KEGG   Vitis vinifera (wine grape): 100264876
Entry
100264876         CDS       T01084                                 
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At4g14820
Organism
vvi  Vitis vinifera (wine grape)
SSDB
Motif
Pfam: PPR PPR_2 PPR_1 DYW_deaminase PPR_3 E_motif PPR_long TPR_19 Eplus_motif
Other DBs
NCBI-GeneID: 100264876
NCBI-ProteinID: XP_002278762
UniProt: D7T700
Position
5:join(5548997..5549586,5549905..5551498)
AA seq 727 aa
MSQTALALPPNPNPATPTTLHSHHTLFSALSSATSLTHLKQVHAQILRSKLDRSTSLLVK
LVISSCALSSSLDYALSVFNLIPKPETHLCNRFLRELSRSEEPEKTLLVYERMRTQGLAV
DRFSFPPLLKALSRVKSLVEGLEIHGLAAKLGFDSDPFVQTGLVRMYAACGRIAEARLMF
DKMFHRDVVTWSIMIDGYCQSGLFNDALLLFEEMKNYNVEPDEMMLSTVLSACGRAGNLS
YGKMIHDFIMENNIVVDPHLQSALVTMYASCGSMDLALNLFEKMTPKNLVASTAMVTGYS
KLGQIENARSVFNQMVKKDLVCWSAMISGYAESDSPQEALNLFNEMQSLGIKPDQVTMLS
VITACAHLGALDQAKWIHLFVDKNGFGGALPINNALIEMYAKCGSLERARRIFDKMPRKN
VISWTCMISAFAMHGDAGSALRFFHQMEDENIEPNGITFVGVLYACSHAGLVEEGRKIFY
SMINEHNITPKHVHYGCMVDLFGRANLLREALELVEAMPLAPNVIIWGSLMAACRVHGEI
ELGEFAAKRLLELDPDHDGAHVFLSNIYAKARRWEDVGQVRKLMKHKGISKERGCSRFEL
NNEIHEFLVADRSHKHADEIYEKLYEVVSKLKLVGYSPNTCSILVDLEEEEKKEVVLWHS
EKLALCYGLMRDGTGSCIRIIKNLRVCEDCHTFIKLASKVYEREIVVRDRTRFHHYKDGV
CSCKDYW
NT seq 2184 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcgcagactgccttagcactccctcctaacccaaaccccgccacacccaccaccctc
cacagccaccacaccctcttctcagctctctcctccgctacctctcttacccaccttaaa
caagtccacgcccaaatccttcgatccaaacttgaccgctccacctcactcctcgtcaaa
ctcgtcatctcctcctgcgctctctcctccagcctcgactacgctctctctgtcttcaac
ctcattcccaagcccgaaactcacctctgcaaccgcttcctgcgcgagctgtcgaggagt
gaggagccggagaaaactcttttggtgtacgagagaatgaggacgcaaggattggccgtg
gacaggttcagctttccgcccctcttgaaagcattgtcgagagtgaagtctctggttgaa
gggctggagattcatggattggctgctaagttggggtttgactcggacccctttgttcaa
actggtttggtacgaatgtacgcggcttgtgggcggattgcagaggcgaggttgatgttt
gataaaatgttccaccgggatgttgtcacatggagcattatgattgacggatattgtcag
agtggccttttcaatgatgctttgctgctatttgaagagatgaagaactataatgtggag
cctgatgagatgatgctttctacagttctttctgcttgtggccgtgctggaaatttaagt
tatgggaaaatgatccatgatttcattatggagaataatattgtggttgatcctcatttg
cagagtgctcttgtcaccatgtatgcaagttgtggctccatggatttggctctgaattta
tttgagaagatgacaccaaaaaaccttgttgcttcaactgctatggttactgggtattca
aaacttggacagattgaaaatgctcgctcagttttcaatcaaatggttaaaaaggacttg
gtctgttggagtgctatgatatctggttatgctgagagtgatagtcctcaagaagctctt
aatttgttcaatgaaatgcaatctttgggaataaaacctgatcaagttaccatgttgagt
gttatcacagcttgtgctcatcttggtgcattggatcaagccaaatggatccatttattt
gttgataagaatggttttgggggagctttgcctattaacaatgcccttattgaaatgtat
gccaaatgtgggagtttggagagagcaagaagaatttttgataagatgcccagaaaaaat
gtgatatcctggacctgcatgatcagtgcctttgccatgcatggggatgccggtagtgca
ttgaggttcttccatcaaatggaagatgaaaatattgaacccaatgggattacatttgtt
ggtgtactttatgcttgtagccatgcaggattggttgaggagggtcgcaagatcttttac
tcaatgattaatgagcacaacatcaccccaaaacatgtgcactatggttgcatggtagat
ctctttggccgtgctaatctccttagagaagcccttgagcttgtagaggctatgcctttg
gcaccaaatgttatcatctggggatctttgatggctgcttgccgagtccatggtgagatt
gaattaggagaatttgcagcaaaaaggcttcttgagctagatccagatcatgatggggct
catgtgttcttgtcaaacatctatgccaaagcaaggagatgggaggatgttggacaagtg
aggaaattgatgaaacataaagggatttctaaggaaagaggatgcagtagatttgaactg
aacaatgagatacatgagtttttggtggcagataggagtcataaacatgcagatgagata
tatgaaaagctatatgaggtggttagcaagttgaagctggttggttattctccaaatacc
tgtagcattttggttgatttagaagaagaagaaaaaaaggaagtggttctatggcacagt
gagaagttggcactttgttatgggcttatgagggatggaacagggtcttgcatacgtata
attaagaatcttagggtctgtgaggactgccatacctttattaagttggcatcaaaggtg
tatgaaagagagattgttgtcagagataggactaggtttcaccattacaaagatggtgta
tgttcttgtaaagattattggtaa

  All links  
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (12)   
   RefGene (8)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   OC (1)   
   PGDBJ (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (5)   
   RefSeq(nuc) (1)   
   GenBank (2)   
   EMBL (2)   
Protein domain (9)   
   Pfam (9)   
All databases (29)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system