43_007805 O6P43_031442
FVE: 101306821 101308090
RCN: 112178558 112197468
PPER: 18773392 18792433
PMUM: 103323719 103326252
PAVI: 110755321 110766187
PDUL: 117631946 117633670
MDM: 103404070 103424165 103441992
MSYL: 126596601 126606528 126632866
PXB: 103946403 103959399
ZJU: 107417661 107425364
MNT: 21391596 21394245
CSAV: 115713019 115713075
CSV: 101203071 101205306
CMO: 103492231 103497670
BHJ: 120067305 120079058
MCHA: 111016207 111018196
CMAX: 111491727 111494259 111499210
CMOS: 111436255 111460149 111464445
CPEP: 111778667 111805403 111807085
RCU: 8262570 8281906
HBR: 110644527 110667557
MESC: 110606747 110619281
POP: 18098364 7485515
PEU: 105122527 105128434
PALZ: 118031099 118033630
JRE: 108990711 109007032
CILL: 122297549 122311746
CAVE: 132180460 132183687
QSU: 111996114 112019562 112021159
QLO: 115969535 115976313
TWL: 119993220 119997445 120016875
VVI: 100246661 100258243
VRI: 117916203 117925207
SLY: 101257307 101261492 101262619
SPEN: 107007221 107007506 107020509
SOT: 102587109 102587942 102605528
SSTN: 125862622 125866118 125866848
SDUL: 129870242 129880678 129885943
CANN: 107839830 107870955
LBB: 132598601 132636241 132640604
NTA: 107766793 107781853 107799000 107800695 107801795 107812229 107830836
NSY: 104219768 104221972 104228357
NTO: 104086057 104087455 104098783 104100747 104112745
NAU: 109225491 109226807 109234130
INI: 109146768 109167173
ITR: 116012762 116029263
SIND: 105161994 105172506 105173854
OEU: 111392358 111404207 111409808
EGT: 105962564 105970956
SSPL: 121747982 121749037 121752380 121779645 121782279 121796200 121799948
SMIL: 130986473 131004906 131013935 131013969
SHIS: 125193923 125213570 125214608
APAN: 127251904 127252445
HAN: 110885612 110886229 110894081
ECAD: 122595620 122596645
LSV: 111878019 111918646
CCAV: 112502783 112516652
DCR: 108204662 108214563
CSIN: 114290607 114298526
RVL: 131306358 131320942
AEW: 130754316 130782071
BVG: 104886775 104897021
SOE: 110783960 110803579
CQI: 110683789 110687913 110706925 110710326
ATRI: 130803472 130821191
MOF: 131149123 131163710
NNU: 104593867 104610841
MING: 122059927 122065938 122084719
TSS: 122661470 122669297 122669522
PSOM: 113287134 113291597 113299999 113321769 113328876 113358781
OSA: 4349924 9268439
DOSA: Os11t0176200-01(Os11g0176200) Os12t0279000-01(Os12g0279000)
OBR: 102708098 102714969
OGL: 127754237 127757482
BDI: 100822667 100834961
ATS: 109733440 109737999 109773536
TDC: 119286527 119288348 119295247 119329220 119353683 119362856
TAES: 123044089 123051960 123086655 123088572 123091275 123096259 123151531 123169955 123187841
TUA: 125526001 125546033 125550813
LPER: 127311690 127342514
LRD: 124660873 124684954
SBI: 8067882 8078772
ZMA: 103634889 103638180
SITA: 101767036 101778212
SVS: 117851890 117866550
PVIR: 120643807 120669807 120685266 120702330
PHAI: 112889365 112902218
PDA: 103713132 103720870
EGU: 105033482 105049277
MUS: 103975252 103976859
ZOF: 121971561 121996302
DCT: 110096722 110099286 110107726
PEQ: 110027992 110030136
AOF: 109826762 109840545
MSIN: 131217555 131219374
NCOL: 116250156 116266772 116268294
ATR: 18440758 18448613
SMO: SELMODRAFT_107227 SELMODRAFT_174598 SELMODRAFT_268485 SELMODRAFT_79650
PPP: 112287773 112291762
CRE: CHLRE_02g117900v5 CHLRE_06g289950v5
VCN: VOLCADRAFT_107315 VOLCADRAFT_121704
CSL: COCSUDRAFT_30930 COCSUDRAFT_37565
CVR: CHLNCDRAFT_141429 CHLNCDRAFT_28067
APRO: F751_3524 F751_4582
OLU: OSTLU_49799 OSTLU_50379
OTA: OT_ostta06g03010 OT_ostta09g02930
BPG: Bathy05g03250 Bathy10g01610
MIS: MICPUN_78446 MICPUN_88392
MPP: MICPUCDRAFT_32119(JGI:MicpuC2_32119) MICPUCDRAFT_44758(JGI:MicpuC2_44758)
CME: CYME_CMA072C
GSL: Gasu_41650
CCP: CHC_T00010189001
SCE: YJL050W(MTR4)
SEUB: DI49_2965
SPAO: SPAR_J01520
AGO: AGOS_AEL181C
ERC: Ecym_6303
KLA: KLLA0_F01364g
KMX: KLMA_50057(MTR4)
LTH: KLTH0H10406g
VPO: Kpol_1035p20
ZRO: ZYRO0B09306g
CGR: CAGL0J04928g
NCS: NCAS_0A09110(NCAS0A09110)
NDI: NDAI_0G05850(NDAI0G05850)
TPF: TPHA_0O01420(TPHA0O01420)
TBL: TBLA_0F01280(TBLA0F01280)
TGB: HG536_0F02130
TDL: TDEL_0D01990(TDEL0D01990)
KAF: KAFR_0A00860(KAFR0A00860)
KNG: KNAG_0E02660(KNAG0E02660)
ZMK: HG535_0C04840
DHA: DEHA2C13068g
PIC: PICST_36809(MTR4)
PGU: PGUG_05017
SPAA: SPAPADRAFT_57398
LEL: PVL30_005297(MTR4)
CAL: CAALFM_C703400CA(CaO19.1335)
CTP: CTRG_05135
COT: CORT_0G03860
CDU: CD36_73050
CTEN: CANTEDRAFT_118199
YLI: YALI0D12210g
CLU: CLUG_02971
CLUS: A9F13_18g00825
CAUR: CJI96_0002326
SLB: AWJ20_4263(MTR4)
PKZ: C5L36_0A08820
BNN: FOA43_000561(MTR4)
BBRX: BRETT_003176(MTR4)
OPA: HPODL_03649
SLUD: SCDLUD_003572
NCR: NCU03363(frh)
NTE: NEUTE1DRAFT84510(NEUTE1DRAFT_84510)
SMP: SMAC_04070
PAN: PODANSg6419
PBEL: QC761_305840(MTR4)
PPSD: QC762_305840(MTR4)
PPSP: QC763_305840(MTR4)
PPSA: QC764_305840(MTR4)
TTT: THITE_2123361
MTM: MYCTH_2311660
CTHR: CTHT_0001850
MGR: MGG_03931
PPEI: PpBr36_04403
PGRI: PgNI_06997
TMN: UCRPA7_880
SSCK: SPSK_03926
FGR: FGSG_01656
FPU: FPSE_11504
FPOA: FPOAC1_001778
FVN: FVRRES_01992
FVR: FVEG_09752
FOX: FOXG_11049
NHE: NECHADRAFT_89658
FFC: NCS54_00019100
FKR: NCS57_00016900
FMU: J7337_000214
TRE: TRIREDRAFT_49059
TRR: M419DRAFT_110734
MAW: MAC_05806
MAJ: MAA_08584
PCHM: VFPPC_02325
CMT: CCM_02156
AMUS: LMH87_003242
PLJ: VFPFJ_07358
PTKZ: JDV02_010386(MTR4)
VAL: VDBG_05820
VDA: VDAG_07754
CFJ: CFIO01_07951
CLUP: CLUP02_01774
CHIG: CH63R_10707
SAPO: SAPIO_CDS0897
ELA: UCREL1_10698
PFY: PFICI_08821
SSL: SS1G_03952
BFU: BCIN_04g01950
MBE: MBM_08039
PSCO: LY89DRAFT_624442
GLZ: GLAREA_09020
ANI: ANIA_04412
AFM: AFUA_4G07160
ACT: ACLA_046470
NFI: NFIA_109060
AOR: AO090023000859
ANG: An04g01570
AFV: AFLA_007211
ALUC: AKAW2_51188S(MTR4)
ACHE: ACHE_20617S(MTR4)
APUU: APUU_70612S(MTR4)
PCS: N7525_004515
PDP: PDIP_12850
POU: POX_f07771
TMF: EYB26_001171
TRG: TRUGW13939_03402
CIM: CIMG_04158
CPW: CPC735_002590
URE: UREG_05592
PBL: PAAG_07594
PBN: PADG_08293
ABE: ARB_01604
TVE: TRV_03549
AJE: HCAG_05592
BGH: BDBG_02637
PNO: SNOG_05249
PTE: PTT_10466
BZE: COCCADRAFT_6289
BSC: COCSADRAFT_178265
BOR: COCMIDRAFT_105310
AALT: CC77DRAFT_993628
ARAB: EKO05_0007177
ZTR: MYCGRDRAFT_111559
PFJ: MYCFIDRAFT_202861
FFU: CLAFUR5_13830
CBET: CB0940_04887
BCOM: BAUCODRAFT_147755
NPA: UCRNP2_9000
TML: GSTUM_00010488001
SPO: SPAC17H9.02 SPAC6F12.16c(mtr4)
SOM: SOMG_01907(mtr4) SOMG_02646(mtl1)
CNE: CND05090
CNB: CNBD1250
CNG: CNAG_01398
CGI: CGB_I1720C
CDEU: CNBG_5969
TMS: TREMEDRAFT_63092
TASA: A1Q1_07724
CCAC: CcaHIS019_0111700(MTR4)
TVS: TRAVEDRAFT_60006
DSQ: DICSQDRAFT_160409
PCO: PHACADRAFT_259600
SHS: STEHIDRAFT_62380
HIR: HETIRDRAFT_67679
PSQ: PUNSTDRAFT_54914
ADL: AURDEDRAFT_108144
FME: FOMMEDRAFT_138021
GTR: GLOTRDRAFT_65749
RSX: RhiXN_05893
LBC: LACBIDRAFT_255896
CCI: CC1G_09925
ABP: AGABI1DRAFT46451(AGABI1DRAFT_46451)
ABV: AGABI2DRAFT77358(AGABI2DRAFT_77358)
MRR: Moror_10465
MORE: E1B28_003825(MTR4_1) E1B28_006011(MTR4_2)
SCM: SCHCO_02484574(SCHCODRAFT_02484574)
CPUT: CONPUDRAFT_65143
SLA: SERLADRAFT_363717
WSE: WALSEDRAFT_70839
WIC: J056_003791
UMA: UMAG_11667
PFP: PFL1_01094
SGRA: EX895_004289
MGL: MGL_2627
MRT: MRET_0460
MSYM: MSY001_0212
PGR: PGTG_11325 PGTG_19883
PTRC: PtA15_13A18
PSTR: Pst134EA_024690
MLR: MELLADRAFT_111500
ECU: ECU04_0910
EIN: Eint_040860
EHE: EHEL_040820
ERO: EROM_040850
NCE: NCER_101250
MBR: MONBRDRAFT_35219
SRE: PTSG_02517
DDI: DDB_G0275633
DPP: DICPUDRAFT_53548
DFA: DFA_11873
EHI: EHI_134610(131.t00001)
EDI: EDI_338690
EIV: EIN_315510
ACAN: ACA1_204440
PFA: PF3D7_0602100
PFD: PFDG_02041
PFH: PFHG_05334
PREI: PRSY57_0600700
PGAB: PGSY75_0602100
PYO: PY17X_0102500
PCB: PCHAS_0101600
PBE: PBANKA_0100900
PVV: PVVCY_0100230
PKN: PKNH_1148600
PVX: PVX_113270
PCY: PCYB_115430
PMAL: PMUG01_11060700
PREL: PRELSG_1146200
TAN: TA13610
TPV: TP02_0517
TOT: TOT_020000507
BEQ: BEWA_022720
BBO: BBOV_II005660
BMIC: BMR1_01G03045
BBIG: BBBOND_0104620
CPV: cgd8_2520
CHO: Chro.80294
TGO: TGME49_213770
TET: TTHERM_00316180
PTM: GSPATT00016170001
SMIN: v1.2.001880.t1(symbB.v1.2.001880.t1)
PTI: PHATRDRAFT_50326
FCY: FRACYDRAFT_190861
TPS: THAPSDRAFT_34661
AAF: AURANDRAFT_268
PIF: PITG_09042
PSOJ: PHYSODRAFT_528925
SPAR: SPRG_14450
EHX: EMIHUDRAFT_50949 EMIHUDRAFT_72279 EMIHUDRAFT_73784
GTT: GUITHDRAFT_111376
TBR: Tb10.6k15.3220
TBG: TbgDal_X9120
LMA: LMJF_36_3000
LIF: LINJ_36_3150
LDO: LDBPK_363150
LMI: LMXM_36_3000
LBZ: LBRM_35_3220
LPAN: LPMP_353070
NGR: NAEGRDRAFT_81560
TVA: TVAG_2v0596890 TVAG_2v0995750 TVAG_2v1017600
GLA: GL50803_0017146
 » show all
Reference
PMID:15828860
  Authors
Vanacova S, Wolf J, Martin G, Blank D, Dettwiler S, Friedlein A, Langen H, Keith G, Keller W
  Title
A new yeast poly(A) polymerase complex involved in RNA quality control.
  Journal
PLoS Biol 3:e189 (2005)
DOI:10.1371/journal.pbio.0030189
  Sequence
[sce:YJL050W]
Reference
PMID:17412707
  Authors
Schilders G, van Dijk E, Pruijn GJ
  Title
C1D and hMtr4p associate with the human exosome subunit PM/Scl-100 and are involved in pre-rRNA processing.
  Journal
Nucleic Acids Res 35:2564-72 (2007)
DOI:10.1093/nar/gkm082
  Sequence
[hsa:23517]

  All links  
Ontology (8)   
   KEGG BRITE (6)   
   GO (1)   
   COG (1)   
Pathway (2)   
   KEGG PATHWAY (2)   
Chemical reaction (1)   
   KEGG ENZYME (1)   
Gene (9596)   
   KEGG GENES (1285)   
   KEGG MGENES (2294)   
   RefGene (6002)   
   OC (15)   
Literature (2)   
   PubMed (2)   
All databases (9609)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system