KEGG   Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343: MCAP_0336
Entry
MCAP_0336         CDS       T00309                                 
Name
(GenBank) transcription elongation protein nusA, putative
  KO
K02600  transcription termination/antitermination protein NusA
Organism
mcp  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mcp00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:mcp03021]
    MCAP_0336
   03009 Ribosome biogenesis [BR:mcp03009]
    MCAP_0336
Transcription machinery [BR:mcp03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   Other transcription-related factors
    RNA polymerase-associated proteins
     MCAP_0336
Ribosome biogenesis [BR:mcp03009]
 Prokaryotic type
  rRNA transcription factors
   MCAP_0336
SSDB
Motif
Pfam: NusA_N KH_5 KH_1 KH_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABC01459
UniProt: Q2SSE3
Position
complement(399479..401155)
AA seq 558 aa
MLNGTELLESIKLIEKEKGISKESIINGLKEGLQKAYERFYDTDAIIKIDINEKTGSITM
HQELKVVEELDDDWLEITLQKAKLQNPNAQIGDIIYKPIEFSEEFSRMVVNQVRQIFQQK
IREAERARIYEQFISLEGEVVQAKVVGMNRENNYVLDINGTTAYLWKNKTINNEIFQINE
IIDVYIEVVEKESKLSQIAISRTAPAFLTKLIEREVPEVRMGIVEIKGVSREPGKRSKVA
VVTHNQNVEPIGAIIGVGGNRINRISDILKGEKIDVIRWSDDQITYLINAMTPVKVISIN
KIGDEYDIVVPDSQLSLAIGKQGITAKLIASLLKNKINIFSYSIALKENMDILWNGDTTK
QEVETNSYIPKTKISKKEEKIVNTIIKKPIKKKEENIIDVDALIAFQAEVEQEQDAKIYE
EINQELADDKVQPDSDKVKAIVNVIKNSDDEITKVEIKTDDTAVNITTNNNVVTNDKLVN
DEIKTETKPNLTKIEVSKPNFKKQKHKEELNIDFNLENEPDIDEIDANLKAFNDAILKQE
DEEDIDIDSLDDYDKYYD
NT seq 1677 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgctaaacggaacagaactattagaatcaattaaattaatagaaaaagaaaagggaatt
agtaaagaaagtattataaatggtcttaaagaaggactacaaaaagcttatgaaagattt
tatgatactgatgcaattattaaaattgatattaatgaaaaaacaggatcaattactatg
catcaagaactaaaagtagttgaagaacttgatgatgattgattagaaatcactttacaa
aaagcaaaattgcaaaacccaaatgctcaaattggagatatcatttataaaccaattgaa
tttagcgaagaattttcaagaatggtagttaaccaagtaagacaaatttttcaacaaaaa
attagagaagctgaaagagctagaatttatgaacaatttataagtttagaaggtgaagtt
gttcaagctaaagtagttggaatgaatagagaaaataattatgttctagatattaatgga
acaactgcttatttgtgaaaaaataaaactattaataatgaaatttttcaaataaatgaa
attattgatgtttatattgaagttgttgaaaaagaaagtaaattatcacaaattgctatt
tcaagaactgctcctgcttttttaacaaaactaattgaaagagaagttccagaagtaaga
atgggaattgttgaaattaaaggtgtaagtcgtgaacccggaaaacgttcaaaagttgct
gtagttactcataatcaaaatgttgaaccaattggagctattattggagttggtggtaat
agaattaatagaattagtgatattctaaaaggtgaaaaaattgatgttattagatgaagt
gatgatcaaataacttatttaattaatgcaatgactcctgttaaagtaatttcaattaat
aaaattggtgatgaatatgacattgttgttcctgattctcaactatcattagctattgga
aaacaaggaataactgctaaactaattgctagcttattaaaaaataaaattaatattttt
tcttattcaattgctttaaaagaaaatatggatattttatgaaatggtgatactacaaaa
caagaagttgaaactaattcatacattcctaaaactaaaatatctaaaaaagaagaaaaa
atagttaatactattattaaaaaacctataaagaaaaaagaagaaaacattattgatgtt
gatgcattaatagcctttcaagccgaagttgaacaagaacaagatgcaaaaatttatgaa
gaaattaatcaagaacttgctgatgataaagttcaaccagatagtgataaagttaaagca
atagttaatgttattaaaaatagtgatgatgaaatcactaaagttgaaattaaaacagat
gatacagctgttaatatcacaactaataacaatgttgttacaaatgataaattagtaaat
gatgaaattaaaacagaaactaaaccaaatctaactaaaatcgaagtatcaaaacctaat
tttaaaaaacaaaaacataaagaagaattaaatattgattttaatttagaaaatgaacca
gatattgatgaaattgatgcaaatttaaaagcatttaatgatgcgattttaaaacaagaa
gatgaagaagatattgatattgattcattagatgattatgacaaatactatgattaa

  All links  
Ontology (3)   
   KEGG BRITE (3)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (3)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   UniProt (1)   
Protein domain (4)   
   Pfam (4)   
All databases (12)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system