KEGG   ORTHOLOGY: K14327Help
Entry
K14327                      KO                                     

Name
UPF2, RENT2
Definition
regulator of nonsense transcripts 2
Pathway
RNA transport
mRNA surveillance pathway
Module
M00430  
Exon junction complex (EJC)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Translation
   03013 RNA transport
    K14327  UPF2, RENT2; regulator of nonsense transcripts 2
   03015 mRNA surveillance pathway
    K14327  UPF2, RENT2; regulator of nonsense transcripts 2
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   RNA processing
    M00430  Exon junction complex (EJC)
     K14327  UPF2, RENT2; regulator of nonsense transcripts 2
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 
26019(UPF2)
PTR: 
450304(UPF2)
PPS: 
100978757(UPF2)
PON: 
MCC: 
693842(UPF2)
MCF: 
102116951(UPF2)
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326622(Upf2)
RNO: 
361271(Upf2)
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100771546(Upf2)
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101707612(Upf2)
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102483349(UPF2)
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487130(UPF2)
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100482868(UPF2)
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102949990(UPF2)
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781181(UPF2)
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102283316(UPF2)
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102332997(UPF2)
CHX: 
102173398(UPF2)
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102504956(UPF2)
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103016542(UPF2)
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103069173(UPF2)
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100069342(UPF2)
MYB: 
102255117(UPF2)
MYD: 
PALE: 
102894458(UPF2)
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100013371(UPF2)
SHR: 
100930896(UPF2)
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100084994(UPF2)
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419100(UPF2)
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100218189(UPF2) 100231950(UPF2)
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101811115(UPF2)
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102101409(UPF2)
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101798229(UPF2)
FPG: 
101914352(UPF2)
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102084676(UPF2)
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102373885(UPF2)
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102941313(UPF2)
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734721(upf2)
XTR: 
100158573(upf2)
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569006(upf2)
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XMA: 
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102358754(UPF2)
CMK: 
103187917(upf2)
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CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
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DSE: 
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DGR: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
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413146(Upf2)
NVI: 
TCA: 
BMOR: 
API: 
100168119(UPF2)
PHU: 
ISC: 
CEL: 
CBR: 
CBG05463(Cbr-smg-3)
BMY: 
LOA: 
TSP: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
100197170(upf2)
TAD: 
AQU: 
ATH: 
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CRB: 
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CIT: 
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TCC: 
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101214324(UPF2)
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POP: 
POPTR_0008s04510g(POPTRDRAFT_421447) POPTR_0010s22310g(POPTRDRAFT_886092)
VVI: 
SLY: 
101253276(UPF2)
SOT: 
DOSA: 
Os02t0631500-00(Os02g0631500) Os02t0631601-00(Os02g0631601)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_04g026740(SORBIDRAFT_04g026740)
SITA: 
ATR: 
s00041p00123630(AMTR_s00041p00123630)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
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OTA: 
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MIS: 
MPP: 
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GSL: 
CCP: 
SCE: 
YHR077C(NMD2)
AGO: 
ERC: 
KLA: 
LTH: 
PPA: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0H01720(NCAS0H01720)
NDI: 
NDAI_0C01910(NDAI0C01910)
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TPHA_0D02130(TPHA0D02130)
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TBLA_0A03200(TBLA0A03200)
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TDEL_0E02650(TDEL0E02650)
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KAFR_0D04740(KAFR0D04740)
DHA: 
PIC: 
PGU: 
SPAA: 
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CAL: 
CaO19.8483(NMD2) CaO19.864(NMD2)
CTP: 
COT: 
CDU: 
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NCR: 
SMP: 
PAN: 
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AOR_1_710174(AO090005000406)
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ANI_1_332064(An07g02760)
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PGR: 
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DFA_03176(upf2)
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EHI_068520(61.t00032)
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TPS: 
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EHX: 
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TCR: 
NGR: 
TVA: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Chamieh H, Ballut L, Bonneau F, Le Hir H
  Title
NMD factors UPF2 and UPF3 bridge UPF1 to the exon junction complex and stimulate  its RNA helicase activity.
  Journal
Nat Struct Mol Biol 15:85-93 (2008)
  Sequence
[hsa:26019]

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