KEGG   Vitis vinifera (wine grape): 100264679
Entry
100264679         CDS       T01084                                 
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21300
Organism
vvi  Vitis vinifera (wine grape)
SSDB
Motif
Pfam: PPR_2 PPR PPR_1 PPR_3 E_motif PPR_long Eplus_motif AEP1
Other DBs
NCBI-GeneID: 100264679
NCBI-ProteinID: XP_019077990
Position
10:complement(15670776..15673337)
AA seq 853 aa
MHHKNLSSIYKCFLPSTTFKLKSFHTNSVNIGKPLQFSIHNDDSLAPQLVSILQTCTDPS
GLSQGRQAHAQMLVNGIGYNGILGTKLLGMYVLCGAFLDAKNIFYQLRLWCSEPWNWMIR
GFTMMGQFDFALLFYFKMLGCGTLPDKYTFPYVIKACGGLNSVALGRVVHDKIQFMGFEL
DVFVGSSLIKFYSENGCIHDARYLFDRMPSKDGVLWNVMLNGYVKNGDWDNATGVFMEMR
RTETNPNSVTFACVLSVCASEIMINFGSQLHGLVVSSGLEMDSPVANTLLAMYAKCGHLF
DARRLFDMMPKTDLVTWNGMISGYVQNGFMDEASCLFHEMISARMKPDSITFSSFLPLLS
EGATLRQGKEIHCYIIRNGVSLDVFLKSALIDIYFKCRDVEMARKIFDQRTPVDIVVCTA
MISGYVLNGMNNNALEIFRWLLQERMRANSVTLASVLPACAGLAALTLGKELHGHILKNG
HGGSCYVGSAIMDMYAKCGRLDLAHQTFIGISDKDAVCWNSMITSCSQNGKPEEAIDLFR
QMGMAGTKYDCVSISAALSACANLPALHYGKEIHAFMMRGAFRSDLFAESALIDMYSKCG
NLDLACRVFDTMEEKNEVSWNSIIAAYGNHGRLKDSLNLFHGMLGDGIQPDHVTFLAIIS
ACGHAGQVDEGIHYFRCMTEELGIMARMEHYACMVDLFGRAGRLNEAFGMINSMPFSPDA
GVWGTLLGACRLHGNVELAEVASRNLFDLDPQNSGYYVLLSNVHANAGQWESVLKIRSLM
KERGVQKVPGCSWIDVNNTTHMFVAADRSHPQSSQIYLLLKNLFLELRKEGYVPQLYLPM
HPQTMGLQSSEKG
NT seq 2562 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcaccacaaaaatctatcttcaatctataaatgtttcttaccaagtaccacatttaag
ctcaagtcctttcacacaaattccgtaaacattggaaagccacttcagttctccatacac
aatgatgactctttggcaccccaacttgtatcaatcttgcaaacctgtaccgacccttct
ggtctctcacaaggtcgccaggcccatgcccagatgcttgtcaacggaattggctacaat
gggattctcggtaccaagcttttggggatgtatgtgctttgtggtgccttcttagatgct
aagaacatattttatcagcttcgactttggtgttctgagccttggaattggatgattagg
ggttttactatgatgggtcagtttgattttgccttgttgttttactttaagatgttgggc
tgtggcactttgcctgataaatatacttttccttatgtgattaaggcttgtggtggcttg
aatagcgtggccttgggaagggtagttcatgataagattcagtttatgggttttgagttg
gatgtgtttgtgggtagttctttgataaagttttattcggagaatggttgcattcatgat
gcccgttatttgtttgatagaatgccgagcaaagacggtgttttgtggaatgtgatgctt
aatggttacgtgaaaaatggggactgggataatgctacaggggtgtttatggaaatgagg
agaactgaaactaatcctaattctgtaacatttgcttgtgttctgtctgtctgcgcttct
gagataatgattaattttggttcacagcttcatgggcttgttgtcagttctgggttggag
atggattctccagtagcaaacacattgttagccatgtatgcaaaatgtgggcacttgttt
gacgcacgtaggttgtttgatatgatgcctaaaactgatttggtgacttggaatgggatg
atttctgggtatgtccagaatgggtttatggatgaggcttcatgtttgtttcatgagatg
atttctgctcgtatgaaaccagactctatcacattctcaagtttccttccattgctttct
gaaggggcaactctcagacaaggtaaggaaattcattgctatattatcaggaatggtgtg
tccttggatgtgtttttgaagagtgcacttattgatatatactttaagtgcagggatgtg
gagatggcacgcaagattttcgaccaaagaacccctgtagatattgtggtgtgcacagct
atgatttcaggttatgtactaaatgggatgaataacaatgccttggaaattttccggtgg
ttgcttcaagagagaatgagagccaattcagtaacactggcaagtgtcttacctgcttgt
gctggtctggctgccttgacattggggaaggaattgcatggtcacatactcaagaatgga
catggaggaagctgctatgtaggaagtgcaataatggacatgtatgcaaaatgtggaaga
ttggacttagctcatcaaacttttattggaatatctgataaagatgctgtctgttggaat
tcaatgatcacaagctgttcccagaatggcaaacctgaagaagctattgatcttttccgt
caaatggggatggcaggaaccaagtatgactgtgtgagcatatcagctgctctttcagct
tgtgcaaatttaccagcactccattatggaaaggagatccatgcttttatgatgagaggt
gcgttcagatctgacctttttgctgagagtgcattaatagacatgtattctaaatgcggg
aacttggaccttgcttgccgtgtttttgacacgatggaagagaagaatgaagtttcatgg
aatagcattatagctgcttatgggaaccatggtcgcctcaaggactctcttaatctgttc
catggaatgttgggagatggaattcagcctgaccatgtcacatttcttgccattatatct
gcttgtggccatgcggggcaagttgatgaaggaattcactactttcgttgcatgactgaa
gaattgggtataatggctaggatggagcattacgcatgcatggttgatttatttggacgt
gctggccgtttgaatgaagccttcggaatgataaatagcatgccattcagtccagatgct
ggtgtatgggggactttacttggagcttgtagacttcatggaaatgttgagcttgcagaa
gtggcatcaagaaatctatttgatttggatccacaaaattccggatattatgtattacta
tcaaatgtacatgcaaatgctgggcaatgggagagtgttcttaagatacggagcttgatg
aaggaaagaggagtgcagaaggtacctggttgcagctggatagatgtcaataacaccacc
catatgtttgttgctgcagacagaagtcacccacagtcttctcagatctatcttttactg
aagaatcttttcttggagctgagaaaagagggttatgttcctcaactctaccttccaatg
cacccacaaaccatggggttacagtcatcagaaaaaggttga

  All links  
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (13)   
   RefGene (9)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   OC (1)   
   PGDBJ (1)   
Protein sequence (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (6)   
   RefSeq(nuc) (2)   
   GenBank (2)   
   EMBL (2)   
Protein domain (8)   
   Pfam (8)   
All databases (29)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system