ID ZF_RANBP2_2; MATRIX.
AC PS50199;
DT 01-DEC-2001 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 25-MAY-2022 INFO UPDATE.
DE Zinc finger RanBP2 type profile.
MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=30;
MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=27;
MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1729000; R2=0.0112922; TEXT='NScore';
MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=941.1036377; R2=2.0848954; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=605; H_SCORE=2202; N_SCORE=8.0; MODE=1; TEXT='!';
MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=472; H_SCORE=1925; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA /M: SY='R'; M=-9,-6,-27,-5,2,-23,-18,-9,-21,20,-20,-9,-3,-7,4,22,-4,-6,-15,-24,-12,1;
MA /M: SY='E'; M=2,-2,-24,0,11,-17,-17,-12,-13,-3,-15,-12,-5,-2,-2,-10,1,-5,-11,-26,-14,4;
MA /M: SY='G'; M=-4,4,-28,4,-6,-29,39,-12,-35,-8,-29,-20,9,-17,-10,-11,2,-14,-28,-26,-25,-8;
MA /I: I=-8; MI=-5; MD=-10; IM=-5; DM=-10;
MA /M: SY='D'; M=-11,9,-27,15,11,-21,-15,0,-25,1,-22,-16,2,-9,8,-4,1,-5,-23,-18,-5,9;
MA /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA /M: SY='E'; M=-9,8,-26,11,12,-26,-17,2,-21,4,-18,-11,4,-9,10,-1,-1,-4,-19,-29,-12,11;
MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA /I: MI=-5; MD=-10; IM=-5; II=-9; DM=-10; I=0,0,-30,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0;
MA /M: SY='S'; M=-4,6,-22,5,4,-23,-11,-5,-22,-1,-26,-17,9,9,-1,-6,11,7,-19,-34,-18,0;
MA /M: SY='S'; M=1,-8,-18,-9,-5,-17,-10,-12,-11,-3,-13,-8,-4,-15,-5,-6,8,7,-2,-29,-13,-5;
MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA /M: SY='T'; M=-5,-6,-7,-11,-12,-10,-3,-13,-14,-14,-8,-9,0,-21,-12,-13,1,3,-11,-26,-11,-12;
MA /M: SY='V'; M=-7,-13,-18,-17,-15,4,-24,-14,8,-14,6,2,-9,-25,-18,-12,-10,-2,12,-22,-1,-16;
MA /M: SY='Q'; M=-8,-6,-23,-8,-3,-16,-19,-4,-9,4,-11,3,-3,-16,8,6,-2,-1,-7,-24,-8,2;
MA /M: SY='N'; M=-10,37,-13,17,-2,-20,-2,8,-21,-2,-29,-20,56,-21,-2,-2,9,-1,-29,-41,-21,-2;
MA /M: SY='F'; M=-8,-10,-20,-12,2,3,-20,-12,-18,-1,-15,-12,-8,-7,-8,-4,-6,-7,-15,-12,-2,-3;
MA /M: SY='A'; M=22,-11,-17,-14,-6,-20,-7,-17,-13,-7,-15,-11,-9,4,-6,-12,7,1,-7,-25,-19,-7;
MA /M: SY='E'; M=-5,-1,-23,-2,3,-15,-15,-4,-20,0,-16,-12,-1,-14,-1,3,3,3,-15,-17,-8,0;
MA /M: SY='R'; M=7,-2,-20,-2,1,-22,-10,-10,-21,4,-20,-14,0,-7,0,9,7,-1,-13,-27,-17,-1;
MA /M: SY='T'; M=-6,-6,-20,-11,-8,-10,-19,-12,-3,-6,-6,-3,-1,-14,-7,-4,1,6,-2,-27,-8,-9;
MA /M: SY='K'; M=-6,-4,-26,-3,10,-22,-19,0,-21,20,-20,-9,-3,-13,5,15,-5,-8,-13,-22,-7,6;
MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA /M: SY='V'; M=-5,-10,-18,-17,-18,8,-21,-17,7,-16,0,-1,-4,-23,-20,-15,-7,-4,10,-22,-4,-19;
MA /M: SY='A'; M=9,-9,-12,-14,-7,-19,-13,-11,-12,1,-14,-7,-4,-16,0,6,3,-2,-5,-25,-15,-5;
MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA /M: SY='G'; M=-7,-2,-29,-3,2,-25,8,-8,-27,0,-24,-13,2,-15,8,-2,-1,-10,-26,-8,-14,5;
MA /M: SY='S'; M=9,2,-13,-7,-7,-14,-4,-12,-15,-8,-17,-13,8,-14,-8,-10,13,13,-9,-28,-14,-8;
MA /M: SY='P'; M=-3,-12,-27,-7,0,-21,-17,-12,-14,-10,-15,-12,-11,28,-7,-12,-1,-2,-15,-30,-19,-6;
MA /M: SY='K'; M=-10,-1,-28,-2,4,-25,-16,-7,-27,34,-25,-11,3,-14,7,34,-7,-9,-18,-22,-12,4;
MA /M: SY='P'; M=-8,-8,-29,-4,1,-21,-10,-13,-21,-1,-20,-13,-7,17,-4,-7,-3,-5,-20,-25,-16,-3;
MA /M: SY='D'; M=-3,3,-24,4,1,-24,-2,-11,-20,-6,-19,-14,1,-3,-3,-10,3,-1,-16,-29,-19,-2;
MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR /RELEASE=2022_02,567483;
NR /TOTAL=174(103); /POSITIVE=174(103); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR /FALSE_NEG=12; /PARTIAL=0;
CC /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC /SCALING_DB=reversed;
CC /AUTHOR=K_Hofmann;
CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=8;
CC /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=RanBP2-type;
CC /VERSION=5;
DR Q8W468 , ARI8_ARATH , T; O75808 , CAN15_HUMAN, T;
DR Q9JLG8 , CAN15_MOUSE, T; P27398 , CAND_DROME , T;
DR Q27294 , CAZ_DROME , T; O13801 , DRI1_SCHPO , T;
DR P32770 , DRI1_YEAST , T; Q01844 , EWS_HUMAN , T;
DR Q61545 , EWS_MOUSE , T; Q28009 , FUS_BOVIN , T;
DR P35637 , FUS_HUMAN , T; P56959 , FUS_MOUSE , T;
DR A9JTG5 , HOIL1_DANRE, T; E6ZIJ1 , HOIL1_DICLA, T;
DR Q9BYM8 , HOIL1_HUMAN, T; Q9WUB0 , HOIL1_MOUSE, T;
DR Q62921 , HOIL1_RAT , T; P56950 , MDM2_CANLF , T;
DR O42354 , MDM2_DANRE , T; Q7YRZ8 , MDM2_FELCA , T;
DR P56951 , MDM2_HORSE , T; Q00987 , MDM2_HUMAN , T;
DR Q60524 , MDM2_MESAU , T; P23804 , MDM2_MOUSE , T;
DR P56273 , MDM2_XENLA , T; Q2HJ21 , MDM4_BOVIN , T;
DR Q7ZUW7 , MDM4_DANRE , T; O15151 , MDM4_HUMAN , T;
DR O35618 , MDM4_MOUSE , T; Q5XIN1 , MDM4_RAT , T;
DR Q7ZYI3 , MDM4_XENLA , T; Q3MHN7 , NEIL3_BOVIN, T;
DR Q8TAT5 , NEIL3_HUMAN, T; Q8K203 , NEIL3_MOUSE, T;
DR A0A1L8HU22, NEIL3_XENLA, T; H2KYU6 , NPL41_CAEEL, T;
DR Q95QZ9 , NPL42_CAEEL, T; Q9VBP9 , NPL4_DROME , T;
DR Q8TAT6 , NPL4_HUMAN , T; P60670 , NPL4_MOUSE , T;
DR Q9ES54 , NPL4_RAT , T; Q9VXE6 , NU153_DROME, T;
DR P49790 , NU153_HUMAN, T; P49791 , NU153_RAT , T;
DR Q640Z6 , NU153_XENLA, T; Q8RXW0 , RBL14_ARATH, T;
DR P98175 , RBM10_HUMAN, T; Q99KG3 , RBM10_MOUSE, T;
DR P70501 , RBM10_RAT , T; A0JMV4 , RBM5A_XENLA, T;
DR Q6DDU9 , RBM5B_XENLA, T; Q1RMU5 , RBM5_BOVIN , T;
DR P52756 , RBM5_HUMAN , T; Q91YE7 , RBM5_MOUSE , T;
DR B2GV05 , RBM5_RAT , T; A4IGK4 , RBM5_XENTR , T;
DR A0A0B4K7J2, RBP2_DROME , T; P49792 , RBP2_HUMAN , T;
DR Q9ERU9 , RBP2_MOUSE , T; H2QII6 , RBP2_PANTR , T;
DR Q92804 , RBP56_HUMAN, T; Q96EP0 , RNF31_HUMAN, T;
DR Q924T7 , RNF31_MOUSE, T; Q7SYB3 , RYBPA_DANRE, T;
DR Q5EG55 , RYBPB_DANRE, T; Q8N488 , RYBP_HUMAN , T;
DR Q8CCI5 , RYBP_MOUSE , T; E1BDF2 , SHRPN_BOVIN, T;
DR Q9H0F6 , SHRPN_HUMAN, T; Q91WA6 , SHRPN_MOUSE, T;
DR Q9EQL9 , SHRPN_RAT , T; F4JCU0 , SUA_ARATH , T;
DR Q94KD0 , TA15B_ARATH, T; Q5RFW2 , TAB2_DANRE , T;
DR Q9NYJ8 , TAB2_HUMAN , T; Q99K90 , TAB2_MOUSE , T;
DR Q5U303 , TAB2_RAT , T; Q8N5C8 , TAB3_HUMAN , T;
DR Q571K4 , TAB3_MOUSE , T; Q7ZXH3 , TAB3_XENLA , T;
DR Q9AST1 , TAF15_ARATH, T; Q9VH90 , TRBID_DROME, T;
DR Q9BXU3 , TX13A_HUMAN, T; Q8S9K3 , VAR3_ARATH , T;
DR Q8IY57 , YAF2_HUMAN , T; Q99LW6 , YAF2_MOUSE , T;
DR P87143 , YDMD_SCHPO , T; Q5ZLX5 , ZRAB2_CHICK, T;
DR O95218 , ZRAB2_HUMAN, T; Q9R020 , ZRAB2_MOUSE, T;
DR Q19QU3 , ZRAB2_PIG , T; Q5R580 , ZRAB2_PONAB, T;
DR O35986 , ZRAB2_RAT , T; E1BB03 , ZRAB3_BOVIN, T;
DR Q5FWF4 , ZRAB3_HUMAN, T; Q6NZP1 , ZRAB3_MOUSE, T;
DR A6QP16 , ZRAN1_BOVIN, T; Q9UGI0 , ZRAN1_HUMAN, T;
DR Q7M760 , ZRAN1_MOUSE, T; B1H2Q2 , ZRAN1_XENTR, T;
DR Q5U595 , ZRN1A_XENLA, T; A0JMQ9 , ZRN1B_DANRE, T;
DR Q6NUB7 , ZRN1B_XENLA, T;
DR Q9FFN9 , ARI13_ARATH, N; Q9FFP1 , ARI14_ARATH, N;
DR Q84RQ8 , ARI15_ARATH, N; Q9C5A4 , ARI16_ARATH, N;
DR Q8GXJ1 , HDA15_ARATH, N; Q8IPJ3 , LUBEL_DROME, N;
DR Q9W1A4 , TAMO_DROME , N; A0A0J9YWL9, TX13C_HUMAN, N;
DR A0A0J9YY54, TX13D_HUMAN, N; O43038 , VPS36_SCHPO, N;
DR Q06696 , VPS36_YEAST, N; Q8GZ43 , YZR3_ARATH , N;
3D 1N0Z; 1NJ3; 1Q5W; 2C6A; 2C6B; 2CR8; 2CRC; 2D9G; 2EBQ; 2EBR; 2EBV; 2GQE;
3D 2K0C; 2K1P; 2LK0; 2LK1; 2MXV; 2WWZ; 2WX0; 2WX1; 3A9J; 3A9K; 3B08; 3B0A;
3D 3CH5; 3G9Y; 3GJ3; 3GJ4; 3GJ5; 3GJ6; 3GJ7; 3GJ8; 4OWF; 4S1Z; 4XXB; 5AF6;
3D 5YVG; 5YVH; 6G99; 7E62;
PR PRU00322;
DO PDOC50199;
//
