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Database: Pfam
Entry: Terminase_GpA
LinkDB: Terminase_GpA
Original site: Terminase_GpA 
#=GF ID   Terminase_GpA
#=GF AC   PF05876.7
#=GF DE   Phage terminase large subunit (GpA)
#=GF AU   Moxon SJ
#=GF SE   Pfam-B_9892 (release 8.0)
#=GF GA   21.80 21.80;
#=GF TC   21.80 21.80;
#=GF NC   21.70 21.70;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 23193494 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11866517
#=GF RT   The large subunit of bacteriophage lambda's terminase plays a
#=GF RT   role in DNA translocation and packaging termination. 
#=GF RA   Duffy C, Feiss M; 
#=GF RL   J Mol Biol 2002;316:547-561.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008866;
#=GF CC   This family consists of several phage terminase large subunit
#=GF CC   proteins as well as related sequences from several bacterial
#=GF CC   species. The DNA packaging enzyme of bacteriophage lambda,
#=GF CC   terminase, is a heteromultimer composed of a small subunit,
#=GF CC   gpNu1, and a large subunit, gpA, products of the Nu1 and A
#=GF CC   genes, respectively. Terminase is involved in the site-specific
#=GF CC   binding and cutting of the DNA in the initial stages of
#=GF CC   packaging. It is now known that gpA is actively involved in late
#=GF CC   stages of packaging, including DNA translocation, and that this
#=GF CC   enzyme contains separate functional domains for its early and
#=GF CC   late packaging activities [1]. 
#=GF SQ   1654
#=GS H5HIK3_ECOLX/1-374     AC H5HIK3.1
#=GS F9I186_ECOLX/1-546     AC F9I186.1
#=GS F6BN33_SINMB/36-619    AC F6BN33.1
#=GS B5YV97_ECO5E/38-648    AC B5YV97.1
#=GS B8ICM2_METNO/41-622    AC B8ICM2.1
#=GS H5W5W0_SALEN/1-122     AC H5W5W0.1
#=GS H0A599_9PROT/1-595     AC H0A599.1
#=GS E8XHJ0_SALT4/39-609    AC E8XHJ0.1
#=GS H4TJY9_ECOLX/14-430    AC H4TJY9.1
#=GS A8U0J0_9PROT/1-76      AC A8U0J0.1
#=GS F5ZUV9_SALTU/39-609    AC F5ZUV9.1
#=GS H5FZH9_ECOLX/1-166     AC H5FZH9.1
#=GS D0YWZ6_LISDA/43-656    AC D0YWZ6.1
#=GS E2KDV2_ECO57/39-607    AC E2KDV2.1
#=GS Q8ZQH1_SALTY/36-646    AC Q8ZQH1.1
#=GS H5BTA6_ECOLX/2-62      AC H5BTA6.1
#=GS H4PYV8_ECOLX/39-583    AC H4PYV8.1
#=GS E7U9C6_ECOLX/12-582    AC E7U9C6.1
#=GS F4SWL4_ECOLX/39-607    AC F4SWL4.1
#=GS H5D0K1_ECOLX/39-173    AC H5D0K1.1
#=GS H4L7N4_ECOLX/2-77      AC H4L7N4.1
#=GS B3WTD0_ECOLX/23-508    AC B3WTD0.1
#=GS B5YXF8_ECO5E/39-607    AC B5YXF8.1
#=GS A4N152_HAEIF/1-152     AC A4N152.1
#=GS E8HAT1_ECO57/1-116     AC E8HAT1.1
#=GS A4LDB0_BURPE/42-625    AC A4LDB0.1
#=GS B8F4L0_HAEPS/32-640    AC B8F4L0.1
#=GS D4CFW3_9CLOT/40-611    AC D4CFW3.1
#=GS H4KZ28_ECOLX/1-154     AC H4KZ28.1
#=GS E2QKQ4_ECOLX/1-544     AC E2QKQ4.1
#=GS H5KN18_ECOLX/39-609    AC H5KN18.1
#=GS Q4EBR6_9RICK/1-222     AC Q4EBR6.1
#=GS H4UU37_ECOLX/31-590    AC H4UU37.1
#=GS E8RII1_DESPD/67-622    AC E8RII1.1
#=GS H5B797_ECOLX/1-376     AC H5B797.1
#=GS H3KM77_ECOLX/1-254     AC H3KM77.1
#=GS H5ED46_ECOLX/1-50      AC H5ED46.1
#=GS D4K5F1_9FIRM/42-594    AC D4K5F1.1
#=GS H4RRU0_ECOLX/34-644    AC H4RRU0.1
#=GS G5XTV6_ECOLX/1-39      AC G5XTV6.1
#=GS H5P1G9_ECOLX/39-607    AC H5P1G9.1
#=GS Q3RC48_XYLFA/43-636    AC Q3RC48.1
#=GS Q3R2V3_XYLFA/43-604    AC Q3R2V3.1
#=GS B2U026_SHIB3/39-609    AC B2U026.1
#=GS G1Y9X5_ECOLX/34-644    AC G1Y9X5.1
#=GS H4TK04_ECOLX/39-607    AC H4TK04.1
#=GS H5DIQ3_ECOLX/1-314     AC H5DIQ3.1
#=GS Q6UYH7_9CAUD/24-635    AC Q6UYH7.2
#=GS H6M8D7_ECOLX/39-607    AC H6M8D7.1
#=GS G2BMS5_ECOLX/12-171    AC G2BMS5.1
#=GS D7YUG5_ECOLX/1-63      AC D7YUG5.1
#=GS E7J2N5_ECOLX/39-612    AC E7J2N5.1
#=GS G2AES6_ECOLX/1-611     AC G2AES6.1
#=GS E8IHK6_ECOLX/1-441     AC E8IHK6.1
#=GS H4LE79_ECOLX/1-428     AC H4LE79.1
#=GS G2C7N6_ECOLX/1-607     AC G2C7N6.1
#=GS H4VZX6_ECOLX/39-351    AC H4VZX6.1
#=GS F4UMS5_ECOLX/39-210    AC F4UMS5.1
#=GS F6BS97_SINMB/36-619    AC F6BS97.1
#=GS D8EFC4_ECOLX/32-600    AC D8EFC4.1
#=GS C7G5Z2_9FIRM/38-406    AC C7G5Z2.1
#=GS G5X544_ECOLX/39-552    AC G5X544.1
#=GS A8TYC8_9PROT/56-603    AC A8TYC8.1
#=GS Q8Y140_RALSO/37-603    AC Q8Y140.1
#=GS C0R346_WOLWR/28-584    AC C0R346.1
#=GS H4LRI1_ECOLX/1-374     AC H4LRI1.1
#=GS B7NVH5_ECO7I/34-644    AC B7NVH5.1
#=GS F1Y8H3_ECO57/1-544     AC F1Y8H3.1
#=GS D2AA56_SHIF2/39-609    AC D2AA56.1
#=GS G2AUQ9_ECOLX/39-85     AC G2AUQ9.1
#=GS G1ZG74_ECOLX/29-99     AC G1ZG74.1
#=GS H5ITA3_ECOLX/2-161     AC H5ITA3.1
#=GS D7X0P1_ECOLX/39-122    AC D7X0P1.1
#=GS D7XMP4_ECOLX/34-384    AC D7XMP4.1
#=GS E9VXB9_ECOLX/1-190     AC E9VXB9.1
#=GS H4N847_ECOLX/1-314     AC H4N847.1
#=GS H5NPE7_ECOLX/34-644    AC H5NPE7.1
#=GS G2KY65_PSEAI/39-611    AC G2KY65.1
#=GS Q1ILS3_KORVE/41-605    AC Q1ILS3.1
#=GS H5EJ77_ECOLX/28-473    AC H5EJ77.1
#=GS D0ZTF3_SALT1/46-656    AC D0ZTF3.1
#=GS H5R9L0_ECOLX/1-274     AC H5R9L0.1
#=GS B1IR47_ECOLC/39-608    AC B1IR47.1
#=GS H4IB11_ECOLX/39-571    AC H4IB11.1
#=GS Q8XC13_ECO57/51-621    AC Q8XC13.1
#=GS A0LBP7_MAGSM/34-583    AC A0LBP7.1
#=GS D7JPN5_ECOLX/34-644    AC D7JPN5.1
#=GS G7RNT8_ECOC1/53-623    AC G7RNT8.1
#=GS F3G6T3_PSESJ/12-374    AC F3G6T3.1
#=GS I1B4K0_ECOLX/1-264     AC I1B4K0.1
#=GS A9C2C4_DELAS/26-691    AC A9C2C4.1
#=GS H4SKW1_ECOLX/1-611     AC H4SKW1.1
#=GS D9YDG3_9DELT/77-650    AC D9YDG3.1
#=GS F4H968_GALAU/32-642    AC F4H968.1
#=GS G9T6C8_SALMO/39-609    AC G9T6C8.1
#=GS G5UJ41_ECOLX/39-552    AC G5UJ41.1
#=GS E9X561_ECOLX/1-498     AC E9X561.1
#=GS D5D1N3_ECOKI/1-376     AC D5D1N3.1
#=GS H4KZN2_ECOLX/1-239     AC H4KZN2.1
#=GS F8FUU0_PSEPU/1-456     AC F8FUU0.1
#=GS B0PEX9_9FIRM/40-608    AC B0PEX9.1
#=GS B6IMM9_RHOCS/41-594    AC B6IMM9.1
#=GS A6DHQ0_9BACT/68-376    AC A6DHQ0.1
#=GS H5EWI8_ECOLX/1-241     AC H5EWI8.1
#=GS G4KQ85_OSCVS/50-605    AC G4KQ85.1
#=GS B5N379_SALET/47-657    AC B5N379.1
#=GS Q6VT78_9CAUD/40-638    AC Q6VT78.1
#=GS G4PUP5_ECOLX/39-609    AC G4PUP5.1
#=GS G1USD2_9DELT/28-589    AC G1USD2.1
#=GS H5GAD1_ECOLX/2-172     AC H5GAD1.1
#=GS A4N153_HAEIF/3-385     AC A4N153.1
#=GS C9L4D4_RUMHA/40-611    AC C9L4D4.1
#=GS E3XQW1_ECOLX/1-587     AC E3XQW1.1
#=GS G7R1Y5_ECOC2/53-623    AC G7R1Y5.1
#=GS H4NN85_ECOLX/39-299    AC H4NN85.1
#=GS H4LSN3_ECOLX/2-310     AC H4LSN3.1
#=GS B3I258_ECOLX/39-610    AC B3I258.1
#=GS D0D598_9RHOB/51-265    AC D0D598.1
#=GS B5S6W9_RALSL/37-603    AC B5S6W9.1
#=GS H4STH9_ECOLX/2-109     AC H4STH9.1
#=GS E7JQ59_ECOLX/2-77      AC E7JQ59.1
#=GS G9SAD7_CITFR/39-608    AC G9SAD7.1
#=GS Q2WAE9_MAGSA/53-621    AC Q2WAE9.1
#=GS H1PWD6_9FUSO/33-580    AC H1PWD6.1
#=GS E7URM3_ECOLX/39-607    AC E7URM3.1
#=GS B9A903_9RICK/28-585    AC B9A903.1
#=GS B5N1N3_SALET/39-609    AC B5N1N3.1
#=GS C2BG34_9FIRM/42-591    AC C2BG34.1
#=GS B7M6H5_ECO8A/39-607    AC B7M6H5.1
#=GS C1KFK1_9CAUD/1-215     AC C1KFK1.1
#=GS H4J450_ECOLX/39-240    AC H4J450.1
#=GS G1ZEL0_ECOLX/3-195     AC G1ZEL0.1
#=GS O64317_BPN15/39-608    AC O64317.1
#=GS H5MDE7_ECOLX/1-374     AC H5MDE7.1
#=GS H4TMH6_ECOLX/1-188     AC H4TMH6.1
#=GS A7ZJH8_ECO24/39-524    AC A7ZJH8.1
#=GS G1ZTP2_ECOLX/1-264     AC G1ZTP2.1
#=GS H5ITA4_ECOLX/1-154     AC H5ITA4.1
#=GS D7Y3T0_ECOLX/39-608    AC D7Y3T0.1
#=GS F6DZ41_SINMK/40-657    AC F6DZ41.1
#=GS A8U203_9PROT/56-350    AC A8U203.1
#=GS C8U3B9_ECO10/29-599    AC C8U3B9.1
#=GS Q64HL9_9VIRU/1-233     AC Q64HL9.1
#=GS G1ZG96_ECOLX/39-389    AC G1ZG96.1
#=GS H1D5G9_9FUSO/1-377     AC H1D5G9.1
#=GS E7NZ02_PSESG/12-590    AC E7NZ02.1
#=GS F4V2A4_ECOLX/1-87      AC F4V2A4.1
#=GS B7V6J2_PSEA8/32-608    AC B7V6J2.1
#=GS G5WQS2_ECOLX/39-552    AC G5WQS2.1
#=GS B3CNV8_WOLPP/28-584    AC B3CNV8.1
#=GS A7JTN8_PASHA/32-640    AC A7JTN8.1
#=GS B3XBL1_ECOLX/39-607    AC B3XBL1.1
#=GS G5GSI2_FUSNP/27-574    AC G5GSI2.1
#=GS H4NM80_ECOLX/1-175     AC H4NM80.1
#=GS D2K0C6_9CAUD/61-249    AC D2K0C6.1
#=GS G3IRD6_9GAMM/39-594    AC G3IRD6.1
#=GS B3ARR5_ECO57/1-314     AC B3ARR5.1
#=GS E2XMF5_PSEFL/36-601    AC E2XMF5.1
#=GS H4MR16_ECOLX/39-209    AC H4MR16.1
#=GS E8H3F4_ECO57/3-85      AC E8H3F4.1
#=GS E6T6S5_SHEB6/39-616    AC E6T6S5.1
#=GS G1V7I8_9DELT/57-622    AC G1V7I8.1
#=GS F7XZX0_MESOW/40-606    AC F7XZX0.1
#=GS H4STE3_ECOLX/1-126     AC H4STE3.1
#=GS C6ABY7_BARGA/40-593    AC C6ABY7.1
#=GS H3KLU7_ECOLX/34-491    AC H3KLU7.1
#=GS C6USU6_ECO5T/38-648    AC C6USU6.1
#=GS H4HXL0_ECOLX/39-250    AC H4HXL0.1
#=GS Q3QZT4_XYLFA/43-604    AC Q3QZT4.1
#=GS H5C347_ECOLX/1-129     AC H5C347.1
#=GS F3U361_RHOSH/51-675    AC F3U361.1
#=GS H5FXZ1_ECOLX/3-83      AC H5FXZ1.1
#=GS Q8FIH7_ECOL6/39-609    AC Q8FIH7.1
#=GS G5W4N1_ECOLX/39-609    AC G5W4N1.1
#=GS H5ITQ0_ECOLX/23-508    AC H5ITQ0.1
#=GS H5Q071_ECOLX/29-475    AC H5Q071.1
#=GS G9Y669_HAFAL/34-644    AC G9Y669.1
#=GS B0KSE8_PSEPG/36-601    AC B0KSE8.1
#=GS C1D856_LARHH/33-626    AC C1D856.1
#=GS G2ABY2_ECOLX/1-119     AC G2ABY2.1
#=GS H5DLN8_ECOLX/39-484    AC H5DLN8.1
#=GS H4MQB2_ECOLX/12-50     AC H4MQB2.1
#=GS C1A9W4_GEMAT/43-623    AC C1A9W4.1
#=GS E7T0T2_SHIBO/34-644    AC E7T0T2.1
#=GS D5D0G0_ECOKI/1-376     AC D5D0G0.1
#=GS G7ZAT3_AZOL4/34-584    AC G7ZAT3.1
#=GS E8IKY6_ECOLX/38-648    AC E8IKY6.1
#=GS B6V2Z1_BPSP1/33-390    AC B6V2Z1.1
#=GS E1S4T1_ECOUM/39-609    AC E1S4T1.1
#=GS B0ZSF0_9CAUD/1-590     AC B0ZSF0.1
#=GS E8IW82_ECOLX/39-607    AC E8IW82.1
#=GS Q72A12_DESVH/44-615    AC Q72A12.1
#=GS G4PT78_ECOLX/34-644    AC G4PT78.1
#=GS E1JFX1_ECOLX/11-345    AC E1JFX1.1
#=GS B5P6K9_SALET/47-657    AC B5P6K9.1
#=GS B2NZA8_ECO57/39-607    AC B2NZA8.1
#=GS H4JKN2_ECOLX/1-376     AC H4JKN2.1
#=GS H1US46_ACEPA/1-547     AC H1US46.1
#=GS H5CYD8_ECOLX/1-39      AC H5CYD8.1
#=GS H8D7V8_ECOLX/39-609    AC H8D7V8.1
#=GS E9CQA7_9ENTR/1-233     AC E9CQA7.1
#=GS C4SXA7_YERIN/33-643    AC C4SXA7.1
#=GS H5GPM1_ECOLX/39-181    AC H5GPM1.1
#=GS Q24VG8_DESHY/14-309    AC Q24VG8.1
#=GS H5EIA4_ECOLX/39-519    AC H5EIA4.1
#=GS H5JX69_ECOLX/23-508    AC H5JX69.1
#=GS G5XNS2_ECOLX/1-39      AC G5XNS2.1
#=GS H5J382_ECOLX/1-82      AC H5J382.1
#=GS E7JI06_ECOLX/34-644    AC E7JI06.1
#=GS H5D445_ECOLX/2-179     AC H5D445.1
#=GS C4TVD0_YERKR/33-643    AC C4TVD0.1
#=GS H5HIF3_ECOLX/1-153     AC H5HIF3.1
#=GS H5DFI9_ECOLX/1-68      AC H5DFI9.1
#=GS G2BJ41_ECOLX/7-309     AC G2BJ41.1
#=GS C0YCS0_BURPE/1-583     AC C0YCS0.1
#=GS E9T934_ECOLX/34-115    AC E9T934.1
#=GS E2SYZ6_9RALS/34-598    AC E2SYZ6.1
#=GS A5V8D6_SPHWW/8-594     AC A5V8D6.1
#=GS B5YYJ4_ECO5E/39-607    AC B5YYJ4.1
#=GS D7JKI8_ECOLX/39-231    AC D7JKI8.1
#=GS G0ER24_CUPNN/34-619    AC G0ER24.1
#=GS Q5N3Y0_SYNP6/35-592    AC Q5N3Y0.1
#=GS B6JEE2_OLICO/54-641    AC B6JEE2.1
#=GS C6NTQ5_9GAMM/1-524     AC C6NTQ5.1
#=GS G5YHR4_ECOLX/39-609    AC G5YHR4.1
#=GS F4V3C8_ECOLX/51-622    AC F4V3C8.1
#=GS H3RLL9_ERWST/45-610    AC H3RLL9.1
#=GS A3X5R5_9RHOB/12-579    AC A3X5R5.1
#=GS H4IU22_ECOLX/1-587     AC H4IU22.1
#=GS C8TRT5_ECO26/33-643    AC C8TRT5.1
#=GS A6WZU1_OCHA4/34-570    AC A6WZU1.1
#=GS D0DBM1_9RHOB/53-621    AC D0DBM1.1
#=GS A8EFR1_BURPE/21-604    AC A8EFR1.1
#=GS F4YCR4_9CAUD/33-592    AC F4YCR4.1
#=GS H4L7N6_ECOLX/1-154     AC H4L7N6.1
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#=GS H4SP25_ECOLX/34-644    AC H4SP25.1
#=GS E0F9B3_ACTPL/1-576     AC E0F9B3.1
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#=GS H4SN99_ECOLX/39-607    AC H4SN99.1
#=GS B3WU08_ECOLX/39-609    AC B3WU08.1
#=GS B5YRJ0_ECO5E/34-644    AC B5YRJ0.1
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#=GS B8IRQ4_METNO/45-640    AC B8IRQ4.1
#=GS E1W764_SALTS/18-628    AC E1W764.1
#=GS B4T1I6_SALNS/39-609    AC B4T1I6.1
#=GS E8IKK4_ECOLX/39-109    AC E8IKK4.1
#=GS H5AE38_ECOLX/39-607    AC H5AE38.1
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#=GS H1C663_ECOLX/1-209     AC H1C663.1
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#=GS H5QFA8_ECOLX/28-598    AC H5QFA8.1
#=GS G5U789_ECOLX/39-609    AC G5U789.1
#=GS H5QE59_ECOLX/1-314     AC H5QE59.1
#=GS H5EJ75_ECOLX/1-36      AC H5EJ75.1
#=GS E2ZHL1_9FIRM/45-596    AC E2ZHL1.1
#=GS F3LXL5_ECOLX/1-611     AC F3LXL5.1
#=GS B3G2H1_PSEAI/39-613    AC B3G2H1.1
#=GS G5M1I3_SALET/1-108     AC G5M1I3.1
#=GS H4NM81_ECOLX/1-374     AC H4NM81.1
#=GS E1RRR4_XYLFG/43-636    AC E1RRR4.1
#=GS A7ZNB7_ECO24/45-627    AC A7ZNB7.1
#=GS H4MAZ6_ECOLX/1-314     AC H4MAZ6.1
#=GS G5T9Y7_ECOLX/39-552    AC G5T9Y7.1
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#=GS G5TJJ5_ECOLX/39-609    AC G5TJJ5.1
#=GS B8IET9_METNO/1-173     AC B8IET9.1
#=GS H4HTM4_ECOLX/34-517    AC H4HTM4.1
#=GS C8TRZ4_ECO26/39-607    AC C8TRZ4.1
#=GS F3HXS2_PSESF/36-601    AC F3HXS2.1
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#=GS B7UNV4_ECO27/34-644    AC B7UNV4.1
#=GS B3IAL9_ECOLX/39-609    AC B3IAL9.1
#=GS H4NME2_ECOLX/12-81     AC H4NME2.1
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#=GS B3I8H5_ECOLX/1-591     AC B3I8H5.1
#=GS F9TW47_MARPU/36-633    AC F9TW47.1
#=GS H5C348_ECOLX/1-124     AC H5C348.1
#=GS A0LB98_MAGSM/34-583    AC A0LB98.1
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#=GS B7SYD3_9CAUD/32-586    AC B7SYD3.1
#=GS B3CPI1_WOLPP/28-181    AC B3CPI1.1
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#=GS A8EYV8_RICCK/1-48      AC A8EYV8.1
#=GS H4QGE5_ECOLX/1-376     AC H4QGE5.1
#=GS Q88IF7_PSEPK/36-601    AC Q88IF7.1
#=GS H5E427_ECOLX/12-457    AC H5E427.1
#=GS H5H734_ECOLX/1-126     AC H5H734.1
#=GS H4ZXU2_ECOLX/39-169    AC H4ZXU2.1
#=GS B5PKJ2_SALET/47-657    AC B5PKJ2.1
#=GS G5XVT1_ECOLX/39-609    AC G5XVT1.1
#=GS G5W0E9_ECOLX/39-552    AC G5W0E9.1
#=GS Q2NTL7_SODGM/39-412    AC Q2NTL7.1
#=GS A0LAT5_MAGSM/34-583    AC A0LAT5.1
#=GS E6A293_ECOLX/1-139     AC E6A293.1
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