KEGG T02789: BB2000

Proteus mirabilis BB2000: BB2000_1197

Entry

BB2000_1197       CDS       T02789

Symbol

hrpA

Name

(GenBank) ATP-dependent RNA helicase HrpA

K03578

ATP-dependent RNA helicase HrpA [EC:5.6.2.6]

Organism

pmib Proteus mirabilis BB2000

Brite

KEGG Orthology (KO) [BR:pmib00001]
09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:pmib03019]
    BB2000_1197 (hrpA)
Enzymes [BR:pmib01000]
5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.6  RNA 3'-5' helicase
     BB2000_1197 (hrpA)
Messenger RNA biogenesis [BR:pmib03019]
Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   Other RNA degradation factors
    Others
     BB2000_1197 (hrpA)

SSDB

Motif

Pfam:

DUF3418 OB_NTP_bind Helicase_C DEAD HA2_C nSTAND3 AAA_19 HA2_N AAA_22 ResIII NACHT PhoH L31 ABC_tran T2SSE TsaE AAA_30 NTPase_1 AAA_11

Other DBs

NCBI-ProteinID:

AGS59690

Position

1321348..1325244

AA seq 1298 aa
MALSSAMLYKEIEQLSLRDQQRLRKRLRGVDKISKETSKQAVLSEIEQDIIVAKQRILNR
QAHCPKIVYPENLPVSQKKEAIYNAIKDNQVVIIAGETGSGKTTQIPKICLELGRGVKGY
IGHTQPRRLAARSVAERIAHELNTTLGESVGYKVRFSDHVGDNTLVKLMTDGILLAELQQ
DKLLLQYDTIIIDEAHERSLNIDFILGYLKQLLPKRPDLKVIITSATIDPERFSKHFNQA
PIIEVSGRTYPVEVRYRPIGGDALDSDKDMTEGIIDAIDELSRESAGDILIFMSGEREIR
DTAEALNKLQLRHTEVLPLFARLSNSEQNRIFQPHTGRRIILATNVAETSLTVPGIKYVI
DTGYARISRYSYRTKVQRLPIEPISQASADQRKGRCGRVSDGICIRLYSEDDFISRAQFT
DPEILRTNLASVILQMTSIGLGDISGFPFVQAPDKRNIQDGVRLLEELGALQEGTDNKGA
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VVKELGFPINSQPADFKSIHVALLSGLLSHIGQKDSDKQEFTGARNARFAIYPGSGLFKK
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LYGLPIVASRLVNYGKIDPLLCRELFIRHALVEGDWQTRHAFFRENLKLRTEVEELEHKS
RRRDILVDDETLFTFYDQRIPQDVISTRHFDKWWKIAQKNSPDLLSFEKSMLIKEDAKRV
SALDYPNYWHQDNLKLRLTYQFEPGTAADGVTVHIPLPILNQVKDEGFDWQIPGIRHELV
VALIKSLPKPIRRNFVPAPNYASAFLERVVTPEGELLDKLEKELRRMTGVTIERDSWQLE
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YLHEKLPNKAKLGLYFNPYGKVLDLIDDCIACGVDKLIASYGGLIWQEEQYQKLQDYVRA
ELNDVVVEIAKQVESILTQVFAINKRLKGRVDISVAFALSDIKAQLNQLVFPGFVTSHGW
KRLADIPRYLSAIEKRMEKLAIDPNRDRAQMSRVENVILQWQQWLAKLTEKQKQQEEVQN
IRWMIEELRVSLFAQQIGTPYPISDKRILQAIESISLS

NT seq 3897 nt +upstreamnt +downstreamnt
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tatcccatctctgataaacgcatcttacaagctattgagtctatctcattaagttaa

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