KEGG   ORTHOLOGY: K12881Help
Entry
K12881                      KO                                     

Name
THOC4, ALY
Definition
THO complex subunit 4
Pathway
RNA transport
mRNA surveillance pathway
Spliceosome
Herpes simplex infection
Module
M00406  
TREX complex
M00430  
Exon junction complex (EJC)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Transcription
   03040 Spliceosome
    K12881  THOC4, ALY; THO complex subunit 4
  Translation
   03013 RNA transport
    K12881  THOC4, ALY; THO complex subunit 4
   03015 mRNA surveillance pathway
    K12881  THOC4, ALY; THO complex subunit 4
 Human Diseases
  Infectious diseases
   05168 Herpes simplex infection
    K12881  THOC4, ALY; THO complex subunit 4
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   RNA processing
    M00430  Exon junction complex (EJC)
     K12881  THOC4, ALY; THO complex subunit 4
    M00406  TREX complex
     K12881  THOC4, ALY; THO complex subunit 4
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex C
  Other components
   EJC/TREX
    K12881  THOC4, ALY; THO complex subunit 4
 Other splicing related proteins
  Spliceosome associated proteins (SAPs)
   TREX complex
    K12881  THOC4, ALY; THO complex subunit 4
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 
10189(ALYREF)
PTR: 
744649(THOC4)
PPS: 
100982290(ALYREF)
GGO: 
101140258(ALYREF)
PON: 
100450309(ALYREF)
NLE: 
100598331(ALYREF)
MCC: 
714852(THOC4) 723588
MCF: 
102137569(ALYREF)
CJC: 
MMU: 
100043292(Gm4340) 21681(Alyref) 56009(Alyref2)
RNO: 
690585(Alyref)
CGE: 
100756310(Alyref)
NGI: 
103730234(Alyref)
HGL: 
101714006(Alyref)
TUP: 
CFA: 
607948(THOC4)
AML: 
UMR: 
103666001(ALYREF)
FCA: 
101100167(ALYREF)
PTG: 
102953202(ALYREF)
BTA: 
537706(ALYREF)
BOM: 
102288412(ALYREF)
PHD: 
102345014(ALYREF)
CHX: 
102180256(ALYREF)
SSC: 
CFR: 
102507187(ALYREF)
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103018146(ALYREF)
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103077382(ALYREF)
MYB: 
MYD: 
PALE: 
102888897(ALYREF)
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100025556(ALYREF)
SHR: 
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769169(ALYREF)
MGP: 
APLA: 
101800025(ALYREF)
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100190053(ALYREF)
FAB: 
101820634(ALYREF)
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102105761(ALYREF)
FPG: 
101915709(ALYREF)
FCH: 
102053625(ALYREF)
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ASN: 
102383182(ALYREF)
AMJ: 
102562580(ALYREF)
PSS: 
102456370(ALYREF)
CMY: 
102932069(ALYREF)
ACS: 
100552907(alyref)
PBI: 
103064440(ALYREF)
XLA: 
444644(alyref-b) 734364(alyref)
XTR: 
549781(alyref)
DRE: 
560127(alyref)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102357835(ALYREF)
CMK: 
103175595(alyref)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
725396(GB18402)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CELE_C01F6.5(aly-1) CELE_C02B10.4(C02B10.4) CELE_F23B2.6(aly-2) CELE_M18.7(aly-3)
CBR: 
CBG06234(Cbr-aly-3) CBG19980 CBG21775(Cbr-aly-1) CBG21776
BMY: 
LOA: 
TSP: 
HRO: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
ALY: 
CRB: 
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CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
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PPER: 
PMUM: 
MDM: 
CSV: 
CMO: 
RCU: 
POP: 
POPTR_0001s24350g(POPTRDRAFT_815363) POPTR_0004s08540g(POPTRDRAFT_198513) POPTR_0008s05270g(POPTRDRAFT_563873) POPTR_0009s03370g(POPTRDRAFT_558100) POPTR_0010s21510g(POPTRDRAFT_814194) POPTR_0016s11470g POPTR_0017s02890g
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os03t0278300-01(Os03g0278300) Os06t0256200-01(Os06g0256200) Os07t0237100-00(Os07g0237100) Os08t0427900-01(Os08g0427900) Os11t0100200-00(Os11g0100200) Os12t0100100-01(Os12g0100100)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_01g039330(SORBIDRAFT_01g039330) SORBI_02g007020(SORBIDRAFT_02g007020) SORBI_07g020860(SORBIDRAFT_07g020860) SORBI_10g009240(SORBIDRAFT_10g009240)
ZMA: 
SITA: 
PDA: 
ATR: 
s00010p00163740(AMTR_s00010p00163740) s00012p00035940(AMTR_s00012p00035940)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OTA: 
BPG: 
MPP: 
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CME: 
CCP: 
SCE: 
YDR381W(YRA1)
AGO: 
KLA: 
LTH: 
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CGR: 
NCS: 
NCAS_0A11840(NCAS0A11840)
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NDAI_0A04440(NDAI0A04440)
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TPHA_0E01590(TPHA0E01590)
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TBLA_0A02650(TBLA0A02650) TBLA_0A06405(TBLA0A06405)
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TDEL_0A03220(TDEL0A03220)
KAF: 
KAFR_0E03720(KAFR0E03720)
PPA: 
DHA: 
PIC: 
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LEL: 
CAL: 
CTP: 
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CDU: 
CTEN: 
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SMP: 
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MTM: 
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MAW: 
MAJ: 
CMT: 
VAL: 
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BFU: 
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ANI: 
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AOR: 
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ANI_1_730124(An14g05300)
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ACT: 
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TML: 
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PPL: 
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SHS: 
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CCI: 
SCM: 
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AGABI1DRAFT115275(AGABI1DRAFT_115275) AGABI1DRAFT115306(AGABI1DRAFT_115306) AGABI1DRAFT115612(AGABI1DRAFT_115612)
ABV: 
AGABI2DRAFT194123(AGABI2DRAFT_194123) AGABI2DRAFT194237(AGABI2DRAFT_194237) AGABI2DRAFT194268(AGABI2DRAFT_194268)
CPUT: 
SLA: 
UMA: 
PFP: 
MGL: 
PGR: 
MLR: 
WSE: 
MBR: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
ACAN: 
TGO: 
PIF: 
GTT: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Luo ML, Zhou Z, Magni K, Christoforides C, Rappsilber J, Mann M, Reed R
  Title
Pre-mRNA splicing and mRNA export linked by direct interactions between UAP56 and Aly.
  Journal
Nature 413:644-7 (2001)
  Sequence
[hsa:10189]
Reference
  Authors
Boyne JR, Colgan KJ, Whitehouse A
  Title
Recruitment of the complete hTREX complex is required for Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus intronless mRNA nuclear export and virus replication.
  Journal
PLoS Pathog 4:e1000194 (2008)
  Sequence
[hsa:10189]

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