KEGG   ENZYME: 6.2.1.64
Entry
EC 6.2.1.64                 Enzyme                                 

Name
E1 NEDD8-activating enzyme;
NEDD-activating enzyme E1;
NAE1 (gene name);
UBA3 (gene name)
Class
Ligases;
Forming carbon-sulfur bonds;
Acid-thiol ligases
Sysname
[NEDD8 protein]:[E1 NEDD8-activating enzyme] ligase (AMP-forming)
Reaction(IUBMB)
ATP + [NEDD8 protein] + [E1 NEDD8-activating enzyme]-L-cysteine = AMP + diphosphate + [E1 NEDD8-activating enzyme]-S-[NEDD8 protein]-yl-L-cysteine
Substrate
ATP [CPD:C00002];
[NEDD8 protein];
[E1 NEDD8-activating enzyme]-L-cysteine
Product
AMP [CPD:C00020];
diphosphate [CPD:C00013];
[E1 NEDD8-activating enzyme]-S-[NEDD8 protein]-yl-L-cysteine
Comment
Some RING-type E3 ubiquitin transferase (EC 2.3.2.27) are not able to bind a substrate protein directly. Instead, they form complexes with a cullin scaffold protein and a substrate recognition module, which are known as CRL (Cullin-RING-Ligase) complexes. The cullin protein needs to be activated by the ubiquitin-like protein NEDD8 in a process known as neddylation. Like ubiquitin, the NEDD8 protein ends with two glycine residues. The E1 NEDD8-activating enzyme activates NEDD8 in an ATP-dependent reaction by forming a high-energy thioester intermediate between NEDD8 and one of its cysteine residues. The activated NEDD8 is subsequently transferred to a cysteine residue of EC 2.3.2.34, E2 NEDD8-conjugating enzyme, and is eventually conjugated to a lysine residue of specific substrates in the presence of the appropriate E3 transferase (EC 2.3.2.32, cullin-RING-type E3 NEDD8 transferase).
History
EC 6.2.1.64 created 2020
Orthology
K10686  NEDD8-activating enzyme E1
Genes
HSA: 9039(UBA3)
PTR: 460496(UBA3)
PPS: 100970386(UBA3)
GGO: 101131301(UBA3)
PON: 100173204(UBA3)
NLE: 100597986(UBA3)
MCC: 696493(UBA3)
MCF: 102116964(UBA3)
CSAB: 103227873(UBA3)
CATY: 105585673(UBA3)
PANU: 101013877(UBA3)
RRO: 104677916(UBA3)
RBB: 108520119(UBA3)
TFN: 117083116(UBA3)
CJC: 100392131(UBA3)
SBQ: 101046690(UBA3)
MMUR: 105857801(UBA3)
MMU: 22200(Uba3)
MCAL: 110295730(Uba3)
MPAH: 110314225(Uba3)
RNO: 117553(Uba3)
MCOC: 116099314(Uba3)
MUN: 110551651(Uba3)
CGE: 100756784(Uba3)
PLEU: 114681788(Uba3)
NGI: 103729144(Uba3)
HGL: 101716749(Uba3)
CCAN: 109691366(Uba3)
OCU: 100343309(UBA3)
TUP: 102498293(UBA3)
CFA: 476560(UBA3)
VVP: 112909129(UBA3)
VLG: 121494765(UBA3)
AML: 100479609(UBA3)
UMR: 103674240(UBA3)
UAH: 113257069(UBA3)
ORO: 101370625(UBA3)
ELK: 111144033
MPUF: 101679293(UBA3)
EJU: 114214597(UBA3)
MLX: 118005781(UBA3)
FCA: 101090175(UBA3)
PTG: 102959349(UBA3)
PPAD: 109279028(UBA3)
AJU: 106975135(UBA3)
HHV: 120242879(UBA3)
BTA: 512647(UBA3)
BOM: 102280651(UBA3)
BIU: 109576168(UBA3)
BBUB: 102414641(UBA3)
CHX: 102176174(UBA3)
OAS: 101116609(UBA3)
ODA: 120868411(UBA3)
SSC: 100153428(UBA3)
CFR: 102520733(UBA3)
CDK: 105095258(UBA3)
BACU: 103020006(UBA3)
LVE: 103072527(UBA3)
OOR: 101276676(UBA3)
DLE: 111174201(UBA3)
PCAD: 102975529(UBA3)
ECB: 100053395(UBA3)
EPZ: 103550877(UBA3)
EAI: 106827923(UBA3)
MYB: 102248175(UBA3)
MYD: 102751534(UBA3)
MMYO: 118667899(UBA3)
MNA: 107524035(UBA3)
HAI: 109392528(UBA3)
DRO: 112301217(UBA3)
SHON: 118983430(UBA3)
AJM: 119038290(UBA3)
MMF: 118633446(UBA3)
PALE: 102878332(UBA3)
RAY: 107497447(UBA3)
MJV: 108395823(UBA3)
LAV: 100670330(UBA3)
TMU: 101353473
MDO: 100011849(UBA3)
SHR: 100930499(UBA3)
PCW: 110222518(UBA3)
OAA: 100078310(UBA3)
GGA: 426073(UBA3)
PCOC: 116237074(UBA3)
MGP: 100550920(UBA3)
CJO: 107319855(UBA3)
NMEL: 110404630(UBA3)
APLA: 101796590(UBA3)
ACYG: 106035439(UBA3)
TGU: 100222658(UBA3)
LSR: 110481965(UBA3)
SCAN: 103817086(UBA3)
PMOA: 120495706(UBA3)
GFR: 102042013(UBA3)
FAB: 101809994(UBA3)
PHI: 102113491(UBA3)
PMAJ: 107210284(UBA3)
CCAE: 111934974(UBA3)
CCW: 104683361(UBA3)
ETL: 114063092(UBA3)
FPG: 101922859(UBA3)
FCH: 102050724(UBA3)
CLV: 102092543(UBA3)
EGZ: 104132662(UBA3)
NNI: 104016925(UBA3)
ACUN: 113484714(UBA3)
PADL: 103921789(UBA3)
AAM: 106494568(UBA3)
ASN: 102382320(UBA3)
AMJ: 102576483(UBA3)
CPOO: 109311184(UBA3)
GGN: 109288984(UBA3)
PSS: 102448642(UBA3)
CMY: 102946017(UBA3)
CPIC: 101946322(UBA3)
TST: 117880317(UBA3)
CABI: 116820408(UBA3)
ACS: 100566540(uba3)
PVT: 110083321(UBA3)
PBI: 103067708(UBA3)
PMUR: 107302647(UBA3)
PGUT: 117679010(UBA3)
PMUA: 114591846(UBA3)
ZVI: 118080826(UBA3)
GJA: 107121810(UBA3)
XLA: 108714725(uba3.L) 734782(uba3.S)
XTR: 100124303(uba3)
NPR: 108786184(UBA3)
DRE: 406776(uba3)
IPU: 108276284(uba3)
PHYP: 113530732(uba3)
AMEX: 103047072(uba3)
EEE: 113575467(uba3)
TRU: 101073510(uba3)
NCC: 104944983 104955224(uba3)
ELY: 117256264(uba3) 117258904
PLEP: 121946477 121949671(uba3)
SLUC: 116035189(uba3) 116061992
GAT: 120828986 120835094(uba3)
MSAM: 119886654(uba3) 119906123
CUD: 121506998(uba3) 121516911
OAU: 116310945 116330178(uba3)
OML: 112145215(uba3) 112158859
XMA: 102225974 102230113(uba3)
NFU: 107385429(uba3) 107396417
KMR: 108231938 108241173(uba3)
ALIM: 106518515(uba3) 106519301
CSEM: 103385348(uba3)
XGL: 120783499(uba3) 120803892
HCQ: 109514986(uba3)
BPEC: 110164522(uba3)
SASA: 100196693(uba3) 106567275(uba3) 106572411
ELS: 105013730(uba3)
SFM: 108923369(uba3) 108940090
LOC: 102696967(uba3)
LCM: 102351153(UBA3)
CMK: 103179785(uba3)
RTP: 109910816
BFO: 118416033
CIN: 100183602
SCLV: 120346172
SPU: 587059
APLC: 110974227
SKO: 100373014
DME: Dmel_CG13343(Uba3)
DER: 6549271
DSE: 6609061
DSI: Dsimw501_GD10991(Dsim_GD10991)
DAN: 6496553
DSR: 110189787
DPE: 6592772
DMN: 108159139
DWI: 6640603
DNV: 108654828
DHE: 111595571
DVI: 6625144
MDE: 101890977
LCQ: 111684814
ACOZ: 120951241
AARA: 120896623
AAG: 5576075
AALB: 109408519
CPII: 120413247
AME: 409394
ACER: 108003379
BIM: 100747873
BTER: 100652110
OBB: 114872519
MGEN: 117226522
NMEA: 116432515
SOC: 105205629
MPHA: 105830846
AEC: 105148880
PBAR: 105431396
VEM: 105560517
HST: 105192144
DQU: 106741184
CFO: 105255554
FEX: 115245969
LHU: 105677677
PGC: 109853599
OBO: 105281424
PCF: 106791679
NVI: 100117161
CSOL: 105368140
TCA: 658164
DPA: 109543973
ATD: 109599807
AGB: 108917192
NVL: 108563720
APLN: 108741658
PPYR: 116164551
BMOR: 101738474
BMAN: 114243594
MSEX: 115444055
BANY: 112048968
PMAC: 106718095
PPOT: 106103760
PRAP: 110996453
ZCE: 119838383
HAW: 110374907
API: 100163526
DNX: 107169124
RMD: 113552002
BTAB: 109042585
DCI: 103510542
CLEC: 106664650
NLU: 111046840
ZNE: 110841305
CSEC: 111868238
FCD: 110856139
PVM: 113828240
HAME: 121869689
EAF: 111711538
DSV: 119446177
RSAN: 119389981
RMP: 119174588
VDE: 111246574
VJA: 111262030
TUT: 107361193
DPTE: 113793782
CSCU: 111635613
PTEP: 107446217
SDM: 118190775
CEL: CELE_F11H8.1(rfl-1)
CBR: CBG16503(Cbr-rfl-1)
BMY: BM_BM3316(Bma-rfl-1)
TSP: Tsp_09278
PCAN: 112571589
BGT: 106080113
GAE: 121367643
CRG: 105328387
MYI: 110454458
PMAX: 117331340
OBI: 106883626
LAK: 106180312
NVE: 5513412
EPA: 110249842
ATEN: 116300406
ADF: 107352992
AMIL: 114977759
PDAM: 113673942
SPIS: 111329540
DGT: 114516422
HMG: 105848799
AQU: 100634480
ATH: AT5G19180(ECR1)
ALY: 9310005
CRB: 17883419
THJ: 104818804
CPAP: 110808274
CIT: 102610024
TCC: 18602917
GRA: 105800495
GAB: 108454051
EGR: 104414871
VRA: 106765627
VAR: 108323829
VUN: 114178692
CCAJ: 109809469
APRC: 113874089
CAM: 101506033
LJA: Lj4g3v2400830.1(Lj4g3v2400830.1)
ADU: 107482638
AIP: 107638602
RCN: 112200492
PPER: 18792137
PMUM: 103322816
PAVI: 110770328
PDUL: 117614697
MNT: 21390750
CSV: 101209336
CMO: 103483734
BHJ: 120085702
MCHA: 111009338
CMAX: 111479191
CMOS: 111457804
CPEP: 111791304
RCU: 8271591
JCU: 105631932
JRE: 109010475
QLO: 115995194
VVI: 100256207
VRI: 117914357
SLY: 101252115
SPEN: 107007881
SOT: 102584079
CANN: 107841216
NTA: 107811436
NSY: 104228308
NTO: 104084891
NAU: 109212959
INI: 109175758
ITR: 116002925
SIND: 105171382
OEU: 111392964
EGT: 105953246
HAN: 110918326
LSV: 111881621
CCAV: 112505715
CSIN: 114316179
BVG: 104907952
SOE: 110800550
NNU: 104596446
MING: 122090563
NCOL: 116264697
OSA: 4325169
DOSA: Os01t0271500-01(Os01g0271500)
OBR: 102706977
BDI: 100838283
ATS: 109786876
SBI: 8074525
ZMA: 100283559(umc1139)
SITA: 101786734
PHAI: 112895491
PDA: 103712331
EGU: 105060447
MUS: 103995359
DCT: 110103662
PEQ: 110025914
AOF: 109848222
ATR: 18440540
APRO: F751_5208
SCE: YPR066W(UBA3)
ERC: Ecym_3471
KMX: KLMA_80286(UBA3)
NCS: NCAS_0A11140(NCAS0A11140)
NDI: NDAI_0A05160(NDAI0A05160)
TPF: TPHA_0A03600(TPHA0A03600)
TBL: TBLA_0H01590(TBLA0H01590)
TDL: TDEL_0C04980(TDEL0C04980)
KAF: KAFR_0H00930(KAFR0H00930)
CAL: CAALFM_C600500CA(CaO19.4209)
SLB: AWJ20_1337(UBA3)
NCR: NCU02532
NTE: NEUTE1DRAFT133618(NEUTE1DRAFT_133618)
MGR: MGG_09283
SSCK: SPSK_05272
MAW: MAC_08816
MAJ: MAA_04332
CMT: CCM_02249
MBE: MBM_02447
ANI: AN2416.2
ANG: ANI_1_758024(An02g05450)
ABE: ARB_04414
TVE: TRV_06254
PTE: PTT_10042
SPO: SPAC24H6.12c(uba3)
CNE: CNC02000
CNB: CNBC5240
TASA: A1Q1_02965
ABP: AGABI1DRAFT111125(AGABI1DRAFT_111125)
ABV: AGABI2DRAFT190343(AGABI2DRAFT_190343)
MGL: MGL_0174
MRT: MRET_1144
DDI: DDB_G0283891(ube1c)
DFA: DFA_07215(ube1c)
EHI: EHI_098550(19.t00019)
PCB: PCHAS_072290(PC000482.01.0)
TAN: TA20100
TPV: TP01_0601
BBO: BBOV_I001030(16.m00748)
CPV: cgd8_1730
PTI: PHATRDRAFT_33774(UBA3)
SPAR: SPRG_11296
LOKI: Lokiarch_29320(moeB_2)
 » show all
Reference
1  [PMID:9694792]
  Authors
Osaka F, Kawasaki H, Aida N, Saeki M, Chiba T, Kawashima S, Tanaka K, Kato S
  Title
A new NEDD8-ligating system for cullin-4A.
  Journal
Genes Dev 12:2263-8 (1998)
DOI:10.1101/gad.12.15.2263
  Sequence
[hsa:9039]
Reference
2  [PMID:10207026]
  Authors
Gong L, Yeh ET
  Title
Identification of the activating and conjugating enzymes of the NEDD8 conjugation pathway.
  Journal
J Biol Chem 274:12036-42 (1999)
DOI:10.1074/jbc.274.17.12036
  Sequence
[hsa:9039]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 6.2.1.64
IUBMB Enzyme Nomenclature: 6.2.1.64
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 6.2.1.64
BRENDA, the Enzyme Database: 6.2.1.64

DBGET integrated database retrieval system