KEGG   Saccoglossus kowalevskii (acorn worm): 100303513
Entry
100303513         CDS       T04123                                 
Name
(RefSeq) fibrillar collagen
  KO
K19719  collagen type II alpha
Organism
sko  Saccoglossus kowalevskii (acorn worm)
Pathway
sko04512  ECM-receptor interaction
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sko00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    100303513
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:sko00536]
    100303513
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:sko00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   100303513
SSDB
Motif
Pfam: Collagen COLFI
Other DBs
NCBI-GeneID: 100303513
NCBI-ProteinID: XP_006814954
Position
Un
AA seq 1173 aa
MQDWEEATCDMKETKGEKGESGEESSGFPTFPPGSYGPPGVPGAPGGHGPPGSSGQTGPP
GPRGARGADGPPGQSGPPGSPGQAGQPGFPGMAGAKGESGKPGPRGPTGQQGARGEAGSP
GATGKSGQRGPPGLSGSPGSKGSSGAAGLPGPQGFPGPRGAPGPQGSNGATGPKGSQGNP
GVAGMKGAQGPTGLTGDSGPRGLPGPAGEDGRRGERGEPGSQGTPGPQGEMGAAGVRGFP
GPSGPAGAKGESGEPGRPGPIGSKGSSGDPGRAGQQGMPGARGLTGSPGKEGPSGRPGTP
GEPGKDGDPGPAGARGARGESGKDGDAGPVGPTGPRGPAGERGATGATGSPGFVGQTGQP
GLPGEPGQPGEQGVQGEAGPAGQIGPRGERGHPGERGTPGPNGKKGDRGFQGAAGSDGAK
GSSGPKGVRGEGGPQGLQGLPGPAGLTGATGAKGDRGETGERGVTGAPGKPGDRGSPGPM
GISGPQGSQGEKGQTGAPGPLGQSGPRGDTGETGPAGRPGPQGLAGPQGRPGSTGRAGRD
GKPGAKGDSGDPGEQGDRGDPGPLGPRGIPGAKGDRGPAGRPGPQGLAGAGGRPGATGTT
GPAGAKGAAGAPGTAGAKGEPGESGEQGRPGDQGLEGPEGPYGPKGDAGKDGKDGEPGLP
GPQGAQGSRGSMGMPGQKGESGPRGAPGPQGEDGKTGLPGISGERGPVGPSGPLGPQGPR
GDQGPEGVSGKDGIPGVQGRPGIKGDRGNTGSPGPAGMSGPMGAPGPSGEAGPQGPTGDP
GPSGPVGPEGARGSRGPSGEPGIAGAPGDAGIQGARGAKGHRGFPGLQGIPGSMGVPGED
GMTGPPGPNGPRGATGPRGSPGLNGKDGPMGQPGPEGPRGSRGDRGDSGTSGPPGPPGPP
GPPGDAQGFDAAAFSSMFASFSQPGMKGPQGDEPEPYQGDAIAQKVRDVEVMASLQSLNE
QIQNIQTPTGSKKNPARTCRDLALCHPDWPSGEYWVDPNQGCALDAIKVYCDFKTYESCI
FPEKTEAPKMNYYQGPNKHVWFGDSMKNGFKFNYDVELVQLTFLRLLSVHGRQNVTYHCK
NSVAYFDAETGNFKKAAKLLADTEVELVAQGKTRFQYSVFEDGCTLRNDKWGQTVFEYDT
KKTSRLPIQDFAPFDIGGDDQEFGLTIGPVCFS
NT seq 3522 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcaagattgggaagaggctacatgcgatatgaaggagacaaaaggtgagaaaggagaa
tcaggagaagaatcaagtggcttcccaactttccctccaggttcatatggccctccagga
gttccaggagcaccgggaggccatggcccaccagggtcatcaggtcaaactggaccccct
ggaccaaggggtgcaagaggagctgatggaccacccggacaatctggaccacctggctca
cctggtcaagctggacaacctggatttcctggaatggctggtgctaaaggagaaagtggt
aaacctggtccccgtggtcctactggccaacaaggtgcaagaggtgaagcaggaagccct
ggtgcaacaggaaagtctggtcaaagaggtccccctggacttagcggtagccctggatca
aaaggctcaagtggtgccgctggtttaccaggtccacaaggattcccaggcccaagagga
gctccaggtccacaaggaagtaatggtgctactggtcctaaaggaagtcagggtaaccca
ggtgtagctggaatgaaaggagcacaaggtccaactggtctaacaggtgattctggtcca
aggggtttgcctggacctgctggtgaagatggacgacgaggtgaacgtggagagcccggt
tcacaaggaactccaggaccccagggagaaatgggagcagctggtgttcgtggatttcct
ggtccatctggtccggctggtgctaagggagaatcgggtgaaccaggtcgtccaggtcca
attggttccaaaggatcctcaggtgacccaggtagagcaggacagcaaggtatgccagga
gcaaggggtttaacaggctcaccaggaaaagaaggtccatcaggaagacccggtactcca
ggtgaaccaggtaaagacggtgatccaggtccagccggtgcaagaggtgctcggggtgaa
agtggtaaagatggtgatgccggtcctgttggacctactggtccgcgtggtcccgctggt
gagagaggtgctacaggagctacaggctctccaggttttgtaggacaaacaggtcagcct
ggtctgccaggagaacctggacaacccggtgaacagggtgtacaaggcgaggcaggtcct
gctggacaaattggaccaaggggagagagaggtcatcctggcgagcgtggtacgccgggt
cccaacggaaagaaaggagatcgtggcttccaaggcgctgccggttcagatggtgcaaag
ggttctagcggtccaaaaggtgtgagaggagaaggcggtccacaaggcttacagggttta
ccaggtccagcaggtttaactggtgcgactggtgctaaaggtgatcgtggtgaaactggt
gagaggggagtaacaggtgctcctggtaaacctggagataggggaagcccgggtccaatg
ggtatttctggtccacaaggttcacaaggagaaaaaggacaaactggtgcccctggccca
ttgggtcaaagtggacccagaggagatactggtgaaactggtcctgcaggccgaccaggt
cctcaaggtctagctggtccacagggtcgtccaggttctacaggtcgtgcaggtagagat
ggtaaaccaggagctaagggtgattctggagatcctggtgaacaaggtgatcgtggtgat
cccggtcctcttggtcccagaggtattcctggtgcaaaaggagacagaggtcccgctggg
cgacctggtccacaaggtttggctggtgcaggcggaagacctggtgcaactggaacgact
ggtcctgctggtgctaagggtgctgctggtgctccaggtactgctggtgcaaagggtgaa
cctggtgaaagtggtgaacaaggaagacctggtgatcagggtctcgaaggtccagaaggt
ccatatggtccaaaaggtgatgcaggaaaagatggaaaagatggtgaaccaggtctacca
ggtccacaaggcgcacagggttccagaggttcaatgggtatgccaggacaaaaaggtgaa
tcaggtccaagaggtgcaccaggtccacagggtgaagatggaaaaactggcctgcctgga
atttctggagagagaggtccagttggtccatctggtcctttgggtccacaaggtccaagg
ggagatcaaggtccagagggtgtgagtggtaaagatggtattccaggtgtccaaggacgt
ccaggtattaaaggtgatcgtggtaatacgggtagtcctggtcctgctggtatgtctggt
ccaatgggagctcctggtccatctggagaagctggtcctcaaggccctactggtgatcct
ggtccatccggaccagttggtccagaaggtgcaagaggttcaagaggtccaagcggagaa
ccaggtattgctggcgctcctggagatgctggtatccagggagcaaggggtgcaaaagga
catcgtggattccctggtctacaaggtattcccggtagtatgggtgttccaggtgaagat
ggtatgacaggacctcctggtccaaatggtccaagaggtgcaactggtcctagaggctcg
ccaggtttgaatggaaaagatggtccaatgggtcaacccggtccagagggtccaagaggt
tctcggggtgacaggggagatagcggtacctccggtcctcccggtccacctggtccacct
ggtcccccaggtgatgctcaaggatttgatgctgcagctttttcatctatgtttgcttca
ttctcacaaccaggcatgaaaggaccacaaggagatgaacccgaaccataccaaggagat
gctatcgcccagaaagtcagagatgttgaagttatggcatcgctgcaatcactcaatgaa
caaatacagaatatacaaacacctactggttcaaagaaaaatccagcaagaacttgtcgt
gacctggctctttgccatccagattggcccagtggtgaatactgggtggatcctaatcaa
ggctgtgctttagatgccattaaagtctactgcgatttcaaaacatatgaatcatgtata
ttcccagaaaagactgaggctccaaagatgaactactaccaaggtccaaacaaacatgtc
tggtttggtgatagcatgaagaatgggtttaagttcaattatgatgtggaacttgtacaa
ttgacattcctccgacttctaagtgttcatggtcgtcagaacgtcacctatcactgcaag
aactcagttgcttactttgatgcagaaacgggtaatttcaagaaggctgccaagttattg
gccgacaccgaagtagaattggtggctcagggcaaaacgcgattccagtattcagtattt
gaagatggttgtactttacgaaatgataaatggggacagaccgtgttcgaatacgatacc
aagaaaacctctcgtctacccattcaagactttgctccatttgatatcggtggtgatgac
caagagttcggtttgactataggaccagtctgtttttcataa

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (189)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (185)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (3)   
   RefSeq(nuc) (1)   
   GenBank (1)   
   EMBL (1)   
Protein domain (2)   
   Pfam (2)   
All databases (199)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system