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Database: Pfam
Entry: Terminase_GpA
LinkDB: Terminase_GpA
Original site: Terminase_GpA 
#=GF ID   Terminase_GpA
#=GF AC   PF05876.11
#=GF DE   Phage terminase large subunit (GpA)
#=GF AU   Moxon SJ
#=GF SE   Pfam-B_9892 (release 8.0)
#=GF GA   21.80 21.80;
#=GF TC   23.70 23.10;
#=GF NC   21.60 21.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 26740544 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11866517
#=GF RT   The large subunit of bacteriophage lambda's terminase plays a
#=GF RT   role in DNA translocation and packaging termination. 
#=GF RA   Duffy C, Feiss M; 
#=GF RL   J Mol Biol 2002;316:547-561.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008866;
#=GF CC   This family consists of several phage terminase large subunit
#=GF CC   proteins as well as related sequences from several bacterial
#=GF CC   species. The DNA packaging enzyme of bacteriophage lambda,
#=GF CC   terminase, is a heteromultimer composed of a small subunit,
#=GF CC   gpNu1, and a large subunit, gpA, products of the Nu1 and A
#=GF CC   genes, respectively. Terminase is involved in the site-specific
#=GF CC   binding and cutting of the DNA in the initial stages of
#=GF CC   packaging. It is now known that gpA is actively involved in late
#=GF CC   stages of packaging, including DNA translocation, and that this
#=GF CC   enzyme contains separate functional domains for its early and
#=GF CC   late packaging activities [1]. 
#=GF SQ   539
#=GS A0A0R3MBK7_9BRAD/1-105    AC A0A0R3MBK7.1
#=GS E4PPT6_MARAH/42-595       AC E4PPT6.1
#=GS B8FCS6_DESAA/38-347       AC B8FCS6.1
#=GS A5Z444_9FIRM/33-592       AC A5Z444.1
#=GS D4K5F1_9FIRM/42-592       AC D4K5F1.1
#=GS A0A0S2DQX1_LYSEN/33-595   AC A0A0S2DQX1.1
#=GS A0A074TCV6_9RHOB/38-597   AC A0A074TCV6.1
#=GS D0YWZ6_PHODD/43-656       AC D0YWZ6.1
#=GS Q0FI90_PELBH/35-614       AC Q0FI90.1
#=GS Q8ZQH1_SALTY/36-646       AC Q8ZQH1.1
#=GS E2CJU9_9RHOB/36-586       AC E2CJU9.1
#=GS A0A0M6XTB8_9RHOB/60-628   AC A0A0M6XTB8.1
#=GS A0A0W7WEG8_9RHOB/35-603   AC A0A0W7WEG8.1
#=GS R9KK64_9FIRM/62-611       AC R9KK64.1
#=GS H1D5H0_9FUSO/36-148       AC H1D5H0.1
#=GS N2B047_9CLOT/33-586       AC N2B047.1
#=GS A3VBF4_9RHOB/3-353        AC A3VBF4.1
#=GS A0A061QCF2_9PROT/44-633   AC A0A061QCF2.1
#=GS B8F4L0_HAEPS/32-640       AC B8F4L0.1
#=GS E2CHI4_9RHOB/41-634       AC E2CHI4.1
#=GS Q1GH31_RUEST/40-593       AC Q1GH31.1
#=GS A0A0J5K5N1_PLUGE/1-387    AC A0A0J5K5N1.1
#=GS I0XUN5_9LEPT/60-353       AC I0XUN5.1
#=GS A0A120KNM0_9FUSO/42-594   AC A0A120KNM0.1
#=GS A0A127CH12_9RHIZ/34-570   AC A0A127CH12.1
#=GS TERL_LAMBD/39-606         AC P03708.1
#=GS V6F373_9PROT/53-621       AC V6F373.1
#=GS A0A0A2V4M4_BEABA/193-806  AC A0A0A2V4M4.1
#=GS A0A024HP82_PSEKB/39-616   AC A0A024HP82.1
#=GS A0A0H4W2Q8_9BORD/37-603   AC A0A0H4W2Q8.1
#=GS C2BG34_9FIRM/42-590       AC C2BG34.1
#=GS I4ML57_9BURK/36-602       AC I4ML57.1
#=GS F2J6I3_POLGS/20-588       AC F2J6I3.1
#=GS A0A0D0PDG8_9RHOB/56-624   AC A0A0D0PDG8.1
#=GS Q3SUG6_NITWN/457-570      AC Q3SUG6.1
#=GS C1A9W4_GEMAT/43-622       AC C1A9W4.1
#=GS E8QXH8_ISOPI/424-732      AC E8QXH8.1
#=GS A0A090VRU1_ESCVU/1-300    AC A0A090VRU1.1
#=GS A0A0J5GLH6_9NEIS/36-595   AC A0A0J5GLH6.1
#=GS A0A0C5LGD4_9SPHN/47-649   AC A0A0C5LGD4.1
#=GS A0A071M108_9ENTR/47-660   AC A0A071M108.1
#=GS Q8Y140_RALSO/37-603       AC Q8Y140.1
#=GS Q727H9_DESVH/29-598       AC Q727H9.1
#=GS A0A0L8EW36_9BURK/36-603   AC A0A0L8EW36.1
#=GS R7J609_9FUSO/18-356       AC R7J609.1
#=GS A0A0N0VI25_9PSED/36-449   AC A0A0N0VI25.1
#=GS A0A099GM22_9RHOB/49-617   AC A0A099GM22.1
#=GS S9RVT3_9RHOB/1-494        AC S9RVT3.1
#=GS K2I7E2_9RHOB/29-575       AC K2I7E2.1
#=GS A0A0N7HJ54_9RHOB/57-620   AC A0A0N7HJ54.1
#=GS A0A150MJI8_9BACI/41-581   AC A0A150MJI8.1
#=GS D1Y313_9BACT/49-607       AC D1Y313.1
#=GS B6V2Z1_BPSP1/31-395       AC B6V2Z1.1
#=GS A4J3T4_DESRM/40-582       AC A4J3T4.1
#=GS Q1ILS3_KORVE/41-605       AC Q1ILS3.1
#=GS A7MG08_CROS8/1-268        AC A7MG08.1
#=GS W0E4D8_MARPU/35-592       AC W0E4D8.1
#=GS L9U7W1_9GAMM/70-191       AC L9U7W1.1
#=GS A0A0J5K4W6_PLUGE/1-122    AC A0A0J5K4W6.1
#=GS Q3SUG6_NITWN/51-460       AC Q3SUG6.1
#=GS G4KQ85_OSCVS/50-604       AC G4KQ85.1
#=GS A0A0X1U7Q3_CLOPR/41-586   AC A0A0X1U7Q3.1
#=GS F4H968_GALAU/32-642       AC F4H968.1
#=GS A0A099UZ36_9HELI/2-149    AC A0A099UZ36.1
#=GS A0A0Q1F5T3_9SPHI/45-605   AC A0A0Q1F5T3.1
#=GS A0A011PCR3_9PROT/230-759  AC A0A011PCR3.1
#=GS W8TYH8_YEREN/1-585        AC W8TYH8.1
#=GS C6BVZ9_DESAD/62-632       AC C6BVZ9.1
#=GS A3K1Z4_9RHOB/35-615       AC A3K1Z4.1
#=GS A0A0B0HWI4_9BACL/1-314    AC A0A0B0HWI4.1
#=GS A0A0M7BDF5_9RHOB/56-403   AC A0A0M7BDF5.1
#=GS F2K1G0_MARM1/31-644       AC F2K1G0.1
#=GS E8RII1_DESPD/67-621       AC E8RII1.1
#=GS D8P9H5_9BACT/36-603       AC D8P9H5.1
#=GS A0A0M2NI00_9FIRM/8-61     AC A0A0M2NI00.1
#=GS Q2WAE9_MAGSA/53-621       AC Q2WAE9.1
#=GS A8U0J0_9PROT/1-75         AC A8U0J0.1
#=GS I7EZX4_PHAIB/40-593       AC I7EZX4.1
#=GS A0A0F3IVH9_9PROT/34-590   AC A0A0F3IVH9.1
#=GS A0A074MGC9_9BACL/35-581   AC A0A074MGC9.1
#=GS B8ISB8_METNO/46-641       AC B8ISB8.1
#=GS R5IDD0_9FIRM/33-582       AC R5IDD0.1
#=GS B6IMM9_RHOCS/40-594       AC B6IMM9.1
#=GS A0A0L0WAJ8_CLOPU/36-579   AC A0A0L0WAJ8.1
#=GS Q72FL9_DESVH/53-623       AC Q72FL9.1
#=GS B9QS26_LABAD/13-569       AC B9QS26.1
#=GS G1USD2_9DELT/28-584       AC G1USD2.1
#=GS M3FH41_9LEPT/45-324       AC M3FH41.1
#=GS A0A0S4PZG2_BLAVI/10-577   AC A0A0S4PZG2.1
#=GS A0A0M7B4W6_9RHOB/57-625   AC A0A0M7B4W6.1
#=GS A8U203_9PROT/56-347       AC A8U203.1
#=GS A0A071M5H9_9ENTR/15-557   AC A0A071M5H9.1
#=GS Q9PFZ8_XYLFA/42-636       AC Q9PFZ8.1
#=GS F6DTG5_DESRL/30-359       AC F6DTG5.1
#=GS B0P605_9FIRM/40-603       AC B0P605.1
#=GS E8V6R2_TERSS/42-604       AC E8V6R2.1
#=GS G3IRD6_9GAMM/39-594       AC G3IRD6.1
#=GS Q24VG8_DESHY/14-310       AC Q24VG8.1
#=GS F5R897_METUF/53-643       AC F5R897.1
#=GS D8F203_9DELT/31-596       AC D8F203.1
#=GS V4P5H2_9CAUL/46-650       AC V4P5H2.1
#=GS A0A024QIP5_9BACI/37-201   AC A0A024QIP5.1
#=GS C1D856_LARHH/33-626       AC C1D856.1
#=GS Q2W750_MAGSA/19-497       AC Q2W750.1
#=GS A0A0F2RW07_9RHOB/64-631   AC A0A0F2RW07.1
#=GS A0A142XXB0_9PLAN/434-732  AC A0A142XXB0.1
#=GS A0A061JHL7_9RICK/1-169    AC A0A061JHL7.1
#=GS A0A069PMP2_9BURK/35-604   AC A0A069PMP2.1
#=GS A0A0G0K7S6_9BACT/41-341   AC A0A0G0K7S6.1
#=GS D9QFX5_BRESC/48-640       AC D9QFX5.1
#=GS C3WBA2_FUSMR/33-581       AC C3WBA2.2
#=GS A0A0A0BJI6_9CELL/1-409    AC A0A0A0BJI6.1
#=GS Q72A12_DESVH/44-615       AC Q72A12.1
#=GS G7ZBJ1_AZOL4/55-626       AC G7ZBJ1.1
#=GS A0A0J6WSC5_9FIRM/46-600   AC A0A0J6WSC5.1
#=GS A0A014Q8E3_9BURK/41-622   AC A0A014Q8E3.1
#=GS A0A0N1J5J8_9PSED/36-449   AC A0A0N1J5J8.1
#=GS A0A0Q6MYN9_9BURK/1-152    AC A0A0Q6MYN9.1
#=GS Q8ZMZ3_SALTY/39-608       AC Q8ZMZ3.1
#=GS B6JDN2_OLICO/39-607       AC B6JDN2.1
#=GS A0A021X9J1_9RHIZ/1-526    AC A0A021X9J1.1
#=GS V4NUI7_9CAUL/4-605        AC V4NUI7.1
#=GS R9LUU9_9FIRM/43-585       AC R9LUU9.1
#=GS A0A142XTL8_9PLAN/462-751  AC A0A142XTL8.1
#=GS A0A0C1SX43_9ACTN/1-184    AC A0A0C1SX43.1
#=GS F2J3Q7_POLGS/1-569        AC F2J3Q7.1
#=GS Q5NXG6_AROAE/44-606       AC Q5NXG6.1
#=GS U5QDZ1_9CYAN/1-564        AC U5QDZ1.1
#=GS K7AN93_9ALTE/18-598       AC K7AN93.1
#=GS A0A099GLQ0_9RHOB/47-671   AC A0A099GLQ0.1
#=GS M5RHA9_9PLAN/25-314       AC M5RHA9.1
#=GS F8KPP2_HELBC/56-596       AC F8KPP2.1
#=GS A0A086Y1M0_9RHOB/31-570   AC A0A086Y1M0.1
#=GS A0A0C1Q7I9_9ACTN/36-420   AC A0A0C1Q7I9.1
#=GS G8PUL3_PSEUV/51-622       AC G8PUL3.1
#=GS R7L760_9BACT/1-198        AC R7L760.1
#=GS K4ZSQ7_PAEAL/40-587       AC K4ZSQ7.1
#=GS A3X5R5_9RHOB/12-579       AC A3X5R5.1
#=GS W6TET0_HOLOB/31-585       AC W6TET0.1
#=GS R5F100_9CLOT/39-586       AC R5F100.1
#=GS A0A142WVU0_9PLAN/398-717  AC A0A142WVU0.1
#=GS A6WZU1_OCHA4/34-570       AC A6WZU1.1
#=GS D0DBM1_9RHOB/53-621       AC D0DBM1.1
#=GS A0LAT5_MAGMM/34-581       AC A0LAT5.1
#=GS A0A099T4K7_9RHOB/1-561    AC A0A099T4K7.1
#=GS X2GT37_9BACI/34-576       AC X2GT37.1
#=GS A0A0E3UJM4_9BACT/82-353   AC A0A0E3UJM4.1
#=GS A0A143DDU8_9PROT/38-587   AC A0A143DDU8.1
#=GS A0A098F5A9_9BACI/41-581   AC A0A098F5A9.1
#=GS E9CQA7_9GAMM/1-234        AC E9CQA7.1
#=GS A0A099GMX2_9RHOB/37-616   AC A0A099GMX2.1
#=GS B4CXQ4_9BACT/1-332        AC B4CXQ4.1
#=GS K9Y240_STAC7/31-589       AC K9Y240.1
#=GS A0A0U1NNR0_9RHOB/64-631   AC A0A0U1NNR0.1
#=GS A0A0M3AUM9_9SPHN/46-611   AC A0A0M3AUM9.1
#=GS W0DXT1_MARPU/36-633       AC W0DXT1.1
#=GS L0NDI7_9RHIZ/40-639       AC L0NDI7.1
#=GS A0A0L0GZ13_9ENTR/43-608   AC A0A0L0GZ13.1
#=GS A0A0U2W2I4_9BURK/36-603   AC A0A0U2W2I4.1
#=GS A0A081NI15_9GAMM/30-577   AC A0A081NI15.1
#=GS A0A0J5QEQ7_9RHOB/56-624   AC A0A0J5QEQ7.1
#=GS A6FMD5_9RHOB/49-616       AC A6FMD5.1
#=GS A0A142XZA0_9PLAN/360-514  AC A0A142XZA0.1
#=GS A0A0P7IU03_9RHOB/1-117    AC A0A0P7IU03.1
#=GS R5BXN3_9FIRM/46-593       AC R5BXN3.1
#=GS D5RTG7_9PROT/42-640       AC D5RTG7.1
#=GS A0A150KS48_9BACI/37-579   AC A0A150KS48.1
#=GS A6DHQ0_9BACT/74-354       AC A6DHQ0.1
#=GS M5SXL0_9PLAN/51-626       AC M5SXL0.1
#=GS D5BYU4_NITHN/41-601       AC D5BYU4.1
#=GS A0A061JGR2_9RICK/1-95     AC A0A061JGR2.1
#=GS U1YEK6_9BURK/38-623       AC U1YEK6.1
#=GS A0A085JCZ9_9GAMM/34-645   AC A0A085JCZ9.1
#=GS A0A0F2S5T5_9RHOB/56-624   AC A0A0F2S5T5.1
#=GS A0A011PCR3_9PROT/37-91    AC A0A011PCR3.1
#=GS I9BXX4_9RALS/36-603       AC I9BXX4.1
#=GS A0A0D0Q7Y7_9RHOB/35-480   AC A0A0D0Q7Y7.1
#=GS V6EXP8_9PROT/44-612       AC V6EXP8.1
#=GS B1MAB4_METRJ/40-636       AC B1MAB4.1
#=GS D2Z3S8_9BACT/30-595       AC D2Z3S8.1
#=GS D7N2Y3_9NEIS/44-626       AC D7N2Y3.1
#=GS Q5FNH9_GLUOX/44-648       AC Q5FNH9.1
#=GS A0A099V7J6_9HELI/1-66     AC A0A099V7J6.1
#=GS E3HBM7_ILYPC/36-578       AC E3HBM7.1
#=GS A0A090UZ83_ESCVU/47-175   AC A0A090UZ83.1
#=GS A8TUC3_9PROT/1-167        AC A8TUC3.1
#=GS B9NP67_9RHOB/38-600       AC B9NP67.1
#=GS G2IZL1_PSEUL/39-609       AC G2IZL1.1
#=GS D8F5N8_9DELT/31-596       AC D8F5N8.1
#=GS A0A0P7X0E7_9RHOB/32-569   AC A0A0P7X0E7.1
#=GS A0A0G3BRR3_9BURK/37-603   AC A0A0G3BRR3.1
#=GS A0L9A8_MAGMM/34-581       AC A0L9A8.1
#=GS C8S4N6_9RHOB/65-633       AC C8S4N6.1
#=GS A0A0E3UJM4_9BACT/392-715  AC A0A0E3UJM4.1
#=GS A8TYC8_9PROT/56-602       AC A8TYC8.1
#=GS A0A117KH62_9RHOB/52-620   AC A0A117KH62.1
#=GS F4G816_ALIDK/36-600       AC F4G816.1
#=GS A0A0Q7MGC2_9RHIZ/36-619   AC A0A0Q7MGC2.1
#=GS A0A147H013_9BURK/42-627   AC A0A147H013.1
#=GS B9JWM2_AGRVS/38-609       AC B9JWM2.1
#=GS A0A091AQ85_9GAMM/45-674   AC A0A091AQ85.1
#=GS A0A0P6WGK7_9RHIZ/1-322    AC A0A0P6WGK7.1
#=GS A0A0D6B3Z4_RHOSU/51-659   AC A0A0D6B3Z4.1
#=GS V6F5I0_9PROT/31-599       AC V6F5I0.1
#=GS A0A099GL13_9RHOB/60-628   AC A0A099GL13.1
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