KEGG   ORTHOLOGY: K13126Help
Entry
K13126                      KO                                     

Name
PABPC
Definition
polyadenylate-binding protein
Pathway
RNA transport
mRNA surveillance pathway
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Translation
   03013 RNA transport
    K13126  PABPC; polyadenylate-binding protein
   03015 mRNA surveillance pathway
    K13126  PABPC; polyadenylate-binding protein
  Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K13126  PABPC; polyadenylate-binding protein
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex C
  Other components
   Complex C specific factors
    K13126  PABPC; polyadenylate-binding protein
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 
132430(PABPC4L) 140886(PABPC5) 26986(PABPC1) 340529(PABPC1L2A) 5042(PABPC3) 645974(PABPC1L2B) 80336(PABPC1L) 8761(PABPC4)
PTR: 
452494(PABPC3) 456782(PABPC4) 458273(PABPC1L) 465742(PABPC5) 471308(PABPC4L)
PPS: 
GGO: 
101124017(PABPC1L2B) 101125114 101128950(PABPC1L) 101142042 101146946(PABPC3) 101147266(PABPC4) 101153701(PABPC4L) 101154236(PABPC1)
PON: 
100173418(PABPC5) 100189758(PABPC1) 100437512 100438350(PABPC1L) 100440303(PABPC4L) 100441359 100444664(PABPC4)
MCC: 
696409(PABPC5) 705847(PABPC1) 705906 708443(PABPC1) 708617(PABPC3) 711882(PABPC1L) 716083(PABPC4)
MCF: 
101926560 102118081 102118596(PABPC1L2B) 102123209 102127139(PABPC4L) 102130609 102134259(PABPC4) 102136339(PABPC1L2A) 102144888(PABPC1L) 102146360(PABPC1)
MMU: 
18458(Pabpc1) 18459(Pabpc2) 230721(Pabpc4) 241989(Pabpc4l) 381404(Pabpc1l) 668382(Pabpc1l2b-ps) 67543(Pabpc6) 93728(Pabpc5)
RNO: 
171350(Pabpc1) 291615(Pabpc2) 292295(Pabpc6) 295010(Pabpc4l) 296351(Pabpc1l) 298510(Pabpc4) 302405(Pabpc1l2a) 688518(Pabpc5)
CGE: 
HGL: 
TUP: 
CFA: 
477238(PABPC1L) 482464(PABPC4) 483825(PABPC4L) 492002(PABPC5) 612751(PABPC1)
AML: 
FCA: 
101080709 101083238(PABPC1) 101089931(PABPC1L) 101095427(PABPC4) 101099028(PABPC5)
PTG: 
102949638(PABPC1) 102954151(PABPC1L) 102965854(PABPC4) 102967044(PABPC5) 102967816
BTA: 
101908085 282296(PABPC1) 509864(PABPC1L) 511286(PABPC5) 521086(PABPC1L2A) 534576(PABPC4) 784438(PABPC1L2A)
BOM: 
PHD: 
CHX: 
102168232(PABPC4) 102168992 102170808(PABPC4L) 102172146 102175779(PABPC1) 102183049(PABPC1L2B) 102184918(PABPC1L)
SSC: 
100151962(PABPC1L) 100153958(PABPC1) 100515840(PABPC4) 100518351(PABPC5) 100525442(PABPC1L2A) 100623240(PABPC1L2B) 100627820
CFR: 
ECB: 
100054235(PABPC4) 100056021(PABPC1) 100070836(PABPC1L) 100071641(PABPC4L) 100071995(PABPC5) 100146775(PABPC1L2B)
MYB: 
MYD: 
PALE: 
MDO: 
100025062(PABPC4) 100029897(PABPC1L)
SHR: 
OAA: 
100077488(PABPC1) 100085232(PABPC4)
GGA: 
419189(PABPC1L) 419674(PABPC4) 430997(PABPC1)
MGP: 
TGU: 
100220002 100223990(PABPC1) 100228528(PABPC4)
FAB: 
101812198(PABPC4) 101817790(PABPC1) 101821819
PHI: 
102099286(PABPC4) 102099821 102106843(PABPC1)
APLA: 
FPG: 
101910619(PABPC1) 101914511 101917475(PABPC4)
FCH: 
102055260 102059029(PABPC1) 102060056(PABPC4)
CLV: 
102084806(PABPC4) 102090631(PABPC1) 102097259
ASN: 
102373528 102380833(PABPC1) 102386577(PABPC4)
PSS: 
102453767 102459945(PABPC1) 102461623(PABPC4)
CMY: 
102930005 102943366(PABPC1) 102943661(PABPC4)
ACS: 
XLA: 
379896(pabpc1-a) 398221(pabpc1l-a) 432140(pabpc1-b) 443777(pabpc1l-b) 444284(pabpc4)
XTR: 
448595(pabpc1) 448615(pabpc1l)
DRE: 
321035(pabpc4) 327625(pabpc1l) 393856(pabpc1b) 606498(pabpc1a)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102349905(PABPC4) 102356429 102359475(PABPC1)
BFO: 
CIN: 
SPU: 
576206(pabp)
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
412602(GB11055)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
778529(Pabp)
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CBR: 
CBG02207(Cbr-pab-1) CBG07431(Cbr-pab-2)
BMY: 
LOA: 
TSP: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
TAD: 
AQU: 
ATH: 
AT1G22760(PAB3) AT1G34140(PAB1) AT1G49760(PAB8) AT1G71770(PAB5) AT2G23350(PAB4) AT2G36660(PAB7) AT3G16380(PAB6) AT3G52150 AT4G34110(PAB2)
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
CSV: 
RCU: 
POP: 
POPTR_0001s19230g(POPTRDRAFT_844144) POPTR_0001s31160g(POPTRDRAFT_815675) POPTR_0001s31870g(POPTRDRAFT_549854) POPTR_0002s06340g(POPTRDRAFT_816198) POPTR_0002s12570g(POPTRDRAFT_816470) POPTR_0005s22040g(POPTRDRAFT_1078863) POPTR_0009s07030g(POPTRDRAFT_1087747) POPTR_0009s10220g(POPTRDRAFT_557410) POPTR_0014s02550g
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os03t0278500-01(Os03g0278500) Os04t0504800-01(Os04g0504800) Os04t0682400-01(Os04g0682400) Os06t0589700-01(Os06g0589700) Os08t0314800-01(Os08g0314800) Os09t0115400-01(Os09g0115400)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_01g039310(SORBIDRAFT_01g039310) SORBI_06g021850(SORBIDRAFT_06g021850) SORBI_06g033290(SORBIDRAFT_06g033290) SORBI_10g022900(SORBIDRAFT_10g022900)
ZMA: 
SITA: 
ATR: 
s00002p00197820(AMTR_s00002p00197820) s00002p00257980(AMTR_s00002p00257980) s00051p00026490(AMTR_s00051p00026490) s00078p00149860(AMTR_s00078p00149860) s00100p00087410(AMTR_s00100p00087410)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
OTA: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
CME: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YER165W(PAB1)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
PPA: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0A03680(NCAS0A03680)
NDI: 
NDAI_0B04570(NDAI0B04570) NDAI_0C06100(NDAI0C06100)
TPF: 
TPHA_0B03420(TPHA0B03420)
TBL: 
TBLA_0F03780(TBLA0F03780)
TDL: 
TDEL_0A01350(TDEL0A01350)
KAF: 
KAFR_0B02500(KAFR0B02500)
DHA: 
PIC: 
PGU: 
LEL: 
CAL: 
CTP: 
CDU: 
COT: 
YLI: 
CLU: 
NCR: 
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
MGR: 
FGR: 
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TRE: 
VAL: 
SSL: 
BFU: 
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AFM: 
AOR: 
AOR_1_1646154(AO090003000927)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
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PBL: 
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SCM: 
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MGL: 
PGR: 
ECU: 
EIN: 
EHE: 
NCE: 
MBR: 
DDI: 
DDB_G0293558(pabpc1A)
DPP: 
DFA: 
DFA_03256(pabpc1B) DFA_07428(pabpc1A)
EHI: 
EHI_198750(34.t00052)
EDI: 
ACAN: 
PFA: 
PFD: 
PFH: 
PYO: 
PCB: 
PBE: 
PKN: 
PVX: 
PCY: 
TAN: 
TPV: 
BBO: 
BBOV_IV008280(23.m06515)
BEQ: 
CPV: 
CHO: 
TGO: 
PTM: 
PTI: 
TPS: 
PIF: 
EHX: 
GTT: 
TBR: 
TCR: 
LMA: 
LIF: 
LDO: 
LMI: 
LBZ: 
NGR: 
TVA: 
GLA: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Kuhn U, Wahle E
  Title
Structure and function of poly(A) binding proteins.
  Journal
Biochim Biophys Acta 1678:67-84 (2004)
Reference
  Authors
Gorgoni B, Gray NK
  Title
The roles of cytoplasmic poly(A)-binding proteins in regulating gene expression:  a developmental perspective.
  Journal
Brief Funct Genomic Proteomic 3:125-41 (2004)
Reference
  Authors
Kononenko AV, Mitkevich VA, Atkinson GC, Tenson T, Dubovaya VI, Frolova LY, Makarov AA, Hauryliuk V
  Title
GTP-dependent structural rearrangement of the eRF1:eRF3 complex and eRF3 sequence motifs essential for PABP binding.
  Journal
Nucleic Acids Res 38:548-58 (2010)

DBGET integrated database retrieval system