KEGG   Coturnix japonica (Japanese quail): 107309082
Entry
107309082         CDS       T04297                                 
Symbol
COL1A2
Name
(RefSeq) collagen alpha-2(I) chain
  KO
K06236  collagen type I alpha
Organism
cjo  Coturnix japonica (Japanese quail)
Pathway
cjo04510  Focal adhesion
cjo04512  ECM-receptor interaction
cjo04820  Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:cjo00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    107309082 (COL1A2)
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    107309082 (COL1A2)
  09142 Cell motility
   04820 Cytoskeleton in muscle cells
    107309082 (COL1A2)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:cjo00536]
    107309082 (COL1A2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:cjo00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   107309082 (COL1A2)
SSDB
Motif
Pfam: Collagen COLFI
Other DBs
NCBI-GeneID: 107309082
NCBI-ProteinID: XP_015709029
Position
2:21486997..21522511
AA seq 1363 aa
MLSFVDTRILLLLAVTSYLATSQHVSEASAGRKGPRGDKGPQGERGPPGPPGRDGEDGPA
GPPGPPGPPGLGGNFAAQYDPSKAADFGPGPMGLMGPRGPPGASGPPGPPGFQGVPGEPG
EPGQTGPQGPRGPPGPPGKAGEDGHPGKPGRPGERGVAGPQGARGFPGTPGLPGFKGIRG
HNGLDGQKGQPGTPGTKGEPGAPGENGTPGQPGARGLPGERGRVGAPGPAGARGSDGSAG
PTGPAGPIGAAGPPGFPGAPGAKGEIGPAGNVGPTGPAGPRGEIGLPGSSGPVGPPGNPG
ANGLPGAKGAAGLPGVAGAPGLPGPRGIPGPPGPAGPSGARGLAGEPGPAGAKGESGNKG
EPGAAGPPGPPGPHGEEGKRGSNGEPGSAGPPGPAGLRGVPGSRGLPGADGRAGVMGPAG
NRGASGPVGAKGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGQPGSPGPAGKEGPVGFPGADGRVGPIG
PAGNRGEPGNIGFPGPKGPTGEPGKPGEKGNVGLAGPRGAPGPEGNNGAQGPPGVTGNQG
AKGETGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEAGKPGERGLHGEFGVPGPAGPRGERGLPGESGAVG
PAGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGNAGPAGAPGPAGPGGIPGERGVAGVPGGKGEKGAPG
LRGDAGATGRDGARGLPGAIGAPGPAGGAGDRGEGGPAGPAGPAGARGIPGERGEPGPVG
PSGFAGPPGAAGQPGAKGERGPKGPKGETGPTGAIGPIGASGPPGPIGAAGPAGPRGDAG
PPGMTGFPGAAGRVGPPGPAGITGPPGPPGPAGKDGPRGLRGDVGPVGRTGEQGIAGPPG
FAGEKGPSGEAGAAGPPGTPGPQGILGAPGILGLPGSRGERGLPGIAGATGEPGPLGVSG
PPGARGPSGPVGSPGPNGAPGEAGRDGNPGNDGPPGRDGAPGFKGERGAPGNQGPSGPLG
APGPHGQVGPSGKPGNRGDPGPAGAVGPAGAFGPRGLAGPQGPRGEKGLPGDKGHRGLPG
LKGHNGLQGLPGLAGQHGDQGPPGNNGPAGPRGPPGPSGPPGKDGRNGLPGPIGPAGVRG
SHGSQGPAGPPGPPGPPGPPGPNGGGYEVGFDAEYYRADQPSLRPKDYEVDATLKTLNNQ
IETLLTPEGSKKSPARTCRDLRLSHPEWSSGFYWIDPNQGCTADAIRAYCDFATGETCIH
ANPEDIPTKTWYVSKNPKEKKHIWFGETINGGTQFEYNGEGVTTKDMATQLAFMRLLANH
ASQNITYHCKNSIAYMDEETGNLKKAVILQGSNDVELRAEGNSRFTFSVLVDGCSKKNNK
WGKTIIEYRTNKPSRLPILDIAPLDIGGADQEFGLHIGPVCFK
NT seq 4092 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgctcagctttgtggatacgcggattttgttgctgctcgcagtaacttcatacctagca
acaagccaacatgtgagtgaggcatctgcagggcggaagggccctagaggagacaaaggg
ccacagggagaaaggggtccaccaggtccaccaggcagggatggtgaagatggtccagca
ggtcctccagggccccctggtcctccaggtcttggcggaaattttgctgctcaatatgat
ccatctaaagcggctgactttggccctggacctatgggtttaatgggacctagaggccca
cctggagcatctggacctcctggtcctcccggatttcaaggtgttcctggtgagcctggt
gaacctggtcaaacaggtccccaaggtcctcgtggtccccctggtcctccaggaaaggct
ggtgaagatggtcaccctggcaaacctggaagacctggtgagaggggtgttgctggtcct
cagggtgctcgtggtttccctggaactcctggtctgcctggctttaagggaattagggga
cacaatggtctggatggtcaaaagggacaacctggtactcctggcaccaagggagaacct
ggcgcccctggtgaaaatggtaccccaggacaacctggtgctcgcggtctccctggtgaa
agaggaagagtaggcgcccctggaccagctggtgctcgtgggagtgatggcagcgctggc
cccactggacctgcaggtcccattggtgctgctggtcctccaggcttcccaggtgctcct
ggtgctaagggtgaaatcggacctgctggtaatgttggccctactggtcctgctggtcca
agaggagagattggacttcctggttccagtggtcctgttggccctcctggcaaccctggc
gctaatggtcttcctggggctaaaggtgcagctggtcttcctggtgttgctggtgctcct
ggtctgcctggcccccgtggtattcctggtcctcctggccctgctggcccaagtggtgct
aggggacttgctggtgaaccaggccctgctggtgccaagggagaaagcggtaacaagggt
gagcctggtgctgctggcccccctggccctcctggtccacatggtgaggaaggcaagaga
ggcagcaatggtgaacctggctctgctggtccccctggccctgctggtctaagaggtgtg
cctggatctcgtggtctccctggagctgatggcagagctggtgtcatgggacctgctggt
aaccgtggtgctagtggtcctgttggtgctaagggtcctaatggtgatgctggccgtcct
ggtgagcctggtcttatgggtccaagaggtctcccaggtcaacctggaagcccaggtcct
gctggcaaagaaggtcctgttggtttccctggagcagatggtagggttgggccgatcggt
cccgctggtaatagaggtgaacctggtaacattggattccctggaccaaaaggtcccact
ggtgaacctggcaaacctggtgaaaaaggcaatgttggtcttgctggcccacggggtgct
cctggtcctgagggaaacaacggtgctcaaggtcctcctggtgtcactggcaaccaaggc
gcaaagggtgaaacaggtcctgctggccctccaggcttccagggtctgccaggtccctct
ggtccagctggtgaagctggtaaaccaggcgaaaggggtctccatggtgaatttggtgtc
cctggtcctgctggcccaaggggtgagcgtggtcttcctggtgaaagtggtgctgttggt
cctgctggccctattggaagccgtggtccatctggcccaccaggccctgatggtaacaag
ggtgaacctggtaatgccggtcctgctggtgctcctggtcccgctgggcctggtggaatc
ccaggagagagaggtgttgcaggtgttccaggaggcaagggtgagaagggtgccccaggt
ctgagaggtgatgctggtgcaacaggaagagatggtgcccgtggtctccctggtgctatt
ggtgctcctggtcctgctggtggtgctggtgatcggggtgaaggaggtcctgctggtccc
gctggtcctgctggtgcccgtggtattcctggtgaacgtggtgagcctggtcctgtaggt
cctagtggatttgctgggcctcctggtgcagctggtcagcctggtgctaaaggagagcgt
ggccctaagggaccaaagggtgaaactggaccaacaggtgctattgggccaattggtgct
tctggaccaccaggtcccattggtgctgctggtcctgctggccctcgtggtgatgctggt
cctcctggcatgactggtttccctggtgctgctggaagagttggtcctccaggccctgct
ggtatcactggtccccctggtcctcctggcccagctggcaaagatggtcctagaggtctg
cgtggtgatgttggtcctgttggccgtactggtgaacagggcattgctggcccacctggt
ttcgctggtgagaaaggtccatctggagaggctggtgctgctggtcctcccggtacccca
ggtcctcagggtattcttggtgctcctggtatccttggtctgcctggctctcggggagaa
cgtggtcttccaggcattgctggagcaacaggtgaacctggtcctctgggtgtttctggt
cctcctggtgctcgtggtccctctggtcctgtgggttctcctggtcctaatggtgctcct
ggtgaagctggtcgtgatggcaatcctggaaatgatggtcctccaggccgtgatggtgct
cctggtttcaagggtgagcgtggtgctcctggtaaccaaggtcccagtggtcctttgggt
gctcctggtcctcatggccaagttggtccttctggaaagcctggaaaccgtggtgatcct
ggtcctgctggtgctgttggtcctgctggtgcttttggcccaagaggtctcgctggccca
caaggtccacgtggtgagaaaggtctacctggtgacaagggacatagaggtctgcctggc
ctgaagggacacaatggattgcagggtcttcctggtcttgctggccaacatggtgatcaa
ggtcctcctggcaacaacggtcctgctggcccaaggggtcctcctggtccttctggtcct
cctggtaaggatggtcgcaatggtctccctggacccattggccctgctggtgtacgtggc
tctcatggtagccaaggccctgctggtccccctggtccccctggacctcctggtccccct
ggccccaatggtggcggatatgaagttggctttgatgcagaatactaccgggctgatcag
ccttctctcagacccaaggattatgaagttgatgccactctgaaaacactgaacaaccaa
attgagaccctgctgaccccagaaggctccaaaaagagcccagctcgcacctgccgtgac
ctcagacttagccacccagaatggagcagcggtttctactggattgatcctaaccaaggc
tgcactgcagatgccattagagcatactgtgactttgccactggtgagacttgcatccat
gctaaccctgaagatattcctactaagacctggtatgtcagcaagaatcccaaggagaaa
aagcacatatggttcggtgaaactatcaatggtggtactcagtttgaatacaatggtgaa
ggtgtgaccacaaaggacatggccactcaacttgccttcatgcgtctgctggccaaccat
gcctcccagaacatcacctaccactgcaagaacagcattgcctacatggatgaggagact
ggaaaccttaaaaaggctgttatactccagggatccaatgatgttgaactacgagctgaa
ggcaacagcagattcactttcagtgttcttgtggatggctgctctaaaaagaacaacaaa
tggggcaaaacgatcattgaatacagaacaaataagccatctcgcttgcccatccttgac
attgcacctttggacattggtggcgctgaccaagaattcggtttgcacattggcccagtc
tgtttcaaatga

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Pathway (3)   
   KEGG PATHWAY (3)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (4)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (2)   
   Pfam (2)   
All databases (14)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system