1. Oxidoreductases
2. Transferases
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.2 Glycosylases
3.3 Acting on ether bonds
3.4 Acting on peptide bonds (peptidases)
3.4.11 Aminopeptidases
3.4.13 Dipeptidases
3.4.14 Dipeptidyl-peptidases and tripeptidyl-peptidases
3.4.15 Peptidyl-dipeptidases
3.4.16 Serine-type carboxypeptidases
3.4.17 Metallocarboxypeptidases
3.4.18 Cysteine-type carboxypeptidases
3.4.19 Omega peptidases
3.4.21 Serine endopeptidases
3.4.22 Cysteine endopeptidases
3.4.22.1 cathepsin B
3.4.22.2 papain
3.4.22.3 ficain
3.4.22.6 chymopapain
3.4.22.7 asclepain
3.4.22.8 clostripain
3.4.22.10 streptopain
3.4.22.14 actinidain
3.4.22.15 cathepsin L
3.4.22.16 cathepsin H
3.4.22.24 cathepsin T
3.4.22.25 glycyl endopeptidase
3.4.22.26 cancer procoagulant
3.4.22.27 cathepsin S
3.4.22.28 picornain 3C
3.4.22.29 picornain 2A
3.4.22.30 caricain
3.4.22.31 ananain
3.4.22.32 stem bromelain
3.4.22.33 fruit bromelain
3.4.22.34 legumain
3.4.22.35 histolysain
3.4.22.36 caspase-1
3.4.22.37 gingipain R
3.4.22.38 cathepsin K
3.4.22.39 adenain
3.4.22.40 bleomycin hydrolase
3.4.22.41 cathepsin F
3.4.22.42 cathepsin O
3.4.22.43 cathepsin V
3.4.22.44 nuclear-inclusion-a endopeptidase
3.4.22.45 helper-component proteinase
3.4.22.46 L-peptidase
3.4.22.47 gingipain K
3.4.22.48 staphopain
3.4.22.49 separase
3.4.22.50 V-cath endopeptidase
3.4.22.51 cruzipain
3.4.22.52 calpain-1
3.4.22.53 calpain-2
3.4.22.54 calpain-3
3.4.22.55 caspase-2
3.4.22.56 caspase-3
3.4.22.57 caspase-4
3.4.22.58 caspase-5
3.4.22.59 caspase-6
3.4.22.60 caspase-7
3.4.22.61 caspase-8
3.4.22.62 caspase-9
3.4.22.63 caspase-10
K04400 CASP10; caspase 10 [EC:3.4.22.63]
3.4.22.64 caspase-11
3.4.22.65 peptidase 1 (mite)
3.4.22.66 calicivirin
3.4.22.67 zingipain
3.4.22.68 Ulp1 peptidase
3.4.22.69 SARS coronavirus main proteinase
3.4.22.70 sortase A
3.4.22.71 sortase B
3.4.23 Aspartic endopeptidases
3.4.24 Metalloendopeptidases
3.4.25 Threonine endopeptidases
3.4.26 Glutamic endopeptidases
3.5 Acting on carbon-nitrogen bonds, other than peptide bonds
3.6 Acting on acid anhydrides
3.7 Acting on carbon-carbon bonds
3.8 Acting on halide bonds
3.9 Acting on phosphorus-nitrogen bonds
3.10 Acting on sulfur-nitrogen bonds
3.11 Acting on carbon-phosphorus bonds
3.12 Acting on sulfur-sulfur bonds
3.13 Acting on carbon-sulfur bonds
4. Lyases
5. Isomerases
6. Ligases
7. Translocases