KEGG   ORTHOLOGY: K14326Help
Entry
K14326                      KO                                     

Name
UPF1, RENT1
Definition
regulator of nonsense transcripts 1 [EC:3.6.4.-]
Pathway
RNA transport
mRNA surveillance pathway
Module
M00430  
Exon junction complex (EJC)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Translation
   03013 RNA transport
    K14326  UPF1, RENT1; regulator of nonsense transcripts 1
   03015 mRNA surveillance pathway
    K14326  UPF1, RENT1; regulator of nonsense transcripts 1
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   RNA processing
    M00430  Exon junction complex (EJC)
     K14326  UPF1, RENT1; regulator of nonsense transcripts 1
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.6  Acting on acid anhydrides
   3.6.4  Acting on acid anhydrides to facilitate cellular and subcellular movement
    3.6.4.-  
     K14326  UPF1, RENT1; regulator of nonsense transcripts 1
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 
5976(UPF1)
PTR: 
456373(UPF1)
PPS: 
100967567(UPF1)
GGO: 
101152393(UPF1)
MCC: 
MCF: 
MMU: 
19704(Upf1)
RNO: 
684558(Upf1)
CGE: 
HGL: 
101704366(Upf1)
CFA: 
476664(UPF1)
FCA: 
101096043(UPF1)
PTG: 
102972099(UPF1)
BTA: 
532933(UPF1)
BOM: 
102270024(UPF1)
PHD: 
102337744(UPF1)
CHX: 
102189849(UPF1)
SSC: 
CFR: 
102511479(UPF1)
ECB: 
100071059(UPF1)
MYB: 
102256312(UPF1)
MYD: 
102760523(UPF1)
PALE: 
102884453(UPF1)
MDO: 
100012828(UPF1)
SHR: 
100929203(UPF1)
OAA: 
100078364(UPF1)
GGA: 
420119(UPF1)
MGP: 
TGU: 
FAB: 
101809945(UPF1)
PHI: 
102107506(UPF1)
APLA: 
101804967(UPF1)
FPG: 
101923816(UPF1)
FCH: 
102058336(UPF1)
CLV: 
102095827(UPF1)
ASN: 
102384608(UPF1)
PSS: 
102450038(UPF1)
CMY: 
102939480(UPF1)
XLA: 
XTR: 
100135270(upf1)
DRE: 
406783(upf1)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
CIN: 
100181729(upf1)
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
409839(Upf1)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CBR: 
BMY: 
LOA: 
TSP: 
SMM: 
HMG: 
100203524(upf1)
TAD: 
AQU: 
ATH: 
AT5G47010(LBA1)
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
CSV: 
RCU: 
POP: 
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os07t0495900-01(Os07g0495900)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_02g033940(SORBIDRAFT_02g033940)
SITA: 
ATR: 
s00071p00142490(AMTR_s00071p00142490)
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
OTA: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YMR080C(NAM7)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
PPA: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0A07730(NCAS0A07730)
NDI: 
NDAI_0H02120(NDAI0H02120)
TPF: 
TPHA_0C03950(TPHA0C03950)
TBL: 
TBLA_0B05540(TBLA0B05540)
TDL: 
TDEL_0A02660(TDEL0A02660)
KAF: 
KAFR_0A01950(KAFR0A01950)
DHA: 
PGU: 
LEL: 
CAL: 
CaO19.8554(NAM7) CaO19.939(NAM7)
CTP: 
CDU: 
COT: 
YLI: 
CLU: 
NCR: 
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
MGR: 
FGR: 
NHE: 
TRE: 
VAL: 
SSL: 
BFU: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_1018194(AO090012000584)
ANG: 
ANI_1_848074(An08g06050)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
CPW: 
PBL: 
URE: 
ABE: 
TVE: 
AJE: 
PNO: 
PTE: 
ZTR: 
TML: 
SPO: 
CNE: 
CNB: 
CGI: 
LBC: 
MPR: 
CCI: 
UMA: 
MGL: 
PGR: 
ECU: 
EIN: 
EHE: 
NCE: 
MBR: 
DDI: 
DPP: 
DFA: 
EHI: 
EHI_035550(17.t00041)
EDI: 
ACAN: 
PFA: 
PFD: 
PFH: 
PYO: 
PCB: 
PBE: 
PKN: 
PVX: 
PCY: 
TGO: 
TET: 
PTM: 
PTI: 
PIF: 
EHX: 
GTT: 
TBR: 
Tb927.5.2140(Tb05.3C6.50)
TCR: 
TVA: 
GLA: 
EFD: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Kashima I, Yamashita A, Izumi N, Kataoka N, Morishita R, Hoshino S, Ohno M, Dreyfuss G, Ohno S
  Title
Binding of a novel SMG-1-Upf1-eRF1-eRF3 complex (SURF) to the exon junction complex triggers Upf1 phosphorylation and nonsense-mediated mRNA decay.
  Journal
Genes Dev 20:355-67 (2006)
Reference
  Authors
Chamieh H, Ballut L, Bonneau F, Le Hir H
  Title
NMD factors UPF2 and UPF3 bridge UPF1 to the exon junction complex and stimulate  its RNA helicase activity.
  Journal
Nat Struct Mol Biol 15:85-93 (2008)

DBGET integrated database retrieval system