KEGG   ORTHOLOGY: K14327Help
Entry
K14327                      KO                                     

Name
UPF2, RENT2
Definition
regulator of nonsense transcripts 2
Pathway
ko03013  RNA transport
ko03015  mRNA surveillance pathway
Module
M00430  Exon junction complex (EJC)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Translation
   03013 RNA transport
    K14327  UPF2, RENT2; regulator of nonsense transcripts 2
   03015 mRNA surveillance pathway
    K14327  UPF2, RENT2; regulator of nonsense transcripts 2
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   RNA processing
    M00430  Exon junction complex (EJC)
     K14327  UPF2, RENT2; regulator of nonsense transcripts 2
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic Type
  mRNA surveillance and transport factors
   Surveillance factors
    Surveillance complex
     K14327  UPF2, RENT2; regulator of nonsense transcripts 2
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     K14327  UPF2, RENT2; regulator of nonsense transcripts 2
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 26019(UPF2)
PTR: 450304(UPF2)
PPS: 100978757(UPF2)
GGO: 101149893(UPF2)
PON: 100457608(UPF2)
NLE: 100590240(UPF2)
MCC: 693842(UPF2)
MCF: 102116951(UPF2)
CSAB: 103237890(UPF2)
RRO: 104664888(UPF2)
RBB: 108538537(UPF2)
CJC: 100394499(UPF2)
SBQ: 101035159(UPF2)
MMU: 326622(Upf2)
RNO: 361271(Upf2)
CGE: 100771546(Upf2)
NGI: 103731307
HGL: 101707612(Upf2)
CCAN: 109694903(Upf2)
OCU: 100354055(UPF2)
TUP: 102483349(UPF2)
CFA: 487130(UPF2)
AML: 100482868(UPF2)
UMR: 103676269(UPF2)
ORO: 101365022(UPF2)
FCA: 101085899(UPF2)
PTG: 102949990(UPF2)
AJU: 106971037(UPF2)
BTA: 781181(UPF2)
BOM: 102283316(UPF2)
BIU: 109567876(UPF2)
PHD: 102332997(UPF2)
CHX: 102173398(UPF2)
OAS: 101116751(UPF2)
SSC: 100621126(UPF2)
CFR: 102504956(UPF2)
BACU: 103016542(UPF2)
LVE: 103069173(UPF2)
OOR: 101270644(UPF2)
ECB: 100069342(UPF2)
EPZ: 103543551 103563935(UPF2)
EAI: 106836522(UPF2)
MYB: 102255117(UPF2)
MYD: 102758860 102773877(UPF2)
HAI: 109390478(UPF2)
RSS: 109433772(UPF2)
PALE: 102894458(UPF2)
LAV: 100653556(UPF2)
TMU: 101351600
MDO: 100013371(UPF2)
SHR: 100930896(UPF2)
OAA: 100084994(UPF2)
GGA: 419100(UPF2)
MGP: 100538610(UPF2)
CJO: 107317075(UPF2)
APLA: 101798229(UPF2)
ACYG: 106046208(UPF2)
TGU: 100218189(UPF2) 100231950
GFR: 102042418(UPF2)
FAB: 101811115(UPF2)
PHI: 102101409(UPF2)
PMAJ: 107204365(UPF2)
CCW: 104694506(UPF2)
FPG: 101914352(UPF2)
FCH: 102046367(UPF2)
CLV: 102084676(UPF2)
EGZ: 104135773(UPF2)
AAM: 106485396(UPF2)
ASN: 102373885(UPF2)
AMJ: 102558003(UPF2)
PSS: 102460014(UPF2)
CMY: 102941313(UPF2)
CPIC: 101942768(UPF2)
ACS: 100567412(upf2)
PVT: 110081225(UPF2)
PBI: 103065354(UPF2) 103065758
GJA: 107111124(UPF2)
XLA: 108711221(upf2.L) 734721(upf2.S)
XTR: 100158573(upf2)
NPR: 108784819(UPF2)
DRE: 569006(upf2)
SRX: 107707109 107707983(upf2)
SANH: 107658991(upf2) 107662208
SGH: 107561226(upf2) 107568704
CCAR: 109091224
IPU: 108275048(upf2)
AMEX: 103037867(upf2)
TRU: 101067492(upf2)
LCO: 104927099(upf2)
MZE: 101464657(upf2)
OLA: 101175361(upf2)
XMA: 102229634(upf2)
PRET: 103459091(upf2)
NFU: 107386997(upf2)
CSEM: 103382449(upf2)
LCF: 108895880(upf2)
HCQ: 109532617(upf2)
BPEC: 110161872(upf2)
ELS: 105020176(upf2)
SFM: 108931527(upf2)
LCM: 102358754(UPF2)
CMK: 103187917(upf2)
CIN: 100175747
SPU: 755564
APLC: 110983656
SKO: 100368739
DME: Dmel_CG2253(Upf2)
DSI: Dsimw501_GD16133(Dsim_GD16133)
MDE: 101887325
AAG: 5573561
AME: 413146(Upf2)
BIM: 100748969
BTER: 100647091
SOC: 105197809
AEC: 105152415
ACEP: 105626457
PBAR: 105431472
HST: 105186662
CFO: 105257366
LHU: 105668860
PGC: 109863996
NVI: 100119197
TCA: 658027
DPA: 109544785
NVL: 108563710
BMOR: 101741929
PMAC: 106713836
PRAP: 111001579
PXY: 105393769
API: 100168119(UPF2)
DNX: 107173260
ZNE: 110828216
FCD: 110863420
CEL: CELE_Y73B6BL.18(smg-3)
CBR: CBG05463(Cbr-smg-3)
BMY: Bm1_38785
TSP: Tsp_03193
CRG: 105344597
MYI: 110442124
OBI: 106869790
LAK: 106154323
SHX: MS3_10102
EPA: 110236772
ADF: 107354321
HMG: 100197170(upf2)
AQU: 105313701
ATH: AT2G39260
CRB: 17888114
BRP: 103857854
BOE: 106335178
THJ: 104809987
CPAP: 110824017
CIT: 102617412
TCC: 18586320
GRA: 105772934
EGR: 104454177
VRA: 106762070
VAR: 108322636
CCAJ: 109815524
CAM: 101507130
ADU: 107479500
AIP: 107630559
LJA: Lj0g3v0146979.1(Lj0g3v0146979.1) Lj6g3v1094850.1(Lj6g3v1094850.1)
FVE: 101296765
PPER: 18787405
PMUM: 103332422
PAVI: 110761066
PXB: 103966663
ZJU: 107413612
CSV: 101214324(UPF2)
CMO: 103501680
MCHA: 111006232
RCU: 8281969
JCU: 105635232
HBR: 110641284
JRE: 108997084
VVI: 100258101
SLY: 101253276(UPF2)
SPEN: 107017729
SOT: 102580674
CANN: 107847405
NSY: 104227740
NTO: 104096645
INI: 109192533
SIND: 105165822
LSV: 111888292
DCR: 108199391
BVG: 104906630
SOE: 110797541
NNU: 104594732
DOSA: Os02t0631500-00(Os02g0631500) Os02t0631601-00(Os02g0631601)
OBR: 102721707
ATS: 109766485(LOC109766485) 109780045(LOC109780045)
SBI: 8074783
ZMA: 103627442
MUS: 103992360
DCT: 110100855
AOF: 109844463
ATR: 18441596
PPP: 112288757
SCE: YHR077C(NMD2)
ERC: Ecym_8169
KMX: KLMA_50353(NMD2)
NCS: NCAS_0H01720(NCAS0H01720)
NDI: NDAI_0C01910(NDAI0C01910)
TPF: TPHA_0D02130(TPHA0D02130)
TBL: TBLA_0A03200(TBLA0A03200)
TDL: TDEL_0E02650(TDEL0E02650)
KAF: KAFR_0D04740(KAFR0D04740)
PIC: PICST_81669(NMD2)
CAL: CAALFM_C203550CA(CaO19.864)
CAUR: QG37_04713
SLB: AWJ20_2746(NMD2)
NCR: NCU05267
NTE: NEUTE1DRAFT129153(NEUTE1DRAFT_129153)
MGR: MGG_06063
MAW: MAC_08625
MAJ: MAA_01098
CMT: CCM_02952
MBE: MBM_01743
ANI: AN6695.2
ANG: ANI_1_332064(An07g02760)
PBL: PAAG_11065(PAAG_00179)
ABE: ARB_04754
TVE: TRV_03454
PTE: PTT_02291
SPO: SPAC19A8.08(upf2)
CNE: CNF01510
CNB: CNBF3200
ABP: AGABI1DRAFT119574(AGABI1DRAFT_119574)
ABV: AGABI2DRAFT118092(AGABI2DRAFT_118092)
MGL: MGL_3993
DFA: DFA_03176(upf2)
EHI: EHI_068520(61.t00032)
PYO: PY17X_0829900(PY03876)
PCB: PCHAS_082690(PC000932.02.0)
SMIN: v1.2.017466.t1(symbB.v1.2.017466.t1) v1.2.017466.t2(symbB.v1.2.017466.t2)
NGD: NGA_0364100(UPF2)
SPAR: SPRG_08789
TCR: 506297.40
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Chamieh H, Ballut L, Bonneau F, Le Hir H
  Title
NMD factors UPF2 and UPF3 bridge UPF1 to the exon junction complex and stimulate its RNA helicase activity.
  Journal
Nat Struct Mol Biol 15:85-93 (2008)
DOI:10.1038/nsmb1330
  Sequence
[hsa:26019]

DBGET integrated database retrieval system