KEGG   Mycoplasma mobile: MMOB2820
Entry
MMOB2820          CDS       T00176                                 
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase beta' chain
  KO
K03046  DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:2.7.7.6]
Organism
mmo  Mycoplasma mobile
Pathway
mmo03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mmo00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    MMOB2820 (rpoC)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:mmo03021]
    MMOB2820 (rpoC)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mmo03400]
    MMOB2820 (rpoC)
Enzymes [BR:mmo01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     MMOB2820 (rpoC)
Transcription machinery [BR:mmo03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Core subunits
     MMOB2820 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:mmo03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
      MMOB2820 (rpoC)
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb1_4 Apocytochr_F_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: AAT27768
UniProt: Q6KI08
Position
340636..344910
AA seq 1424 aa
MNKILKGDNQNWAEYEIDSISLALATDEDVLNWSNGEVTKPETVNYKTYKPEKHGLFDEL
IFGPTTDYKCPICGKKYKISNEGSTCGNTEECKREKPEILPKISRRSRMGHIRLHAPIVH
FWFFKVDNSIISKLLGLKSENSNKYYSKKEIEALIYYTSHIVVESGGLNSLPKHTVIYSD
NAAIIYRDALEEIRSKYDRSIPEQNEIIEEISEALVNLAELKNANSSKKENSKQEKDYGI
DFYEYNEIIEEYSGAKIKTGSEAVEYLLKNFDLTAEQEVIKDKIKALNEAIEKESKTSQS
KVEERKKLYKRLSIINAFINSNQKPESMLIRNLPVIPADLRPLIQLDGGRHSTSDINELY
RRIIIRNNRLKKWQESNAPQIIIQNELRMIQESVDALIDNQRRSPSPVVSKENRPLKSIS
DALTGKKGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPDLKMHQAGIPRQMAAKLFEPWIIKELIEK
EIAPTIKSAKKLIEDQNPIIWPHVARVIVDKPVLLNRAPTLHRLSIQAFEPVLIRGKAIK
LHPLVTTAFNADFDGDQMAVHVPISDESVREAKELLMANRNILGPKDGEPIINPSQDIIL
GLYYLTREVKGAKGEAKYYMSYDDMYAAYSSKKIDLHARVAIPYRTVKAFKVNQNVEYII
STVGKFIFNRAFPDNFPFIFDNKFDNYRNNEENKYLVPKGTKLDEYIKNLPVNNPFNKKE
IAKFVRIVFDEFSGAMPISKIASVVKKVNSGNYHDTVMMYADLFKDKQNKKSVRHAQILA
NYTKQEFEKINKKLTLQNEGVERVWDSKHRSELLEKIWFAYNNIVASVLDKIKVLGFKFS
MQSGSTFSINDIKTSLDKEKYVKEGEEYINNLNKMYENGFITDDEKYTLAISEWAKIKEK
ITNSLKKIIEDNKENSIFMMMQSGARGNISNYVQLAGMRGLMANNVKTLKADAQNERVVR
STVEVPVKSSFLDGLTAYEFYSSTHGARKGLTDVALNTARSGYLTRRLVDVAQNIVVSED
DCGSDFGLKVKDITDTRTATIIVPLIERIEGRYLNSALYSNEGQLLANKNTLVTEEFADQ
IVNKYNIKEVEIRSILGCHTRNGVCKLCYGKDLASNAPVNIGEAVGIIAAQSIGEPGTQL
TMRTFHTGGVAGVEDITGGFGRLIELIDAFEKPWGLLAQISKWYGVVSEIKESKTASNKL
IVSIKEDFKNTLRTEEVSKDRKLRVKVGDRVKPGSKITEGPIVLKELLKYTDARTVQKYL
LKEIQRLYRMQGISISDKYIEIIIRQMLSKVDIVEPGDSNFFAGSIVDIFEYQEENGRLL
SEGKKPAYGKVIIKGAKQSPLLSDSFLAAASFQETAKILVHSAISRKVDELSGLKENIIL
GHKIPSGTSSKYEVDSKYDIRDPKSFFEDESKYEYLKFEDKWIA
NT seq 4275 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaataaaatcttaaaaggtgataaccaaaattgagctgaatatgaaattgattcaatt
tctttagctcttgcaacagatgaagatgttttaaactgatctaatggtgaagttacaaaa
cctgaaactgtcaattataaaacttataaacctgaaaaacacggtttatttgatgaacta
atttttggaccaacaactgattataagtgtccaatttgtggtaaaaaatataaaatttct
aatgaaggttctacttgtggtaacacagaagagtgtaaacgcgaaaaacctgaaatttta
ccaaaaatttcgcgtcgtagtagaatgggtcacattagattacatgctccaattgtgcac
ttttgattttttaaagttgataattcaattatttctaaattattaggtttaaaatcagaa
aattcaaataaatattattctaaaaaagaaattgaagctcttatttactatacaagtcat
attgttgttgaaagtgggggacttaattctttaccaaaacacactgtaatttatagtgat
aatgctgcaattatttatcgtgatgctttagaagaaattagatctaaatatgatcgtagt
attcctgaacaaaatgaaattattgaagaaatttcagaagctttagtaaatttagctgaa
ttaaaaaatgctaattcttctaaaaaagaaaattctaagcaagaaaaagattatggaatt
gatttttatgaatacaatgaaattattgaagaatatagtggagctaaaattaaaacaggt
tctgaagcagttgaatatttattaaaaaactttgatttaacagcagagcaagaagttatt
aaagataaaattaaagctctgaacgaagcgattgaaaaagaatcgaaaacttcacaatca
aaagtcgaagaaagaaaaaaactttataaaagattatctatcattaatgcttttattaat
agtaatcaaaaaccagaaagtatgttaattagaaacttaccagttatccctgctgattta
agacctttaattcaacttgatggtggtagacattcgactagtgatatcaatgaattatat
cgtcgtattatcattagaaataatcgcctgaaaaaatgacaagaatctaatgctcctcaa
attattattcaaaatgaattaagaatgattcaagaatctgttgatgctttaattgacaac
caaagaagatcaccttctcctgttgtttctaaagaaaatcgccctttaaaatcaattagt
gatgcactaactggtaaaaaaggtcgttttagacaaaacttactaggaaaaagagttgat
tattcaggacgtagtgttatagttgttggtccagatttaaaaatgcatcaggcaggaatt
ccaagacaaatggctgctaaattatttgaaccttgaattatcaaagaattaattgaaaaa
gaaattgctccaacaattaaatctgctaagaaattaattgaagatcaaaatcctattatt
tgaccacatgttgctagagttattgttgataaaccagttttactaaatcgtgctccaaca
ttacaccgtctatcaattcaagcttttgaacctgttttaattagaggtaaagcaattaaa
ttgcatccattagtaacaactgcttttaacgcagattttgatggggaccaaatggctgtt
catgttcctattagtgatgaatcagttcgtgaagctaaagaattattaatggctaatcgt
aacattttaggacctaaagatggtgaaccaattatcaatccttctcaagatattatttta
ggtctatattatttaactagagaagtaaaaggtgcaaaaggtgaggcaaaatattacatg
tcttatgatgacatgtatgcagcatatagttcaaaaaaaattgatttacatgctcgtgta
gcgattccatatcgtacagtaaaagcatttaaagtaaatcaaaatgttgaatacattatt
tctactgtaggtaaatttatttttaatcgtgcttttccagataatttcccttttattttt
gataataaatttgataattatcgtaataatgaagaaaataaatatttagttcctaaaggt
actaaattagatgaatatattaaaaatttaccagttaataatccttttaataaaaaagaa
attgcaaagtttgtaagaattgtttttgatgagttttcaggagcaatgccaatttcaaaa
attgctagtgttgtgaaaaaagttaatagtggaaattaccatgatacagttatgatgtac
gcggatttatttaaagataaacaaaataaaaaatcagtaagacatgcacaaattcttgca
aattatacaaagcaagaatttgaaaaaattaataaaaaacttactttacaaaatgaaggt
gttgaaagagtttgggattcaaaacatcgctcagaattattggaaaaaatttgatttgct
tacaacaatattgtagcttcagttttggacaaaattaaagttttaggattcaaattttca
atgcaatcaggttcaacattttcaattaatgatattaaaacttctttagacaaagaaaaa
tatgttaaagaaggtgaagaatacattaataatttaaataaaatgtatgaaaatggattc
attactgatgatgaaaaatatactttggcaattagtgaatgagctaaaattaaagaaaaa
atcacaaattcattgaaaaaaattattgaagataataaggaaaattctattttcatgatg
atgcaatcaggtgctagaggaaatatttctaactatgttcaactagccggtatgagaggg
ttgatggccaataatgttaaaactttaaaagccgatgctcaaaatgaaagagttgtacgt
tcaactgttgaagtacctgttaagtcttcgtttttagatggattaacagcttatgaattt
tactcttcaactcatggtgctagaaaaggactaactgatgttgctttaaatacagctcgt
tcaggttatttgactagacgtttagttgatgttgctcaaaatattgttgtgagtgaagat
gattgcggaagtgattttggacttaaagttaaagatattactgacacaagaactgcaaca
attattgttcctttaatcgaaagaattgaaggaagatacttaaattcagctctttattca
aatgaaggacaattacttgcaaataaaaatactttagtaacagaagaatttgcagatcaa
attgttaataaatacaacataaaagaagttgaaattcgttcaattttaggttgtcataca
agaaatggtgtatgtaaattatgttatggtaaagacttagcttcaaatgctcctgttaat
attggtgaagcagtaggaattattgctgctcaatcaattggtgaaccaggaactcaatta
acaatgcgtactttccatacaggaggagttgctggagttgaagatattacaggtggattt
ggtagattaattgaattaattgatgccttcgaaaaaccttgaggtcttttagctcaaatt
tctaaatgatatggagttgtaagtgaaattaaagaatcaaaaactgcatctaataaatta
attgtttcaattaaagaagattttaaaaacactttaagaactgaagaggtttctaaagat
agaaaattaagagttaaagtcggggatagagttaaaccaggttcaaaaattactgagggt
ccaattgtattgaaagaattattaaaatatacagatgcaagaacagttcaaaagtattta
ttaaaagaaattcaaagactatatcgtatgcaaggtatttcaattagtgataaatatatt
gaaattattattagacaaatgctttctaaagttgatattgttgagccaggagattcaaat
ttctttgcaggttcaattgtagacatttttgaatatcaagaagaaaatggtcgtttatta
tctgaaggtaaaaaaccagcttatggaaaagttatcattaaaggtgctaaacaatcacct
cttttatcagattcattcctagctgctgcttcattccaagaaacagctaaaatcttagta
cattcagcaatttcaagaaaagttgatgaattatctggattgaaagaaaatattatttta
ggacataaaattccttcaggaacttcttctaaatacgaagttgattctaaatatgatatt
agagatccaaaatcattttttgaagatgaatcaaaatatgagtatctaaaatttgaagat
aaatgaatcgcctaa

  All links  
Ontology (4)   
   KEGG BRITE (4)   
Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Chemical reaction (1)   
   KEGG ENZYME (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (3)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   SWISS-PROT (1)   
Protein domain (6)   
   Pfam (6)   
All databases (18)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system