KEGG   Vitis vinifera (wine grape): 100248441
Entry
100248441         CDS       T01084                                 
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: pentatricopeptide repeat-containing protein At2g22410, mitochondrial
Organism
vvi  Vitis vinifera (wine grape)
SSDB
Motif
Pfam: PPR_2 PPR PPR_1 E_motif PPR_3 PPR_long Eplus_motif AARP2CN
Other DBs
NCBI-GeneID: 100248441
NCBI-ProteinID: XP_010651252
Position
6:2407833..2409823
AA seq 663 aa
MFILFLIRLGSLRWIQKPSLPSSRHIHTRALSPHKENPINWNTNHSFVLSNPFLSLLEKC
KSISQLKQIQSQMVLTGLIEDGFASSRLIAFCAISEWRDLDYCTNILFNTRNPNTFSWNV
AIRGFLDSENPREAVVLYKRVLQCDGTKPDNYTYPLLFKACARLSLIRMGSEILGHVLHL
GFDSDIFVSNAVIHLLVSCGDLDGARKMFDKSCVRDLVSWNSMINGYVRRGWAYEALNFY
REMKVEGIKPDEVTMIGVVSSCAQLEDLDLGRESHCYIEENGLKLTVPLANALMDMYMKC
GNLESARKLFDSMTNKTMVSWTTMVVGYAQSGLLDMAWKLFDEMPDKDVVPWNAMIGGYV
HANRGKEALALFNEMQAMNINPDEVTMVSCLSACSQLGALDVGIWIHHYIEKHELSLNVA
LGTALIDMYAKCGKITKAIQVFQELPGRNSLTWTAIISGLALHGNAHGAIAYFSEMIDNS
VMPDEVTFLGLLSACCHGGLVEEGRKYFSQMSSKFNLSPKLKHYSCMVDLLGRAGLLEEA
EELIKSMPIEADAVVWGALFFACRIHGNVLMGERAASKLLQMDPHDSGIYVLLANMYGEA
EMWKEAGKARKLMRQRGVEKTPGCSSIEVNGIVYEFIVRDKSHPQSEQIYECXDSVNKTV
GAC
NT seq 1991 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtttatcctctttctcattcgcctcggatctctacgttggattcaaaagccttcactt
ccttcttcacgacacattcacactcgcgctctctcaccccacaaagaaaaccccataaat
tggaacacaaaccactcttttgttctctcaaatcctttcctctctcttctggaaaaatgc
aaatccatctcccagctgaagcaaatccagtcccaaatggtcctaacagggctaatcgaa
gatgggtttgcctccagtaggttgatcgctttttgtgctatctcagaatggcgagatctt
gattactgtactaacattttgtttaatacccgaaaccctaatacgttttcttggaatgtg
gctattagagggtttttggacagcgagaacccgcgagaagctgttgtattgtataagaga
gtgttgcaatgtgatgggactaagcctgataattacacctaccctttgttgtttaaggct
tgtgcgaggttgtcgttgattcggatgggaagtgagattcttgggcatgtgttgcatttg
ggttttgattcggatatatttgtatctaatgcggtgattcacttgttggtgtcgtgtggg
gatctagacggtgcacggaaaatgtttgataaaagttgtgtaagggatttggtttcttgg
aattcaatgataaatgggtatgttcggagagggtgggcgtatgaggcattaaatttttat
agggaaatgaaggtggagggaattaagccagatgaggttacaatgattggggttgtttcc
tcatgtgcccagttggaggatttggatcttggaagagagtcacattgttatattgaagaa
aatggattgaaacttacagttccacttgctaatgcgcttatggacatgtacatgaagtgt
gggaatttagagtcagcacgaaagttatttgatagcatgacaaacaaaaccatggtctcg
tggactacaatggttgtgggctatgcccagtctggccttctggatatggcatggaagctt
tttgatgagatgccggacaaagatgtggtaccttggaatgccatgattggtggttatgtt
catgccaaccgtggtaaggaggctttggctttgtttaatgaaatgcaagccatgaatata
aatcctgatgaggtaaccatggttagctgcttaagtgcatgctcacaacttggagctctt
gatgttggaatatggattcaccattatattgaaaaacatgaactttctctaaatgtggca
ttggggactgccctaattgacatgtatgccaaatgtgggaagatcactaaggctattcag
gttttccaagagcttcctggaagaaattctttgacttggacagccattattagtggttta
gcccttcatgggaatgcacatggtgccatagcttacttctcggagatgattgataatagt
gtgatgccagatgaggtcaccttccttggcttattatcagcttgttgtcatggaggtttg
gttgaagagggtcgtaagtatttttctcaaatgagctccaaatttaatctttcccccaag
cttaaacactattcttgcatggtggatcttctaggaagggctggtcttttagaggaggca
gaagaactgattaagagtatgccaatagaggcagatgctgttgtgtggggtgcactgttt
tttgcatgtcgaattcatgggaatgttttgatgggagaacgagcagcttctaaacttctt
caaatggatcctcatgacagtggaatttatgttttgcttgcaaatatgtatggagaagca
gaaatgtggaaggaggccgggaaggcgaggaagctgatgaggcagagaggagtggagaag
actcctggttgtagttcaattgaggtgaatggtattgtttatgagttcattgttagagac
aaatcacaccctcaatctgaacagatctacgaatgtttgattcagttaacaagacagttg
gagcttgttga

  All links  
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (12)   
   RefGene (8)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   OC (1)   
   PGDBJ (1)   
Protein sequence (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (3)   
   RefSeq(nuc) (1)   
   GenBank (1)   
   EMBL (1)   
Protein domain (8)   
   Pfam (8)   
All databases (25)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system