KEGG   ORTHOLOGY: K12812Help
Entry
K12812                      KO                                     

Name
UAP56, BAT1, SUB2
Definition
ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2 [EC:3.6.4.13]
Pathway
RNA transport
mRNA surveillance pathway
Spliceosome
Influenza A
Module
M00406  
TREX complex
M00430  
Exon junction complex (EJC)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Transcription
   03040 Spliceosome
    K12812  UAP56, BAT1, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
  Translation
   03013 RNA transport
    K12812  UAP56, BAT1, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
   03015 mRNA surveillance pathway
    K12812  UAP56, BAT1, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
 Human Diseases
  Infectious diseases
   05164 Influenza A
    K12812  UAP56, BAT1, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   RNA processing
    M00430  Exon junction complex (EJC)
     K12812  UAP56, BAT1, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
    M00406  TREX complex
     K12812  UAP56, BAT1, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.6  Acting on acid anhydrides
   3.6.4  Acting on acid anhydrides to facilitate cellular and subcellular movement
    3.6.4.13  RNA helicase
     K12812  UAP56, BAT1, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic Type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    EJC complex
     K12812  UAP56, BAT1, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex C
  Other components
   EJC/TREX
    K12812  UAP56, BAT1, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
 Other splicing related proteins
  Spliceosome associated proteins (SAPs)
   TREX complex
    K12812  UAP56, BAT1, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: 
Genes
HSA: 
7919(DDX39B)
PTR: 
463180(DDX39B)
PPS: 
100978005(DDX39B)
GGO: 
PON: 
100174561(DDX39B)
NLE: 
100583305(DDX39B)
MCC: 
715233(DDX39B)
MCF: 
CJC: 
100395064(DDX39B)
MMU: 
53817(Ddx39b)
RNO: 
114612(Ddx39b)
CGE: 
NGI: 
103724455(Ddx39b)
HGL: 
101719937(Ddx39b)
OCU: 
100349333(DDX39B)
TUP: 
102495885(DDX39B)
CFA: 
474839(DDX39B)
AML: 
UMR: 
103682342(DDX39B)
FCA: 
101083847(DDX39B)
PTG: 
102960336(DDX39B)
BTA: 
540191(DDX39B)
BOM: 
102276014(DDX39B)
PHD: 
102324521(DDX39B)
CHX: 
102188099(DDX39B)
OAS: 
101101929(DDX39B)
SSC: 
448813(DDX39B)
CFR: 
102505253(DDX39B)
BACU: 
103007450(DDX39B)
LVE: 
103084702(DDX39B)
ECB: 
100146384(DDX39B)
MYB: 
102249384(DDX39B)
MYD: 
102757850(DDX39B)
PALE: 
102888540(DDX39B)
MDO: 
100022951(DDX39B)
SHR: 
100921090(DDX39B)
OAA: 
PHI: 
CLV: 
ASN: 
AMJ: 
ACS: 
100553235(ddx39b)
PBI: 
XLA: 
447706(ddx39b)
XTR: 
394669(ddx39b)
DRE: 
393917(bat1)
MZE: 
LCM: 
102360471(DDX39B)
CMK: 
103189099(ddx39a)
BFO: 
CIN: 
100182155(bat1)
SPU: 
DME: 
Dmel_CG7269(Hel25E)
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
Dyak_GE18993(Dyak_Hel25E)
DGR: 
DMO: 
DVI: 
MDE: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
552515(GB13214)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CBR: 
CBG00694(Cbr-hel-1)
BMY: 
LOA: 
TSP: 
HRO: 
LGI: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
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CRB: 
BRP: 
CIC: 
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CAM: 
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MDM: 
PXB: 
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CMO: 
RCU: 
POP: 
POPTR_0006s26940g(POPTRDRAFT_819597)
VVI: 
OSA: 
DOSA: 
Os01t0549700-01(Os01g0549700) Os01t0550000-01(Os01g0550000)
OBR: 
BDI: 
ZMA: 
100273717(gpm624) 100283032 100384654(pco088497(644))
SITA: 
PDA: 
MUS: 
CRE: 
VCN: 
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BPG: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YDL084W(SUB2)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
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NDAI_0E01750(NDAI0E01750)
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TPHA_0G02050(TPHA0G02050) TPHA_0G02585(TPHA0G02585)
TBL: 
TBLA_0B08880(TBLA0B08880) TBLA_0B09205(TBLA0B09205)
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TDEL_0G03140(TDEL0G03140)
KAF: 
KAFR_0F02940(KAFR0F02940)
PPA: 
DHA: 
PIC: 
PGU: 
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CAL: 
CTP: 
COT: 
CDU: 
CTEN: 
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CLU: 
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NTE: 
NEUTE1DRAFT118432(NEUTE1DRAFT_118432)
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
CTHR: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
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MAJ: 
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VAL: 
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SSL: 
BFU: 
MBE: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_250094(AO090120000149)
ANG: 
ANI_1_978104(An12g08030)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
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TVE: 
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PNO: 
PTE: 
BZE: 
BSC: 
BOR: 
ZTR: 
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TML: 
SPO: 
CNE: 
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TMS: 
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SHS: 
HIR: 
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FME: 
GTR: 
LBC: 
MPR: 
MRR: 
CCI: 
SCM: 
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AGABI1DRAFT110279(AGABI1DRAFT_110279)
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CPUT: 
SLA: 
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PFP: 
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PGR: 
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WSE: 
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NCE: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
DFA_04265(uap56)
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EHI_036900(283.t00009) EHI_150160 EHI_151600(22.t00040)
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PFA: 
PFB0445c(UAP56)
PFH: 
PYO: 
PCB: 
PBE: 
PKN: 
PVX: 
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TAN: 
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BBOV_IV002750(21.m02887)
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CHO: 
TGO: 
TET: 
PTM: 
PTI: 
PHATRDRAFT_51301(helicase_5)
TPS: 
PIF: 
PSOJ: 
EHX: 
TBR: 
TCR: 
LMA: 
LIF: 
LDO: 
LMI: 
LBZ: 
NGR: 
TVA: 
GLA: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Luo ML, Zhou Z, Magni K, Christoforides C, Rappsilber J, Mann M, Reed R
  Title
Pre-mRNA splicing and mRNA export linked by direct interactions between UAP56 and Aly.
  Journal
Nature 413:644-7 (2001)
  Sequence
[hsa:7919]
Reference
  Authors
Boyne JR, Colgan KJ, Whitehouse A
  Title
Recruitment of the complete hTREX complex is required for Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus intronless mRNA nuclear export and virus replication.
  Journal
PLoS Pathog 4:e1000194 (2008)
  Sequence
[hsa:7919]

DBGET integrated database retrieval system