BLAST Search
BLAST
FASTA
KEGG2
Enter query sequence:
Sequence data
>NC_008576 (refseq) complement(876789..897890) /translation= MAEDTGNQTPTVQVTADDGEEARQNLDDMTVLQNDNSVNLDAEQQQGHDGSRNQNEDLQS MSTIQMGSRVIPNESVTTDAEIAAVESGTVEVEKTDNEAPVQAESNSVDAQEADGGDFAI TPPTAGIASQAGFQFGLPETEVAIPANNESEPNAAVDEPAAIATPEQTAFAPEATTPEVV EEEVAAEEEAVVEEETPDETEVDDTLLADGITLTPEAAAGNEDGWIDINLNVSQEDGAEQ LVVKIEGVPEGSEIRSDAADAFLAENPDAENPIVDNGDGTWTITGDFADGLQLLPPADSN EDFTLNVTATTTETSSGLSNTVTADLNVTVASVADAPELSAADATGNEDATTIPLNIETA ITDMDGSESITSVVISGVPDTVTLSAGTDNGDGTWTLEAGDLDGLSATVDGNVSGVFDMG VTVNVLDVDGDSGGDDTTSSSTSFTLTVNPDADEVTFTAGSASGAEDSWIDVNSSFAVTD TDGSEAVTGVTITGIPEGATLQMADGTPIEITDGSATLSMDQVTDNGDGSYSLAGLQVMA PADSNENFELGIRVTTTDDNGVSTDSEITTGSISVEVASVADAPDLSAADATGNEDATTI PLNIETAITDMDGSESITSVVISGVPDTVTLSAGTDNGDGTWTLEAGDLDGLSATVDGNV SGVFDMGVTVNVLDVDGDSGGDDTTSSSTSFTLTVNPDADEVTFTAGSASGAEDSWIDVN SSFAVTDTDGSEAVTGVTITGIPEGATLQMADGTPIEITDGSATLSMDQVTDNGDGSYSL AGLQVMAPADSNENFELGIRVTTTDDNGVSTDSEITTGSISVEVASVADAPDLSAADATG NEDATTIPLNIETAITDMDGSESITSVVISGVPDTVTLSAGTDNGDGTWTLEAGDLDGLS ATVDGNVSGVFDMGVTVNVLDVDGDSGGDDTTSSSTSFTLTVNPDADEVTFTAGSASGAE DSWIDVNSSFAITDTDGSEAVTGVTITGIPEGATLQMADGTPIEITDGSATLSMDQVTDN GDGSYSLAGLQVMAPADSNDNFELGIRVTTTDDNGATTDSEITNGTISVEVASVADAPEL SAGDVTGGEDATTIPLDIASAVTDMDGSESITSVVISGVPDTVTLSAGTDNGDGTWTLEA GDLDGLSATVDGNVSGVFDMGVTVNVLDADGDSGGDDTSSASTSFTLTVNPDADEVTFTA GSASGAEDSWIDVNSSFAVTDTDGSEAVTGVTITGIPEGATLQMADGTPIEITDGSATLS MDQVTDNGDGSYSLAGLQVMAPADSNENFELGIRVTTTDDNGVSTDSEITNGTISVEVSS VADAPELSAGDVTGGEDATTIPLDIASAVTDMDGSESITSVVISGVPDTVTLSAGTDNGD GTWTLEAGDLDGLSATVDGNVSGVFDMGVTVNVLDADGDSGGDDTSSASTSFTLTVNPDA DEVTFTAGSASGAEDSWIDVNSSFAVTDTDGSEAVTGVTITGIPEGATLQMADGTPIEIT DGSATLSMDQVTDNGDGSYSLAGLQVMAPADSNENFELGIRVTTTDDNGVSTDSEITNGT ISVEVSSVADAPELSAGDVTGGEDATTIPLDIASAVTDMDGSESITSVVISGVPDTVTLS AGTDNGDGTWTLEAGDLDGLSATVDGNVSGVFDMGVTVNVLDADGDSGGDDTSSASTSFT LTVNPDADEVTFTAGSASGAEDSWIDVNSSFAVTDTDGSEAVTGVTITGIPEGATLQMAD GTPIEITDGSATLSMDQVTDNGDGSYSLAGLQVMAPADSNENFELGIRVTTTDDNGVSTD SEITNGTISVEVASVADAPELSAGDVTGGEDATTIPLDIASAVTDMDGSESITSVVISGV PDTVTLSAGTDNGDGTWTLEAGDLDGLSATVDGNVSGVFDMGVTVNVLDVDGDSGGDDTT SSSTSFTLTVNPDADEVTFTAGSASGAEDSWIDVNSSFAVTDTDGSEAVTGVTITGIPEG ATLQMADGTPIEITDGSATLSMDQVTDNGDGSYSLAGLQVMAPADSNENFELGIRVTTTD DNGVSTDSEITNGSISVEVSSVADAPELSAGDVTGGEDATTIPLDIASAVTDMDGSESIT SVVISGVPDTVTLSAGTDNGDGTWTLEAGDLDGLSATVDGNVSGVFDMGVTVNVLDADGD SGGDDTSSASTSFTLTVNPDADEVTFTAGSASGAEDSWIDVNSSFAVTDTDGSEAVTGVT ITGIPEGATLQMADGTPIEITDGSATLSMDQVTDNGDGSYSLAGLQVMAPADSNENFELG IRVTTTDDNGVSTDSEITTGSISVEVASVADAPELSAADATGNEDATTIPLNIETAITDM DGSESITSVVISGVPDTVTLSAGTDNGDGTWTLEAGDLDGLSATVDGNVSGVFDMGVTVN VLDADGDSGGDDTSSASTSFTLTVNPDADEVTFTAGSASGAEDSWIDVNSSFAVTDTDGS EAVTGVTITGIPEGATLQMADGTPIEITDGSATLSMDQVTDNGDGSYSLAGLQVMAPADS NENFELGIRVTTTDDNGVSTDSEITTGSISVEVASVADAPELSAADASGNEDATTIPLDI AAAVTDTDGSESITSVVISDVPDTVTLSAGTDNGDGTWTLSVEDLDGLSATVDGDVSGVF NMGVTVNVLDVDGDSGGDDTTSVSSQFTLTVNPEADGVEITAGSASGSEDQWISVNEPTF IIQDSDGSESVTGVTITGIPEGTELRLADGTEITVEADGTAVIPMGAVSETATEGTFTID GLEIKAPSDSNVDFSLGITVETTDTNGVTSDTVLDSGAINVEVVSVADAPDLVANDVTGN EDAATINLDIATAVTDVDGSESISSVVITNVPESMTLSAGTDNGDGTWTLEVGDLEGLTA SVEGDLSGSWDLGVTVNVLDADADGAAGDDVTSRSTNFTVTVTPDADGVTITDGSGSGVE DQWISVNEPLFEIQDTDGSETVTGVTITGIPEGAEVRMDDGTAIEVTDGSATIPMSYVTD LGDNTFTINGLEVKAPADSNANFSLGIDIETTDSNGVTSDTTIDSGSISIEVISDADAPD LSAGDVTGGEDATTIPLDIASAVTDMDGSESITSVVISGVPDTVTLSAGTDNGDGTWTLE AGDLDGLSATVDGNVSGVFDMGVTVNVLDADGDSGGDDTTSASTSFTLTVNPDADEVTFT AGSASGAEDSWIDVNSSFAVTDTDGSEAVTGVTITGIPEGATLQMADGTPIEITDGSATL SMDQVTDNGDGSYSLAGLQVMAPADSNENFELGIRVTTTDDNGVSTDTEITNGSISVEVA SVADAPELSAGDVTGGEDATTIPLDIASAVTDMDGSESITSVVISGVPDTVTLSAGTDNG DGTWTLEAGDLDGLSATVDGNVSGVFDMGVTVNVLDADGDSGGDDTSSASTSFTLTVNPD ADEVTFTAGSASGAEDSWIDVNSSFAVTDTDGSEAVTGVTITGIPEGATLQMADGTPIEI TDGSATLSMDQVTDNGDGSYSLAGLQVMAPADSNDNFELGIRVTTTDDNGATTDSEITNG TISVEVASVADAPELSAGDVTGGEDATTIPLDIASAVTDMDGSESITSVVISGVPDTVTL SAGTDNGDGTWTLEAGDLDGLSATVDGNVSGVFDMGVTVNVLDADGDSGGDDTSSASTSF TLTVNPDADEVTFTAGSASGAEDSWIDVNSSFAVTDTDGSEAVTGVTITGIPEGATLQMA DGTPIEITDGSATLSMDQVTDNGDGSYSLAGLQVMAPADSNDNFELGIRVTTTDDNGATT DSEITTGTISVEVASVADAPELSAGDVTGGEDATTIPLDIASAVTDMDGSESITSVVISG VPDTVTLSAGTDNGDGTWTLEAGDLDGLSATVDGNVSGVFDMGVTVNVLDADGDSGGDDT SSSSTSFTLTVNPDADEVTFTAGSASGAEDSWIDVNSSFAVTDTDGSEAVTGVTITGIPE GATLQMADGTPIEITDGSATLSMDQVTDNGDGSYSLAGLQVMAPADSNVDFELGIRVTTI DDNGATTDTEITNGTISVEVTGVADDPSLTVNDTTGTEDQAITLDISGGLADVDGSETLV VTIGGVPAGAQLSAGTDNGDGTWTITSTGDAPVDFSAIQLTDLPEDYSGKFDLDVSWNLN DVGDDGVTVDDSLNGSSSFTVTVNPDADAPDLNVGDVVGQEDATSIPLDIAAAVTDTDGS ESITSVVISDVPDTVTLSAGTDNGDGTWTLSVGDLDGLSATVDGDVSGVFNMGVTVHVLD DGANSGGTDTTSVSSQFTLTVNPEADGVEITAGSASGREDQWISVNEPTFALQDTDGSES VTGVTLTGIPDGTEIRLADGTEITVNADGTAVIPMGAVTETATEGTFTIDGLEIKAPSDS NVDFSLGITVETTDSNGVTSDTVLDSGAINVEVVSVADAPDLVANNVAGNEDAATIPLDI AAAVTDMDGSESITSVVISGVPDTVTLSAGTDNGDGTWTLEAGDLDGLSATVDGDVSGVF DMGVTVNVLDADADGAAGDDTTSRSTSFTLTVNPDSDGVSIVDGSASGLEDQWISVNEPV FTLLDTDGSEHVTGVVITGIPAGAELQMSDGTPINVNNGRATIPMDYVVEGDAENSYTIN GLEIKAPADSNVDFELGIRVTTTDSNGVTNDTARTNGTISVEVTGVADDPSLAFNDTTGT EDQAITLDISGGLADVDGSETLVVTIGGVPAGAQLSAGTDNGDGTWTITSTGDAPVDFSA IQLTDLPEDYSGQFGLDVSWNLNDYAEDGVTVDDALSGSSSFTVTVNPDADEVSVTSSAS GSEDSWIDVSTSFAITDNDGSESVGSVTFSGLPAGASLQIVDPDSGDIIDLGTSTGTGDS FTIPAEYVVTSDHENFEVVGLQVQAPADSNVDFNMNLNVEVTDDNGITTDTITSTNAVHV EVVGVADGVQNMADAQDVDVREDNWFYLNSSSNGPGISSDLIDTDGSEQIFYQINADSSD VKLQVKVGNNWTTQSTDGDGNWNVSAADVDSGKVRMYGGSNEDSDFTVNVNAYTKDFAED GSTVDDVSSLQSTSFSVNVQSDADGTKISFSGAGVEDTAITINNSIQLNDTDGSESLQGP VIISGVPEGATLSIVGDNAGFIHDNGDGSYSIDQEALSPTANNAHGDYKWEIPGLTFTPA ENDSTDVKLTFTTTTVEATDDGNGYATQLTSKAVTIRVDADADGATINTVDAHGLEDHAI SLEPTITLNGDIDGSETILGDVIITSDDPGAAGATMVVNGVTIQSSSHTVTTPVTDGAGN VVLGDNGKPQTTTETTTTWRVPTALLSVTVDGDGNTTGWTFDTMTVTPPENSDADFQLDF ALVISDDGQDTAMATGSIHVEVDAVADAPELSVGNVGGTEDTAISLNINAALVDVDGSES MSVVIAGVPSGAMLSAGTDNGDGTWTLEPGDLQGLTITPPAQSNDAMHLTVTATSTESNP TTDQDAGTVDTPSASTSASFSVTVIGDADAAEFGDLSASMVEDQVVAGAPNGSVLLDLTS ITLGADADDNSEQLSVVLSIPNDAPAGTYLWAPEADDLSYAGNGNWVVSEDAMGSIRLVT PEDYSGEINVDVAITVTERGFQVDDQGNLMLDGNGERIELTGGDKWTTTEQFHVTVIADA DEPHISIQAAGHEDMDGGIPFTISPSVTDGNAHGGAEVITSVTVSDIPANVVLMQDGLPL TPDADGNYVFEPDNLDGLTLVTPTHSNEDFQVTVTATAMDNNGDVESNSVVHTVDVVGVA DGVNDLVAGQSADATALVLQIAKGTNSAHAGEFEIFIDGESVGTYQTDVFHNNGNDAWDT LTINDVDFSQVDPNSITFQPTSNQSNILIKGVEIAGHTYDPTNGSGDFSVNGDGDGGDYV RMAGNGKELSLDLSGTDFSDMPLNNDIASDGVHQIPIQIESTMIDQDGSESRYYIVSDVP DGAFLAAGVDSDGNAIHAGINAGEGQWIVTEDQLGALHIVPQGGLVTGDHFDITVTAVTV ENDGDVNFDSHVTVSIHIDTDLDQSYNPGPGNGHPNSDVAWDGEVSGVSISSGGVGNEDS SIDMGITATSLQGNAGGNDDNDNQGQGSGNHGSGNDGQGSGNHASGNSGQGSGNHGSGNH GSGNHGSGNSGQGSGNHASGNSGHGSGNHASGNSGHGSGNHSSGNSGHGSGNHASGNSGH GSGNHSSGNSGHGSGNHASGNSGHGSGNHSSGNSGHGSGNHSSGNSGHGSGNHASGNSGH GSGNHASGNSGHGSGNHASGNSGHGSGNGGQCSGGHGQNSGNNAIEPPPAADAGNAQSSS AGSEITSFVIADADLPEGASLSAGIFNPLNGTWVFTAEQVETLEVTPPEDFSGEMNIPMQ AITIDVNGQELVQDHIVTVDVNAITDGPNIHISPVGGMEDSAIEIQVTLNMPDADGSETL SGVVIVEGVPEGATLSLGEQNPDTGNWEIPVAELTVTGSAEDGTATSWRTDGLTLTPPED GNTNFNLTFKATGGEGGVDGAEDITVSATVNVNVVADADDVLLTVQDQVVTGLEDTGFEL EGLSAVLDGSGAESINVVISGFPEGTTFSHGFNNGDGTWSVAPDDLDDLSVKPPVDFSGN MDLQLTSYSVDRDPDTGEIDIQANSSAEFTVTFEADADIFNASAEDAAGIENSAISLNLS AASLDMSDASPETMLIILDGLPDGSQLSAGTDNGDGTWSLTGDQLNGLTMTPPEEFTGTI HVTMSVSSDQNNVNVVDMDLGFTIEVDDTPVVTMDEMLVYDDIGDGLVDIGSHITITDTD SQNFSGATIAITDGEGAGDSFSFNGFQVSELVADDGSSTFMIDGTNITVSGGGFGGEGDL VLSGVESTDTYENVLHSIQLDVDEPGTRSLSVEVTDEEGATSEAGLFDVAVTQDEIQGTA GDDVMTGTDGNDHLSGGDGNDIFQGGMGDDILSGGAGDDLFIFGMNDGSDFISGGADYND VIRMDGMTSDPVLDLGDVGNWTIDTNSDFTLQTIDVGGDVFDAITFDAGDAAGYITLEDG TQIDFDGIDQIIW
Select program and database:
BLASTP (prot query vs prot db)
BLASTX (nucl query vs prot db)
KEGG GENES
Eukaryotes
Prokaryotes
Viruses
Favorite
organism code or category
KEGG MGENES
Environmental
Organismal
Favorite
samples
Microbial Reference Genes
Ocean (OM-RGC)
Human gut (IGC)
nr-aa (GenBank, UniProt, RefSeq and PDBSTR)
Swiss-Prot
UniProt
RefSeq
PDBSTR
UniRef50
UniRef90
UniRef100
Virus-Host Database
BLASTN (nucl query vs nucl db)
TBLASTN (prot query vs nucl db)
KEGG GENES
Eukaryotes
Prokaryotes
Viruses
Favorite
organism code or category
KEGG MGENES
Environmental
Organismal
Favorite
samples
KEGG GENOME
Favorite
organism code or category
Microbial Reference Genes
Ocean (OM-RGC)
Human gut (IGC)
Ocean (MATOU)
EGENES
nr-nt (GenBank, EMBL and RefSeq)
dbEST
dbGSS
HTGs
dbSTS
RefSeq
Ribosomal Databases
SILVA (SSU, 16S/18S)
SILVA (LSU, 23S/28S)
PR2 (Protist Reference)
RDP (Prokaryotic 16S)
RDP (Fungal 28S)
EPD
Virus-Host Database
CDS
Genomes
Scoring matrix:
BLOSUM62
BLOSUM80
PAM30
PAM70
PAM250
(except for BLASTN)
Filter:
None
DUST in BLASTN, SEG in others
Output options:
Set the maximum number of database sequences to be reported:
Set the maximum number of alignments to be displayed:
Optional parameters:
(see
manual
for details)
E-value threshold
Alignment view:
Pairwise
master-slave with identities
master-slave without identities
flat master-slave with identities
flat master-slave without identities
Get ASN.1 for SeqAnnot
Get ASN.1 for the Blast Object
(except for BLASTX)
Additional options:
(delimited by whitespaces)
Feedback
KEGG
GenomeNet
Kyoto University Bioinformatics Center