KEGG   Falco peregrinus (peregrine falcon): 101924780
Entry
101924780         CDS       T02856                                 
Symbol
COL1A1
Name
(RefSeq) collagen type I alpha 1 chain
  KO
K06236  collagen type I alpha
Organism
fpg  Falco peregrinus (peregrine falcon)
Pathway
fpg04510  Focal adhesion
fpg04512  ECM-receptor interaction
fpg04820  Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:fpg00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    101924780 (COL1A1)
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    101924780 (COL1A1)
  09142 Cell motility
   04820 Cytoskeleton in muscle cells
    101924780 (COL1A1)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:fpg00536]
    101924780 (COL1A1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:fpg00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   101924780 (COL1A1)
SSDB
Motif
Pfam: Collagen COLFI VWC TILa VWA_N2
Other DBs
NCBI-GeneID: 101924780
NCBI-ProteinID: XP_005235901
Position
Un
AA seq 1453 aa
MFSFVDSRLLLLIAATVLLTRGQGEEDIQTGSCIQDGLTYNDKDVWKPEPCQICVCDSGN
ILCDEVICEDTSDCPNAEIPFGECCPICPDTDASPVYPESAGVEGPKGDTGPKGDRGLPG
PPGRDGIPGQPGLPGPPGPPGPPGLGGNFAPQMSYGYDEKAGGMAVPGPMGPAGPRGLPG
PPGAPGPQGFQGPPGEPGEPGASGPMGPRGPAGPPGKNGDDGEAGKPGRPGERGPPGPQG
ARGLPGTAGLPGMKGHRGFSGLDGAKGEPGPAGPKGEPGSPGENGAPGQMGPRGLPGERG
RPGPSGPAGARGNDGAPGAAGPPGPTGPAGPPGFPGAAGAKGETGPQGARGSEGPQGARG
EPGPPGPAGAAGPAGNPGADGQPGAKGATGAPGIAGAPGFPGARGPSGPQGPSGAPGPKG
NSGEPGAPGNKGDTGAKGEPGPAGVQGPPGPAGEEGKRGARGEPGPAGLPGPAGERGAPG
SRGFPGADGIAGPKGPPGERGSPGPAGPKGSPGEAGRPGEPGLPGAKGLTGSPGSPGPDG
KTGPPGPAGQDGRPGPPGPPGARGQAGVMGFPGPKGAAGEPGKPGERGAPGPPGAVGAAG
KDGEAGAQGPPGPTGPAGERGEQGPAGAPGFQGLPGPAGPPGEAGKPGEQGVPGDAGAPG
PAGARGERGFPGERGVQGPPGPQGPRGANGAPGNDGAKGDAGAPGAPGNQGPPGLQGMPG
ERGAAGLPGAKGDRGDPGPKGADGAPGKDGLRGLTGPIGPPGPAGAPGDKGEAGPPGPAG
PTGARGAPGDRGEPGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGETGDAGAKGDAGPPGPAGPTGAPG
PAGAVGAPGPKGARGSAGPPGATGFPGAAGRVGPPGPSGNIGLPGPPGPSGKEGGKGPRG
ETGPAGRPGEPGPAGPPGPPGEKGSPGADGPIGAPGTPGPQGIAGQRGVVGLPGQRGERG
FPGLPGPSGEPGKQGPSGSPGERGPPGPMGPPGLAGPPGEAGREGAPGAEGAPGRDGAAG
PKGDRGETGPAGPPGAPGAPGAPGPVGPAGKNGDRGETGPQGPAGPPGPAGARGPAGPQG
PRGDKGETGEQGDRGMKGHRGFSGLQGPPGPPGSPGEQGPSGASGPAGPRGPPGSAGAAG
KDGLNGLPGPIGPPGPRGRTGDVGPVGPPGPPGPPGPPGPPSGGFDFSFLPQPPQEKAHD
GGRYYRADDANVMRDRDLEVDTTLKSLSQQIENIRSPEGTRKNPARTCRDLKMCHGDCKS
GEYWIDPNQGCNLDAIKVYCNMETGETCVYPTQATIAQKNWYLSKNPKEKKHIWFGETMS
DGFQFEYGGEGSNPADVAIQLTFLRLMSTEATQNITYHCKNSVAYMDHDTGNLKKALLLQ
GANEIEIRAEGNSRFTYGVTEDGCTSHTGAWGKTVIEYKTTKTSRLPIIDLAPMDVGAPD
QEFGIDIGPVCFL
NT seq 4362 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttcagctttgtggattctcggttactgctgttgatagcagcgactgtactactcacc
cgcgggcaaggagaagaagacattcaaactggaagctgcatacaggatgggctaacatac
aacgacaaggatgtgtggaaacccgaaccctgccagatctgcgtctgcgacagtggcaac
atcctctgcgatgaggtgatctgcgaggacacctccgactgccccaatgctgagatcccc
ttcggagagtgctgccccatctgtcccgacaccgacgcctcccctgtctacccagaaagc
gctggagtagagggccctaagggagacaccggccccaaaggagacaggggactccccggc
ccccctggcagagatggcatccctggacagcctggcctcccgggacccccaggccctcca
ggtcctccaggccttggcggaaacttcgctcctcaaatgtcttatggctacgatgagaaa
gccggtggcatggccgtgcctggccccatgggtccagctggtccccgcggtctccccggt
cctcctggtgctcctggtcctcaaggtttccaaggtccccctggtgaacccggagagcct
ggtgcatctggtcccatgggtccccgtggtcctgctggcccccctggcaagaatggagat
gacggtgaagctggaaagcccggccgtcccggagagcgcggtccacccggcccccagggc
gcacgtggtctcccaggaacagccggtctgccaggcatgaagggtcacagaggcttcagt
ggtctggatggtgccaagggtgagcctggtcctgctggccccaagggtgagcccggcagc
cccggggagaacggtgctcctgggcagatgggtcctcgtgggcttcccggcgagagaggc
cgtcctggtccttctggccctgctggtgctcgtggtaacgatggtgctcctggtgctgcc
ggtcctcccggtccaactggccccgctggtccccctggcttccctggtgctgctggtgct
aagggtgaaaccggtccccagggagctcgtggcagtgaaggtccgcagggtgcccgtggt
gagcccggtccccctggccctgctggcgctgctggtcctgctgggaaccccggtgctgat
ggtcaacctggtgccaagggtgcaactggtgctcctggcattgctggtgctcctggcttc
cccggtgcccgcggtccctccggaccccagggtcccagcggtgcccccggtcccaagggt
aacagcggtgaacccggtgctccaggcaacaagggagacactggtgccaaaggcgaacct
ggtcctgctggtgtccaaggtccccccggcccagccggtgaggaaggcaagagaggagct
cgtggtgagcctggccctgctggacttcctggccccgctggcgaacgtggtgctcctggc
agccgcggcttccctggtgctgatggcattgctggtcccaagggtccccccggcgagcgt
ggctcccctggccctgccggccccaaaggatctcctggtgaagctggacgccctggggaa
cctggcctccctggtgctaagggtctgactggaagccctgggagccctggtcctgacggc
aagactggcccccccggtcccgctggtcaagatggtcgccccggcccccccggcccccct
ggtgccagaggtcaagctggtgtgatgggtttccctggtcccaaaggtgctgcgggtgag
cctggcaagcccggcgagagaggtgctcccggtccccccggcgccgttggtgctgctggt
aaagatggtgaagctggtgcccaaggtcctcccggccccaccggtcctgctggagaaaga
ggtgaacaaggtcctgctggtgctcctggcttccagggtctgccgggccctgctggcccc
cccggcgaggctggcaagcctggtgaacagggtgtccccggagatgctggtgcccccggt
cccgctggtgccaggggtgagagaggtttccccggtgaacgtggtgtccaaggccctccc
ggtccccaaggtcctcgtggtgctaacggtgctcccggtaacgatggtgctaagggtgat
gctggtgctcccggtgcccccgggaaccaagggccccccggtctgcagggtatgcccgga
gagcgtggtgctgctggcctgccaggtgccaagggtgacaggggtgaccccggtcccaaa
ggtgctgacggtgctcctggcaaagacggtctccgaggtctgactggtcccatcggcccc
cctggccctgctggtgctcccggtgacaagggtgaagctggtcccccgggtcctgctggt
cccactggtgcccgtggtgctcctggtgaccgtggcgagcccggccctcctggtcctgct
ggatttgctggcccccccggtgccgatggccagcctggtgctaaaggtgaaactggtgat
gctggagccaagggtgatgccggtccccccggccctgccggccccactggtgctcctggc
cctgctggtgctgttggtgctcctggtcccaaaggtgctcgtggtagtgctggaccccct
ggtgctactggtttccctggtgctgctggaagagttggtccccctggcccctctggaaac
atcggcctccctggcccccctggccccagcgggaaggaaggtggcaaaggaccccgtggt
gaaaccggccccgctgggcgccctggtgaacctggccccgctggcccccctggcccccct
ggtgagaagggctctcctggtgccgatggccccattggagctcctggcacccccggaccc
caaggtatcgccggccagcgtggtgttgtcggtctccctggacagagaggagaaagaggc
ttccctgggctgcctggcccctctggtgaacccggcaagcaaggtccctctggttcccct
ggcgagcgcggtcctcccggccccatgggcccccccggcctggcgggaccccccggtgaa
gctggacgtgagggtgctcctggtgctgaaggtgcccctggtcgtgatggtgctgctggt
cccaagggtgatcgtggtgagactggccctgctggcccccctggtgctcccggtgcccct
ggtgcccccggccccgttggtcctgctggcaagaatggagatcgcggtgagaccggtccc
caaggtcccgctggcccccctggtcctgctggtgctcgtggtcctgctggtccacaaggt
ccccgtggtgacaaaggtgaaactggtgaacagggtgacagaggcatgaaaggtcacaga
ggcttctccggtctccagggaccacctggtcctcctggctctcctggtgaacaaggtcct
tctggtgcttctggtcccgccggtccaagaggtcctcctggctctgctggtgctgccggc
aaagatggtctcaacgggctgcccggccccatcggcccccccggcccccgcggtcgcacc
ggtgatgttggccctgtcggtccccctggcccccctggcccccctggtcctcccggcccc
cccagcggtggcttcgacttcagcttcctgccccagccaccccaggagaaggcccacgat
ggtggacgctactaccgagctgatgatgccaacgtaatgcgcgaccgggacctggaagtt
gacaccaccctcaagagcctgagccaacagatcgagaacatccgcagccccgagggcacc
cgtaaaaaccctgcccgtacctgccgcgacctgaagatgtgccatggcgattgtaagagc
ggcgaatactggatcgaccccaaccaaggctgcaacctggatgccatcaaggtctactgt
aacatggagacaggcgagacatgcgtctaccccacccaggccaccattgcccagaagaac
tggtacctcagtaagaatcccaaggagaagaagcacatttggtttggcgagacgatgagt
gacggcttccagttcgagtatggtggtgagggctccaaccctgctgacgtcgccatccag
ctaaccttcctccgcctcatgtccactgaggccacccagaacatcacctaccactgcaag
aacagcgtcgcctacatggaccacgacactggcaacctgaagaaggcccttctcctccaa
ggagccaacgagatcgagatcagggctgaaggcaatagccgcttcacctacggtgtcacc
gaggacggctgcacgagtcacaccggtgcttggggcaagacagtcatcgagtacaagacg
acgaagacctcccgcctgcccatcatagatttggctcccatggacgttggtgctccagac
caggaattcggcattgacatcggccccgtctgcttcttgtaa

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Pathway (3)   
   KEGG PATHWAY (3)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (37)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (33)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (3)   
   RefSeq(nuc) (1)   
   GenBank (1)   
   EMBL (1)   
Protein domain (5)   
   Pfam (5)   
All databases (52)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system