KEGG   Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0289659
Entry
DDB_G0289659      CDS       T00245                                 
Symbol
rrpA
Name
(RefSeq) RNA-directed RNA polymerase
Organism
ddi  Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Motif
Pfam: RdRP Helicase_C ResIII DEAD
Other DBs
NCBI-GeneID: 8627305
NCBI-ProteinID: XP_636093
dictyBase: DDB_G0289659
UniProt: Q54H25
Position
5:3196021..3203356
AA seq 2417 aa
MEVDSKSKEIEQYDQWLYCSNCLNGVLEYKHLGFYIDMEGVYLEVLRDSSSIFNNNHFYD
HNYRDGADIIDQLPNIDRYHLVSKSLQQQYSTTVNDNSYYMFDSRKHDLLVQKPYLMCSY
KECYNIIGFYHMNPFKKVFSFRLDHAKTILDFGYEDKPWKFFLNNPIFEKIQVYKNQDID
YYGFNSINKKYNNNNDNNNNFNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNSLNSL
FKNNDNSNKFQPRMETKDVHYKPTKLPQEKPMIPKFKEGVEIIPRDYQIESYYQSTQDNT
LLVLPTGMGKTLVSIMTLLEMFSINDQDNSCGDSKRIALFLVDRVPLVTQQAGAIEAITN
LKVCKLYGEINDSRTRAFVRSKEYDVLVSTVGSLVNLLEVRHLNILDFYFITFDEVHHAT
GEHDFNKVVDYIRKTDLNYRPRILGLTASLVSIGNSTIDIVQRSIKDMEERMLSRVFKPT
SLLTNSTQSELQPELVSFKTSGQESLIETSICEFLVSNSKELQIFLNYSDVDLDGVRGNP
SFLKALERLDKYSKQLESIYIEYTKVLIELYALLSVLSTEGPKQVLTRLDLLMQSTNQEN
ELYNKLLELRYYISGQYEDRESNFEKGSTRYRKLISSLEYAISDASDGELQKDLRILVFV
ETRFGASNLTSMLKKEPFQEYLHTKRLVGHNGVDGMDSEKQQSIIRKFRDGKCRLIVTTN
VLEEGIDVQDCNIVICYDGILSLKSLIQRRGRARSKNESKFIIIYNDDKDLKILDILSSE
NLLNNSINQILSNRERQAITKNQFLNWKKLNINNEYFTNNQLDGGPLDKDIKCVILSIYH
IEIDIETFRELLLFQLPDIINQVDQVSIRMEGDDEYLSSYIIVILNTCIDKEQSIYRLKS
LLNINGLKYWMIDRSSFHFEDDNINDLSQSKNKNYSIRSFEYGNMSSPTKYHGIGQLDDS
FELFYGKREMFFTKKTRFQRYRLNLKLTDIESTFLLVNDKYQNIVHILLIVKRPLIFEEE
KKTHIVFWNKSKPKKDDFGQAFVYRLTLSTIDNEIKEVIKPLIANGFRMYESSLELNCFI
QGGINKNNNCMIIDLNLQYIKRNLEIHYLLQCLQSQSSYGRVLNQDFIVEINNLLAFGKQ
EEAEFIITSLISKRTKFINYKEFIGDCLKNFLPDPYYAKKKDLSTKSGEFTMIRDVFITP
SRTIFIQPTLQRSCRAVRKFGSSNFIVVKIVNESLEPLQGVNNKHPLHENRIKPILEGGI
LVGGEIYSYAGNSNSQLREYSSWFVSNQIGTHTVKIWSGIEHVDNVRKFFRCIGLMFSTT
IPTVTLPQNRIYRIQDITRNTHEFTEGCGEIGPELAKHLNENYNFRPSTCAYQVRIGGNK
GVLVVNNQAPDPSGIYIRPSMVKFNPIDCGDEHRTLEICSVSTTSRCKLNRQVISLLSTL
GTQDNVFFALQDHYLNQVAQIVNDTNASKQAIVEFFPDITEGELYQDPYIRRILISLYKL
KMERIQQKCHIEIKDSRMLLGVCDPTNSLPPNTVFVQLEEEDEDDDDDGRKYEKVIEGLV
MVIKNPCTHPGDVRYLKAVDNIRLRHLRNVLVFSTKGDVPNFKEISGSDLDGDRYFFCYD
KSLIGNRSESETAYLVVETVSNNDKKANVFNDPFALSSMYSTNAERQELGKLYHSHLAIS
DQYGANHKYSIQISKECFKEIDYPKTGIHGTIPKEVNIRLQTVGYPHYMQRENSTRVYYQ
SKKIMGKMYDQIDQLVYIGDFLPNISLDKSNLVDGYEIYLNSAKILYSQYKLQVHSLLRH
YSAESEESIMIGFLDQGFISDKVSKDIKGEMKNDYIKIQQTFENEFLKEFGEQHKENCLL
IHRVNIEKKVSAWYHVAYSDLKDDRALGFYWIARSFKQMTLDQESQKKKNILVNSILDHM
NKKKDTLFPLYESRLLIVKELTSFLNTLNDTVFKESTLEIIGSTATMLFDENSNLNLYLK
LENQNDHMNLAEKNEILNQLKDEIKTSSFISAEACSIIKIQGDIPLFKFKIDKIQCLIGL
ETSKWYETLVQQQYITKNPSILSILFSIIDWSINSLFVDSETGEIINNSKVYSSLNLQKV
IVENSMIPSIFNNKNHNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKHSVKNLTKS
NLFSLLIDFCIINKYIDKCNPNELTNTTSNLTIGNWVKLIEIASRYFSVDNNNNNNNKGH
KRKKNKNLDEYNTNNLGDTILSFFRFYSDSFGRSIYGNEPFIIKLFSKDANDIENQILNP
STESHKTALLFYQESFRHAFHSLSTFVSVEEFLSNCLKTTKKIMPIKKNQINLLQERSVN
EEIVKNVQLCGCSIKIDTNVKNPYILIDGKPQQIRLAQNAIRDLLSIKTENYNLAITKRN
NKRKNFTLGDFAKNKIK
NT seq 7254 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaggtcgattccaaatcaaaagagattgaacaatatgatcaatggttatattgttca
aattgtttaaatggagtgttggaatataaacatttgggtttttatattgatatggagggt
gtttatctcgaggttctaagagatagttcaagtatttttaataataatcatttctatgat
cacaactatagagatggtgctgatattatagatcaattaccaaatattgatagatatcat
ttagtttcaaaatcattacaacaacaatattcaacaacagtcaatgataatagttattat
atgtttgattcaagaaaacatgatttattagtccaaaaaccatatttaatgtgtagctat
aaagaatgttataatataattggtttctatcatatgaatccatttaaaaaggtattttca
tttcgtcttgatcatgcaaaaacaattttagactttggatatgaagataaaccatggaaa
ttctttttaaataatcctattttcgaaaaaattcaagtttataaaaatcaagatattgat
tattatggttttaattcaataaataaaaaatataataataataatgataataataataat
tttaataataataataataataataataataataataaaaataataataataataataat
aataataataataataataataataataataataataacaataatagtttaaatagttta
tttaaaaataatgataatagtaataaatttcaaccaagaatggaaacaaaagatgttcat
tataaaccaacaaagttaccacaagaaaaaccaatgataccaaaatttaaagaaggtgta
gaaattataccaagagattatcaaattgaaagttattatcaatctactcaagataataca
ttattggtattaccaactggtatgggtaagacattggtatcaataatgacattgttagag
atgtttagtataaatgatcaagataattcatgtggtgattcaaagaggatagctttgttt
ttggttgatagagtaccattggttacacaacaagccggtgcaattgaagcaattacaaat
ttaaaagtatgtaaattatatggtgaaattaatgatagtagaacaagagcatttgttaga
tcaaaagaatatgatgtattggtgtccacagtcggtagtttagtgaatcttttagaggta
cgtcatttgaatatactcgatttctatttcatcacttttgatgaagttcatcatgcaact
ggtgaacatgatttcaataaggtggttgattacattcgtaaaaccgatttaaactataga
ccaagaatcttgggtttaacggcttcacttgtaagtattggtaattcaacgattgatata
gttcaaagatcaatcaaagatatggaggaaagaatgctttcaagagttttcaaaccaaca
tcattacttacaaattccactcaatcagaattacaacctgaattggtttcgttcaaaacc
tctggtcaagaatcattaatagaaacttcgatttgtgaatttttggtatcaaatagtaaa
gaattacaaatctttttaaattatagtgatgttgatttggatggtgttagaggtaatcca
tcttttttaaaagcattggaaagattagataaatattccaaacaattagaatcaatctat
atagagtatacaaaagtattgatagaactatatgcattgttatcagtattgtcaacagaa
ggaccaaaacaagttttaactagattggatcttttaatgcaatctaccaatcaagagaat
gaactctacaataaattattggaattaagatattacattagtggtcaatatgaagatagg
gaatcaaattttgaaaaaggttcaactcgttatagaaagttaatcagttctttagaatat
gcaattagcgatgcatccgatggtgaattacaaaaggatttaagaattttagtttttgtt
gaaactagattcggtgcatcaaatttaacttcaatgttaaagaaagaaccattccaagag
tatttacacaccaagagattggttggtcataatggtgtcgacggtatggattcagagaaa
caacaaagtataattagaaaatttagagatggtaaatgtaggttaatagttacaacaaat
gtattggaagagggtattgatgttcaagattgtaatatagtaatttgttatgatggtata
ttaagtttaaaatcattaattcaacgtagaggtagagctagatcaaaaaatgaatcaaaa
ttcattataatttataatgatgataaagatttaaaaatattagatatattaagtagtgaa
aatttattaaataattcaattaatcaaattttatcaaatagagagagacaagctattaca
aaaaatcaatttttaaattggaagaaattaaatattaataatgaatattttacaaataat
caacttgatggtggtccattagataaagatataaaatgtgtgattttatcaatttatcat
attgaaattgatattgaaacttttagagagcttttattattccaacttccagatattatc
aatcaagttgaccaagtttcaattagaatggaaggtgatgatgaatatttatcaagttat
ataatcgttattttaaatacatgtatagataaagagcaatcaatttatagattaaaatct
ttattaaatataaatggtcttaaatattggatgattgatagatcttcgtttcattttgaa
gatgataatattaatgatttaagtcaatctaaaaataaaaattattcaattagaagtttt
gaatatggtaatatgtcaagtccaacaaaatatcatggtattggtcaattggatgattca
ttcgaattgttttatggcaaaagagaaatgtttttcacaaaaaaaactagatttcaaaga
tatagattaaatttaaaattaaccgatattgaaagtacatttttacttgtaaatgataaa
tatcaaaatattgttcatatcctattgattgtaaaaagaccattaattttcgaggaagag
aaaaaaacacatatagttttttggaataaatcaaaaccaaagaaagatgattttggtcaa
gcatttgtatatagattaacattatcaacaatagataatgaaattaaagaagtgattaaa
ccattgatagccaatggattcagaatgtatgaatcatctttagagttaaattgttttatt
caaggtggtattaacaaaaataacaattgtatgattatcgatttaaatttacaatatatt
aaaaggaatttggaaattcattatttattacaatgtttacaaagtcaaagttcatatggt
agagttttaaatcaagattttatagttgaaattaataatctattggcatttggtaaacaa
gaggaagcagagttcattataacatcattgatttcaaagagaactaaattcattaattat
aaagaattcataggtgattgtttgaaaaattttttacccgatccttattatgcaaagaaa
aaggatctctcaacaaagagtggtgaatttacaatgattcgtgatgtttttataacacca
agtagaactattttcattcaaccaacactacaaagatcatgtagagctgttcgtaaattt
ggttcatccaatttcattgtggttaaaattgtaaatgaatcattggaaccacttcaaggt
gtaaataataaacatccacttcatgagaatagaattaaaccaatacttgagggtggtata
ttggttggtggtgaaatctattcgtatgctggtaatagtaatagtcagttaagagaatat
tcatcttggttcgtttctaatcaaattggtacacatacggttaaaatttggagtggtata
gagcatgttgataatgttagaaagtttttcagatgtattggtttaatgttttcaacaacg
attccaacagttacattaccacagaatcgtatctatagaatccaagatatcaccagaaat
acccatgaattcaccgagggatgtggtgaaattggtccagaacttgctaaacatttaaat
gaaaattataatttcagaccatcaacatgtgcatatcaagttagaataggtggaaataaa
ggtgtgttggtggtaaacaatcaagcacccgatccatctggtatttatattagaccaagt
atggtgaaattcaatccaatcgattgtggtgatgaacatagaacattagagatttgcagt
gtttcgacaacttcaagatgtaaattaaatagacaagtcatcagtttactctcaacattg
ggtacacaagataatgttttctttgcattacaagatcattatctaaatcaagtggctcaa
atcgtaaatgataccaatgcttccaaacaagcaatcgttgaattctttccagatattaca
gagggtgaactttatcaagatccttacattcgtagaattttaattagtctttataaatta
aaaatggagagaattcaacaaaaatgtcatatagagattaaagatagtagaatgttgttg
ggtgtttgtgatccaacaaattcattaccaccaaatactgtatttgttcaattggaagag
gaagatgaagatgatgatgatgatggtcgtaaatatgaaaaagtaatcgaaggattggta
atggtaattaaaaatccttgtactcatcctggtgatgtaagatatctaaaggctgttgat
aatataagattaagacatttaagaaatgtattggttttctcaacaaaaggtgacgtacca
aactttaaagaaatttcaggttcagatttagatggtgatcgttatttcttttgttacgat
aaatcattgattggtaatcgttcagaatcagagacagcctatttagttgtcgagaccgtt
tcaaacaatgataaaaaggccaatgttttcaatgatccatttgctttatcctcaatgtac
tctacaaatgctgaacgtcaagaacttggtaaattgtatcattcacatttggcaatctct
gatcaatacggtgcaaatcacaaatattcaattcaaatctctaaagaatgttttaaagaa
attgattatccaaaaactggtattcatggcactattccaaaagaagtaaacattcggtta
caaactgtaggttatccacattatatgcaaagagagaattcaaccagagtctattatcaa
tcgaaaaaaattatgggtaaaatgtatgatcaaattgatcagttggtttatattggtgat
ttcttaccaaatattagtcttgataaaagtaatttggttgatggctatgaaatctattta
aatagtgctaaaatcttatatagtcagtataaacttcaagttcattcattgttaagacat
tattcagcagaatctgaagaatctataatgattggtttccttgatcaaggtttcattagt
gataaagtttcaaaagatatcaaaggtgaaatgaaaaatgattacattaaaattcaacaa
acttttgaaaatgagtttttaaaggaatttggtgaacaacacaaagagaattgtttattg
attcatagagtaaacattgaaaagaaggtttcagcttggtaccatgttgcatatagtgat
ttgaaagatgatagagcattaggtttctattggattgctcgttcgttcaaacagatgaca
ttggatcaagaaagtcaaaagaaaaaaaatattttggttaatagcatcttggatcatatg
aacaaaaaaaaagatactttattcccattatacgaaagtcgtttattgattgtcaaagaa
ttaacatcatttttaaatacgttaaatgatacagtatttaaagaatcaacattggaaatt
attggttcaaccgctacaatgttatttgatgaaaattcaaatttaaatttatacttaaaa
ctagagaatcaaaatgatcatatgaatttagctgaaaagaacgaaattttaaatcaatta
aaagatgaaattaaaacatcctcttttatatcagctgaagcttgttcaattatcaagatc
caaggtgacattccattatttaaattcaaaatagataaaattcaatgtttaattgggctt
gaaactagtaaatggtatgaaacattggtacaacaacaatacattactaaaaatccttca
attttatcaatattgttttcaatcattgattggagtattaattcattgtttgttgatagt
gaaactggtgaaattataaataattcaaaggtttattcatctttaaaccttcaaaaagtt
atagttgagaattcaatgataccaagtatattcaataataaaaatcataacaataacaat
aataataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataataataataataaacatagtgtaaagaatcttacaaaatca
aatttgttctctttgttaattgatttttgtattatcaacaagtatatagataaatgtaat
ccaaatgaacttacaaatactacatccaatttaacaattggaaattgggtgaaattgata
gaaatagcttcaagatacttttcagtggataataataacaataataacaataaaggtcat
aaaagaaagaaaaacaaaaatttggatgaatataatacaaataatttaggtgatacaatc
ttatcattttttagattctattcagatagttttggacgttcaatctatggaaatgaacca
ttcattattaaattgttttctaaagatgccaatgatattgaaaatcaaatactcaatcct
tcaactgaatcacataaaactgctttattattttatcaagaatcatttagacatgcattt
cattctcttagtacttttgttagcgttgaagagttcttatcaaattgtttaaaaactaca
aaaaaaataatgccaattaaaaaaaatcaaattaatcttttacaagagagaagtgtaaat
gaagaaatagttaaaaatgttcaattatgtggttgtagtattaaaattgatacaaatgtt
aaaaatccttatattttaatcgatggaaaaccacaacaaataagattggctcaaaatgca
attagagatctcttgtctataaaaactgaaaactataatttggccatcacaaaaagaaat
aataaaagaaagaattttacattgggtgattttgctaaaaataaaataaaataa

  All links  
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (73)   
   RefGene (69)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   DICTYBASE (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (4)   
   Pfam (4)   
All databases (81)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system