#=GF ID Transformer
#=GF AC PF06495.17
#=GF DE Fruit fly transformer protein
#=GF AU Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE Pfam-B_13780 (release 10.0)
#=GF GA 26.70 26.70;
#=GF TC 26.70 26.70;
#=GF NC 26.60 26.50;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -E 1000 --cpu 8 -Z 90746521 HMM pfamseq
#=GF TP Family
#=GF WK Tra_(gene)
#=GF RN [1]
#=GF RM 8013913
#=GF RT Molecular population genetics of sex determination genes: the
#=GF RT transformer gene of Drosophila melanogaster.
#=GF RA Walthour CS, Schaeffer SW;
#=GF RL Genetics 1994;136:1367-1372.
#=GF DR INTERPRO; IPR010519;
#=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC This family consists of transformer proteins from several
#=GF CC Drosophila species and also from Ceratitis capitata
#=GF CC (Mediterranean fruit fly). The transformer locus (tra) produces
#=GF CC an RNA processing protein that alternatively splices the
#=GF CC doublesex pre-mRNA in the sex determination hierarchy of
#=GF CC Drosophila melanogaster [1].
#=GF SQ 96
#=GS A0A6J2UC87_DROLE/263-386 AC A0A6J2UC87.1
#=GS Q7ZY06_XENLA/5-122 AC Q7ZY06.2
#=GS A0A4S2LJ24_OPIFE/44-183 AC A0A4S2LJ24.1
#=GS A0A8C3MTB0_GEOPR/6-132 AC A0A8C3MTB0.2
#=GS A0A5N5Q5C2_PANHP/4-131 AC A0A5N5Q5C2.1
#=GS H0W3M0_CAVPO/330-455 AC H0W3M0.2
#=GS A0A8J5N3W6_HOMAM/32-195 AC A0A8J5N3W6.1
#=GS A0A504Z086_FASGI/36-182 AC A0A504Z086.1
#=GS A0A5A9N1D7_9TELE/4-129 AC A0A5A9N1D7.1
#=GS A0A6P4ILQ5_DROKI/1-178 AC A0A6P4ILQ5.1
#=GS A0A6J2W7K5_CHACN/5-129 AC A0A6J2W7K5.1
#=GS A0A8C1IJE1_CYPCA/4-130 AC A0A8C1IJE1.1
#=GS A0A034WF92_BACDO/256-407 AC A0A034WF92.1
#=GS A0A8S9YXQ7_9TREM/83-226 AC A0A8S9YXQ7.1
#=GS H2Z1Z9_CIOSA/1-132 AC H2Z1Z9.1
#=GS A0A6P6R4X7_CARAU/4-130 AC A0A6P6R4X7.1
#=GS A0A498HLI7_MALDO/999-1159 AC A0A498HLI7.1
#=GS A0A9J8BHD5_CYPCA/4-130 AC A0A9J8BHD5.1
#=GS A0A6P6R451_CARAU/4-130 AC A0A6P6R451.1
#=GS A0A034WF92_BACDO/141-260 AC A0A034WF92.1
#=GS A0A671Q5D0_9TELE/4-132 AC A0A671Q5D0.1
#=GS A0A8C1IJ45_CYPCA/4-131 AC A0A8C1IJ45.1
#=GS E7F8Y4_DANRE/5-131 AC E7F8Y4.3
#=GS B4L9E2_DROMO/1-197 AC B4L9E2.1
#=GS A0A1S3YZ20_TOBAC/116-264 AC A0A1S3YZ20.1
#=GS A0A811V031_CERCA/97-210 AC A0A811V031.1
#=GS A0A672N9C4_SINGR/4-132 AC A0A672N9C4.1
#=GS A0A7J6B1P6_AMEME/5-132 AC A0A7J6B1P6.1
#=GS A0A9Q0BQR5_9MUSC/1146-1316 AC A0A9Q0BQR5.1
#=GS A0A8E0VKR5_9TREM/42-182 AC A0A8E0VKR5.1
#=GS A0A672NDC1_SINGR/4-132 AC A0A672NDC1.1
#=GS A0A3Q0GZD2_ALLSI/292-408 AC A0A3Q0GZD2.1
#=GS A0AAD9DWG7_9TELE/5-129 AC A0AAD9DWG7.1
#=GS A0A9R1SQ91_CYPCA/4-130 AC A0A9R1SQ91.1
#=GS A0A3Q0GZE8_ALLSI/292-408 AC A0A3Q0GZE8.1
#=GS A0A6P4ERD9_DRORH/3-181 AC A0A6P4ERD9.1
#=GS A0A2H1CKV4_FASHE/36-182 AC A0A2H1CKV4.1
#=GS W2PYB1_PHYN3/65-216 AC W2PYB1.1
#=GS V9ERF1_PHYNI/63-214 AC V9ERF1.1
#=GS Q6NVN9_XENTR/6-122 AC Q6NVN9.1
#=GS A0AA88TR75_9TELE/5-132 AC A0AA88TR75.1
#=GS A0A6P8XAT3_DROAB/1-187 AC A0A6P8XAT3.1
#=GS A0A6J2U9M1_DROLE/1-215 AC A0A6J2U9M1.1
#=GS A0A6P5DDN5_BOSIN/6-124 AC A0A6P5DDN5.1
#=GS A0A8J4TBW6_9TREM/43-186 AC A0A8J4TBW6.1
#=GS A0A6P4F5V6_DRORH/1-122 AC A0A6P4F5V6.1
#=GS A0A3B1KG14_ASTMX/5-128 AC A0A3B1KG14.1
#=GS A0A811V031_CERCA/206-371 AC A0A811V031.1
#=GS A0A1L8FMU9_XENLA/6-121 AC A0A1L8FMU9.1
#=GS G7YVU8_CLOSI/44-183 AC G7YVU8.1
#=GS B5DR46_DROPS/1-187 AC B5DR46.2
#=GS A0A6P6R3X2_CARAU/4-130 AC A0A6P6R3X2.1
#=GS A0A812WMA8_9DINO/2-165 AC A0A812WMA8.1
#=GS A0A673IKY5_9TELE/4-132 AC A0A673IKY5.1
#=GS A0A671PZU4_9TELE/6-128 AC A0A671PZU4.1
#=GS A0A6P6R457_CARAU/4-130 AC A0A6P6R457.1
#=GS A0A6J2UC87_DROLE/157-267 AC A0A6J2UC87.1
#=GS R7UB06_CAPTE/564-706 AC R7UB06.1
#=GS A0A1L8FGS2_XENLA/6-122 AC A0A1L8FGS2.1
#=GS B4J1D8_DROGR/261-443 AC B4J1D8.1
#=GS A0A182YCS6_ANOST/44-174 AC A0A182YCS6.1
#=GS A0A9W7WQT5_TRIRA/4-129 AC A0A9W7WQT5.1
#=GS A0A7J6C7Y5_9TELE/5-132 AC A0A7J6C7Y5.1
#=GS Q8MWH1_CERCA/252-417 AC Q8MWH1.1
#=GS A0A9E8BW93_9ABAC/106-221 AC A0A9E8BW93.1
#=GS Q8MWH1_CERCA/142-260 AC Q8MWH1.1
#=GS A0A1U7YQ33_NICSY/115-264 AC A0A1U7YQ33.1
#=GS S8BSI1_DACHA/12-142 AC S8BSI1.1
#=GS A0A8T2IPV8_9PIPI/6-122 AC A0A8T2IPV8.1
#=GS A0A6P3VNT8_CLUHA/3-129 AC A0A6P3VNT8.1
#=GS TRSF_DROME/3-187 AC P11596.1
#=GS B3M4G4_DROAN/3-179 AC B3M4G4.2
#=GS B4H201_DROPE/1-143 AC B4H201.1
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#=GS A0A8J0TBG2_XENLA/6-121 AC A0A8J0TBG2.1
#=GS A0A498N7F9_LABRO/5-132 AC A0A498N7F9.1
#=GS A0A0R3SJW2_HYMDI/34-170 AC A0A0R3SJW2.1
#=GS A0A484B9M7_DRONA/1-204 AC A0A484B9M7.1
#=GS A0A6P8SDK1_GEOSA/6-122 AC A0A6P8SDK1.1
#=GS A0A5J4N9G6_9TREM/43-186 AC A0A5J4N9G6.1
#=GS B4QMV6_DROSI/1-172 AC B4QMV6.1
#=GS A0A4W4FQW6_ELEEL/5-129 AC A0A4W4FQW6.1
#=GS A0A8X7WY61_POLSE/34-156 AC A0A8X7WY61.1
#=GS A0A8T2IUA3_9PIPI/6-122 AC A0A8T2IUA3.1
#=GS Q28EQ0_XENTR/6-122 AC Q28EQ0.1
#=GS A0A074ZGI3_9TREM/102-241 AC A0A074ZGI3.1
#=GS A0A1L3KIY5_9VIRU/2-147 AC A0A1L3KIY5.1
#=GS W2YXA1_PHYNI/65-216 AC W2YXA1.1
#=GS A0A8C6X926_NAJNA/6-122 AC A0A8C6X926.1
#=GS A0A671Q131_9TELE/4-132 AC A0A671Q131.1
#=GS A0A8C0YQJ0_CYPCA/4-130 AC A0A8C0YQJ0.2
A0A6J2UC87_DROLE/263-386 ..................................................hdhlrdle------------.--.........................-------....--------.----------.-------.--.-----.KRT.......RSRSRSRERRTR.....RTS.C.GRRY...QD...R........NANQ...RGS..TTserr.rsysRD.TSSR.DC.....SPR.R....----RT..R..wRSP...APPIISVP....VP...VPA..ADP.-YGY.L.--...--..---FNAM.....Y..A.P.LS...F....PIH.H....H....P-...-PW-..---------..-----.--.--.-----dqfrgrlppppsyfga..........................................
Q7ZY06_XENLA/5-122 ..............................................deferqlnenkq------------.--.........................-------....--------.----------.-------.E-.---RD.KEN.......RHRKRSRSRSK-.....--S.K.ERKR...RS...R........SKER...R--..-A.........RE.QRSG.SR.....DRR.R....RSRSPR..H...--E...KKKKIRKY....WD...IPP..PGF.EH--.-.--...--..-------.....-..-.-.--...-....---.-....-....--...----..---------..-----.--.--.-----itplqykamqaagqipatallptmtpdglavtptpv......................
A0A4S2LJ24_OPIFE/44-183 ..............................................dinsteyldrkd------------.--.........................-------....--------.----------.-------.-R.-SPRH.RKR.......DSSSEDRGRDRK.....RDK.K.RSRS...RS...R........SRER..rRHS..RD.........RH.RDRS.RE.....RRS.K....HRHSRH..R...-SE...TPPLIYKY....WD...VPP..PGF.EHVT.P.AQ...YK..AMQASGQ.....I..P.V.NV...Y....AAG.Q....I....PM...PAH-..AP-------..-----.--.--.-----napltlttnipfagsa..........................................
A0A8C3MTB0_GEOPR/6-132 .................................................eferqlnen------------.--.........................-------....--------.----------.-------.--.--KQE.RDK.......ENRHRKRSHSRS.....RS-.R.DRKR...RS...R........SRER...R--..-N.........RD.QRSV.SR.....DRR.R....RSRSPR..H...-EK...-KKKIRKY....WD...VPP..G--.----.-.--...--..-------.....-..-.-.--...-....---.-....-....--...----..---------..-----.--.--.-----fehitpmqykamqaagqipatallptmtpdglavtptpvpvvgsqmtrqa........
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H0W3M0_CAVPO/330-455 ................................................vqeevfeqea------------.--.........................-------....--------.----------.-------.--.-----.KKV.......AVRSRSRTHSRS.....RSR.R.KHRK...RS...R........SRSR...ERK..RK.........SS.RSYS.S-.....ERR.A....REREKE..R..qKKG...LPPIRSKT....L-...---..---.----.-.--...--..-------.....-..-.-.--...-....---.-....-....--...----..---------..-----.--.--.-----svcsttlwvgqvdkkatqqdltnlfeefgqiesinmipprgcayvcmvhr........
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A0A504Z086_FASGI/36-182 .........................................hddrdgdfsthsqennk------------.--.........................-------....--------.----------.-------.--.-NLSP.KSH.......KRDSSNEDRSRD.....RKR.D.KRRS...RS...R........SYSRdrrRRS..RS.........RH.RDRS.RE.....RRS.K....RRHSRH..R...SPS...TPPLIYKY....WD...VPP..PGF.EHVT.P.--...--..-AQYKAM.....QasG.Q.IP...V....NLY.A....A....GQ...IPM-..---------..-----.--.--.-----pahtpnapltlntnipfagsa.....................................
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A0A6J2W7K5_CHACN/5-129 ......................................................defe------------.--.........................-------....--------.-------RQL.SENKHER.DK.--ENK.HHR.......--RSGSRSRSRD.....RE-.R.KRRS...RD...R........DRER...RGS..RD.........RH.GDSK.D-.....RRH.R....RSRSPH..R...EKK...--KKQKKY....WD...VPP..PGF.EH--.-.--...--..-------.....-..-.-.--...-....---.-....-....--...----..---------..-----.--.--.-----itpmqykamqaagqipatallptmtpdglavtptpvp.....................
A0A8C1IJE1_CYPCA/4-130 ................................................fdeferqlte------------.--.........................-------....--------.----------.---NKQA.DR.DKENK.HHR.......RTGSRSRSRDQD.....R--.-.--KR...RS...Q........DRER...R-G..GS.........RD.RHGD.SK....dRRH.R....RSRSPH..R...EKK...KIKV-KKY....WD...VPP..PGF.EHI-.-.--...--..-------.....-..-.-.--...-....---.-....-....--...----..---------..-----.--.--.-----tpmqykamqaagqipatallptmtpeglavtptpvp......................
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A0A6P6R451_CARAU/4-130 ................................................fdeferqlte------------.--.........................-------....--------.----------.---NKQA.DR.DKENK.HHR.......RSGSRSRSRDQD.....---.-.-RKR...RS...R........DRER...R-G..GS.........RD.RHGD.SK....dRRH.R....RSRSPH..R...EKK...KIKV-KKY....WD...VPP..PGF.EHI-.-.--...--..-------.....-..-.-.--...-....---.-....-....--...----..---------..-----.--.--.-----tpmqykamqaagqipatallptmtpeglavtptpvp......................
A0A034WF92_BACDO/141-260 ........................................sddkyaarrnaspspnyr------------.--.........................--RKTPE....KIPYFVDQ.VRERDRIRRK.YGSTRNK.SP.PASSKfRRR.......RSISRSRSRSHS.....RDS.L.KTKQ...RSparR........TNYR...RRS..IS.........VD.REWG.GN.....SKR.E....REREKS..R...AD-...--------....--...---..---.----.-.--...--..-------.....-..-.-.--...-....---.-....-....--...----..---------..-----.--.--.-----kdlhg.....................................................
A0A671Q5D0_9TELE/4-132 ................................................fdeferqlte------------.--.........................-------....--------.----------.---NKQA.DR.DKENK.HHR.......RSGSRSRSR--D.....QD-.R.KRRS...RD...Q........DRER...RG-..SS.........RD.RHGD.SK....dHRH.R....RSRSPH..R...EKK...KIKV-KKY....WD...VPP..PGF.EHI-.-.--...--..-------.....-..-.-.--...-....---.-....-....--...----..---------..-----.--.--.-----tpmqykamqaagqipatallptmtpeglavtptpvp......................
A0A8C1IJ45_CYPCA/4-131 ................................................fdeferqlte------------.--.........................-------....--------.----------.---NKQA.DR.DKENK.HHR.......RTGSRSRSRDQD.....R--.-.--KR...RS...Q........DRER...R-G..GS.........RD.RHGD.SK....dRRH.R....RSRSPH..R...EKK...KIKV-KKY....WD...VPP..PGF.EHI-.-.--...--..-------.....-..-.-.--...-....---.-....-....--...----..---------..-----.--.--.-----tpmqykamqaagqipatallptmtpeglavtptpvpv.....................
E7F8Y4_DANRE/5-131 .................................................deferqlte------------.--.........................-------....--------.----------.---NKQA.DR.DKENK.HH-.......-RRSGSRSRSRD.....RD-.R.KRRS...RD...R........DRER...RGS..RD.........RH.GDSK.D-.....RRH.R....RSRSPH..R...EKK...KIKV-KKY....WD...VPP..PGF.EHI-.-.--...--..-------.....-..-.-.--...-....---.-....-....--...----..---------..-----.--.--.-----tpmqykamqaagqipatallptmtpeglavtptpvp......................
B4L9E2_DROMO/1-197 ..........................................................MDADSSSRSPRD.TR.........................RRTRPKEkekeKVPYFADE.ARERDRVRNL.RLRKTSI.TR.PTTPP.RGR.......PRRARSRSYSAE.....RNC.C.HRRR...RS...R........SYER...RHS..SN.........RY.KSAT.ALaakpnRRR.S....RSRSRS..R..sRSR...TPRIITVP....VP...VPA..ADY.PYAY.A.WP...PPpqRPHFNPM.....Y..G.A.VP...Y....GLP.P....R....PVypgHPYF..APYPRPRPT..FPYRA.AP.FR.PHPRF..........................................................
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