KEGG   ORTHOLOGY: K14328Help
Entry
K14328                      KO                                     

Name
UPF3, RENT3
Definition
regulator of nonsense transcripts 3
Pathway
RNA transport
mRNA surveillance pathway
Module
M00430  
Exon junction complex (EJC)
Disease
H00658  
Syndromic X-linked mental retardation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 Genetic Information Processing
  Translation
   03013 RNA transport
    K14328  UPF3, RENT3; regulator of nonsense transcripts 3
   03015 mRNA surveillance pathway
    K14328  UPF3, RENT3; regulator of nonsense transcripts 3
KEGG modules [BR:ko00002]
 Structural complex
  Genetic information processing
   RNA processing
    M00430  Exon junction complex (EJC)
     K14328  UPF3, RENT3; regulator of nonsense transcripts 3
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 
65109(UPF3B) 65110(UPF3A)
PTR: 
452689(UPF3A) 465954(UPF3B) 750926
PPS: 
100982672(UPF3B) 100989122(UPF3A)
GGO: 
101143632(UPF3B) 101145894(UPF3A)
PON: 
100434953(UPF3A) 100435868(UPF3B)
MCC: 
694247(UPF3B) 716601
MCF: 
MMU: 
67031(Upf3a) 68134(Upf3b)
RNO: 
313449(Upf3b) 361176(Upf3a)
CGE: 
100767364(Upf3b)
HGL: 
101700790(Upf3b) 101724600(Upf3a)
TUP: 
102485827(UPF3A) 102492717(UPF3B)
CFA: 
481031(UPF3B) 607836(UPF3A)
AML: 
FCA: 
101084940(UPF3B) 101099267(UPF3A)
PTG: 
102966594(UPF3B) 102969703(UPF3A)
BTA: 
529442(UPF3A) 616181(UPF3B)
BOM: 
102278751(UPF3B) 102286064(UPF3A)
PHD: 
102320043(UPF3A) 102333889(UPF3B)
CHX: 
SSC: 
CFR: 
102504055(UPF3A) 102512452(UPF3B)
BACU: 
102998145(UPF3A) 103000082(UPF3B)
LVE: 
103075114(UPF3A) 103075430(UPF3B)
ECB: 
100058559(UPF3B) 100069294(UPF3A)
MYB: 
102252944(UPF3B) 102260941(UPF3A)
MYD: 
102754778(UPF3B) 102765531(UPF3A)
PALE: 
102879573(UPF3A) 102892473(UPF3B)
MDO: 
100019877(UPF3B) 100020995(UPF3A)
SHR: 
100913987(UPF3B) 100918373(UPF3A)
OAA: 
100074759(UPF3A) 100078880(UPF3B)
GGA: 
100858231(UPF3B) 418734(UPF3A)
MGP: 
TGU: 
100221665(UPF3B) 100224732(UPF3A)
FAB: 
101812999(UPF3A) 101815266(UPF3B)
PHI: 
102110745(UPF3A) 102112072(UPF3B)
APLA: 
101790864(UPF3B)
FPG: 
101912521(UPF3B) 101924369(UPF3A)
FCH: 
102050966(UPF3A) 102053277(UPF3B)
CLV: 
102089034(UPF3A) 102091006(UPF3B)
ASN: 
102376629(UPF3B) 102377674(UPF3A)
AMJ: 
102564547(UPF3B) 102569632(UPF3A)
PSS: 
102445866(UPF3B) 102458964(UPF3A)
CMY: 
102937721(UPF3B) 102944085(UPF3A)
ACS: 
PBI: 
103054075(UPF3A) 103055549(UPF3B)
XTR: 
100145010(upf3b) 100492664(upf3a)
DRE: 
393929(upf3b) 566608(upf3a)
TRU: 
MZE: 
OLA: 
XMA: 
LCM: 
102346438(UPF3A) 102366445(UPF3B)
CMK: 
BFO: 
CIN: 
SPU: 
DME: 
DPO: 
DAN: 
DER: 
DPE: 
DSE: 
DSI: 
DWI: 
DYA: 
DGR: 
DMO: 
DVI: 
AGA: 
AAG: 
CQU: 
AME: 
552225(Upf3)
TCA: 
BMOR: 
API: 
PHU: 
ISC: 
CEL: 
BMY: 
LOA: 
SMM: 
NVE: 
HMG: 
ATH: 
AT1G33980(UPF3)
ALY: 
CRB: 
EUS: 
CIT: 
CIC: 
TCC: 
GMX: 
PVU: 
MTR: 
CAM: 
FVE: 
PPER: 
CSV: 
RCU: 
POP: 
VVI: 
SLY: 
SOT: 
OSA: 
DOSA: 
Os04t0440100-01(Os04g0440100)
OBR: 
BDI: 
SBI: 
SORBI_06g017380(SORBIDRAFT_06g017380)
SITA: 
ATR: 
s00071p00188270(AMTR_s00071p00188270)
SMO: 
PPP: 
CRE: 
VCN: 
OLU: 
OTA: 
MIS: 
MPP: 
CSL: 
CVR: 
GSL: 
CCP: 
SCE: 
YGR072W(UPF3)
AGO: 
KLA: 
LTH: 
PPA: 
VPO: 
ZRO: 
CGR: 
NCS: 
NCAS_0B05240(NCAS0B05240)
NDI: 
NDAI_0B02610(NDAI0B02610)
TPF: 
TPHA_0M00500(TPHA0M00500)
TBL: 
TBLA_0F01000(TBLA0F01000)
TDL: 
TDEL_0D04830(TDEL0D04830)
KAF: 
KAFR_0C01160(KAFR0C01160)
DHA: 
PIC: 
PGU: 
LEL: 
SPAA: 
CAL: 
CDU: 
COT: 
CLU: 
NCR: 
SMP: 
PAN: 
TTT: 
MTM: 
CTHR: 
MGR: 
TMN: 
FGR: 
NHE: 
TRE: 
MAW: 
MAJ: 
CMT: 
VAL: 
ELA: 
SSL: 
BFU: 
MBE: 
ANI: 
AFM: 
AOR: 
AOR_1_736144(AO090023000434)
ANG: 
ANI_1_3126014(An01g11820)
AFV: 
ACT: 
NFI: 
PCS: 
CIM: 
CPW: 
PBL: 
URE: 
ABE: 
TVE: 
AJE: 
PNO: 
PTE: 
BZE: 
ZTR: 
PFJ: 
BCOM: 
TML: 
SPO: 
CNB: 
CGI: 
PPL: 
LBC: 
MPR: 
CCI: 
SCM: 
UMA: 
MGL: 
PGR: 
MBR: 
DPP: 
TGO: 
PIF: 
GTT: 
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Chamieh H, Ballut L, Bonneau F, Le Hir H
  Title
NMD factors UPF2 and UPF3 bridge UPF1 to the exon junction complex and stimulate  its RNA helicase activity.
  Journal
Nat Struct Mol Biol 15:85-93 (2008)
Reference
  Authors
Chan WK, Bhalla AD, Le Hir H, Nguyen LS, Huang L, Gecz J, Wilkinson MF
  Title
A UPF3-mediated regulatory switch that maintains RNA surveillance.
  Journal
Nat Struct Mol Biol 16:747-53 (2009)

DBGET integrated database retrieval system