KEGG   ORTHOLOGY: K12878Help
Entry
K12878                      KO                                     

Name
THOC1
Definition
THO complex subunit 1
Pathway
ko03013  RNA transport
ko03040  Spliceosome
Module
M00405  THC complex
M00406  TREX complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Transcription
   03040 Spliceosome
    K12878  THOC1; THO complex subunit 1
  Translation
   03013 RNA transport
    K12878  THOC1; THO complex subunit 1
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   RNA processing
    M00405  THC complex
     K12878  THOC1; THO complex subunit 1
    M00406  TREX complex
     K12878  THOC1; THO complex subunit 1
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic Type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    TREX complex
     K12878  THOC1; THO complex subunit 1
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex C
  Other components
   EJC/TREX
    K12878  THOC1; THO complex subunit 1
 Other splicing related proteins
  Spliceosome associated proteins (SAPs)
   TREX complex
    K12878  THOC1; THO complex subunit 1
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 9984(THOC1)
PTR: 455324(THOC1)
PPS: 100975888(THOC1)
GGO: 101144825(THOC1)
PON: 100431839(THOC1)
NLE: 100580031(THOC1)
MCC: 697954(THOC1)
MCF: 101864817(THOC1)
CSAB: 103222672(THOC1)
RRO: 104655464(THOC1)
RBB: 108530563(THOC1)
CJC: 100393939(THOC1)
SBQ: 101052441(THOC1)
MMU: 225160(Thoc1)
RNO: 291797(Thoc1)
CGE: 100758451 100770844(Thoc1)
NGI: 103728975(Thoc1)
HGL: 101719619(Thoc1)
CCAN: 109689992(Thoc1)
OCU: 100350164(THOC1)
TUP: 102468042(THOC1)
CFA: 490529(THOC1)
AML: 100473279(THOC1)
UMR: 103662831(THOC1)
ORO: 101385430(THOC1)
FCA: 101094299(THOC1)
PTG: 102963057(THOC1)
AJU: 106970028(THOC1)
BTA: 100138748(THOC1)
BOM: 102284986(THOC1)
BIU: 109577785(THOC1)
PHD: 102337554(THOC1)
CHX: 102168224(THOC1)
OAS: 101121992(THOC1)
SSC: 100625217(THOC1)
CFR: 102509483(THOC1)
CDK: 105086241(THOC1)
BACU: 103004761(THOC1)
LVE: 103083639(THOC1)
OOR: 101279647(THOC1)
ECB: 100051155(THOC1)
EPZ: 103562847(THOC1)
EAI: 106845105(THOC1)
MYB: 102239888(THOC1) 102246100
MYD: 102756955(THOC1)
HAI: 109388823(THOC1)
RSS: 109452357(THOC1)
PALE: 102880532(THOC1)
LAV: 100658183(THOC1)
TMU: 101341542
MDO: 100013574(THOC1)
SHR: 100914787(THOC1)
OAA: 100077326(THOC1) 100092994
GGA: 421062(THOC1)
MGP: 100538518(THOC1)
CJO: 107310040(THOC1)
APLA: 101801491(THOC1)
ACYG: 106037593(THOC1)
TGU: 100220228(THOC1)
GFR: 102037359(THOC1)
FAB: 101805719(THOC1)
PHI: 102101441(THOC1)
PMAJ: 107199143(THOC1)
CCW: 104687307(THOC1)
FPG: 101916897(THOC1)
FCH: 102052799(THOC1)
CLV: 102097182(THOC1)
EGZ: 104134147(THOC1)
AAM: 106484722(THOC1)
ASN: 102377036(THOC1)
AMJ: 102559048(THOC1)
PSS: 102447403(THOC1)
CMY: 102938419(THOC1)
CPIC: 101948264(THOC1)
ACS: 100558864(thoc1)
PVT: 110079446(THOC1)
PBI: 103059838(THOC1)
GJA: 107120575(THOC1)
XLA: 398505(thoc1.L)
XTR: 733546(thoc1)
NPR: 108797183(THOC1)
DRE: 373077(thoc1)
IPU: 108267256(thoc1)
AMEX: 103041587(thoc1)
TRU: 101070705(thoc1)
LCO: 104917745(thoc1)
NCC: 104942422(thoc1)
MZE: 101477998(thoc1)
OLA: 101157731(thoc1)
XMA: 102235698(thoc1)
PRET: 103479723(thoc1)
NFU: 107383842(thoc1)
CSEM: 103396391(thoc1)
LCF: 108883338(thoc1)
HCQ: 109521248(thoc1)
BPEC: 110169988(thoc1)
ELS: 105019902(thoc1)
SFM: 108937477(thoc1)
LCM: 102347083(THOC1)
CMK: 103183445(thoc1)
CIN: 100179277
SPU: 589021
APLC: 110985710
SKO: 100367757
DME: Dmel_CG2031(Hpr1)
DSI: Dsimw501_GD19579(Dsim_GD19579)
MDE: 101897929
AAG: 5580204
AME: 409647
BIM: 100740929
BTER: 100649742
SOC: 105196856
AEC: 105152883
ACEP: 105627456
PBAR: 105430904
HST: 105186511
CFO: 105254396
LHU: 105674727
PGC: 109856299
NVI: 100123388(Hpr1)
TCA: 658815
DPA: 109536923
NVL: 108558138
BMOR: 101742757
PMAC: 106713738
PRAP: 111002124
PXY: 105398174
ZNE: 110829409
FCD: 110850730
TUT: 107363259
CEL: CELE_T02H6.2(thoc-1)
CBR: CBG24217(Cbr-thoc-1)
BMY: Bm1_42335
TSP: Tsp_12746
CRG: 105338779
MYI: 110461533
SHX: MS3_04886
EPA: 110252215
HMG: 100209197
AQU: 100637238
ATH: AT5G09860(THO1)
CRB: 17883277
BRP: 103850354
BOE: 106320174
THJ: 104826748
CPAP: 110814881
CIT: 102612813
TCC: 18587092
GRA: 105780200
DZI: 111296365
EGR: 104445651
GMX: 100781333
VRA: 106762555
VAR: 108333895
CCAJ: 109818744
CAM: 101513603
ADU: 107486759
AIP: 107630030
LJA: Lj0g3v0087829.1(Lj0g3v0087829.1)
LANG: 109334160
FVE: 101308506
PPER: 18771779
PMUM: 103339041
PAVI: 110772734
PXB: 103944397
CSV: 101216402
CMO: 103499294
MCHA: 111010121
CMAX: 111466514
CMOS: 111449893
CPEP: 111802273
RCU: 8283403
JCU: 105631259
HBR: 110666944
SLY: 101245499
SPEN: 107007975
SOT: 102589544
CANN: 107839361
NSY: 104222030
NTO: 104102721
INI: 109148474
SIND: 105168045
OEU: 111394830
HAN: 110922195
LSV: 111900437
DCR: 108228155
BVG: 104898822
SOE: 110774872
OSA: 4331353
DOSA: Os03t0110400-01(Os03g0110400)
OBR: 102706637
BDI: 100832078
ATS: 109787591(LOC109787591)
SBI: 8078017
ZMA: 100304252
SITA: 101786851
PDA: 103712979
EGU: 105053713
MUS: 103972960
AOF: 109825643
ATR: 18437658
PPP: 112278897
APRO: F751_6053
NCR: NCU07865
NTE: NEUTE1DRAFT80974(NEUTE1DRAFT_80974)
MGR: MGG_06394
MAW: MAC_08338
MAJ: MAA_03586
CMT: CCM_07411
MBE: MBM_03643
ANI: AN7013.2
ANG: ANI_1_1042124(An14g00510)
ABE: ARB_03584
TVE: TRV_00269
PTE: PTT_08697
CNE: CNG03370
CNB: CNBG1380
MGL: MGL_3467
DDI: DDB_G0275717(thoc1)
DFA: DFA_06354(thoc1)
NGD: NGA_2044900(THOC1)
SPAR: SPRG_04163
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Boyne JR, Colgan KJ, Whitehouse A
  Title
Recruitment of the complete hTREX complex is required for Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus intronless mRNA nuclear export and virus replication.
  Journal
PLoS Pathog 4:e1000194 (2008)
DOI:10.1371/journal.ppat.1000194
  Sequence
[hsa:9984]

DBGET integrated database retrieval system