KEGG   ORTHOLOGY: K01148
Entry
K01148                      KO                                     
Symbol
PARN, PNLDC1
Name
poly(A)-specific ribonuclease [EC:3.1.13.4]
Pathway
map03018  RNA degradation
Disease
H00507  Dyskeratosis congenita
H01282  Spermatogenic failure
H02569  Pulmonary fibrosis and/or bone marrow failure, telomere-related
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K01148  PARN, PNLDC1; poly(A)-specific ribonuclease
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K01148  PARN, PNLDC1; poly(A)-specific ribonuclease
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.13  Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.13.4  poly(A)-specific ribonuclease
     K01148  PARN, PNLDC1; poly(A)-specific ribonuclease
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Other 3'-5' decay factors
     K01148  PARN, PNLDC1; poly(A)-specific ribonuclease
Other DBs
GO: 0004535
Genes
HSA: 154197(PNLDC1) 5073(PARN)
PTR: 453936(PARN) 463111(PNLDC1)
PPS: 100986002(PARN) 100992111(PNLDC1)
GGO: 101146526(PNLDC1) 101150804(PARN)
PON: 100172259(PARN) 100173475(PNLDC1)
NLE: 100586640(PNLDC1) 100598246(PARN)
MCC: 707835(PNLDC1) 712984(PARN)
MCF: 102118442(PNLDC1) 102119460(PARN)
CSAB: 103228729(PARN) 103240827(PNLDC1)
CATY: 105572229(PARN) 105581320(PNLDC1)
PANU: 101001405(PNLDC1) 101026430(PARN)
TGE: 112614387(PARN) 112622996(PNLDC1)
RBB: 108516170(PNLDC1) 108523758(PARN)
TFN: 117096924(PNLDC1) 117097631(PARN)
PTEH: 111547275(PNLDC1)
CJC: 100388797(PNLDC1) 100394289(PARN)
SBQ: 101034109(PARN) 101052910(PNLDC1)
CSYR: 103257700 103267256(PARN) 103276931(PNLDC1)
MMUR: 105855234(PARN) 105868609(PNLDC1)
OGA: 100947311(PARN) 100967205(PNLDC1)
MMU: 240023(Pnldc1) 74108(Parn)
MCAL: 110284098(Pnldc1) 110311785(Parn)
MPAH: 110329518(Parn) 110338358(Pnldc1)
RNO: 360464(Parn) 361478(Pnldc1)
MCOC: 116076795(Pnldc1) 116085448(Parn)
MUN: 110547874(Pnldc1) 110556852(Parn)
CGE: 100762328(Pnldc1) 100771839(Parn)
PLEU: 114691374(Pnldc1) 114707334(Parn)
NGI: 103731559(Parn) 103734800(Pnldc1)
HGL: 101709845(Pnldc1) 101715275(Parn)
CPOC: 100726732(Pnldc1) 100732149(Parn)
CCAN: 109682986(Pnldc1) 109694360(Parn)
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OPI: 101516220(PNLDC1) 101533100(PARN)
TUP: 102473091(PARN) 102498089(PNLDC1)
CFA: 479839(PARN) 484065(PNLDC1)
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VLG: 121484078(PNLDC1) 121486906(PARN)
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UMR: 103660901(PNLDC1) 103668616(PARN)
UAH: 113259622(PNLDC1) 113270774(PARN)
UAR: 123778609(PARN) 123797506(PNLDC1)
MPUF: 101676171(PNLDC1) 101682567(PARN)
ORO: 101370054(PARN) 101382142(PNLDC1)
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ZCA: 113926263(PNLDC1) 113933217(PARN)
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PBG: 122471643(PARN) 122490150(PNLDC1)
PTG: 102950961(PNLDC1) 102959344(PARN)
PPAD: 109245389(PNLDC1) 109278360(PARN)
AJU: 106965974(PNLDC1) 106970567(PARN)
HHV: 120223337(PNLDC1) 120232716(PARN)
BTA: 524155(PARN) 615807(PNLDC1)
BOM: 102283407(PNLDC1) 102287848(PARN)
BIU: 109563599(PNLDC1) 109578580(PARN)
BBUB: 102391386(PARN) 102411464(PNLDC1)
CHX: 102171479(PARN) 102183329(PNLDC1)
OAS: 101111555(PNLDC1) 101112185(PARN)
ODA: 120862816(PNLDC1) 120874988(PARN)
CCAD: 122432858 122433845(PNLDC1)
SSC: 100152694(PNLDC1) 100515887(PARN)
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CBAI: 105073749(PARN) 105077367(PNLDC1)
CDK: 105091385(PARN) 105100384(PNLDC1)
VPC: 102526216(PNLDC1) 102526727(PARN)
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OOR: 101285176(PARN) 101286303(PNLDC1)
DLE: 111163471(PARN) 111167578(PNLDC1)
PSIU: 116740730(PARN) 116763347(PNLDC1)
ECB: 100050655(PARN) 100058786(PNLDC1)
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EAI: 106842041(PNLDC1) 106847167(PARN)
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MYD: 102753760(PARN) 102756543(PNLDC1)
MMYO: 118656125(PARN) 118659754(PNLDC1)
MLF: 102421437(PNLDC1) 102427204
MNA: 107524349(PARN) 107535724(PNLDC1)
PKL: 118703143(PARN) 118705894(PNLDC1)
HAI: 109394002(PNLDC1) 109395237(PARN)
DRO: 112297413(PNLDC1) 112314903(PARN)
SHON: 118995474(PNLDC1) 119002083(PARN)
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PHAS: 123806323(PARN) 123821940(PNLDC1)
MMF: 118620801(PNLDC1) 118641616(PARN)
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PALE: 102887262(PNLDC1) 102891690(PARN)
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PVP: 105290939(PARN) 105305670(PNLDC1)
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TOD: 119241907(PARN) 119253029(PNLDC1)
SARA: 101550663(PARN) 101558931(PNLDC1)
LAV: 100654816(PARN) 100663740(PNLDC1)
DNM: 101429685(PNLDC1) 101434972(PARN)
MDO: 100024540(PARN) 100032453(PNLDC1)
GAS: 123232972(PARN) 123246972(PNLDC1)
SHR: 100915402(PARN) 100925885(PNLDC1)
PCW: 110198320(PARN) 110208610(PNLDC1)
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GGA: 416423(PARN) 428595(PNLDC1)
PCOC: 116237548(PARN) 116241999(PNLDC1)
MGP: 100544728(PARN) 100550227(PNLDC1)
CJO: 107311529(PNLDC1) 107320526(PARN)
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SPAR: SPRG_10440
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Reference
  Authors
Gao M, Fritz DT, Ford LP, Wilusz J
  Title
Interaction between a poly(A)-specific ribonuclease and the 5' cap influences mRNA deadenylation rates in vitro.
  Journal
Mol Cell 5:479-88 (2000)
DOI:10.1016/S1097-2765(00)80442-6
  Sequence
[hsa:5073]
Reference
  Authors
Anastasakis D, Skeparnias I, Shaukat AN, Grafanaki K, Kanellou A, Taraviras S, Papachristou DJ, Papakyriakou A, Stathopoulos C
  Title
Mammalian PNLDC1 is a novel poly(A) specific exonuclease with discrete expression during early development.
  Journal
Nucleic Acids Res 44:8908-8920 (2016)
DOI:10.1093/nar/gkw709
  Sequence
[hsa:154197]

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