KEGG   Viruses: 11256996
Entry
11256996          CDS       T40000                                 
Symbol
mg339, MegaChil__gp0339
Name
(RefSeq) Megavirus chiliensis; RNA polymerase beta subunit
Virus
1094892  Megavirus chiliensis
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb2_6 RNA_pol_Rpb2_1 RNA_pol_Rpb2_7 RNA_pol_Rpb2_4 RNA_pol_Rpb2_2 RNA_pol_Rpb2_3 RNA_pol_Rpb2_5 LAGLIDADG_3 NatB_MDM20
Other DBs
NCBI-GeneID: 11256996
NCBI-ProteinID: YP_004894390
RS: NC_016072
UniProt: G5CSE9
Position
NC_016072:complement(join(341204..341535,343136..345914,347310..348857))
AA seq 1552 aa
MSKKSKEVEDVDNKYDPEPFFGLLDLFFERSGQILVSHHIDSFNQLIEETIPSILQSGEN
IISEKTTENKVIRYRLTFDDLGIKPPSLDNDEGLLYPLDAIRKQLSYSSKYTATVTQWQD
IVDISTGNTETRIIGAPEKDVPIAKIPIMVKSKYCNLTLRPDLSCRHCKYDAGGYFIING
SEKVVLSVESMIRRKPMVFTQKDQNSLIYYVRVLSQPPTQLVGNPQTFTIRMKKDNSIIL
SVPYFKDVSIFTLIRAMGIENDEDIVDAILDVRREKDLLNQLSISMNLQNSPSMTQEEAM
EKMIDSLKSTKTYSESNPETRAKQRRKYVEKIMKQYILPHVSSGTNNPKIDMLYKAYYIC
YMIHKLLKCYTKNSKDVEEYRGCDDRDSMVNKRIMLTGTLLGSLFKQFYEKMINDCNKIF
RTKNADDKKPPNIIPHIKANTIEQGLRQALSTGVFGTQSLKGLSQMLNRMNHLHSLSYLR
RVITPTVDASTNKMTSPRHLHNTQYGSVDPLETPEGPKTGIVKNMTMTEYITISMNSQIP
IIENYLSGKLITLESVNKKRLHTYVKVFLNGNWLGVTDNIIKIHNDLRNMRFRGEIHKHV
SFDLNFKLAEFNIYTDGGRLIRPYLTVTENKLNFKPEMLDQVNSWDEFIAKFPNVIEFVD
KEEEQNMMLAVFPHYIEQAQKLMMQKSLRNAKDIDKVNRTNRYDGHVYQRYTHCEIHPCM
ILGLISSNIPFPDHNQSPRGIFQYNQARQAMGLYISDYRERTDISYILYHSQIPLVTSRA
SKYTGTHIFPSGENSIVAIASYTGFNQEDSLLMNESAIQKGYMRAQALKKYFETIKKNPA
SSQTGIFMKPDPNKVDNLKDANYDKLSEEGYAKVETVIRDGDVIIGMVNPKPTTREDEKP
YKDNSTIYKSLVPGAIDKVITEVNNDGYPIIKIRVRSERIPAVGDKFSSRAGQKGTVGFK
IHRADLPFTKSGLIPDIIINPNCMPKRMTIGQLIECLLGKVCAIKGVYGDATPFTGVNIN
KINDDLVALGHEAWGNETMYNGMTGQRMEVKIFIGPTYYQRLKQMVGDKTHCLSTDHEVL
TLNGWKYNHQLSMNDKIATLVNKELVYQNPIKILDYPNYKGDMYHIKNQQIDLMVTPNHR
MWVSKRFGRKNEWLDHDFESAEDIIGKRRKYKKDANWNAIDYQFKLPSIICNNGIVYPEK
DVDMDSWLKFFGIWIAEGWTTSTPDNRWPNSKSHRVEICQCKKRVIKELVPAIKKLGYHY
RQYKDKFIINNKQLFNYMKQFSVGASNKFLPDWVWCLSSRQAIILLESMILGDGSYHGSS
VVYYTSSIKLADNVMQLALHCGWSSNKWLHLKAGNETIIEGRNVKSNHDIWRLAIIKSKN
NPEVNHGHTKEQNAQTEEIIKDYNKPVFCLEVPGGVFYVRKNGKSVWTGNSRARGATQLL
TRQPPEGRSRDGGLRIGEMERDAICAHGLAQFLKERLVDNSDIYTAYVCDMCGMFAHKVP
DKKYYTCTGCQNSTSISKIVIPYAFKLLMQELASINILGRIRTSKSIVTPRS
NT seq 4659 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtccaaaaagagtaaagaagttgaagatgtagataataaatatgatcccgaaccattt
tttggtcttttggacttattttttgaaagaagtggacaaatattagtaagtcatcatatt
gattcttttaatcaacttattgaagaaactatccccagtattttacaatctggagaaaat
attatttctgaaaaaactacagaaaataaagtaattagatatcgtctcacttttgacgat
ttaggaattaaacctccttctcttgataatgatgaaggattattatatccgcttgatgca
attcgaaaacaattatcatattcttctaaatatacagcgactgtaacacaatggcaagat
attgttgatattagtacaggaaatactgaaacacgtattattggtgcacctgaaaaagat
gtaccaattgctaaaatacccattatggtcaaaagtaaatattgtaatttaactttgaga
ccagatttgtcttgtcgacattgtaaatacgatgctggtggatattttattataaacggt
agcgaaaaagtagtattgtctgtggaatccatgattcgtagaaaaccaatggtttttact
caaaaagatcaaaattctttaatttattatgtgcgagtattgtcacaaccaccaacacaa
ctagttggtaatccgcaaacttttaccattcgtatgaaaaaagataattcaattatatta
tctgtaccatattttaaagatgtttcaattttcacattaattcgagcaatgggaatagaa
aatgacgaagatattgttgatgctattctagatgttagacgagaaaaagatcttttgaat
cagttatcaatttctatgaatttacaaaattcaccttccatgacacaagaagaagctatg
gaaaaaatgatagatagtttgaaatctaccaaaacttattctgaatctaatcctgaaaca
agagctaaacagagaagaaaatatgtggaaaaaattatgaaacaatatatattaccacat
gttagttctggtacaaataatcctaaaattgatatgttatacaaagcatattatatttgt
tatatgatacataaattacttaaatgttacactaaaaatagcaaagatgtagaagaatat
cgtggttgcgatgatagagattcaatggttaataaaagaattatgttaactgggacatta
ttgggatctttattcaaacaattttatgagaaaatgataaatgattgtaataaaatattt
agaacaaaaaatgctgatgataaaaaacctccaaatattattccacacatcaaagcaaat
actattgaacaaggattacgtcaagctttatcaactggtgtatttggaacacaatctctc
aaaggtttatctcaaatgttaaatagaatgaatcatttacattcactttcatatttgcgt
cgtgttattacaccaactgttgacgcatctactaataaaatgaccagtccacgtcattta
cataatacacagtacggatctgttgatccattggaaactccagagggtccaaaaacagga
attgttaaaaatatgacaatgacagaatatattacaataagtatgaattcacaaatacca
attattgagaattatttatccggaaaattaattacacttgaatctgttaataagaagcga
ttacacacatatgttaaagtatttttgaatggtaattggcttggtgtaacagataacatt
attaaaatacataatgatcttagaaatatgagattcagaggagaaattcacaaacatgtt
tcttttgatttaaatttcaaattggctgaatttaatatttatactgatggtggtaggtta
ataagaccttatcttaccgtgactgaaaacaaacttaatttcaaaccagaaatgttagat
caagttaattcttgggatgaatttatagccaaattcccaaatgtgatagaatttgttgac
aaagaagaagaacaaaatatgatgttggctgtatttccacattatattgaacaagcacaa
aaattaatgatgcaaaaatcattacgtaatgctaaagatattgataaagtgaatagaact
aatcgatatgatggtcatgtatatcaaagatatacacattgtgaaatacatccttgtatg
attttgggattaatttcttcgaatattccgttcccagatcacaatcaatcacctcgtggt
attttccaatacaatcaagctagacaagctatgggattatatatctctgattatcgtgaa
agaactgatattagttacatactttatcattctcaaataccacttgtaacatcacgagca
tccaaatatactggaacacatattttcccgtctggagaaaatagtattgtagcaattgca
agttatacagggtttaaccaagaagattcattgttaatgaatgaatcagcaattcaaaag
ggatatatgagagcccaagcactcaaaaaatattttgaaacaattaaaaagaatccagca
tcatcacaaactggtatatttatgaaaccagatccaaataaagtagataatttgaaagat
gctaattatgataaattatccgaagaaggatatgctaaagtagagacagttattcgtgat
ggtgatgttattattggtatggttaatcccaaaccaacaactcgtgaagatgaaaaacct
tacaaggataattcaacaatttataagtcactcgttcctggagccatcgataaagttatt
acagaagttaataatgatggatatcctattattaagattcgagttagatcagaaagaatt
ccagcagtaggtgataaattctcatcaagagctggacaaaaaggaacagttggatttaaa
attcatcgtgcagatcttccattcacaaaatcaggattaattcctgatattattattaat
cctaattgtatgcccaaacgtatgacgataggtcaattaattgaatgtttactaggtaaa
gtttgtgcaattaaaggggtatatggagatgcaactccatttacaggagttaatattaat
aaaattaatgatgatttagtagctttaggacatgaagcatggggaaatgaaacaatgtat
aatggaatgacgggacaaagaatggaagttaaaatattcattggtccaacatattatcaa
cgtctcaaacaaatggtgggagataaaacccattgtttaagcacagatcatgaagtatta
actcttaatggatggaaatataatcatcaactaagcatgaatgataaaattgccacacta
gttaataaggaattagtttatcaaaatccaataaaaatacttgattatccaaattataaa
ggtgatatgtatcatattaaaaatcaacaaatagatctaatggtaacaccaaatcatcgt
atgtgggtttctaaaagatttggtcgtaaaaatgaatggttagatcatgattttgaatca
gctgaagatattattggaaaacgtcgtaaatacaaaaaagatgctaactggaatgctatt
gattatcaattcaaattaccgagtataatttgtaacaatggcatagtatacccagaaaaa
gatgtggatatggattcctggcttaaatttttcggaatatggatagctgaaggatggact
acatctacaccggataatagatggccaaacagtaaatctcatcgcgtagaaatatgtcaa
tgtaaaaaacgggttattaaagaattagttcctgcaatcaaaaaattaggatatcattac
agacaatacaaagataaatttataataaataataaacagttgttcaattatatgaaacaa
tttagtgtaggagcttccaataaatttttaccagattgggtatggtgtttaagttcacga
caagcaataatattattggaaagtatgatattaggtgatggatcatatcatggatcaagt
gttgtgtattatacatcatcgattaaattggcagataatgttatgcaattggctttacat
tgtggatggtcaagtaataaatggcttcatttaaaagcaggtaatgaaacaataatagaa
ggtaggaatgtcaaatccaatcatgatatatggagacttgcaattatcaagtcaaaaaat
aatccagaagttaatcatggtcacacaaaagaacaaaatgcacagacagaagaaattatt
aaagattataataaaccagtcttttgtttagaagttccaggtggagtattttatgttaga
aaaaatgggaaatcggtttggactggtaattcacgcgcgagaggagcaacacaattactt
acgaggcagcctccagagggaagaagtagggatggtggattaagaataggtgaaatggaa
agggacgcaatatgtgcacatggattagcacagttcctaaaagaaagattagttgacaat
tcagatatttatacagcatatgtatgtgacatgtgtggtatgtttgcgcacaaagtaccc
gataaaaaatattacacatgtactggctgtcaaaattcaacaagcatatcaaaaatagta
attccatatgcattcaaactattgatgcaagaattagcatcgattaatattctgggaaga
attcgaacatcaaagtcaattgtgacacccagatcataa

  All links  
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (152)   
   RefGene (150)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
Protein domain (9)   
   Pfam (9)   
Taxonomy (1)   
   TAX (1)   
All databases (165)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system